Bombus impatiens (common eastern bumble bee): 100742287
Help
Entry
100742287 CDS
T04362
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 isoform X1
KO
K03002
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
bim
Bombus impatiens (common eastern bumble bee)
Pathway
bim03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bim00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
100742287
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
bim03021
]
100742287
Enzymes [BR:
bim01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
100742287
Transcription machinery [BR:
bim03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
100742287
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpa2_4
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100742287
NCBI-ProteinID:
XP_003485659
UniProt:
A0A6P3DKY5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1122 aa
AA seq
DB search
MLIEPKLTNTSTNFGKPPEKQNPLLQSLGAPHIDSFNYMLEDGLSEAVRDNPLVYIHLPN
EDKIALWIDDVSIHQPSIPSGAIGVKNHKIYPTECRQRGCTYKGKIIVKLGWSINNKVQE
TLERDLGEIPIMIKSNRCHLSKMSPKDLVAHGEHEQEWGGYFIIKGLERIIRMLLMTRRN
YPIAIRRSGWKARGIQFSDLGLLLRSVRDDNTTANNTLHYVTDGSAKLMFSYRKVLYYVP
LILMLKCLVDVSDIFIYSALTAGCEDDLYYKGCILNMLRAVHEQGLNSHEECKAYIGRMF
RIKLFELPYDATDIDVCDFIIKHCIAIHLHDPLDKFYLLAFMTKKLFALANNKCAVEGAD
AVMMQECLLGGHLYLQVLKERLYSWLTGLKMGILKRARSAGNRYTLNVQEMLNAMKHGNS
LELQMENFLSTGNLRSPTGLGLMQNTGLTIVAENINRMRYMSHFRAIHRGSFFQEMRTTE
ARQLLPDAWGFICPVHTPDGAPCGLLNHLTMNCIITKHTNPKLKANVPIILMDLGMIPLS
IADNWKKSYIVILDGKLIGLIDDNIISRVTDKLRLLKIKGQEVPCTMEIALVPKKNVPAQ
YPGLYLFTNPARMMRPVMNLAAKKVEYIGTFEQIYLNICVTPEEAYEGLTSHQELSKTAF
LSNLASLIPMPDCNQSPRNMYQCQMGKQTMGTPCHTWQLQSETKLYRLQTPATPLFRPVH
YDEINLDDFAMGTNAIVAVISYTGYDMEDAMIINKAAHDRGFAHGLIYKSEFVDLKDQKS
YFARNPDKPDLAEKLDVDGLPILGTMISEGDVYYCYYDADQSTYVTGKYHGKEDAYVDTV
KLCGTLHSHIPRRACITFRIPRNANVGDKFASRAGQKGICSQKWPAEDLPFTETGLIPDI
VFNPHGFPSRMTIAMMIEVMAGKSAAIHGLVHDATSFRFNEDETAVEYFGKLLERGGYNY
YGTERMYSGIDGREMTADIFFGIVHYQRLRHMVSDKWQVRSTGPIDVLTRQPIKGRRRGG
GVRFGEMERDSLLSHGCSFLLQDRLFHCSDKTTTLVCKKCGTLLGPVMEMGLSASGLNDK
TKCRLCGDDESVREVDIPYIFRYLVTQLTSCNINVKLSFAEK
NT seq
3369 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgattgaaccgaaattgacaaatacgtcaacaaatttcggcaaacctccagaaaag
cagaatcctttgttgcagagcttaggtgctccgcacatagattcttttaattatatgcta
gaagatggcctgtctgaggcagttagagacaatccacttgtttatattcatctgccaaat
gaagacaaaatagcattatggatcgacgatgtatctattcatcaaccaagtattccatct
ggcgcaattggggtgaagaatcataaaatctatcctacagaatgtagacaacgaggatgt
acttataaaggaaagataatagtcaaattaggatggtctatcaataataaagtgcaagag
acgcttgaaagggatttaggagaaattccaattatgattaaatctaatagatgtcattta
agtaagatgagtcctaaagatttagttgctcatggagaacatgaacaagaatggggtgga
tatttcatcattaaaggccttgagaggattataagaatgttattaatgacaaggaggaat
tatcctattgctattagaagatcaggctggaaagctcgtggcatacaatttagcgatctt
gggttgctattaagaagtgtacgagatgataatactacagctaataatactttgcattat
gtaactgatggctcagcaaaattaatgttttcatataggaaagttttatactatgttcca
ttgatcttgatgttaaaatgcttggttgatgtttcggacatttttatttatagtgcatta
acagctggatgtgaagatgatttatattacaaaggttgtattttaaatatgctaagagct
gtacatgaacaaggtttaaatagtcatgaagaatgcaaagcttatatagggagaatgttt
agaataaaactttttgaattaccttatgatgctactgatattgatgtttgtgacttcata
attaagcattgtatagcaattcatcttcatgatccactggataaattttatttactcgca
tttatgacaaaaaagctatttgctcttgcaaataataaatgtgccgtagaaggtgctgat
gctgtgatgatgcaggaatgtttactgggtggtcatttatatttgcaagtattgaaagaa
agattatatagttggttgactggccttaaaatgggtattttgaaacgtgcaaggagtgct
ggtaataggtacaccttaaatgtgcaggaaatgctaaatgcaatgaaacatggaaattcg
ctggaattacaaatggaaaattttttatctactggaaatttaagatcaccaacaggttta
ggattgatgcaaaatacaggtcttacaattgtcgctgaaaatattaatagaatgcgatac
atgagccattttcgtgcaatacacagaggttcctttttccaagaaatgaggaccacagaa
gctagacaattattgccagatgcatggggtttcatttgtcctgtacatacacctgatggt
gcaccttgtggtcttcttaatcatttaacaatgaattgcatcattacgaaacatactaat
ccgaaattgaaagctaatgttcccatcatactaatggatcttggaatgattccactgtca
attgctgacaactggaaaaaatcttacattgtaatattggatggaaaattaataggatta
atagacgataatataatttcaagagtaacagacaagctacgattgcttaaaataaaaggc
caagaggttccgtgtacgatggagatagcactggtgccaaaaaaaaatgtaccagcacaa
tatccaggattatatttatttacaaatccagctcgtatgatgagaccagtaatgaattta
gctgccaaaaaggtggaatatataggaacatttgaacagatttatttaaatatctgtgtt
acacctgaagaagcctatgaagggttgacatcacatcaagaattatcaaaaacggctttc
ttaagtaatttagcaagtcttatcccaatgccagattgtaatcaaagtccacgaaatatg
tatcaatgtcagatgggtaaacaaacaatgggcactccatgccatacatggcaattacaa
tctgaaactaaattatataggttgcaaacacctgcaacaccactctttcgaccagtgcat
tatgatgaaattaatcttgatgattttgctatgggtactaatgcaattgttgccgttatt
tcttacacagggtatgatatggaagacgcgatgatcataaacaaagcagcgcacgataga
ggttttgcacatggattgatttataaatctgaattcgtagatttgaaagatcagaaaagt
tattttgcaaggaatcctgataaacctgatcttgcagaaaaattagacgtcgatggcctt
cctattttaggtacaatgatttcagaaggtgatgtctattattgctattatgatgcagat
caatcaacatatgttactggtaaatatcatggaaaggaggatgcttatgttgatactgta
aaactttgtggaacattacatagtcatattccacgtagagcttgtatcacttttcgtatt
ccacgtaatgcaaatgttggagataaatttgcttcgagggcaggtcaaaagggtatctgt
tcacaaaaatggcctgcagaggatctaccatttacagaaacaggtttaattccagatatt
gtttttaatcctcatggttttccaagtcgtatgacaatagctatgatgatcgaggtgatg
gctggaaaatcagcagccatacatgggttggtacatgatgcaacatcgtttagatttaac
gaggatgagacagctgttgaatattttggaaaattattggaacgcggtggttataattat
tatggaacagaaagaatgtattcaggaatagacggaagagaaatgactgctgatatattt
tttggaatagtacattatcaacgattacgtcacatggtttcagataagtggcaggtgaga
agtactgggccaattgatgttttaacaagacagcctataaagggtagaaggaggggtggt
ggtgttcgttttggagaaatggaacgagattcattactatctcatggttgttcgttctta
cttcaggatcgtcttttccattgttcagacaaaactaccactctagtttgtaaaaaatgt
ggaacgttattgggtccggtaatggaaatgggtctaagtgcatcaggattaaatgacaag
acaaaatgtcgtctttgtggtgatgatgaatctgtgagagaagttgacataccatacatt
ttccgatatctcgtaacgcaattaacatcttgcaatattaatgtaaagttgtcatttgcg
gagaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
