Niallia circulans: C2I06_04330
Help
Entry
C2I06_04330 CDS
T06357
Name
(GenBank) hyaluronate lyase
KO
K01727
hyaluronate lyase [EC:
4.2.2.1
]
Organism
bcir
Niallia circulans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bcir00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
C2I06_04330
Enzymes [BR:
bcir01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.1 hyaluronate lyase
C2I06_04330
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lyase_8_N
Lyase_8
Lyase_8_C
Big_2
CBM_4_9
DUF642
Big_13
aBig_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYV66165
LinkDB
All DBs
Position
955637..959299
Genome browser
AA seq
1220 aa
AA seq
DB search
MEDGKMQKGISVFLFTFMIISFVLPARNITAEETINENLIQNGGFETVTSNSSWANSEGP
GKWSTWIPSGTPELRMDDSVFYEGEKSISIKATETSRADVLQDVSVKSGFTYQLSFWVKT
ENIEASGGGVFVRTQYLDSANKKISDGPSTEKLKGSQDWNTKRLGLTIPNNASKVRIELF
FETAKGQAWFDEVALKESDKTVTDFSLKQNAVKVGIGETVTLEPVFTPADVTDKTVTWTS
SNPEIASVNSAGVVTGAESGAATIKATSKDGGFTAECLISVDSVEDIGYYDELRLSWFHK
LTGNELYNPADQDAAAYMSGLEKKVTNKDGTGIWDMMNKMENRNSLWADNESTTNSAQIT
TSYQRLKDMALAYSSKGSALFRNQALKTDIIIGLDWLHNNRYNADKEEYGNWWDWEIGIP
QTLNDIMVLMYNDLSSLQINNYIKAIDRFVPDPTKRVSLGDPNFRETGANLLDKALVVSL
RGIIEKNSGKVLKGRDSISKEYIYVNSGDGVYRDGSLVQHFNVAYTGGYGATWVGRTADM
LYLLKDSPWEVKDSNVDNVFNWVSDSFEPLIYKGAMMDMVSGRGVSRQSTNDHATGRSTI
LSLLRLADAAPQEHALSIKQMVKEWIQTDTTFSNYVNGLSIYQIHLVHTLVNDTTIEPRG
ELIKNQVFAGMDRVVHLRPDFGFGISMFSDRISGFEYGNGENKKGWYTGAGATYLYNNDL
KQFSNDYWPTVDSYRLPGTTTDQSKGTLKDWESYYNPRSWVGGSNLDDLYGAAGMDFSLE
KLTGSSLKGKKSWFMFDDEIVALGAAINSTGESEVETIVENRQLNANGNNKLLINGEEKI
KELGDSEVLNDVQWAHLEKNVQGSDIGYYFPNSPSLRGLRESRTGSWNEINSGGSTESIT
RNYLSLAFDHGKQPVDETYSYVLLPNKDVEQTKNYSEKPDVTILANTASVQAVREETLKL
TAANFYQKDTVGFIKAGSAASVMVKEEKNGLTLSVSDPTQKQDKIVIEMNKTGLEVDKKD
DKIKVLQNSPTIQVEVNVANSIGKTHSIQFIDKESPTISAPEAEDIYRTDTVNLAFAMSD
SYSDIASKEFYLDDVAVSNPIEIKPYSLSLGEHTIKVLATDQAGNVAEEIYQLNVIMDIN
HLREAINYGRDKEWINNEIANNLHVKINHIIQKEKMNNKQIRNNLHAMTKLIQAQSGKKI
DESFANLLLEDIFNLLTLYQ
NT seq
3663 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggatgggaaaatgcaaaaaggaattagtgtttttttattcactttcatgataatt
agtttcgttctccctgctcgtaacatcacagctgaagaaacgataaacgagaatttgatc
cagaatggtgggtttgagacggtaacgagtaatagttcttgggcaaatagtgaggggcca
ggaaaatggagcacctggattccaagtggtaccccggagctgcgaatggacgatagtgta
ttttacgagggtgaaaaatctatttctatcaaagccacagaaactagcagagcggatgtt
ctccaagatgtttctgtcaagtctggcttcacttatcaattatctttctgggtcaaaaca
gaaaatattgaagcctctggtggaggtgtatttgtccgaacacaatatttagatagtgca
aacaaaaaaatcagcgatggaccttctactgaaaaattaaaaggttcacaggattggaac
acaaaacggcttggtttaacgattcctaataatgcaagtaaagtaagaatagagttattt
tttgaaacagcaaaaggacaggcttggtttgatgaagtggctttgaaagaatcagataaa
acagtaacggatttttcgttaaagcaaaatgccgttaaggtaggaataggagagacagtg
actttggagcctgtttttacaccggctgatgtgacagacaaaacggtaacttggacatcc
tccaaccctgaaattgcctctgttaatagcgcgggcgttgttacaggcgcagagtcagga
gctgcgactattaaagcaacatcaaaagatggcggttttacggcagaatgtctaattagt
gtagattctgtggaggacattgggtactatgatgagctccgattaagttggttccataaa
cttacaggaaatgagctttataatccggctgatcaggatgcagccgcctatatgagtggc
ttagaaaagaaagttacaaataaggatggaacaggtatatgggatatgatgaataaaatg
gagaatcgaaattccttgtgggcagataatgaaagtacaactaattcagctcaaattact
acctcctatcaacgcttaaaggatatggctcttgcttattcaagtaaaggttcagcattg
tttcgcaatcaagctttaaagactgatattattattggattagattggttgcataataat
cgatacaatgctgataaagaagaatacggtaattggtgggactgggaaattggaattccc
caaacgttgaacgatattatggtgttaatgtataacgatttatcatcgcttcaaattaat
aattatattaaagcaattgacaggtttgttcctgatcctacgaaacgggtttcacttggt
gacccaaacttccgtgaaacaggcgcaaaccttttggataaggctttagttgtttctctt
cgcggtattatcgaaaaaaatagcggaaaggtactgaaagggcgtgattccattagtaaa
gaatatatctatgttaacagcggggacggtgtatacagagacggttcacttgttcaacac
tttaatgttgcatacacagggggatatggagcaacatgggtcggccgaacagctgatatg
ttgtatttattaaaagattcaccatgggaggtcaaggattcaaacgttgacaacgtattt
aactgggtgagcgattcgtttgaaccacttatttataaaggcgccatgatggacatggtg
tcaggcagaggtgtttcgaggcagagcaccaatgatcatgcaacaggcagatcgacgatt
ttgagtttgcttcggttagcagatgcagctccacaagaacatgcattgtccattaaacaa
atggtcaaagagtggattcaaacagatacgacctttagcaattatgttaatggtttatcc
atttatcaaatccatcttgtccatacactggtgaatgacacaacgatcgaaccgaggggt
gagttaatcaagaatcaagtgtttgcaggcatggaccgtgttgttcatttgcgtcctgat
tttggttttggaatcagtatgttttctgatagaatttcaggtttcgaatatggcaatgga
gaaaataaaaaaggctggtacacaggggctggtgctacatatttatataacaatgattta
aagcaattcagcaatgattactggccaactgtggacagctatcgattaccaggaacaaca
accgatcaatcgaaaggaactttaaaagattgggaaagctactataacccaaggtcatgg
gttggcggttctaatctggatgatctttatggtgcagcaggaatggatttttcccttgag
aagttaacgggaagttcattaaaaggaaaaaaatcatggtttatgtttgatgatgaaatt
gtggcattaggtgcagctattaatagcacgggagaatctgaagtagaaacaattgttgaa
aatcgacaattaaatgccaacggtaataataagctgctgatcaatggagaagaaaagata
aaagaacttggtgattcagaggtcttaaacgatgttcaatgggctcatttagagaaaaat
gttcaaggatcagatataggctattattttcccaattcacctagtctccgtggtttacgg
gaatcaagaacaggatcttggaatgaaattaatagtggaggatctaccgaatccattaca
agaaattatttaagtttagcctttgaccatggcaaacagcctgtagatgaaacttactcc
tatgttcttttacctaataaggatgtggaacaaacaaaaaattacagcgagaaacctgat
gttactattcttgccaatacagcatctgttcaggcagttagagaggaaacacttaagcta
acagcagcaaacttttatcaaaaagacacagtaggtttcattaaagcagggagcgctgca
tctgtaatggtaaaagaagagaaaaatggcttgacactttccgtctcagatccgacacaa
aaacaggataaaatcgtaatcgagatgaataaaacaggactagaagtagataagaaagat
gataaaataaaagttctgcagaattccccaaccattcaggtggaagtgaatgtggccaat
tcgattggcaaaacacattctattcaatttatcgataaagaatctccaactatatcagcg
ccagaagcggaggatatttatcgaaccgacaccgtcaatttagcatttgcgatgtctgat
tcttatagcgatatagcaagtaaagagttttacttagatgatgtggctgtaagcaacccg
atagaaatcaaaccgtattctctatctttaggagaacataccattaaggtactcgctacc
gatcaggctggaaatgtggctgaagaaatatatcagctaaacgttataatggatatcaat
catttaagggaagcgattaattatggaagagacaaagaatggataaataatgagatcgct
aataatctacatgtaaagattaaccatattattcaaaaggaaaagatgaataacaaacaa
atcaggaataatttacatgccatgacaaaattaattcaagcacaatccggtaaaaagatc
gatgaatcctttgccaacttactgttggaggatatatttaatttacttaccttatatcaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system