KEGG   COMPOUND: C20660
Entry
C20660                      Compound                               
Name
Wybutosine in tRNA(Phe)
Formula
C21H29N6O12P(C5H8O6PR)n(C5H8O6PR)n
Structure
Comment
Generic compound in reaction hierarchy
3'-adjacent to the anticodon (position 37) in cytoplasmic tRNA(Phe)
Reaction
Enzyme
Other DBs
PubChem: 172232382
LinkDB
KCF data

ATOM        66
            1   C1y C     9.8700  -21.2100
            2   C1y C    11.2700  -21.2100
            3   C1y C    11.6900  -19.8800
            4   C1y C    10.5700  -19.0400
            5   O2x O     9.4500  -19.8800
            6   O2b O    12.2500  -22.1900
            7   C1b C     8.6800  -21.9100
            8   R   R     9.8700  -17.8500
            9   O2b O     7.2800  -21.9100
            10  P1b P     5.8800  -21.9100
            11  O1c O     5.8800  -23.3100
            12  O1c O     5.8800  -20.5100
            13  O1c O     4.3400  -21.9100
            14  C1y C    19.1800  -21.4900
            15  C1y C    20.5800  -21.4900
            16  C1y C    21.0000  -20.1600
            17  C1y C    19.8800  -19.3200
            18  O2x O    18.7600  -20.1600
            19  O2b O    21.3500  -22.3300
            20  C1b C    17.9900  -22.1900
            21  O2b O    16.5900  -22.1900
            22  P1b P    15.1900  -22.1900
            23  O1c O    15.1900  -23.5900
            24  O1c O    15.1900  -20.7900
            25  C1y C    27.8600  -21.6300
            26  C1y C    29.2600  -21.6300
            27  C1y C    29.6800  -20.3000
            28  C1y C    28.5600  -19.4600
            29  O2x O    27.4400  -20.3000
            30  O1a O    30.2400  -22.6100
            31  C1b C    26.6700  -22.3300
            32  R   R    27.8600  -18.2700
            33  O2b O    25.2700  -22.3300
            34  P1b P    23.8700  -22.3300
            35  O1c O    23.8700  -23.7300
            36  O1c O    23.8700  -20.9300
            37  O1a O    12.6700  -18.9000
            38  O1a O    21.7700  -19.0400
            39  O1a O    30.6600  -19.3200
            40  N4y N    16.3100  -14.9100
            41  C8y C    16.3100  -16.3100
            42  N4y N    17.5000  -17.0100
            43  C8y C    18.7600  -16.3100
            44  C8y C    18.7600  -14.9100
            45  C8y C    17.5000  -14.2100
            46  N4y N    20.0900  -16.7300
            47  C8x C    20.8600  -15.6100
            48  N5x N    20.0900  -14.4900
            49  C8y C    14.9800  -14.4900
            50  C8y C    14.1400  -15.6100
            51  N5x N    14.9800  -16.7300
            52  O5x O    17.5000  -12.8100
            53  C1a C    12.8100  -15.4700
            54  C1b C    14.2800  -13.3000
            55  C1b C    14.9800  -12.0400
            56  C1c C    14.2800  -10.8500
            57  C7a C    12.9500  -10.5000
            58  O7a O    11.9700  -11.4800
            59  O6a O    12.2500   -9.2400
            60  N1b N    14.9800   -9.6376
            61  C1a C    10.6177  -11.1177
            62  C7a C    16.3800   -9.6376
            63  O6a O    17.0800  -10.8500
            64  O7a O    17.0704   -8.4421
            65  C1a C    18.4704   -8.4421
            66  C1a C    17.4828  -18.4099
BOND        71
            1     1   2 1
            2     2   3 1
            3     3   4 1
            4     4   5 1
            5     1   5 1
            6     2   6 1 #Down
            7     1   7 1 #Up
            8     4   8 1 #Up
            9     7   9 1
            10    9  10 1
            11   10  11 2
            12   10  12 1
            13   10  13 1
            14   14  15 1
            15   15  16 1
            16   16  17 1
            17   17  18 1
            18   14  18 1
            19   15  19 1 #Down
            20   14  20 1 #Up
            21   20  21 1
            22   21  22 1
            23   22  23 2
            24   22  24 1
            25   22   6 1
            26   25  26 1
            27   26  27 1
            28   27  28 1
            29   28  29 1
            30   25  29 1
            31   26  30 1 #Down
            32   25  31 1 #Up
            33   28  32 1 #Up
            34   31  33 1
            35   33  34 1
            36   34  35 2
            37   34  36 1
            38   34  19 1
            39    3  37 1 #Down
            40   16  38 1 #Down
            41   27  39 1 #Down
            42   40  41 1
            43   41  42 1
            44   42  43 1
            45   43  44 2
            46   44  45 1
            47   40  45 1
            48   43  46 1
            49   46  47 1
            50   47  48 2
            51   44  48 1
            52   40  49 1
            53   49  50 2
            54   50  51 1
            55   41  51 2
            56   45  52 2
            57   50  53 1
            58   49  54 1
            59   54  55 1
            60   55  56 1
            61   56  57 1
            62   57  58 1
            63   57  59 2
            64   17  46 1 #Up
            65   56  60 1 #Up
            66   58  61 1
            67   60  62 1
            68   62  63 2
            69   62  64 1
            70   64  65 1
            71   42  66 1
BRACKET     1     5.3900  -23.5200    5.3900  -16.1700
            1    13.5100  -16.1700   13.5100  -23.5200
            1  n
 ORIGINAL  1    1   2   3   4   5   6   7   8   9  10  11  12  38
 REPEAT    1
            2    23.4500  -23.9400   23.4500  -16.5200
            2    31.5700  -16.5200   31.5700  -23.9400
            2  n
 ORIGINAL  2   25  26  27  28  29  30  31  32  33  34  35  36  40
 REPEAT    2

» Japanese version

DBGET integrated database retrieval system