KEGG   Candidatus Carsonella ruddii HC: A353_0105
Entry
A353_0105         CDS       T02197                                 
Symbol
putA
Name
(GenBank) delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase
  KO
K13821  RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase [EC:1.5.5.2 1.2.1.88]
Organism
crh  Candidatus Carsonella ruddii HC
Pathway
crh00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
crh00330  Arginine and proline metabolism
crh01100  Metabolic pathways
crh01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
crh_M00970  Proline degradation, proline => glutamate
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:crh00001]
 09100 Metabolism
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    A353_0105 (putA)
   00330 Arginine and proline metabolism
    A353_0105 (putA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors [BR:crh03000]
    A353_0105 (putA)
Enzymes [BR:crh01000]
 1. Oxidoreductases
  1.2  Acting on the aldehyde or oxo group of donors
   1.2.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.2.1.88  L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase
     A353_0105 (putA)
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.5  With a quinone or similar compound as acceptor
    1.5.5.2  proline dehydrogenase
     A353_0105 (putA)
Transcription factors [BR:crh03000]
 Prokaryotic type
  Ribbon-helix-helix
   Other families
    A353_0105 (putA)
SSDB
Motif
Pfam: Aldedh Pro_dh Pro_dh-DNA_bdg
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFP83943
UniProt: J3YQ22
LinkDB
Position
complement(76690..79746)
AA seq 1018 aa
MIFNFLLNIVSKHYIIDENIYLLEILKNCFFKWSFFKKVESFSNNLINKSREKILLDNVD
NILNEYNLSNKEGIQMMCLAESLLRIPDIFTINSFIKDKIFFQEWEYYYSSDYLKIIVYN
LAIDLVSNLFYNNNNDIINDKKFFLYIFRKVISLFANHLMKNIGKKFVYSNNSKKAVQKA
LLDKKIFSFDMLGEAAITFYDANKFFNQYIKLISNIKKNFMGCSRNKIPTVSIKLSALHP
KYSFYNRKDVFKKLSLILKILIIKVKKANSLLTIDAEECDRMELNLELFNTLFYSEYCLY
WNNFGLVIQAYSKRALPALYWLRTIAFMRQTKIPVRLVKGAYWDYEIKFIQSLNMNLYPV
YIKKFCTDLSYLLCTCFLLSNKCNNIILPQFATHNIQTISFIVVLSKGRHLEFQKLYGMG
DNIYETLKNMHKITCREYAPIGTYKDLLPYLVRRLLENGANSSFVNKLVNKNCNIIKLTN
NPLLKKEVKYNKLLPSSIDLFGGVRLPHLFYNLNISFHYYNFYKKICIYDKKVWIAYSFN
NSIKNNIKIYSPINKKIFLGIVKQDIKINFSIKILKKSFIFWKLISINKKIFIIKNFIIL
LKKNFIEMIILCCKEAGKTILDSISDIKEAIDFCKYYSNQALYIYNKYNLPNYTGENNIY
YLEGKGVFATISPWNFPVAIFCGQTISALISGNVVLAKPAESTSIIAYKIFQLLYKSGLP
ISVCQIIFGSGSKIGNRISFHKDIYGVIFTGSNNVANTINRNLLMRNNRPIHKLIAETGG
INAMIADSSTLIEQLISDVLESSFKSCGQRCSALRMLYLHEEIYEESLKLIFGAIRTFSL
GNVLNISNDIGPVISNKNKVKLVSYLKSLNKDDVFSVNNYKYDNDNNYIFPHVVKVNGIS
DLKSEQFGPILHIAMFNNFQLKDIINDINNSEFGLTLGIHSRNESFYKYVANKLNIGNVY
INRNTIGAIVGMQPFGGCNFSGTGPKAGGPNYLVSLINEKTVTINTTAQGGNVELLNE
NT seq 3057 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatttttaattttttattaaacattgtaagtaaacattatataattgatgaaaatatt
tatttattagaaattttaaaaaattgtttttttaaatggagtttttttaaaaaagtagaa
agtttttctaataatttaataaataaaagtagagaaaaaattttattagataatgtagat
aatattttaaatgaatataatttaagtaataaagaaggtatacaaatgatgtgtttagct
gaatctttattaagaattcctgatatatttacaataaattcttttattaaagataaaatt
ttttttcaagaatgggaatattattattcttcagattatttaaaaataattgtatataat
ttagcaattgatttagtttctaatttattttataataataataatgatataataaatgat
aaaaaattttttttatatatttttagaaaagttatttctttatttgcaaatcatttaatg
aaaaatattggaaaaaaatttgtttattctaataattctaaaaaagctgttcaaaaagcg
ttattagataaaaaaattttttcttttgatatgttaggtgaagctgctataacattttat
gatgcgaataaattttttaatcaatatataaaattaataagtaatattaaaaaaaatttt
atgggatgttctagaaataaaataccaacagtatcaataaaattatctgctcttcatcct
aagtattctttttataatagaaaagatgtatttaaaaaattatcattaattttaaaaatt
ttgattataaaagttaaaaaagctaattctttattaacaatagacgctgaagagtgtgat
agaatggaattaaatttagaattatttaatacattattttattctgaatattgtttatat
tggaataattttggtttagttattcaagcatattcaaaaagagctctccctgcattatat
tggttaagaactatagcatttatgagacaaactaaaattccagtaagattagttaaaggt
gcatattgggattacgaaataaaatttattcaatctttaaatatgaatttgtatccagta
tatattaaaaaattttgtactgatttatcttatttattatgtacttgttttttattatca
aataaatgtaataatataattttaccacaatttgcaacacataatatacaaactatatct
tttatagtagtattaagtaaaggtagacatttagaatttcaaaaattgtatggaatgggt
gataatatttatgaaactttaaaaaatatgcataaaataacttgtagagaatacgcacct
attggaacttataaagatttattaccatatttagtaagaagattacttgaaaatggagca
aattcatcatttgttaataaacttgttaataaaaattgtaatataattaaattaacaaat
aatcctttattaaaaaaagaagtaaaatataataaacttttaccttcttcaattgattta
tttggcggagtaagattaccacatttattttataatttaaatatttcatttcattattac
aatttttataaaaaaatatgtatttatgataaaaaagtttggatagcttattcttttaat
aattctataaaaaacaatataaaaatttattctcctataaacaaaaaaatttttttagga
atagttaaacaagatattaaaattaatttttcaataaaaattttaaaaaaatcatttatt
ttttggaaattaattagtattaataaaaaaatttttataataaaaaattttattatttta
ttaaaaaaaaattttattgaaatgattattttatgttgtaaagaagcgggtaaaacaatt
ttagattcaatttcagatataaaagaggctattgatttttgtaaatattattctaatcaa
gctttatatatttacaataaatataatttaccaaattacacaggagaaaacaatatttat
tatttagaaggaaaaggggtttttgcaacaattagtccttggaattttccagttgcaatt
ttttgtggtcaaactatatctgctttaatatcaggaaatgtagttttagctaaacctgca
gaaagtacttctataatagcatataaaatttttcaattattatacaaatctggtttacct
attagtgtatgtcaaataatatttggttctggttcaaaaattggaaatagaatttctttt
cataaagatatatatggtgtaatttttactggttcaaataatgttgctaatactattaat
agaaatttattaatgagaaataatagacctattcataaattaatagcagaaactggtggt
ataaatgcaatgattgctgattcttccactttaattgaacaattaatatcagatgtttta
gaatcatcttttaaaagttgtggtcaaagatgttcagcattaagaatgttatatttacat
gaagaaatttatgaagaatcattaaaattaatatttggcgctattagaacattttcttta
ggaaacgttttaaatatttctaacgatataggtccagtaataagtaataaaaataaagtt
aaattagtttcttatttaaaatccttaaacaaagatgatgttttttctgttaataattat
aaatatgataatgataataattatatttttcctcatgtagtaaaagtaaatggtatttca
gatttaaaatcggaacaatttggtccaattttacatatagcaatgtttaataattttcaa
ttaaaagatataattaatgatataaataactcagaatttggtttaacattaggaatacat
agtagaaatgaatctttttacaaatatgttgctaataaattgaatataggtaatgtttat
attaatagaaatacaattggtgctattgtaggtatgcagccttttggtggatgtaatttt
tctggtacaggaccaaaagcaggtggaccaaattatttagtatcattaattaatgaaaaa
acagttactataaatactactgctcaaggagggaacgttgaattattaaatgaataa

DBGET integrated database retrieval system