Condylostylus longicornis: 129607653
Help
Entry
129607653 CDS
T09756
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1
KO
K03018
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
clon
Condylostylus longicornis
Pathway
clon03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clon00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
129607653
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
clon03021
]
129607653
Enzymes [BR:
clon01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
129607653
Transcription machinery [BR:
clon03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
129607653
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129607653
NCBI-ProteinID:
XP_055374770
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1380 aa
AA seq
DB search
MPKEQFREADVIKKISHVQFCIDSPQQIQQESVLRIVSKNLYGPNREPIPYGVLDRRMGI
SMKDALCETCNQGLNECVGHFGYLDLALPVFHVGHFRATISILQMICKTCSHIMLKDTDK
VIFAKRLLNPDLSYLAKKNIHSQILTKAKKNNKCLHCGAINGGVKKGPGLMKILHDPYKG
KKATDPIMTQALDELVEATQSNRELNQILNQNSLVEELNPLTVYELFKNIPKCDVPILGM
TSEDADPLNLIVTRVFVPPVCIRPSVVSDVKAGTTEDDLTMKQSEILLINDVILKHMNSG
GKIELIQEDWDFLQLHVALYFNSEISGIPLSMVPKKSTRGIVQRLKGKQGRFRGNLSGKR
VDFSARTVISPDPNLMIHQVGVPDRVAKILTYPEKVNPANIQRMKQLVRNGTNVHPGANY
VQQRGSTFKKYLAYGNRDKVAHDLKCGDIVERHMTDGDIVLFNRQPSLHKLSIMSHQVKV
QPQRTFRFNECACTPYNADFDGDEMNLHLPQTEEARAEALILMGNKSNLVTPKNGEILIA
ATQDFITGGYLLTQKDEFLTKEQAMQLAACMLAGPDSNMDIDLPPPAIIKPRRFWTGKQI
FSLILKPNKKCTVLANLSTKGRNYTKNTDMCVKDSWVVIRNSELLCGSMDKATLGSGTKN
CIFYVILRDFGEMHATKAMWRLARMASYFMMNRGFSFGISDVTPSQKLLSEKQKLLERGY
RKCDDYIMEMKKGILQCQPGCTPEQTLEAVMLKELSTIREQAAQICFRELHPTNSALIMA
LSGSKGSNINISQMIACVGQQAINGKRVPNGFEDRALPHFEKFSKIPAARGFVQNSFYSG
LTPPEFFFHTMAGREGLVDTAVKTAETGYLQRRLVKCLEDLVVHYDGSVRNAIGEIVELT
YGGDGLDPAFMEVKNKPVDLVRQFNHIRAIKPLRNEVPLPGNEIKLIAEKILQEEEFYNC
RNDFRNECLQFLEKTGKRISDIQGRYKCHKNLVNEIERCTEGQIREFCRIVNDKYNRSVA
EPGTAVGALAAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITQGVPRIVEIINATKTISTPIITA
EIENNTNMEFARKVKARIEKTTLSEIASYIEEVYKPDDAFLLIKLDLDRIRVLGLEINAD
SIRYSICVSKLRIKPANVITYGESIIIVRPDLVKHGNALNAELQRLVIAIQSVVVAGLQN
VSRAVIAVDDSIKPPKYKLCVEGSGLRDVMATFGVIGTRTRSNNIWEVYNTLGIEAARTT
IMNEITDVMEGHGMSVDHRHIMLLASQMTARGDVLGITRHGLAKMRESVFNLASFEKTAD
HLFDAAYYGQTDSIDGVSERIILGMPASIGTGLFKLIHNHNNEPLEPPVEPLLSSYNIDD
NT seq
4143 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgaaagaacagtttcgtgaagcagatgttatcaaaaaaatttcacatgttcagttt
tgtattgatagcccacaacaaattcaacaggagtctgttttacgaattgtttcgaaaaat
ctttatggaccaaaccgtgaaccaataccatatggtgttctagataggcgtatgggaata
agtatgaaagatgcattatgtgaaacatgtaatcaaggattaaatgaatgtgttggacat
tttggttatttagatttagctttaccagtatttcatgttggtcatttccgtgctactatt
tcaattttacaaatgatatgtaaaacatgttcccatattatgctaaaggatacagataaa
gttatttttgctaaaagattattaaatccagatttatcatatttagctaaaaagaatata
cactctcaaatattaacgaaagcgaagaaaaataataaatgtttgcattgtggggcaatc
aatggaggtgttaaaaaaggtcccggtcttatgaagatactacatgatccatataaaggg
aaaaaagcaaccgatccaataatgactcaagctcttgatgagttagttgaagctacacaa
tcaaatcgcgaattaaatcaaattcttaatcaaaattcattagtcgaagaacttaatcct
ctgacggtttatgaactctttaaaaacattccaaaatgtgatgtacctatacttggtatg
acttcagaagatgcagatcctttaaatttaatcgttacaagagtatttgtgccaccagtt
tgtataagaccttcagttgtatcagatgtgaaagctggaacaactgaagatgatcttaca
atgaaacaaagtgaaattttacttataaatgatgttattctaaaacacatgaatagtgga
ggaaaaattgaattaatacaagaagattgggattttttacaattacatgttgctttatat
tttaatagtgagatatctggaataccacttagtatggtacctaaaaaatctactaggggt
attgttcaaagactcaaaggaaaacaagggcgatttagaggaaatctttctgggaaacgt
gtagatttttctgctcgtactgtaatttctccggatcccaatttaatgatacaccaagtc
ggagttccagatcgtgttgcaaaaatattaacgtatcctgaaaaagtaaatccagcaaat
attcaaagaatgaaacaattggtccgcaatggaactaatgtacacccgggagcaaattat
gttcaacaacgtggtagtacttttaaaaagtatttagcatatggtaatcgagataaagtt
gcacacgatttgaaatgcggtgatattgttgaaaggcacatgacagatggggatatagta
ttatttaatcgtcaaccaagtttacataaacttagtattatgtcacatcaagtcaaggta
caaccacaacgaaccttccgatttaatgaatgtgcatgtacaccatacaacgccgatttt
gatggtgatgaaatgaatttacatttaccacagactgaagaagctcgggcggaagctttg
attcttatgggtaataaatcaaatttagtgacaccaaaaaacggtgaaatattaattgct
gcaacacaagattttataactggtggttatttgttaacacaaaaagatgaatttttaaca
aaagaacaagcaatgcaattagctgcttgtatgttggcaggaccagattcaaatatggat
attgatttaccaccacccgctataataaaaccaagacgtttttggactggaaaacaaata
ttcagtttaatattaaaaccaaataaaaaatgtacagttcttgctaatttatcaactaaa
gggcgaaattacacaaagaatacagatatgtgtgttaaggattcatgggttgttataaga
aattcagaacttttgtgtggttctatggataaagcaacattgggatctggaacgaaaaat
tgtatattttatgttattttaagagattttggtgaaatgcatgcaacaaaagcgatgtgg
cgattagcgcggatggcatcttattttatgatgaatcgaggtttctcatttggaattagt
gatgtcacacctagtcagaaattactttcagaaaaacaaaaacttttagaaagaggttat
agaaaatgtgatgattatattatggaaatgaaaaaaggaattttacaatgtcagcccggt
tgcacaccggaacagacattggaagctgtaatgttaaaagaattgtcaaccattcgtgaa
caggccgctcaaatttgtttccgcgaattacacccaacaaatagtgctttaataatggcg
ttgtctggatcaaaaggttcaaatattaatatttcgcaaatgattgcttgtgttggtcag
caagctattaacggcaaacgtgtaccaaacggttttgaagatagagctctaccccatttt
gagaaattttcaaaaatacctgctgccagaggttttgtacaaaacagtttctattctggt
ttaacacctcctgaatttttctttcatacaatggcaggacgtgaaggtttagttgataca
gctgtaaaaactgcagaaacgggttatttacagagacgtttagtaaagtgtttggaagat
ctagtagtgcattatgatggttcagtaagaaatgcgattggagagattgttgaattaact
tatggtggagatggtttagatccagctttcatggaagtaaaaaataaacctgtagactta
gtgcgccagtttaatcatataagagctataaaaccgttgaggaacgaggtacccttacct
ggtaacgaaattaaattaatcgcggagaaaatattacaagaagaagaattttataattgc
cgaaatgattttcggaacgaatgtttacagttcttggaaaaaactggaaaaagaattagt
gatattcaaggtcgatacaagtgtcataaaaatttagttaatgaaattgagcgatgtacg
gaaggtcaaattagagaattttgtcgtatagttaatgataaatacaacagaagtgtagcc
gaaccaggaacagctgtcggtgctttggcagcgcagagtattggtgaaccaggaacccaa
atgacattgaaaactttccattttgctggtgtagcttctatgaatattacacagggtgta
cctcgtattgttgaaattattaatgctactaaaacaatttctactcccattataacagca
gaaattgaaaataacactaatatggagtttgctagaaaagttaaggctcgcatagaaaaa
acgactttatcagaaatcgcttcatatattgaagaagtttataaaccagatgacgcattt
ttattaattaaattagatttagatagaattagagtattaggactagaaattaatgcggat
tcaattcgttattcgatatgtgtatctaagttgagaataaaaccagcaaatgtaataaca
tatggtgaatcaataattatcgtacgacccgatttagtaaagcacggtaatgctctaaat
gcggaactacaacgtttggttattgcgatacaaagtgttgttgttgctggtcttcaaaat
gtttcgagagcagtaattgctgtggatgattctataaaaccaccaaagtataaattgtgt
gttgaaggttctggtttaagagatgttatggctacatttggtgtaataggtacaagaact
cgtagtaataacatttgggaagtttataatacattaggtatcgaagcagcccgtaccaca
attatgaatgaaataacagatgttatggaaggccatggtatgagtgttgatcatcgtcat
attatgctattagctagtcaaatgactgcccgtggtgacgttctaggtataacaagacat
ggtttagcaaaaatgagagaaagtgtatttaatttagcttcgtttgagaaaacagctgac
catttatttgatgctgcttattatggtcaaacagattcaattgatggtgtttcagaacgt
attatattaggaatgccagcttctattggcactggattattcaaattaatacacaatcac
aacaatgagccgttagagccacccgtggaaccattactttctagttacaacatagatgat
tga
DBGET
integrated database retrieval system