Capnocytophaga leadbetteri: CGC53_00350
Help
Entry
CGC53_00350 CDS
T05313
Name
(GenBank) type II restriction endonuclease
Organism
clk
Capnocytophaga leadbetteri
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7149
DUF7814
Eco57I
TaqI_C
MmeI_Mtase
UPF0020
TypeIII_RM_meth
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATA80911
UniProt:
A0A250F730
LinkDB
All DBs
Position
complement(66281..69967)
Genome browser
AA seq
1228 aa
AA seq
DB search
MNNIITALNKAFLKLKPSRSEINEFKANFKRLFTLINDNESEEYNKNLISDFLKDTYYKQ
AYFMNTKDRKDLVIHNGALPDNTAGVIIETKKFSNKSEMVTCENLNAKALQELVWYFLGE
RITQKNIDIKHLIITNVYEWFIFDAQIFEKLFAQNKTLVKHYTDFINGTALGNKTEHFYK
EIAQPFIEKVKEELHYTYFNLKDFQSIVENDNSQDDNELIPLYKILSPQHLLKLPFVNDS
NTLDKGFYAELLHIIGLAETKNGGQILIERPKEGERNEGTMLEETISKLHSLNKIKQLKN
AAAYGETYEERLFNVALELNITWINRVLFLKLLEAQLIAYHKDNEQDYAFLNFCKITEYD
ILERLFFEVLAKDYNDRSKEIAAAYPKIPYLNSSLFEPTELEHSTLLISNLPDDKTIPLL
PTTVLKDTQGKKRTGTLKSLQYLLDFLDAYDFSSEGSVEIQEENKTLINAAVLGLIFEKI
NGYKDGSFFTPGIITMYMCEESLRKATVQKFNEIKGWHLNNFDELKDRIDPFNKEAREEA
NAIINQIRICDPSVGSGHYLVSALNEFIAMKSDLKILQDEHKNRIHHQIKIENDELLVYE
ADDNERFFRYNPKNTESQIVQKTLFNEKKTIIENCLFGVDINPNSVKICRLRLWIELLKN
AYYKNATELETLPNIDINIKNGNSLLSRFPLDTDLKTALKKTEISIAEYKNAFHKYQNAE
NKEQKWELEHFINEIKNNFRTEINKNSKEVKELQKLEREYFLKYESAQLFQDALTPEQEK
HKKQLESAIEKIETEIEAMNGNKIYENAFEWRFEFPQVLDDEGNYIGFDIVVGNPPYGTN
IDNFILNFKRIYPQTTKGFNEIYKLFFNRGIDILKEKGILTYITPNTYLLQPRYKDLRKF
LLQYCLDIIINLGENVFDNAVVSTAIILLEKKKENSKIKIADLSANSKFLGSLDKIVFSE
IVQTTFDDTESNVFVMNIREKTENEYSLGEIMDLKDAGFKYQRKNVGLSEKGNNDLAERI
FYEGNIKNKEDIPILIGKDINTYYHSEIPNKKLRKEYENLLKDNESTYYNKEIMNSKEKL
IWRQTAPYFIGTILKNKIYFGNTIQAGIIKNSFVNKISYEYLCGLLNSKYLRYLYENNVR
ETGKVFPQVKLEKLRPLPIIISKNQSSIVNLVNEAIKIKKEDSKADITNIENQIDILVYK
LYGLSYEEIEVITPSIKDIISKEDYETE
NT seq
3687 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatattataactgctcttaataaagcctttctaaaacttaaacccagtaggagt
gaaataaatgagtttaaagctaattttaagcgtctttttactctcattaacgataatgaa
agtgaggagtacaataagaacctaatctctgactttcttaaagatacttactacaagcaa
gcgtactttatgaatactaaagaccgtaaagaccttgttattcacaatggagcactgcct
gataatactgcaggtgtgattattgagactaaaaagttctctaataaatcggaaatggta
acttgtgaaaacttgaatgctaaggctttgcaagaacttgtatggtattttttaggtgag
cgcattacacagaaaaatattgatataaaacaccttatcattactaatgtgtatgagtgg
tttatttttgatgctcaaatatttgaaaagctatttgctcaaaataaaactcttgtaaaa
cactatactgattttattaatggtactgctttaggtaataaaactgaacatttttacaaa
gaaatagcacaaccttttattgagaaagtaaaagaggaacttcactatacttatttcaat
cttaaagattttcaaagtattgttgaaaatgataattcgcaagatgacaatgagttaatc
cctctttataaaatcttatcaccacaacatcttttaaaattaccttttgtaaacgacagt
aataccttagataaaggcttttatgctgaactgcttcatattattgggcttgctgaaact
aaaaacggcggacagatacttattgaacgacctaaagagggtgaacgcaatgagggtaca
atgttagaagaaaccatttctaagttgcacagcctcaataaaattaagcaactgaaaaat
gcagctgcctatggcgaaacttatgaagaacgcctttttaatgtagccttagaactcaat
attacttggattaatagagtgcttttcctcaaattgttagaagcgcaacttattgcctat
cataaagataatgagcaagactatgcgtttttgaacttttgcaaaataaccgagtatgat
attttggaacgcttattttttgaagtcctagccaaagattacaatgatagaagcaaggaa
attgcagcagcctatccgaaaataccttaccttaatagttcattatttgagcctactgaa
ttagagcatagtactttgcttataagtaacctccccgatgataaaacaatccctttgcta
cctactacagtgctaaaagatacacaaggtaagaagcgcacagggactctcaaatcgttg
caatacttacttgattttttagatgcgtacgattttagcagtgaaggttctgttgagatt
caagaagaaaacaaaactcttatcaatgcggctgtattaggacttatctttgagaaaatt
aatggttataaagatggttctttcttcacccctggtatcatcacaatgtatatgtgtgaa
gagtcattgcgcaaagctactgtacagaaattcaacgaaataaaaggttggcacctcaat
aacttcgatgagctaaaagaccgtatcgacccatttaataaagaagctagagaggaagct
aatgctattattaaccaaattagaatatgtgacccctcagtagggtcggggcattatttg
gtttctgcccttaatgagtttatagcgatgaaaagtgatttgaagattttgcaagacgaa
cacaaaaaccgcattcatcaccaaataaagatagaaaacgatgagcttttagtatatgaa
gctgatgataacgaacgctttttccgctacaatcctaagaatactgaaagccaaatagtg
caaaaaacactttttaatgagaaaaagactattattgaaaattgtcttttcggggtagat
atcaaccccaattcagtgaaaatttgtcgtttgcgcttatggattgagcttttgaagaat
gcctactacaaaaatgctactgaattagaaactttgcctaatattgatatcaatattaag
aatggtaactctttattaagtcgttttcctcttgatactgacctaaaaacagctttaaag
aagactgaaatatcgatagcagagtataaaaatgctttccataagtaccaaaatgctgaa
aataaggaacaaaaatgggagttagaacattttataaatgaaattaaaaataatttccgc
actgaaataaataagaatagcaaagaggtaaaagaactgcaaaaacttgaaagggagtat
tttttaaaatatgagtcagcacagctctttcaggatgcccttacacccgaacaagagaag
cataaaaagcaattagagtcagctatagaaaagatagaaaccgaaatagaagctatgaat
ggtaataaaatttatgaaaatgcttttgaatggcgttttgaatttccgcaggttttagat
gatgaagggaactatataggttttgatatagtagtaggtaatccgccgtatggtactaat
atagataattttattcttaattttaagagaatttaccctcaaaccactaagggattcaat
gagatatataaacttttttttaatagaggtattgatatcttaaaagagaaaggaatttta
acttatattactcctaatacatacttactacaaccaagatataaagatttacgcaaattt
ttattgcaatactgtttggatataattatcaatttaggtgaaaatgtgtttgataatgct
gtagtttctactgctatcatacttcttgaaaagaaaaaagaaaatagtaaaataaaaata
gcagacctttctgcaaactcaaaatttttagggtcacttgataagatagttttctcagag
atagtacaaacaacttttgatgatactgagagcaacgtatttgttatgaatattagggaa
aagacagaaaatgaatattctttaggtgagataatggatctaaaagatgcaggatttaag
tatcaacggaaaaatgtaggtttatctgagaaaggtaataatgatttagctgaacgaata
ttttatgaaggtaacattaaaaataaagaggacattcctattttaataggtaaggatatt
aatacatattatcattcagaaattcctaataaaaagctaagaaaagagtatgaaaatctt
ttaaaagataatgaaagtacctactataataaagaaattatgaatagtaaagaaaaacta
atatggagacaaacagctccttattttataggtactatcctaaaaaataaaatttatttt
ggaaatacaatacaagcagggattataaaaaattcttttgttaataaaatatcatatgaa
tatctttgtggcttattaaattctaaatacttaaggtatctatatgaaaataatgtaaga
gaaacaggaaaggttttccctcaagtaaaattagaaaaattaaggccattacctattatt
atctcgaaaaatcaatcatctattgttaatttggtaaatgaggctattaagataaaaaaa
gaggattctaaagctgatattacaaatatagaaaaccaaatagatattttagtttataaa
ctttatggcttgagctatgaggaaatagaagtgataacgcctagtattaaagatattata
tcaaaagaagattatgaaactgaatga
DBGET
integrated database retrieval system
