KEGG   ORTHOLOGY: K15737
Entry
K15737                      KO                                     
Symbol
csiD
Name
glutarate dioxygenase [EC:1.14.11.64]
Pathway
map00310  Lysine degradation
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Module
M00956  Lysine degradation, bacteria, L-lysine => succinate
M00957  Lysine degradation, bacteria, L-lysine => glutarate => succinate/acetyl-CoA
M00960  Lysine degradation, bacteria, L-lysine => D-lysine => succinate
Reaction
R12216  glutarate,2-oxoglutarate:oxygen oxidoreductase ((S)-2-hydroxyglutarate-forming)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09105 Amino acid metabolism
   00310 Lysine degradation
    K15737  csiD; glutarate dioxygenase
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.14  Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
   1.14.11  With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
    1.14.11.64  glutarate dioxygenase
     K15737  csiD; glutarate dioxygenase
Genes
ECO: b2659(glaH)
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PANC: E2636_12560(csiD)
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Reference
PMID:14731280
  Authors
Metzner M, Germer J, Hengge R
  Title
Multiple stress signal integration in the regulation of the complex sigma S-dependent csiD-ygaF-gabDTP operon in Escherichia coli.
  Journal
Mol Microbiol 51:799-811 (2004)
DOI:10.1046/j.1365-2958.2003.03867.x
  Sequence
[eco:b2659]
Reference
PMID:30498244
  Authors
Knorr S, Sinn M, Galetskiy D, Williams RM, Wang C, Muller N, Mayans O, Schleheck D, Hartig JS
  Title
Widespread bacterial lysine degradation proceeding via glutarate and L-2-hydroxyglutarate.
  Journal
Nat Commun 9:5071 (2018)
DOI:10.1038/s41467-018-07563-6
  Sequence
[eco:b2659]
LinkDB

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