Chiloscyllium plagiosum (whitespotted bambooshark): 122564628
Help
Entry
122564628 CDS
T08871
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
cpla
Chiloscyllium plagiosum (whitespotted bambooshark)
Pathway
cpla04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpla00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
122564628
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
EGF_2
Notch
NOD
NODP
EGF_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122564628
NCBI-ProteinID:
XP_043575653
LinkDB
All DBs
Position
30:complement(45346236..45478674)
Genome browser
AA seq
1635 aa
AA seq
DB search
MHSSNHTIKFTDNTTVVGLINTNDESAYREEMQQPTDWCKANNLSLNVDKMKEMVFNFRR
AQSDHSPLNVDGSPVEIETSSKALRCYTPCSNGGRCNRNPNGTEDCLCSSGYVGARCQFA
DPCLSSPCENHGSCSAVVRGQTVDYACACQLGYTGHQCLSLLDNACLSKPCHNGGSCQLV
NNLREYKCRCLPGWAGKQCQQADPCASNPCANGGQCVAFEAHYICKCIAGFHGPTCNQDV
NECGVNPSPCRNGGTCFNHIGSYQCTCPPEYTGHSCENLYVPCSPSPCQNGGTCRQLGDA
LYDCTCLPGFSGQHCEVNVDDCAEHHCQNKGLCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDEC
QLQPNACQNGGTCHNTNGGYNCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAACYSGATCHDRVASFYC
ECPHGRTGLLCHLDDACISNPCHEEANCSTNPVNGKAICTCPVGFSGASCKQDDDECSLG
SNPCEHSGKCVNTLGSFKCLCQPGYHGPRCELDINECMSSPCHNDATCLDLIGKFQCICM
SGYEGVFCEIDIDECASNPCLNKGNCVDKINKFECECPSGFNGNLCQIDVDECASTPCQN
EARCVDGPNKYHCQCLEGFTGTLCETDIDECEQDPCHYGVCKDEIATFLCVCNQGYTGRV
CDININECQSQPCQNGGSCQDKIDGYVCACLKGTTGVNCETNLDDCASNPCEYGNCIDQI
NSYDCVCEIGYSGPMCNINIDECASNPCHNGGTCKDGINSFTCVCPEGYHDLVCLSEVNE
CNSNPCIHGECQDHLNGYSCDCSPGWTGTNCDLNVNECESHPCVNGGTCRDMNNGYLCDC
QPGFRGPNCQTNINECASNPCLNQGSCIDDIAGYKCNCVLPYTGVNCEDVLAPCSSQPCQ
NGGVCQESEDYENFSCDCPEGWQGQTCQKDVNECVKSPCLNGATCQNSMGGFQCVCRQGY
TGTICETDVDDCQPNPCHNGGSCSDGVSSFTCDCLPGFRGPKCEEDINECASDPCRNSGN
CTDCVNSYTCTCPLGFSGMHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINTFTCLCPTGFTGSYCQ
HNINECDSRPCLNAGTCHDSYGTYKCTCPQGYSGLNCQNLVRWCDSSPCKNGGTCWQTGT
TYRCECRSSWTGLYCDVPSVSCEVAAKQQGTLQCGPPQGYEGASCENQASVCGNLQCHNG
GTCVLTQGGSPRCACPLGQGGVDCQLPTRNPCKSNPCYNGGTCESVPTEPFYRCHCPRLF
NGLQCFILDYEFEGGNGQNITFPPNIEQGCDKPECVQLAKNRVCEAHCNTHACDWDGGDC
SLNFNDPWKNCSHALQCWRYFGDGKCDKHCNNVGCLYDGFDCQSIESQCNPLYDQYCKDH
YDDGHCDQGCNNIECGWDGLDCANDKPQKLAEGTLLLIVLVPPEQLLNDSVGFLRELSHI
LHTNVKFKRHPNGDMMVYPYYGNKEQLHRHHVKRSMAEASDRVIDALSHVKRSLYALVSP
RSRRELDRQEVKGSIVHLEIDNRQCYQAFSDCFASTTDVAAFLGAMASQGSLQLPYNIET
VESEGIVTIHDDNLYPMYVVVSVLIFLAFIGMGVLVSRKRHREHGQLWFPEGFKVTESSK
KKRREPVGEDSVGLK
NT seq
4908 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcacagctcgaatcacaccatcaagttcactgataatacaactgtggtgggtctcatc
aacacaaacgatgagtcagcatacagagaggagatgcagcagccaacggactggtgcaaa
gccaacaacctgtctctgaatgtggacaagatgaaagagatggtttttaacttcaggaga
gcacagagcgaccactctccactgaacgttgatggctcccctgtggagatcgagacctct
agcaaagctttgaggtgctacaccccctgctccaacgggggcaggtgtaacaggaatccg
aatggtactgaagattgtctgtgcagtagtggctatgttggagctcggtgccagttcgca
gacccatgcctaagctccccatgtgagaaccatgggagctgcagtgctgttgtccggggc
cagactgtcgattatgcatgtgcctgccagctgggttacacagggcaccaatgcctctcc
ctcctcgacaatgcctgtctcagcaagccctgccacaatggaggcagctgccaactggtc
aacaacctgcgggaatacaagtgtcgctgtctgccaggctgggcaggaaagcagtgccaa
caggccgacccttgtgcatccaatccatgtgccaatggaggtcaatgtgtagcgtttgaa
gctcattacatctgcaaatgcatagctggattccatggtcccacgtgcaatcaggacgtg
aatgaatgtggagtaaacccctcaccctgtcgcaatggcgggacctgcttcaaccacatc
ggctcttaccagtgcacctgcccccccgagtacactggccacagctgtgagaatctctac
gtgccatgttcaccatcaccttgccagaatgggggcacctgtcggcagctcggagacgct
ctgtatgactgtacctgcctcccagggttttctggacagcactgtgaggtgaatgtggac
gattgtgctgaacatcactgtcagaacaaaggcctgtgtgtggacggtgtgaacacctac
aattgccagtgtccaccagagtggacaggtcagttttgtacggaggatgtggacgaatgc
cagctacagcccaatgcctgtcagaatggaggcacctgccataacacgaatgggggctat
aactgcgtctgtgtcaatggctggacaggagatgattgcagtgagaacatcgatgactgt
gccattgcagcctgctacagtggggccacgtgccacgatcgtgtcgcctccttctactgc
gagtgtccccatggcaggaccgggttgctgtgtcacctcgacgacgcttgtattagtaat
ccctgccatgaggaggcaaactgcagtacaaatcctgtcaacggcaaagccatctgcacg
tgtccagtcggattctcgggggcttcctgcaagcaggatgatgatgaatgctctctgggg
tccaatccgtgtgagcattcagggaagtgtgtgaacaccctgggatctttcaagtgtctg
tgccagcccggttaccatggacctcgctgtgagctggacattaatgaatgtatgtccagc
ccctgccacaatgatgccacctgcctcgacctgattggaaaattccagtgcatctgcatg
tctggatatgagggagtcttctgcgaaattgatattgatgaatgtgccagtaatccgtgc
ttaaacaagggtaactgcgtcgacaaaatcaataagtttgagtgcgaatgcccctcagga
ttcaatgggaatctgtgtcagatagatgtggacgaatgtgcaagtactccctgtcagaat
gaagcccgctgtgtggatggacccaacaaatatcactgtcaatgtttggaaggttttact
ggaacactgtgtgagacggacatcgatgagtgtgagcaggacccctgtcactatggcgtt
tgtaaggatgagattgcgacctttctctgtgtctgtaaccagggttacacaggccgagta
tgtgatatcaacattaatgagtgtcagagccagccatgtcagaatggaggaagctgccag
gataagatcgatggctatgtgtgtgcctgtctaaaaggaaccacaggcgtgaactgtgaa
acaaatctggatgattgtgccagtaacccgtgtgaatatggcaactgcatcgatcagatt
aacagttatgactgtgtctgtgagatcggatattcaggccctatgtgtaacattaacatt
gatgagtgtgcttcaaacccttgccacaacgggggcacctgcaaagatgggatcaacagc
ttcacttgtgtctgtccagagggttatcacgacttggtttgtctgtcagaggtgaatgag
tgcaacagcaacccctgtatccatggagaatgtcaagaccacctcaatgggtacagctgt
gattgtagtccaggttggactggaacaaactgtgacctgaatgttaatgagtgtgagtct
cacccttgcgtgaatgggggcacgtgtcgggatatgaacaatggctacctgtgtgactgt
cagcctgggttccgaggacccaactgccagacgaacatcaatgagtgtgcatcgaaccca
tgcctgaaccaggggagctgcattgatgatattgctggatacaagtgtaactgtgtttta
ccatacacaggagtgaattgtgaggacgtccttgctccgtgctctagtcagccgtgtcaa
aatggtggcgtgtgtcaagagtctgaggattacgagaatttctcctgcgactgtccagag
ggatggcaaggtcagacttgtcagaaagatgtgaacgaatgtgtgaaaagtccctgcctc
aatggagccacttgccagaactcgatgggaggattccagtgtgtctgccgacagggttac
accggcaccatctgtgagaccgacgtggatgactgtcagcccaatccatgccataatgga
ggctcgtgctctgatggagtcagtagcttcacctgtgactgtctccctggattccgtggt
cccaaatgtgaggaggatattaacgagtgtgccagtgacccctgcaggaacagtggtaac
tgcacggactgtgtcaacagttacacatgtacctgtcccctgggcttcagtggtatgcac
tgtgagaacaacacccccgactgcacagagagttcatgttttaatggtgggacttgtgtt
gatggaatcaataccttcacctgcctttgtccgactggtttcacagggagttactgccaa
cacaacatcaatgagtgtgactccagaccatgtctcaatgctggcacttgtcatgacagc
tatggcacctacaagtgcacctgtccccaaggctactctggcctcaactgtcagaaccta
gtacgttggtgtgactcgtcaccttgtaagaatgggggaacctgttggcagactggcacc
acctatcgatgtgaatgtcggagcagctggactggcctctactgtgatgtgcccagtgtg
tcctgtgaagtggcagccaaacaacaaggtaccctccagtgtggacccccgcagggttat
gagggagcatcctgtgagaatcaggccagtgtctgtggtaatctgcagtgtcataatggg
ggaacgtgtgtactgacgcaggggggttctccccgctgtgcctgccccctgggacaaggc
ggggtggactgccagctgcccaccaggaacccgtgcaagtccaacccatgttacaatggg
ggcacatgcgagagtgtacccactgagcctttttaccgctgccattgtcctcgcctcttc
aatgggctgcagtgcttcatcctggattatgagtttgaaggaggaaatggacagaacatc
acgtttcccccgaacattgagcagggctgtgataaacccgagtgtgtgcagcttgccaaa
aaccgggtgtgtgaggctcactgtaacactcacgcctgcgactgggatggtggagattgt
tccctcaacttcaatgatccctggaagaattgctcacatgctctgcaatgctggcgttac
tttggagatgggaaatgtgataaacactgcaacaatgtgggctgcctgtatgatggtttt
gactgtcagagcatcgagtcccagtgcaatcccctgtatgaccagtactgcaaagatcac
tatgacgatggccactgcgaccagggctgtaataatatcgagtgtggatgggatggtctg
gattgtgccaatgacaagccacagaagctggcagagggaacactgctcctcattgtcctg
gtgcctcctgaacaactactgaatgactcggtggggttccttcgtgagctcagccacatc
ctgcacaccaatgtcaagtttaagaggcaccccaatggcgacatgatggtttacccttac
tatgggaacaaggagcagctgcacagacaccatgtgaagaggtcaatggcagaggccagt
gaccgagtcattgacgcattgagtcatgtcaaacgctcgctctatgcactggtgtcccct
cggagccgcagggagttggaccggcaagaggtcaaagggtcgattgttcacctggaaatc
gataatcgacagtgttaccaggctttctctgactgttttgccagtacaacagatgtggca
gctttcctgggtgccatggcttcccaaggcagcctccagctaccatacaacattgagact
gtggagagtgaaggaattgtgaccattcatgacgataacctatatcccatgtacgttgtg
gtgtctgtgctcatatttctggccttcattgggatgggggtgctggtgtctcggaaacga
catcgagagcacggacagctctggttccccgaaggttttaaggtgacagagagcagcaag
aagaaacgccgggagccggtgggcgaggattcggttgggttgaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
