Chrysoperla carnea: 123299245
Help
Entry
123299245 CDS
T09255
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1
KO
K02999
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Pathway
ccrn03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
123299245
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ccrn03021
]
123299245
Enzymes [BR:
ccrn01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
123299245
Transcription machinery [BR:
ccrn03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
123299245
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_4
Nop14
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123299245
NCBI-ProteinID:
XP_044737511
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(121662348..121668042)
Genome browser
AA seq
1584 aa
AA seq
DB search
MDPYNQDFGLGEALGRNEIETSSIEFSVLTQEEILKLSVKKISTSLTFDQLGYPINGGLY
DLALGPLLKNVKDQSDPCATCHKNVYQCPGHFGHYELPVICVNPLFYSSVELLLKTSCMT
CYQLQFPLNIKKLFILQMKLIQAGYIIEAQEISNYMLTDEENDKESKSSTPNQLLKKYHR
LLEKNSKNEFNNKNIESVKNSFVKNLIRSMKLGKKCRYCSAMIKKISTSYHKIMIYESLE
DPNSSGHMGPRMIMADESQQILRKIYGNDHEIVSSLIPILAGIKSDYPTDIMFINVLPIL
PSIVRPVNYLNNQIVEHPQTQLYKYIIECSLMIRYIIQLLQSDGVKDEKNVQIQQVLNLP
DLKDKNKILEKFHNQWQELQTYIDFIMDTSSTTAQKLRNKCEGIKQIIEKKTGIIRQHMM
GKRVNYAARSVITPDPNININEVGIPLVFAKQLTYPVRVTTYNVNQLREMIKNGPDQYPG
AVMVENEDGVLKLIPQDPNQKESIAKRLLVATDEVILKGNNKNKRNSVKIIHRHLLNGDV
VLLNRQPTLHKPSIQGHHVRILNSINNDKTIRLHYGNCKAYNADFDGDEMNIHLPQNELS
HSEAINIVNVSNQYLVPKDGTPLCGLIQDHIIAGVKLTIRDKLFNKFDYQQFIYHALSSL
SRSNNIKLLSPCIVKPQKLWSGKQIISTILINLIPTPYINFTSQSKIRHFNDDSQIIIRN
GELISGILDKQSYGATPYSLIHAIYELYGGDYSTKILSAFSKLFTLYLQCADSFTLGVAD
ILVKNQENSKRDEIINELRDEMINKQIVLKSLNSSETDPLIDEDELKLQVEKSLVLNDKY
RMILDREYKHSLDKYTNKINKALVPNGLITSYPDNNLQLMINSGAKGSMVNSMQISCLLG
QIELEGKRPPLMISGKSLPSFIPYDFQPRAGGFIDQRFMTGIQPQEFFFHCMAGREGLID
TAVKTSRSGYLQRCLVKHLEGLTVQYDLTVRDSDNSIIQFLYGEDGMDICKAQYLKDLKY
FQFLDDNKEVFKNFDANIDEEIKKYLHQLKTWDGKNRKPDPIISKYQPDHYFGALNENME
ALIKKYTENKKHTKEFSKMIKAKCQQTLTVPGEPVGMLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGR
GDMNVTLGIPRLREILMTASKEIKTPNMVIPINSNFTDTDAIANLCKKLTRCTLDNILNK
IHIKSKLNVVGRNYEYQIKFHFLPHKLYSNQFYIRRKYVMNFMEKKFFPSIFNAIYKAAH
IKTSLITATLENDKPKKKSNAEEDEEVGNNENDANFDAEEMNNEDKEQNSDDDSESENEE
ESKFKRNKYSDDESEDENVAEDNLENTTVEKNIKTELTEDDLHRSKVVDSLNFVTDYKYD
QKSKQWCELTFTLPLTFKNIDIQAILKDLSMKSIIWQTPLIKRAITYKDEQTQELILRTD
GININEMFKYNHILNLNKLYTNDIHKMADVYGIEAAACVIRKEIKEVFGVYGINVDYRHL
SLISDYMTYNGIYQPMSRTGMEDSISPLQQMSFEKSLGFLKNAITFGKYDYIQTPSSCLM
LGSPSRVGTNGSFSIIHDITKYLQ
NT seq
4755 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatccatataatcaagattttggacttggcgaagcattaggcagaaatgaaattgaa
acatcatcaatagaattctctgtattaacacaagaagaaattctaaaattaagtgtaaaa
aagataagtacttcattaacattcgaccaattaggatatccaattaatggtggtctctat
gatctagcactaggtccattattaaagaacgtaaaagatcaaagtgacccatgtgccaca
tgccataaaaacgtttatcaatgtccaggacattttggacattatgagttacctgttatc
tgtgtaaatcctttattttatagttcggtcgaattattattaaagacctcgtgtatgacc
tgttatcagttacaatttccgttaaatattaaaaaattatttatcctacaaatgaaatta
atccaagcgggatatatcatcgaagcacaagaaatatcgaattatatgttaacagatgaa
gaaaatgataaggaatcaaaatcttctactccaaatcaattattaaaaaaataccataga
ttattagaaaaaaattcgaaaaacgaatttaataataaaaatatcgaatctgttaaaaat
agttttgttaaaaatttaattcgttctatgaaattaggtaaaaaatgtcgatattgtagt
gcaatgataaaaaaaattagcacgtcttatcataaaattatgatttacgaatcattagaa
gatcctaatagttcgggacatatgggaccaagaatgataatggcggacgaatcacaacag
atacttagaaaaatctatgggaatgatcatgaaattgtctctagtctaataccaatttta
gctggtattaaaagcgattatccaacggatattatgttcattaatgttcttccaattttg
ccatcgattgtacgacccgttaattatttaaacaatcaaattgttgagcatcctcaaaca
caattatacaagtacataattgaatgctcattgatgattcgctacatcattcaattatta
caaagcgatggtgtaaaagacgaaaaaaatgttcaaatacaacaagttttaaatttacca
gatctcaaggataaaaataaaattttagaaaagttccataatcaatggcaagaattacaa
acatatattgattttataatggacacaagttcaacaacagctcaaaaattacgtaataaa
tgcgagggaattaaacagataattgagaaaaaaaccggaattatacgacaacatatgatg
ggaaaacgtgttaattatgcggcacgatctgttataactccagatccgaatataaatatt
aatgaagttggaattcctttggtgtttgcaaaacaattaacatatccggtacgtgtaacg
acctataatgttaatcaacttcgagaaatgattaaaaatggtcctgatcaatatcccggt
gctgttatggttgaaaacgaagatggtgttttaaaattaataccacaagatcccaatcaa
aaagaatcgattgcaaaacgattattagtcgctaccgatgaagtcattttgaaagggaat
aataaaaataaaagaaattcagttaaaattattcatcggcatttattaaatggcgatgta
gttttgttaaatcgacaaccgacgttacataaaccatcgatacaaggtcatcatgtacga
attttaaattcgattaacaatgataaaacaattcgtttgcattatggaaattgtaaagca
tataacgcggattttgatggggatgaaatgaatatacatttaccccaaaatgagttatca
cacagtgaagcaattaatattgtgaatgtttcaaatcagtatttggtcccgaaagatgga
actccactatgtggtttaatacaagatcatattattgcgggagtaaaattaactatacga
gataaattatttaataaattcgattatcaacaatttatttatcatgcgttatcgagttta
tcacgctcaaataatattaaattattatcaccttgtatcgtaaaaccacaaaaattatgg
tcaggaaaacagattatatcgacaattctaataaatttaataccaactccgtacattaat
tttacaagtcaatcgaaaattcgacattttaacgacgattcccaaattatcattcgtaat
ggagaactaatatctggaattttggataaacaatcgtatggagcaacaccttacagttta
atacacgcaatttatgaattatatggtggggattattccacaaaaattttaagtgccttt
tctaaattgtttacgctttacttacaatgtgcggatagtttcactctaggagttgctgat
attttggttaaaaatcaagagaattcaaaacgagatgaaattattaacgaattacgggat
gaaatgattaacaaacaaattgttttaaagtctttaaatagttctgaaacggatccttta
attgatgaggatgaattaaaattacaagttgaaaaatcgttagtgttaaacgataaatat
cgtatgatcttagatcgagaatataaacactccttagataaatatacgaataaaattaat
aaggctttagttccaaatggtttaattacaagttatcctgataataatttacagttaatg
attaattcaggtgcaaaaggttcaatggttaattctatgcaaatatcttgtttacttgga
caaattgaacttgagggaaaacgaccacccttaatgatttctggaaaaagtttaccaagc
tttattccatatgattttcaaccccgtgctggtggatttattgatcaacgttttatgact
ggtattcaacctcaggaattctttttccattgtatggcaggacgtgaaggtttaattgat
actgctgtcaaaacaagtcgtagtggatacttacagcgttgtttagttaaacatttagaa
ggtttaactgtacaatatgatttaactgttcgagattcagacaactcgattatacaattc
ttatatggcgaagatggtatggatatttgtaaggcacaatatttaaaagatttaaaatat
ttccaatttttggatgataataaagaagtttttaagaatttcgatgcaaatatcgatgaa
gaaataaaaaaatatttacatcagttaaaaacatgggatggaaaaaatcgtaaaccggat
ccaattatatcaaaatatcaaccagatcattattttggtgccttaaatgaaaatatggaa
gctttaataaaaaaatataccgaaaataaaaaacacaccaaagagttttcaaaaatgatt
aaagcgaaatgtcaacaaacgttaactgttcctggagaaccggttggtatgttagccgca
caaagtattggtgagccgtccacacagatgacattgaacacatttcattttgctggacgt
ggtgatatgaatgtaacacttggtatacctcgtttacgagaaatattaatgactgcatcg
aaagaaattaaaacaccaaatatggttattccaatcaattcaaattttacagatacggat
gcgatagcgaatttatgtaaaaagctaactcgttgtacattagataatattttaaataaa
attcatattaagtcaaaattaaatgttgtggggcgaaattacgaatatcaaatcaaattt
cattttcttcctcataaactatattcgaatcaattctatattagaagaaaatatgtgatg
aactttatggaaaagaagttcttcccgagtatatttaatgctatttataaagctgcacat
atcaaaacatctttgataacggcaactttagaaaatgacaaaccaaaaaagaaatctaat
gccgaagaagacgaggaagtaggaaataatgaaaatgatgctaacttcgatgctgaagaa
atgaacaatgaagataaagaacaaaattcagatgatgattctgaaagtgaaaatgaggaa
gaaagtaaatttaaacgtaataaatacagtgatgatgaatcggaagacgaaaacgttgct
gaagataatttagaaaacactacagtggaaaagaatattaaaaccgaattgacagaagat
gatttacatcgtagtaaagttgtcgattcgttgaatttcgttacggattataaatatgat
caaaaatcaaagcaatggtgtgaattaacatttacattaccgttaacatttaaaaatatc
gatatacaagctattttaaaagatttatcgatgaaatcgataatatggcaaacaccctta
ataaaacgagcgattacttataaagatgaacaaactcaagagttaattctacgtacagat
gggatcaatattaacgaaatgtttaaatacaatcatattttaaatctaaataaattatat
acaaatgatattcacaagatggcagatgtctatggtattgaagccgctgcatgtgttatt
cgtaaagaaattaaagaagtgtttggtgtttatggaattaacgtagattatcgacattta
tctttgattagtgattatatgacgtataatggaatatatcaaccaatgtcacgaactgga
atggaagattcgatatcgccgttacaacaaatgtcttttgagaaatcgttaggatttttg
aaaaatgcgataacgtttggtaaatatgattatatacaaacaccatcgagttgtttgatg
cttggatcaccgtcacgcgttggaacaaatggatcgttttcgataatacatgatattact
aaatatttgcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
