Clostridium gelidum: psyc5s11_20900
Help
Entry
psyc5s11_20900 CDS
T08447
Symbol
bgaB
Name
(GenBank) beta-galactosidase
KO
K12308
beta-galactosidase [EC:
3.2.1.23
]
Organism
cgel
Clostridium gelidum
Pathway
cgel00052
Galactose metabolism
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cgel00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00052 Galactose metabolism
psyc5s11_20900 (bgaB)
Enzymes [BR:
cgel01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.23 beta-galactosidase
psyc5s11_20900 (bgaB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_42
Glyco_hydro_42M
ABC_transp_aux
DUF551
Glyco_hydro_42C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCZ46023
LinkDB
All DBs
Position
2410103..2412106
Genome browser
AA seq
667 aa
AA seq
DB search
MEKLLFGVAYYDEYMPYDRLNEDIKMMKSANINVVRIAESTWSSVEPQNGEFDFKHIDRV
IDAMEEAGISVIIGTPTYAIPTWLVSECPEALAVTKSGQGVYGTRQNMDITNPTYLFYAE
RVIRKIMDRVSKRKCVIGYQLDNETKHYDTAGSNVQHLFIKYLRKKFPNINDLNDEFGLA
YWSNRINSWEDFPNVLGTINGSLGAEFEKFQRTLVNKFLSWQSDIVNEYKRENQFVTQNF
DFEWRGYSFGVQPKVNHFEASKCLTIAGVDIYHPTQDYLTGTEISFGGDMTRSLKNDNYL
VLETEAQGFEHWVPYDGQLRLQAFSHVASGANSVMYWHWHSIHNSAETYWKGLLSHDFKE
NPTYNESKIIGDEFNRFGDKLVNLKKKNDVAILVSNEALTAIEWFSWTLDFKYNDVVRWV
YDELYKMNVGCDFINPDSEDIEKYKLIVAPALYSAPSDLLNKLNSYVKNGGNLVVTFKSA
FTNENVKVSHNDQPNIINKCLGVTYNQFTKPDKVSLKGHDFKVSDEENEVSHWMELLKIT
TAETIAYYDHPNWGKYSAITKNHYGEGIATYIGCFANKAILKEVLIEVLKEANLFGQEQQ
YNFPIIIKSGYNSENKKIVYYFNYSCEKKEIEYSHNEGIELTKNQPIKKGEKVVLKPWGL
IIVEENK
NT seq
2004 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaattactttttggagtggcgtattatgatgaatacatgccatatgatagatta
aatgaagatattaaaatgatgaaatcagctaatattaatgttgttagaattgctgaatca
acttggagtagtgtagagccacaaaatggcgagtttgattttaaacatatagatagagtg
attgatgcaatggaggaagcaggcattagtgtgattattggaacacctacgtatgcaata
ccaacatggcttgtatctgaatgtcctgaagcactggcagttaccaagagtggacaaggc
gtttatggaacaagacaaaacatggacataactaatccaacatacctattttatgcagag
agggtcattagaaaaattatggacagggtaagcaagagaaaatgtgttatagggtatcag
cttgataatgaaactaaacactatgacacagctggttctaatgtgcaacatttgtttatt
aaatatttaagaaagaaattcccaaatataaatgatttaaatgatgaatttggattagct
tattggagtaatagaattaattcatgggaagacttccctaatgttcttggaactataaat
ggaagtcttggggcagaatttgaaaaattccaaagaactcttgtaaataaatttttaagc
tggcaatctgatattgtaaatgaatataaaagagaaaatcaatttgtaactcaaaacttt
gattttgaatggagaggatattcttttggagttcaacctaaagtaaatcattttgaagca
tcaaagtgtttaactattgcaggtgttgacatatatcatccaactcaagattatttaact
ggaactgaaatctcttttggtggtgatatgacaagatcccttaaaaatgataattatctt
gttttggaaacagaggctcaaggatttgaacattgggtaccttatgatggacaacttaga
ttacaagcttttagtcatgtagcttcaggagcaaattctgttatgtattggcattggcat
tctattcataattcagctgaaacttattggaaaggtcttttaagtcatgactttaaagaa
aatcctacatataatgaatcaaagattattggggatgaatttaatagatttggagataag
cttgtaaatttaaagaagaaaaatgatgtggctattcttgtaagtaatgaagcattaact
gcaattgaatggtttagctggacattagattttaaatataatgatgttgtaagatgggta
tatgatgaattatacaaaatgaatgtaggctgtgactttattaatcctgattctgaggat
atagaaaaatataaattaattgtagctccagctttatattcagcacctagtgatttactt
aataaattaaattcatatgttaaaaatggtggtaatttagttgttacctttaagagcgca
tttacaaatgaaaatgtaaaagttagccacaatgaccaacctaacataataaataaatgt
cttggagttacttataatcaatttacaaagccagacaaagtttctttaaaaggacatgac
tttaaggtatcagacgaagaaaatgaagtttcccattggatggaattattaaagattaca
acggctgaaactattgcatattatgatcatccaaattggggaaaatattcagctataaca
aagaatcattacggagaaggaattgcaacttatattggatgttttgcaaataaagcaatt
ttaaaagaagttttaatagaggtattaaaagaagctaatttatttggacaagaacaacaa
tacaattttcctattataattaaatctggttacaattcagaaaataagaagatagtatat
tactttaactattcttgtgaaaagaaagaaattgagtatagtcataatgaaggaatagaa
ttaactaaaaatcagcctattaaaaaaggtgaaaaagtggtattaaagccttggggtcta
ataattgtagaagaaaataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
