Apis cerana (Asiatic honeybee): 108003312
Help
Entry
108003312 CDS
T07475
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 isoform X1
KO
K03018
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
acer
Apis cerana (Asiatic honeybee)
Pathway
acer03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acer00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
108003312
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
acer03021
]
108003312
Enzymes [BR:
acer01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
108003312
Transcription machinery [BR:
acer03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
108003312
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108003312
NCBI-ProteinID:
XP_016920966
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1385 aa
AA seq
DB search
MVKEQFRETDVARKISHVSFGVDSRHNMERQAHMHVVAKNLYNQDVEHTPVPYGVLDRRM
GTCNNTTNCASCGKTLNECIGHFGYIDLELPVFHVGYFRSIIGILQTICKNCSHVMLSEI
DKKHYLTRVLNPNLGYLTRKALRKQILDKAKKTSVCQNCGDLNGTVKKAGLLKIVHEKYK
AKKKVDVIVQQKLAEYNNVLEENKALEGILQSGLVNVLNPLEVQSILEKIPENDIPLLMM
NTECALPKDLILTRIPVPPICIRPSVVSDIKAGTTEDHLTMKLSEIVFINDVIQKHRQSG
AKVQMYSEDWEFLQLHCALYINSEMSGIPLNMQPKKSGRGLVQRLKGKQGRFRGNLSGKR
VDFSSRTVISPDPNLRIEQVGVPIHVAKILTYPEKVNPSNIELMRKLVRNGPDIHPGANF
IQQGKTQFKKYLRYGNRQKIAQDLQYGDIVERHLRDDDVVLFNRQPSLHKLSIMAHKAKI
LDHRTFRFNECVCTPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARAEALVLMGNKSNLVTPRNGELLIA
ATQDFITGGYLLTQKDMFLNKTQASQLAGCLLAGPDITMSINLPEPAILKPTILWTGKQI
FSLILKPNNTCNIKANLKTKGRAYTTNEELCINDSYVIIRNSELLAGSMDKSTLGSGSKQ
NIFYILLRDWGEDIATIAMWRLARMASFFLMNRGFSIGIGDVTPGQGLLKAKQELLNAGY
SKCTEYIQDMEEGRLICQPGCTEEETLEAMILKELSVIRDHAGKACLKELHPSNSPLIMA
LSGSKGSFINISQMIACVGQQAISGHRVPNGFEDRALPHFERHSKIPAAKGFVENSFYSG
LTPTEFFFHTMGGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLVKSLEDLCLHYDMTVRNSVGDIVQIL
YGGDALDPTYMEGKDCPVDYKRILDHVRAKSPCKNEESLDGHSVIKATNELLNSEEYECL
SEEFKQELSTFLKTVARKIARLRHNAVLNVPVILQLERLTVSQLVEFIHTCKEKYMRAKI
EPGTAVGALAAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITQGVPRIKEIINASPKISTPIITA
ALINDADPEYARRVKGRIEKTTLGEVTEYIEEVYLPDDCFLLIKIDIDRIKLLKLEVDVN
SIRYSICTSKLRLNPKLVNVRGDSIITVNPSKNKYSLNYALTQLKELIPNIVIKGLPSVS
RAVIHNDDSCGKKKYKLFVEGDNMRDVMATLGVLGKKTTSNNTIEVFKTLGIEAARATIM
TEIKLVMENHGMSIDRRHPMLVADLMTSRGEVLGITRQGLAKMKESVLNLASFEKTSDHL
FDAAYYGQKDVICGVSESIIMGIPVPVGTGIFKLLHKADKDEPKKRDLIFDDLQFKKIIK
SATKS
NT seq
4158 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaaagaacaatttagagaaacagacgtagctcgcaaaatttctcatgtctcattt
ggagtggatagccgccacaatatggaaagacaagcccatatgcatgttgtggctaaaaat
ttatataaccaggatgttgaacacactccagttccatatggagttcttgatagaagaatg
ggtacctgtaataatactaccaattgtgcatcatgtggtaaaactttaaacgaatgtatt
ggacattttggttatattgatttagaattgccagtttttcatgttggttattttagatct
attattggtattcttcaaactatttgtaaaaattgttctcatgttatgttatctgaaata
gataaaaaacattatttaactagagtattaaatcctaatttgggatatttaacacgtaaa
gcattacgtaaacagattttggataaagctaaaaaaacatcagtttgtcaaaattgtgga
gatcttaatggaactgtcaaaaaagctggtttactcaaaatagttcatgaaaaatataaa
gcgaaaaaaaaagtagatgttattgttcaacaaaagttagcagaatataataatgttctt
gaagaaaataaagcattagaaggaatacttcaaagtggattagttaatgtattaaatcct
ttagaggtacaaagtattttggaaaaaattccagaaaatgacattcctctattaatgatg
aatacagaatgtgcattaccgaaagatttaatattaacaaggattcctgtaccaccaatt
tgtattaggcctagtgttgtatctgatatcaaagctggtacaacagaagatcatttaaca
atgaaattatcagaaatagtttttatcaatgatgttattcaaaaacacagacaaagtgga
gctaaagtacaaatgtatagtgaggattgggaatttctacaattgcattgtgccctttat
ataaatagtgaaatgtctggtatacctctcaatatgcaaccaaaaaaatctggaagagga
ttggttcaaagattaaaaggaaaacaaggtcgttttcgtggtaatttatctggtaaacgt
gtagatttttccagtagaactgttatttcaccagatcctaatcttagaattgaacaagtt
ggtgtacctattcatgttgccaaaattttaacatatcctgaaaaagttaatccatcaaac
atagaattaatgagaaaacttgtaagaaatggtccagatatacatccaggagcgaatttt
atacaacaaggaaaaacacaattcaaaaaatatttaagatatggtaaccgtcaaaaaatt
gctcaagatttacagtatggtgacattgttgaaagacatctgagagatgatgatgtagtg
ttattcaataggcaaccatcattacataaattaagcatcatggcacataaagcaaaaata
ttagatcatagaacatttagatttaatgaatgtgtttgtactccatataatgctgatttc
gacggcgatgaaatgaatttacacgtccctcaaactgaagaagcaagagcagaagcttta
gttttaatggggaataagtcaaatttagttacacctcgtaatggagaattactaatagct
gcgacacaagattttattactggtggatatcttctgactcaaaaggacatgttcctaaat
aaaactcaagcaagtcaattagctggttgtcttctagcaggacctgatattactatgtct
ataaatctacctgaaccagctattttaaaaccaactatattatggacaggaaaacaaatt
tttagtttaattttaaaacctaataatacttgtaatattaaagctaatttaaaaaccaaa
ggaagagcttacaccaccaatgaggaattatgtattaatgattcttatgttattattcgg
aattcagaattattagcaggatctatggataaatcaacattaggttcaggatcaaaacaa
aatatattttatattttattgcgtgattggggtgaagatattgcaacaatagctatgtgg
cgattagcaagaatggcaagtttcttccttatgaatagaggtttttcaattggtattggt
gatgttacacctggtcaaggacttcttaaagctaaacaagaacttttaaatgcaggatat
tctaagtgtacagaatatattcaagacatggaagaaggacgtcttatatgtcaacctggt
tgtacagaagaagaaacattagaagcaatgatattaaaagaactttcagtaattcgtgat
catgctggtaaagcatgtttaaaagaacttcatccaagtaatagtccattaattatggca
ttatctggcagtaaaggaagctttattaatatttctcaaatgattgcatgtgtgggacaa
caagctattagtggtcatagagttccaaatggatttgaagacagagctttaccacatttt
gaaagacattcaaaaattcctgcagctaaaggttttgtagaaaattcattctattctggt
ttaacaccaacagaatttttttttcatacaatgggtggaagagaaggtcttgtagataca
gcagttaaaactgctgaaactggttacatgcaacgacgattagttaagagtttagaagat
ttgtgccttcattatgatatgacagttcgtaattcagtaggagatattgttcaaatattg
tatggtggagatgctctagatcccacatacatggaaggaaaagactgtccagtggattat
aagagaatattggatcatgtaagagccaaatctccatgtaaaaatgaagaatcattagat
ggtcatagtgtaattaaagctacaaatgaattactaaattctgaggaatatgaatgtctc
agtgaagaatttaaacaagaactatccacattccttaaaactgtagcacgtaaaatagca
cgccttcgacataatgctgtattaaatgtacctgtaattttacaacttgaacgactcaca
gtttctcaattagttgaatttattcatacttgtaaagaaaaatacatgagagcaaagata
gaaccaggtactgctgtaggtgcacttgctgcacaaagtattggagaaccaggaacacaa
atgacattaaaaactttccatttcgccggtgtagcgtctatgaatattactcaaggtgta
ccgcgtattaaagaaattattaatgcaagtcccaaaattagtactccgattattactgct
gctttaataaatgatgcagatccggaatatgctagaagagtaaaaggcaggattgaaaaa
actactttaggagaagtgacggaatatattgaagaagtttatcttccagatgattgtttc
ttattaattaagatagatattgatagaataaagttattgaagttagaagtagatgtcaat
tctatacgttattcaatttgtacatcaaaattaagactaaatccaaaattggtaaatgtt
agaggagattctattattactgtgaatccaagcaaaaataaatatagtttaaattatgct
cttacacaacttaaagaattgattccaaatattgttataaagggtttaccatcagtttct
agagctgtaattcataatgatgattcatgtggtaaaaaaaaatataaattattcgtagaa
ggagacaatatgcgagatgtaatggcaactcttggagttcttggcaaaaaaacaacttca
aacaatacgattgaagtttttaaaactttaggtattgaggctgcaagagcaactataatg
acagaaattaaattggtcatggaaaatcatggaatgagtattgatcgaagacatccaatg
cttgtagcagatttaatgactagtaggggagaagtattaggtattacaagacaaggttta
gctaaaatgaaggagtctgtcttaaatttagcttcgtttgaaaagacatctgatcactta
tttgatgcagcttattatgggcaaaaagatgttatttgcggagtttctgaatcaattata
atgggtattccagtacccgtaggaacaggaattttcaaattacttcacaaagctgataaa
gatgaaccaaaaaaaagggatttgatatttgatgatctacaattcaagaaaattataaaa
tctgcaacaaaatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
