Boleophthalmus pectinirostris (great blue-spotted mudskipper): 110153962
Help
Entry
110153962 CDS
T05002
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
bpec
Boleophthalmus pectinirostris (great blue-spotted mudskipper)
Pathway
bpec04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bpec00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
110153962
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
Notch
NOD
NODP
Ank_3
Ank_5
Ank_4
DL-JAG_EGF-like
EGF_3
JAG1-like_EGF2
Plasmod_Pvs28
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110153962
NCBI-ProteinID:
XP_020773553
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2499 aa
AA seq
DB search
MHILFVHLTLLSLIAFTRGQRCLMPTEKCLNQGTCERTPDGLSECKCRDGFVGSRCQFHD
PCTTAPCLNGGTCQAVSKGNTVDFSCTCKLGFSERRCMTPINNICINSPCHNGGTCELET
LQTYKCRCPPGWSGTLCQHRDPCASNPCANGGQCSAIESHYICLCSPFFSGMTCKQDINE
CDATPPPCKNGGVCINEVGGYRCQCPLEYTGKHCETRYFPCSPSPCLNGGTCVQKGDTSY
ECSCVPGFTGKNCNINIDDCPNHECQNGGTCVDGVNTYNCQCKPEFTGQLCNDDVDECQL
MPNACQNGGTCHNTFGSYQCVCVNGWTGDDCSENIDDCASAACFHGSTCHDRVASFVCEC
PPGRTGLLCQLDDACISNPCQKGSNCDTNPVSGDHFCTCPLGYIGASCDQDVDECSLGPN
PCEHAGKCINTKGSFQCKCMIGYVGPRCELDINECMSNPCKNEATCLDQIGNFQCICMPG
YEGKFCEIDTDECTSSPCLNNGKCIDKINNFLCQCPTGFTGTHCQRDIDECASTPCKNGA
KCTDGPNKYTCECTEGYSGIHCETDINECYSSPCHYGTCIDGLASFSCLCKPGYTGRLCE
TNINECLSQPCRNGGVCQDRENSYICNCPKGTTGINCEINIDDCKSNPCDYGTCLDKING
YECACEPGYTGTMCNINIDECAINPCHNGGTCIDGINGFTCVCPEGYHDTTCFSQVNECL
SSPCIHGHCEDKINGYNCVCDSGWIGKNCDINNNECESNPCMNGGTCKDMISGYICSCRV
GFTGPNCKTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCVCSLPYTGENCETLMAPCSSKPCRHG
GVCQESEDYQSFSCVCPEGWQGQTCDVDIKECVKNPCRNGATCQNTLGSYRCNCKPGFSG
RNCETDIDDCKPNPCSNGGVCKDEVNGFLCTCQPGFRGTKCEEDINECESNPCKNGANCT
DCVNSYTCTCPSGFSGIHCEINTPDCTESSCLNGGTCVDGINAFTCVCPPGFTGNYCQHD
INECDSKPCMNGGTCHDSYGTYKCTCPHGYTGLNCQDLVRWCEFSPCKNGGTCWHRGTTY
SCQCATGWSGQYCDVPSVSCEVAAQQRGVDVSQLCRNSGQCLDAGNVHYCHCQLGYTGSY
CEEQVDECNPNPCQNGATCTDFLGGYSCKCMPGFVGTNCSDEINECFSQPCQNGGTCIDL
INTYKCSCPRGTQGVHCEINIDDCNPFIDIVTKEPKCFNKGKCVDRVGGYHCVCPSGYVG
ERCEGDVNECLSNPCDPRGTHSCIQLTNNYRCECRTGYTGRHCDVIFDGCKGKPCRNGGT
CAVASNTPYGFICKCPPGFSGSTCEYDAQACGTLHCHNGGTCISGHKSPKCLCTPSFTGP
ECKFPANSPCTSNPCYNGGTCENTSEAPFYHCVCPTNFVGQRCHILDHGLQEVCGIPECE
DLKHNKICDVVCNNHACGWDNGDCSLNFDDPWKNCSASLQCWRYFNNGKCDAQCDNAGCL
YDGFDCQNLEGQCNPLYDQYCRDHYADGHCDQGCNNAECGWDGLDCAHMPEKLAVGQLVL
VVHIVPEQLLNNSFGFLRELSLVLRTNVLIRRDSKGQMMVYPYYGNQHELKKYNVKRSVD
AWSDVPAKVLNIVKRSLFDSPKEHALAKRELDPLQIKGSIVHLEVDNRQCFQQSTECFQS
TNEAAAFLGALKSSDKLDVPYTIEAVYSGVDPQPPQDFYVIYLVLAGVGLLAFLGVGMVA
ARKRRHEHGRLWLPEGFKTTEPSKKKRREPVGEDSVGLKPLKNTSDISLMDDAQNDWGED
ESSDVKRFKHFDEHAILDTDDQTDHRQWTQQHLDAADLRIPSIAPTPPQGEIENDCMDVN
VRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEEDASANVINDFIYQGANLHNQTDRTGETALHL
AARYARSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMHD
GTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVEAAIVLLKNGANK
DMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLMD
EYNLVRSPQMHAGSLSTTLSPPLCSPNGYLGSMKQPPPQGACLGKKARKPSTKGIGCKEG
KEIKVKKKNSQDGKSGSLLDSSAVLSPVDSLESPHGYVSDVASPPMMTSPFQQSPSVSLN
HLQGMSDPHLAVNHMVLPSKQDLARMQFDPLPPRLTHLPVSGSTGQATMNGQCDWLSRMH
GTMNQPAQFNPIRGGPAGQGGLHQGGQHGLMASHHNNHATASLSQMISYQGIPNGRLAPP
PHMMQQQAQQIQQMQNLQQIQQQQQSIQLQHQSSNTGNSQNFMNGELSSPELQQGTGTTS
IPIHTILPQDTQIRPTSMNQSIPSTQFLTPPSQHSYSSPLDNTPNHQVQVPDHPFLTPSP
GSPDQWSSSSPHSNMSDWSEGISSPPTSLPSQIAPTRTV
NT seq
7500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatattttatttgttcacctaactttattgtcgctgatagcatttacgcgaggccaa
agatgcctaatgcccacagagaagtgtttgaaccaggggacatgcgagcggacacctgat
ggactcagtgaatgcaaatgccgtgatggatttgtagggagcagatgccagttccatgac
ccctgcaccactgcaccgtgcctgaacggaggcacctgtcaggccgtctccaaaggcaac
actgtagacttcagctgcacctgcaaactgggcttttccgaacgcagatgcatgactcca
atcaacaacatttgtattaattcaccctgccacaatggtggcacctgtgagctagagact
cttcaaacttacaagtgccgctgccctcccggatggtcaggtacattgtgtcaacaccga
gacccctgcgcctcaaacccatgtgccaatggtggccagtgctctgctatagagtcccac
tacatctgcttatgctcacctttcttctctggaatgacctgcaagcaagacattaatgaa
tgtgatgctaccccacccccctgcaagaacggaggcgtgtgtataaatgaggttggcggg
taccgatgccagtgccccctggagtacaccggcaaacactgcgagacacgctacttcccc
tgcagtccctctccgtgcctcaatggaggaacctgtgttcagaagggagacaccagctac
gagtgctcatgtgttccaggttttaccgggaaaaactgcaacatcaacatcgacgactgt
ccaaatcatgagtgtcagaatggaggcacctgtgtagatggagtgaacacctataactgt
cagtgtaaaccagaatttacaggccagctatgtaacgatgacgttgatgaatgccagctg
atgcccaacgcctgtcaaaatggcggcacgtgccacaacacctttggcagttaccagtgt
gtgtgtgtaaacggttggactggagatgactgcagtgagaacatagacgactgtgccagt
gcagcctgcttccatggctccacctgccatgaccgagtggcttcttttgtctgtgaatgc
cctcctggacgcacaggactgctgtgtcaattggatgacgcctgcatcagcaacccatgc
cagaaggggtctaactgtgacaccaaccctgttagtggggatcacttctgcacttgccct
ttaggctacattggagcttcatgtgatcaagatgtggatgagtgctcattgggtcccaat
ccttgtgaacatgcagggaagtgtatcaacaccaaaggatcattccagtgcaaatgtatg
attggttatgtggggccccgctgtgagctggacattaatgagtgcatgtcaaacccctgt
aaaaatgaagccacttgcctggatcaaataggaaacttccagtgtatctgcatgccaggt
tacgaagggaagttctgtgaaattgatactgatgagtgcaccagcagtccatgcctgaac
aatggcaaatgtatcgacaagatcaacaattttctttgccagtgccccacaggcttcacc
ggaacccactgccagagagacatcgatgagtgtgccagtacgccttgcaaaaatggtgcc
aagtgcacagatgggcccaacaagtacacatgtgaatgcacggaaggatactcaggaata
cattgtgagacggacatcaatgagtgttactcaagcccttgtcactatgggacttgcatt
gacggcttggcctccttcagttgcctttgtaaacctggctatacaggacgtctatgtgaa
actaacatcaatgagtgtttaagccaaccctgccggaatggaggcgtttgccaggacaga
gaaaactcttacatctgcaactgtcccaaaggcactactggaatcaattgtgaaatcaac
attgatgattgcaaaagcaatccatgtgactatggaacctgcctggacaaaatcaatggc
tatgaatgtgcttgtgagcctggttacactggcacaatgtgtaacattaacatagatgag
tgtgccatcaacccttgccacaatggcggcacttgcattgatggtatcaatggcttcacc
tgtgtgtgtcctgaggggtaccatgacactacctgcttctcccaagtcaacgagtgcctc
agtagtccttgtattcatggtcactgtgaagataaaatcaatggatacaattgtgtttgt
gactctggttggattggcaaaaactgtgacataaacaataatgagtgtgaatctaaccca
tgcatgaatggaggcacatgtaaggacatgatcagtggatacatctgcagctgtcgggtg
ggcttcacaggaccaaactgcaagactaatatcaacgaatgtgcctccaacccttgtctc
aaccaagggacctgcattgatgatgttgctggatataaatgcgtctgttccttaccttac
actggagagaactgtgaaacattaatggcaccatgtagttccaaaccctgtcgtcatggc
ggcgtgtgtcaggaatcagaggactatcagagcttctcctgcgtttgtcctgaaggatgg
caaggtcaaacctgtgatgtggatatcaaagaatgtgtaaagaatccttgtcgcaatgga
gccacttgtcagaacactttaggcagttatcgatgtaactgcaaaccaggtttcagtgga
cgaaactgtgaaacggacattgatgattgcaaaccaaatccttgtagcaatggtggagtc
tgtaaggacgaggtgaatggctttttgtgcacctgccagcctggttttcgggggaccaaa
tgtgaggaggacataaatgagtgcgagagtaacccatgtaaaaatggagcaaactgcacc
gactgcgtgaacagttacacctgcacatgtccgtctggcttcagtggaattcattgtgaa
atcaacactccagactgtacagagagctcctgtttgaatggtgggacatgtgtagatggt
attaacgcctttacatgtgtctgccccccgggtttcactggtaactactgccagcatgat
atcaatgagtgtgactctaagccttgcatgaatggaggcacatgtcatgacagctatggc
acctacaagtgtacctgtccacatggatacactggacttaactgtcaggatttggtccgc
tggtgtgaattttcaccctgtaaaaatggagggacttgttggcacaggggcaccacatac
agctgccaatgtgcaacaggctggagtgggcagtactgtgatgtcccaagtgtttcgtgt
gaagtagcagctcaacaaagaggggtggatgtttctcagttgtgtcgcaactctggccag
tgtctggatgcaggaaatgtccattattgtcactgtcagttgggatacactgggagttac
tgtgaggagcaggtggatgaatgtaacccgaacccctgtcagaatggagccacctgcact
gactttttgggtggatactcatgcaagtgcatgccaggctttgtggggaccaactgttct
gatgagatcaatgaatgcttctcccagccatgccagaacgggggcacctgcattgacctg
atcaatacctacaaatgctcctgtccccggggaacccaaggtgttcattgtgagatcaac
attgatgactgtaacccatttattgacattgtaaccaaagagcctaagtgttttaacaaa
ggcaaatgtgtggatcgagttggggggtaccactgcgtatgcccttctggatacgtgggg
gagcgctgtgaaggagacgtgaacgagtgtctgtctaacccatgtgacccacgaggcaca
cacagctgtatccaactgaccaacaactaccgctgtgagtgtcgcaccggatacacaggt
cgacattgtgacgtaatatttgatggctgtaaagggaaaccttgtcgcaatgggggtacc
tgtgctgttgctagtaatacaccatatggatttatctgcaaatgccctcctggattttca
ggttctacgtgtgaatatgatgctcaggcctgtggcacgcttcattgccacaatggaggc
acttgtatctcaggccacaaaagtccaaaatgtctgtgcactccatctttcactgggcct
gaatgcaaatttcctgctaacagcccctgcacttcaaacccatgctacaatggtggtaca
tgtgagaacacttctgaggctccattctaccactgtgtctgccccactaactttgttggt
cagcgctgtcacattttggaccatggtttgcaagaagtgtgtgggatacctgagtgtgaa
gacctaaaacacaataagatttgtgatgtggtgtgtaacaaccatgcgtgtggatgggac
aatggagactgctctcttaactttgacgacccctggaaaaactgctctgcctcccttcag
tgctggcgctactttaataatggcaaatgtgatgcacaatgtgacaacgctggatgtctg
tatgatggctttgactgtcagaacctagagggccagtgcaaccccctatatgaccaatac
tgcagagaccattatgctgatggccattgcgatcaaggctgcaataatgctgagtgtgga
tgggacggtctggactgtgctcatatgcccgagaagcttgctgtggggcagttggtacta
gttgttcacattgtgcctgagcagcttcttaacaattccttcggctttctgcgcgagctg
agcctggtgcttcgtactaatgttttaatcagaagagactcaaagggacagatgatggtg
tacccctactatggtaatcaacatgagctgaagaagtacaatgttaagcgctcagtagat
gcatggtcagatgttcctgctaaagtgctaaacattgtgaagaggagtctgtttgattca
ccaaaagaacatgcactggccaaacgggaattggatcctttgcaaattaaaggttccatt
gttcatctagaggtggataatcgtcagtgcttccagcaatccacagagtgctttcagagc
accaatgaggctgcagctttcctgggagcattgaaatccagtgacaaactggatgtcccc
tataccatcgaagctgtttacagtggtgtggacccccaaccgccccaggacttctacgtg
atctacttggttcttgctggggttgggttattggccttccttggcgtgggaatggtggct
gcccgaaagcggaggcatgagcatgggcgcttgtggttaccggagggcttcaaaacaacg
gaaccaagtaaaaagaaaagacgggaaccagtcggagaagattctgtgggattaaagcca
ctgaaaaatacatcagatatatccctcatggatgatgcgcaaaatgattggggcgaagat
gagtcatcagatgtaaaacgctttaagcattttgatgaacatgccatcctagacacagat
gatcagacagaccaccgtcagtggacccaacagcacctagatgctgcagatctgcgtatc
ccgtctattgccccaacacctcctcagggcgagatcgagaacgactgcatggatgtcaat
gtcaggggaccagatggattcactcccctgatgattgcatcctgtagtggtggaggtttg
gaaacgggcaacagtgaagaagaggaagatgcttctgccaatgttatcaatgacttcatt
tatcagggtgccaacttacataaccagaccgaccgtacgggagaaacagcgcttcactta
gctgctcgctatgcccgctctgatgctgccaagcggcttttggaggccagtgcagatgcc
aacattcaggacaatatgggccgcacacctctgcatgctgctgtggctgcagacgcacag
ggggtcttccagattttgataagaaaccgtgccacagatcttgacgcacgtatgcatgat
ggaactactcctttgatcttagccgctcgactagcagtggagggcatggtggaggagctg
attaactgtcatgctgatgtgaatgctattgatgactttggaaaatctgctctacactgg
gctgcagctgtgaacaatgttgaggctgcaatagttctacttaaaaatggagccaacaag
gacatgcaaaacaataaggaggaaacacctcttttcttggctgcaagagaaggaagctat
gaaactgcaaaagtattactggaccactttgcaaacagggaaattacagaccacatggac
cggttacccagagacattgctcaagaaagaatgcatcatgatattgtgcgactgatggat
gagtacaatctggtacgtagccctcagatgcatgcagggtctttaagcaccaccctgtca
ccccctttgtgttctccaaatggttacttgggaagtatgaagcaacccccaccccaaggc
gcctgccttggaaaaaaggcacggaaacccagtactaaaggaattggctgcaaagaaggt
aaagaaattaaggtgaaaaagaagaattcacaagatgggaagtcaggtagcctcctggat
agctctgctgttttgtctccagttgactcacttgagtcccctcatggctatgtgtctgat
gtagcctctcctccaatgatgacatcaccttttcagcagtctccctctgtatctctcaac
cacttgcagggcatgtctgaccctcatcttgctgtaaaccatatggtcctacccagcaag
caagacctggccagaatgcagttcgacccacttcctccacgactcacacatttgcctgta
tctggctccactggtcaggcaacgatgaatgggcagtgcgattggctttccagaatgcat
ggcaccatgaaccagcctgcccaattcaaccctatcagaggaggccctgctggtcagggg
ggattacatcaaggagggcaacatgggttaatggcctcccatcacaacaaccatgccacc
gccagcctgtctcaaatgataagttaccaggggatccccaatggccgcttagcaccacca
ccccacatgatgcaacagcaagctcaacaaatccaacagatgcaaaacctacaacaaata
cagcaacagcaacagagcatccagcttcagcaccagagctcaaatacaggcaacagccag
aacttcatgaatggtgaactcagctcccctgaacttcagcaaggcactggaaccaccagc
attcccattcacacaatcctaccacaggacactcaaattagacccacttctatgaaccag
tcaatacccagtacccagttcctcactccaccttcacagcacagttactccagcccgttg
gacaacaccccaaaccaccaggtccaagtgcctgaccatccctttctgaccccctctcct
ggatctcctgaccaatggtcaagctcctctccacattccaatatgtcagattggtcagaa
ggtatttcaagtccacctacaagtcttccatctcagattgcacctacaaggacagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
