Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL: SFBmNL_00774
Help
Entry
SFBmNL_00774 CDS
T03243
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
aso
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL
Pathway
aso03030
DNA replication
aso03430
Mismatch repair
aso03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aso00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SFBmNL_00774 (polC)
03430 Mismatch repair
SFBmNL_00774 (polC)
03440 Homologous recombination
SFBmNL_00774 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
aso03032
]
SFBmNL_00774 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
aso03400
]
SFBmNL_00774 (polC)
Enzymes [BR:
aso01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SFBmNL_00774 (polC)
DNA replication proteins [BR:
aso03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SFBmNL_00774 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
aso03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SFBmNL_00774 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
Rv2179c-like
DEDDh_C
RNase_H_2
DNA_pol3_a_NII
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AID44682
LinkDB
All DBs
Position
774084..778277
Genome browser
AA seq
1397 aa
AA seq
DB search
MKVLKIEIWEDKRNVLIYIEYEDDFNKDDLKAKLRNQVDKNFNYEIILIKNCYSKSVDDF
LHNNYDSFLEYVKFTNPIFYPVFFVKPNVVDSKLIYISSNNFIINKFNNNNVNIELEGFV
KYFFNIDVNIEIVYGNQKEDFIKDDIIVENKTIDSIPNDPVFFNSKVKVDNNKYSDDSVI
VGKQILENAIEISSITIPEKNIVIQGCIFNQKVLTTKTGKKILNFYINDDTSSINVKYFL
RLKDNENILDKVKNDSNVKIKGEVVMDNFTNELAIIAYNISSISKIERRDDYGEKRIELH
SHTNLSTMDSVINVNALFKTLKDWGHKSVAITDHNVVQAYPNVMDASKKFGIKPIYGIEI
NMVDDLKPLINDDFGKTINDTFVVFDIETTGFSNVNEKIIEIGAVKIINGEIVDEFSTFV
NPEMNIPYKITELTSISNEMVAGAPIIENIIGEFYDFCSGAILVAHNIDFDMSFIRRNGN
KFGYSFKNSLLDTIDICKFLFPELKRYRLNVVAKHLAIPLDNHHRAVDDAKATAMILIKC
FERLKSQEILSLEDLNKKYRENIHISKIFTYQTVLLAKDYNGLKNIYKLVSKGHLEYFFK
TSRIPKSEILKHREGILIGASFREGEIFKAITDYLDDDRINDIIDFYDYFEISPPVNCTE
QIRSERFKDYKEIEDVIKEIYKLGKKNEKLVVAVSNAHYIEKKDNIYRNILRVCQNFKVN
LDDTSLYLRTTDEMFKEFEFLSKDVRDEVILLNPSKINDMVDEILPIPNGTFPPKIEGSD
DEIRMMAYEKAHSIYGENLHQIIKDRLDKELNSIISNGYAVLYLIAHKLVKKSLDDGYLV
GSRGSVGSSIVATFCGITEVNGLPPHYVCPKCKDTEFISDGSVNAGVDLPSKDCVKCGTE
YLRDGFDIPFETFLGFDGDKEPDIDLNFSGEYQPLVHKYTEELFGKGYVFRAGTIGTIAD
KTAYGYVKKYIEEMGIRVPQPEIERLSKGLTGVKRTTGQHPGGIMVVPKDNDIFNFTPIQ
HPADDMDADVITTHFDYHSISGRLLKLDILGHDDPTMLKMLKDLTGLNPQEIPLNDEKVL
SLFTGISALNMEPGYIDCSVGTLGIPEFGTKFVRQMLLDTKPTTFSDLVRISGLSHGTDV
WINNAQEFIMKGYTTLKDCISTRDDIMVYLVYKGLPAKKAFDIMESVRKGKGLTKEYEDI
MAENKIESWYIESCRRIKYMFPKGHAVAYVMMAVRIAYYKVYYPIEYYTAYFTVRADEFD
ANLICNGAEFIKEKIGQLNALGNNLTQKDKGLLTVLEIALEAYARDVKFYKVDLYKSHYN
DFKIEDGGILPPINALQGVGATAAKNLYEAGRFCEFISIQDLKNRAKVSKTVIETLQSHG
CIRDLPENNQLSMNLQF
NT seq
4194 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagttttaaaaatagaaatttgggaagataagagaaatgttttaatttatattgaa
tacgaagatgattttaataaggatgatttgaaagcaaaacttagaaatcaagtagataaa
aattttaattatgaaattattttaataaaaaactgctattctaaatctgtggatgatttt
ttacataataattatgattcatttcttgagtatgttaagttcactaatccaatattttat
ccagttttttttgtgaaacctaatgtagttgatagtaaactgatttatatatcgtcaaat
aattttataataaataagtttaataacaataatgtaaatatcgagcttgaaggttttgtt
aaatatttcttcaatatagatgtgaatatagaaattgtttatggtaatcagaaagaagat
tttattaaagatgatataattgttgaaaataaaactattgattctatccctaatgatcca
gttttttttaatagtaaggttaaggtagataataataagtactcagatgatagtgtcatt
gttgggaaacaaattcttgaaaatgcgattgagatatcttcgattactattcctgaaaaa
aatatagttattcaaggatgtatctttaaccaaaaagttttgacaactaaaacaggtaaa
aaaattcttaatttttatatcaatgatgatacatcatctataaatgtaaagtattttttg
agattaaaagataatgaaaatattttagacaaagtgaaaaatgattccaatgttaaaatt
aaaggtgaggttgtgatggataacttcacaaatgaattagcaattattgcgtataatatt
agttctattagtaagatagaacgaagagatgattatggagaaaaacgaattgaattacat
tctcatacaaatcttagcacaatggattctgtgattaatgttaatgcattatttaaaact
ttgaaagattggggacataaatcagtagcaattactgatcataatgtagttcaagcatat
ccaaatgttatggatgcttctaaaaagtttgggattaaacctatttatggtatagagatt
aatatggttgatgatttgaaaccattaattaatgatgattttggtaaaacaattaatgat
acttttgtagtttttgatattgaaaccacgggattttcaaatgtgaatgaaaaaataatt
gagattggtgctgttaaaattataaatggagaaattgtagatgaattttctacatttgtt
aatccagagatgaatataccgtataaaattacagaattaacatcaataagtaatgaaatg
gtagcaggtgctcctattattgaaaatattattggagaattttatgatttttgttctgga
gcaatacttgttgctcacaacatagattttgatatgtcgtttattaggagaaatggtaat
aaatttggatatagttttaaaaattctttacttgatactatagacatatgtaaattctta
tttcctgaacttaagagatataggttaaatgtagttgctaaacatttagcaatacctctt
gataatcatcatagagcggtagatgatgctaaagcaacagcgatgattttaattaaatgt
tttgagcgattaaaatcacaagagattttgagtttagaggatctgaataagaagtataga
gaaaatatacatatatcaaaaatttttacatatcaaactgtattgcttgcaaaagattat
aatggtttaaaaaatatatataagcttgtatctaagggtcatttggaatatttttttaag
acatcgagaattccaaagagtgagatattgaagcaccgagaaggtatattaataggtgca
tcatttagagaaggagaaatatttaaggctattactgattatttagatgatgataggatt
aatgatataatagacttttatgattattttgaaatttctcctcctgttaattgtacagag
cagattagatctgagagatttaaagattataaagagattgaagatgttataaaggaaatt
tataagttagggaagaaaaatgaaaaattagtagttgctgtttcaaatgctcattatata
gaaaagaaggataatatttatagaaatattttaagggtttgtcagaattttaaagtaaat
ttagatgatacgagtttatatttaagaactactgatgaaatgtttaaagagtttgaattt
ttgtcaaaggatgttagagatgaagttatacttttaaatccaagcaagattaatgatatg
gttgatgaaattttgccaataccaaatggaacttttcctcctaagatagaaggatcagat
gatgagataaggatgatggcttatgaaaaggctcactctatttatggagaaaatcttcat
caaataataaaagataggcttgataaggaattgaattctattatatcgaatggatatgct
gtactttatttaattgcacataaacttgttaaaaagtccttagacgatggatacttagtt
ggttcaagaggatctgttggatcatcgattgttgcgacattttgtggaataactgaggtt
aatggacttccaccccattatgtttgtccaaaatgtaaggacacagaatttatatcagat
ggtagtgttaatgctggagtagatttaccatcaaaagattgtgttaaatgtggtacagaa
tatttaagagatggatttgatattccatttgaaacctttttaggatttgatggagataaa
gagcctgatattgatttaaatttttctggagaatatcaaccattggttcataaatatact
gaggagttatttggtaaaggttatgtgtttagagcaggcactattggtactattgctgat
aaaacagcctatggttatgttaaaaaatacatagaagaaatgggtattagagtacctcaa
ccagaaattgagaggttatccaaaggattaacgggagttaaaagaacaactggccaacat
ccagggggtataatggttgtacctaaagataatgatatatttaattttacaccgatacaa
catccagcagacgatatggatgcagatgtaataactactcattttgattatcactcaata
agtggacgtttattaaaacttgatattcttggacatgatgatccaactatgcttaagatg
cttaaagatttaacaggattgaatcctcaagaaataccgttaaatgatgaaaaagtgctt
agtttatttactggtatatctgctcttaatatggagccaggatatatagactgttctgta
ggtacgcttggaattcctgaatttgggactaagtttgtacggcaaatgttacttgatacc
aagccgacaacgttttcagaccttgtaagaatatcgggtttatcacatggaacagatgtt
tggattaataatgctcaggaatttattatgaaaggatatacaacacttaaagattgtata
tccacaagagatgatattatggtttatttggtttataaaggactaccagctaagaaagca
tttgatattatggaaagtgtgcgtaaaggtaaaggtctaacaaaagaatatgaggatata
atggcagaaaataaaatagagtcttggtatattgagtcttgtagaagaattaagtatatg
tttcctaagggtcatgctgtagcttatgttatgatggctgttagaattgcttattataag
gtttattatccgattgagtattatactgcttattttactgttagagctgatgagtttgat
gcaaatttaatttgtaatggagcagagtttattaaagagaaaattggtcaattaaatgct
ttaggaaataatttaactcaaaaagataaaggacttttgacagtacttgagatagctttg
gaagcatatgcacgagatgttaaattctataaggtagacttatataaatcacattacaat
gattttaagatagaagatggaggaatacttccacctattaatgcattgcaaggagttggt
gctacagccgcaaaaaatttatatgaggctggtagattttgtgaatttatatctattcag
gatttgaaaaatagagcaaaggtatctaaaacagtaattgaaacacttcagtcccatgga
tgtataagagatttgcctgaaaataatcaattgtcaatgaatttacaattttag
DBGET
integrated database retrieval system