Apis dorsata (giant honeybee): 102677548
Help
Entry
102677548 CDS
T09121
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1
KO
K02999
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
adr
Apis dorsata (giant honeybee)
Pathway
adr03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
adr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
102677548
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
adr03021
]
102677548
Enzymes [BR:
adr01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
102677548
Transcription machinery [BR:
adr03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
102677548
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102677548
NCBI-ProteinID:
XP_006608785
EnsemblRapid:
LOC102677548
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1707 aa
AA seq
DB search
MVQHKYHTPRLTPKHLDPKCLMFSMFTANDIRNLSVAKIRTPLSFNILGHPLKGGLYDPS
LGPLLESSDPCGTCGCNVFKCPGHFGHIELPMPVINPLFHKGLCMLIKLACLNCFNLQIP
SYVKLLLSAKLKLLQQGYLSDLESLEQEVMIVVFNSDNPYNVDIQSVQNVIDNYIENLLN
KQRFNQSFVQYNEIDINTKNINTQWHTCVENVLKQYTTPKICIYCEEPISKVTTLKNKIM
TTKISNLSNETMQSRGVIHKLDTIMIMPDQSKDYLRKLWQNEKNFLKVIIPCFGMVDIEY
PTDIFFFEVIPVLPPIVRPVNFINGQMIEHPQSQVYKSIIQDCLVLRNIIQTIQDGDTEQ
LPEEGKVVYDHIKGNTAIEKLHNAWQNLQINVDHLMDRDMNRTTDSANCQGLKQVIEKKE
GIIRMHMMGKRVNFAARSVITPDPNLNIDEIGIPEAFALKLTYPTPVTPWNVVQLRQLVL
NGPNIHPGAVMIENEDGSIQRISISDAIQREAIAKRLLTTSDKANKFFKGIKIVHRHLQN
GDILLLNRQPTLHKPSIMAHKARILKGEKTLRLHYANCKSYNADFDGDEINAHHPQNELA
RSEGYNIANVSNQYLVPKDGTPLSGLIQDHIISGVRLTVRGTFFSREDYMQLVYAALSTI
QDNIILLPPSIIKPIALWSGKQIISTVIINIIPPNQARINLTASAKINAKQWQIEKTRYW
KCGTEFSNPNTMSEAEVIIRNGELLCGVLDKTHYGATPFGLVHCIFELYGGTCSAKLLSA
FGKLFQAALQRNGFTLGIEDILLLKKADKKRKEIISNCRKIGENIQKSVLELPNDTPMDI
VTSKMEESYWNDPKFRAQVDRKYKSTLDIYTNDINKICLPAGLLKKFPDNNLQLMVQSGA
KGSTVNTMQISCLLGQIELEGKRPPLMISGKSLPSFSAYDPTPRAGGFIDGRFMTGIKPQ
EFFFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGLVINYDSTVRDSDGSLVQIYYGED
GLDIPGSRFLKKEQLNFLIDNKNAIVNEEMIKNLKEDSDTDKILKLVKKIKKWESKNGNT
LQKKRISPFTRFSMENMNIKSSKYKEIDKQSGRSKAAVSYMRKWIRTTEEDKKWIYNECI
KCPDPVMSKYRQDIDFGVLSERLENLIDEYLTNKSKNFIIRKKDLRDLLSMKVMKVVCPP
GEPVGLLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGRGEMNVTLGIPRLREILMMASKNIKTPSMEIP
FRKDLKNVIKRSNKLKLKLTKCILSNVLDNIIVNRKMEQWPNRQLIYTITINYLPHKSYK
GEFCVQPHEILKKTEEVFFKEIFKEIKKIAKITGALLHVEEEKKSIYEDDVLLDQIEPDQ
GTESILKPQTNLGEMHESSDEEAAAEDADATLTRTISRHRENQEYEDPEEEEMEDINEKE
DDIENETEKLRIEAQEQNEDEDDDDIENEKSECITSEIYNIQRKKNIRNMYVNALEYDYD
EKKFTWCKLTFWLPLKMLKLDLPTIIKNVANRVILWEVPCIKRAFTFQNNNGETILKTDG
INIIEMFKYDKFLNLNQLYSNDIYSISQTYGIEAANRIIIKEVRDVFKMYGITVDSRHLS
LIADYMTFDGRFQPLSRKGMEESASPLQQMSFESSLNFLKNAALQGKRDNLESPSSRLML
GQPCKSGTGICSLLVKIHKQSENNAIV
NT seq
5124 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtacagcataaatatcatactccacgtttaactccaaaacatttagatccaaaatgc
ttaatgttttctatgtttactgcaaatgatataagaaacttaagtgttgctaaaataaga
acacctttatcatttaatattttgggacatcctttaaaaggaggtttatatgatccatca
ttaggtcctcttttagaaagttcagatccatgtggaacatgtggatgcaatgtattcaaa
tgtccaggtcactttggacatatagaattacctatgccagttataaatccattatttcat
aaaggattatgtatgttaattaaattagcatgtttaaattgtttcaatttacaaattcca
tcttatgtaaaattattactctctgcaaaattgaaattacttcaacaaggatatctcagt
gatcttgaaagtttagaacaagaagtaatgattgttgtctttaactcagataatccttat
aatgttgatatacaatctgttcaaaatgttattgataattacattgaaaatcttcttaat
aagcaaagatttaatcagtcttttgtacagtacaatgaaattgacataaacaccaaaaat
attaatacacaatggcatacttgtgttgaaaatgttcttaaacaatatacaacaccgaaa
atttgtatatattgtgaagaacctatatcaaaagtcacaacattaaaaaataaaataatg
acaactaaaatatctaatttatctaatgaaacaatgcaatcacgtggtgtaatacataaa
ttggatactataatgataatgccagatcaatctaaagattatcttagaaaactttggcaa
aatgaaaaaaatttcttaaaagttattataccttgctttggaatggtagatattgaatat
ccaactgatatatttttttttgaagtaataccagttctaccacctatagtaagaccagtt
aattttattaatggacaaatgatagaacatccacaatctcaagtttataagagtatcatt
caagattgtcttgtacttcgaaatatcattcaaacaattcaagatggtgatacagaacaa
ttaccagaagagggaaaagttgtttatgatcacataaaaggtaatacagcaattgaaaaa
ttgcataatgcttggcaaaatttgcaaataaatgtagatcatttaatggatcgtgatatg
aatagaactacagattctgcaaattgtcagggactaaaacaagttatagaaaaaaaagag
ggaattattagaatgcatatgatgggtaaaagagttaattttgctgctcgatcagttatt
actccagatcctaatttgaacatagatgaaattggtattcctgaagcttttgcattgaaa
ctaacatatccaacaccagttacaccttggaatgttgtacaattaagacaattagttttg
aatggtcctaatattcatcctggagcagtgatgattgaaaatgaagatggaagtatacaa
cgtatttctatttcagatgctattcaaagagaggctattgcaaaacgtcttttaacaaca
agtgataaagcaaataaattttttaaaggcattaaaattgtacatagacatttacaaaat
ggagatattctattattaaatcgtcaaccaactttgcataaacctagtattatggctcac
aaagcacgtattttaaaaggagaaaaaacattacgtttacattatgctaattgtaaaagt
tataatgcagattttgatggtgatgaaatcaatgctcatcatcctcaaaatgaactagcc
agaagtgaaggttacaatatagcaaatgtatctaatcaatatcttgtacctaaagatggt
actccattaagtggccttattcaagatcatataatttctggtgtccgtttaacagtaaga
ggaacatttttttcgcgcgaagattatatgcaattagtttatgctgctttatctacaata
caagataatataattcttcttcctcctagtattataaaaccaatagctttatggtctggt
aaacaaattatatcaactgttatcattaatattattccaccaaatcaagcgcgtattaat
ttaacagcaagtgccaagatcaatgcaaaacaatggcaaattgaaaaaacaagatattgg
aaatgtggtactgaattttcaaatcccaatacaatgtcagaagctgaggtaataatacga
aatggagaactattatgtggtgtacttgataaaacacattatggtgcaactccatttggt
cttgtacattgcatttttgaattatatggaggaacatgttctgcaaaattattaagtgct
tttggtaaattgtttcaagcagctttacaaagaaatggatttacacttggcattgaagat
attttattattaaaaaaagcagataagaaacgcaaagaaattatttctaactgtagaaaa
attggtgaaaatattcaaaagtctgtgttagaattacctaatgatacacctatggatata
gttacatctaaaatggaagaatcttattggaatgatcccaaatttcgcgctcaagtcgat
cgaaaatacaaaagtacattagatatttatactaatgatataaataaaatatgtttacca
gctggtcttttgaaaaaatttccagataataatttacaattaatggttcaatctggtgca
aaaggttctactgtaaatactatgcaaatatcttgtttacttggacaaattgaattagaa
ggaaaaagaccacctttaatgatcagtggaaaaagtcttccaagtttttctgcatatgat
ccaacaccaagagcaggtggttttattgatggtagatttatgacaggaattaaacctcaa
gaatttttttttcattgcatggccggtcgtgaaggtctcattgatactgctgtgaaaact
agtagatcaggatatttacaaagatgtcttattaaacatcttgaaggattagtcattaat
tatgattcaacagtacgagattcagatggtagtttagtacagatttattatggagaagat
ggattagatataccgggttcacgatttttaaaaaaagaacaattaaattttttgatagat
aataaaaatgcgattgtaaatgaagaaatgataaaaaatttaaaagaagattcagataca
gataaaattttaaaattggtgaaaaaaattaaaaaatgggaaagtaaaaatggaaatacg
ttacaaaagaaaagaattagtccatttacaagattttcaatggaaaatatgaatattaaa
agttcaaagtataaagaaatcgataaacaaagtggaagaagcaaagctgctgtttcatat
atgagaaaatggataagaactactgaagaggataaaaaatggatatataatgaatgtatt
aaatgtccggatccagtaatgtcaaaatataggcaagatatagattttggtgtactttct
gaacgattagaaaatttaatagatgaatatttaactaataaatctaaaaattttattata
aggaaaaaagatttaagagatcttttatctatgaaagtaatgaaagttgtttgtccacct
ggtgaaccagtaggtttattagcagcacaatcaataggagagccatcaacacaaatgact
ttgaatactttccatttcgccggtcgtggagaaatgaatgttactttgggtatacctaga
ttacgagaaatattaatgatggcatcgaaaaatattaaaacacctagcatggaaatacca
tttcgaaaagatttaaaaaatgtaataaaacgatcaaataaattaaaattaaaattgact
aaatgtattttatcaaatgttttagataatattattgttaatagaaaaatggagcaatgg
cctaatagacaattaatatatactataactattaattatcttccgcataaatcttataaa
ggagaattttgtgttcaaccacatgaaatattaaagaaaactgaagaagtattttttaaa
gaaatatttaaagaaattaaaaaaattgctaaaataacaggtgctttattacatgttgaa
gaggaaaaaaaatctatatatgaagatgatgttctattagatcaaatagaacctgatcaa
ggaacagaatctatattgaaaccacaaacaaatttaggagaaatgcatgaatcttcagat
gaagaagcagcagcagaagatgcagatgcaactttaacacgaacaatttcacgtcataga
gaaaatcaagaatatgaagatccagaagaagaggaaatggaagacataaatgaaaaagaa
gatgatatagaaaatgaaacagaaaagttaagaattgaagcccaagaacaaaatgaagat
gaagatgatgatgacatagaaaatgagaaatcagaatgtattacaagtgaaatatataat
atacaaagaaagaagaatattagaaatatgtatgttaatgcattagaatatgattatgat
gagaaaaaatttacatggtgtaaattgacattttggttacctcttaagatgttaaaatta
gacttaccaacaataattaaaaatgttgcaaatagagttattttatgggaagtaccttgt
ataaaacgtgcttttacatttcaaaataataatggagaaacaattcttaaaactgatggt
attaatatcatagaaatgtttaaatatgataaatttttaaatttgaatcaattatattct
aatgatatttatagtatttctcaaacatatggtattgaagctgctaacagaattattata
aaagaagtgagagatgtattcaagatgtatggaattacagttgattctagacatctgtct
ttaattgcagattatatgacttttgatggtagatttcaacctcttagtcgtaaaggaatg
gaagaatcagcatctcctttacaacaaatgagttttgaaagttcacttaatttcttaaaa
aatgcagctttacaaggaaaacgagataatttggaatctccttctagtcgactaatgtta
ggtcaaccttgcaaatctggtactggaatatgttcattattagtgaaaatacacaaacaa
tcagaaaataatgcaattgtataa
DBGET
integrated database retrieval system
