Malaciobacter mytili: AMYT_2090
Help
Entry
AMYT_2090 CDS
T05895
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase
KO
K20964
c-di-GMP phosphodiesterase [EC:
3.1.4.52
]
Organism
amyt
Malaciobacter mytili
Brite
Enzymes [BR:
amyt01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.4 Phosphoric-diester hydrolases
3.1.4.52 cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase
AMYT_2090
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
ArgoMid
UDPG_MGDP_dh_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXH15639
UniProt:
A0A345J755
LinkDB
All DBs
Position
2127731..2129824
Genome browser
AA seq
697 aa
AA seq
DB search
MLKNISYKNLFVSLIIIFSLIITFIVYLVFSNIEKFHIDKLSKDTYNSEKIHIKSFVKEY
FDVYNNLLITLSNTKEIIEYENNIEIIEKIFNSYEKTLPNLIGIIYLDKNQNEIIKVNKV
YESIKEDYTFFNSLDKTFKAYLTNQKIYLGQNIFKENKKISTLILKIDIKEFISKLVSSN
LYNLTLVNKGKPILNKENLTLSKEEFSLILNNEEYLSNNLYSFSINDFYNQNIKIVLKPK
HTLDDEKLKKSQAIIFLILFFSFLILIPLAMYFSNIPNKILKEYEDKLITHNITGLKNSI
YLDKELNNKTFNNSIIILVYLNNFKKLQSVYGYKIINTILKESSRLIESYKHKDENFEEL
YSIENNLFAIKYNFTNEANLIKFTQLLFTDLERVEILIDKNSSIYLDLTLAISNPLDVKN
NAQKLHEAQMALEYALENKIDILVYDPEVKTKDINSLNLKILKSIKNAIDKNDLVLHYQP
IYNNRTQKIEKYETLMRIRNSNNEIIYPNSFLDIAKNSRKYNKLTYAMIEKSFKYFQNKE
YEFSINLSVLDIVEKGFTAFLVQKIKEYNVEKKLVLEIVESESVTNYKEIKKFIVAIKEL
GCKIAIDDFGSGYANFQHIISLSQYIDYIKFDGSLIKNIHKNRKSQLLVGVIKFLCDSLN
IQTIAEFVEDEDTLNFVDSMGINFSQGYFIGKPIENI
NT seq
2094 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaatatttcttataaaaatctattcgtttcacttataattatcttttcgcta
attattacatttattgtctatttagtatttagtaatattgaaaaatttcatattgacaaa
ctttcaaaagatacttataatagtgaaaaaattcatataaaaagctttgtaaaagaatat
tttgatgtttacaataacttgcttattacactaagcaatactaaagagattattgaatat
gaaaataatatagaaataatagaaaaaatatttaactcttatgaaaaaactctaccaaat
ctaattggaataatataccttgataaaaatcaaaatgaaataataaaagttaataaagtt
tatgaatcaattaaagaagattatactttttttaatagtttagataaaacatttaaagct
tatttaactaaccaaaaaatctaccttggacaaaatatttttaaagaaaataaaaaaatt
tctacacttattttaaaaattgatattaaggaatttatctcaaaacttgtaagttcaaac
ctatataatctaacgttagttaataaaggtaagcctattttaaataaagaaaatcttact
ttatcaaaagaagaattttctttaattttaaataatgaagaatatttatcaaataacctt
tatagcttttcaattaatgatttttacaatcaaaatataaaaattgttctaaaaccaaaa
catactttagatgatgaaaaattaaaaaagtcacaggctataatttttctaattttattt
ttcagttttttaattttaattccacttgctatgtatttttcaaatattccaaataaaatt
ctaaaagaatatgaagataaacttattactcataatattactggattaaaaaatagtatc
tatttagataaagagttaaataacaaaacttttaataattctataataattctagtttac
ttaaataacttcaaaaaactacaaagtgtctatggatacaaaataattaatacaatttta
aaagaatcttcaagattaattgaaagctataaacataaagatgaaaattttgaagagtta
tattctatagaaaataatctttttgcaataaaatataattttacaaatgaagcaaatctt
attaaatttacacaacttttatttactgatttagaaagagtagaaatattaattgataaa
aatagttcaatatatcttgatttaactttagctatttcaaatcctcttgatgtgaaaaac
aatgcacaaaaactccatgaagctcaaatggcgctagagtatgctttagaaaataaaatt
gatattttagtttatgacccagaagtaaaaactaaagatattaatagtctaaatctaaaa
attctaaaatcaattaaaaatgccattgataaaaatgatttagttttacattatcaacca
atatataataatagaactcaaaaaattgaaaaatatgaaactttaatgagaataagaaat
agcaataatgaaattatttatccaaactcttttttagatattgcaaaaaactcaagaaaa
tataataaattaacttatgccatgattgaaaaatcttttaaatattttcaaaataaagag
tatgaattttctataaacttaagtgtcttagatattgtagaaaaaggttttactgctttt
ttagttcaaaaaataaaagagtataatgttgaaaaaaaattagttttagaaatagttgag
tctgaaagtgttacaaattataaagagattaaaaagtttattgttgcaataaaagaatta
ggttgtaagattgctattgatgattttggaagtggatatgctaactttcaacatataatt
agtttaagtcaatatattgactatattaaatttgatggctcactaattaaaaatatacat
aaaaatagaaaatctcaacttcttgttggggtaattaaatttttatgtgatagtttaaat
atacaaactattgcagagtttgttgaagatgaagatactttaaattttgtagattcaatg
ggaataaatttttctcaaggttactttattggaaaacctatagaaaatatataa
DBGET
integrated database retrieval system