Cyprinodon tularosa (White Sands pupfish): 119776570
Help
Entry
119776570 CDS
T07496
Symbol
notch1a
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1
KO
K02599
Notch 1
Organism
ctul
Cyprinodon tularosa (White Sands pupfish)
Pathway
ctul04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctul00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
119776570 (notch1a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
EGF_2
Ank
Notch
NOD
NODP
Ank_4
Ank_3
Ank_5
EGF_3
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119776570
NCBI-ProteinID:
XP_038130973
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2478 aa
AA seq
DB search
MYRFLVKLTFLIPAIVLSQGLKCSLPTESCLNGGRCEATPNGDGECKCSSEYVGDRCQYP
SPCSPSPCRNGGECRPVSHGNTFDFHCICRLGFTDRLCLTPRNHPCMSSPCRNGGTCDLI
SLSSFRCRCPPGWSGKTCQTPNPCASNPCANGGQCLALDSTFKCNCPSNFQGQTCKQDVN
ECAQNPTLCRNGGLCVNEVGSYHCRCPQEFVGQHCETPYSPCSPSPCQNGGTCVQKGETT
YDCSCLSGFTGQNCEHNIDDCPGHNCQNGGVCVDGVNTYNCQCPPHYTGQFCTENVDECE
LMPNACQNGGTCHDTHGSYHCVCVNGWTGDDCSENIDDCASAACYNGATCHDRVASFFCE
CPHGRTGLLCHLDDACISNPCQKGSNCDTNPVNGKAICTCPPGYTGSACNLDIDECSLGA
NPCEHGGRCLNTLGSFQCKCLQGYEGPRCEMDINECISNPCQNDATCLDQIGGFHCICMP
GYEGVFCHINTDECASQPCLNNGKCIDKINLFHCECPKGFSGNLCQVDIDECASTPCKNG
AKCTDGPNKYTCECAEGYTGQHCEVNINECYSDPCHYGTCKDGLASFTCHCHPGYTGRLC
ETNINECLSQPCKNGGTCQDRENSYICSCPKGTAGFNCEVNLDDCKSQPCDYGRCIDKIN
GYECACEPGYTGTMCNINIDDCVINPCHNGGTCIDGVSSFTCICPEGYHDATCLSEVNEC
ASNPCIHGHCQDLINDYICTCDSGWSGKNCNINNNECESNPCMNGGTCKDMTSGYHCTCR
VGFTGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGENCETLLAPCSPRSCKN
GGMCKEAEDYQSFSCICPEGWQGQTCEIDINECVKNPCRNGAVCLNTMGSFQCKCQPGYT
GQHCETNIDDCKPNPCSNGGLCRDGVNTFTCTCLPGFRGSRCEHDINECESNPCKNGANC
TDCVNSYTCTCPPGFSGINCEINTNDCTDSSCFNGGTCVDGINTFTCLCLTGFTGSYCQY
DIDECDSKPCLNGGTCLDGYGTYKCTCPQGYTGVNCQSLVRWCDSSPCKNGGSCWQQGAS
YTCQCQTGWTGLYCDIPSVSCEVAAKRQGVEVSQLCRNSGQCLDAGNTHYCRCQAGYTGS
YCQEQVDECSPNPCQNGATCNDYLGGYSCECVPGYHGMNCSKEINECQSQPCQNGGTCID
LINTYKCSCPRGTQGVHCEINLDDCNPPSDPLTNEPKCFNNGKCVDRIGGYQCLCPPGYV
GERCEGDVNECLSNPCDPRGSYNCIQLPNSYRCECRTGYTGQRCDKVFDGCKGRPCRNGG
TCAVASNTLHGFICKCPIGFTGSSCEYDSRSCGSLNCRNGGTCVSGLLGPRCLCPSTFTG
PECLTPTDSLCISNPCYNGGTCHITPDAPFFQCSCPSNFNGLLCHILDYSFIGGFGRDIT
PPPEVEVSCEIPQCDEWAGNHICDSLCNNHACGWDGGDCSLNFDDPWQNCSAALQCWRYF
NNGKCDGQCNSPGCLYDGFDCQGQEGQCNPLYDQYCKDHYADGHCDQGCNNAECEWDGLD
CANNMPEKLADGHLVLVVHIPPEQLKNRSSSFLRELSSVLHTNVVFRRDAKGEPMVFPYY
GNEQDLMKHNVLKRSADGWPEWTSMPANVLGQVKESVSSVINKRKRRELDPVQVKGSIVY
LEIDNRQCYQQSSECFQSATDVAAFLGALATSGNLNVPYIEAVTSVRPTAPTEELYPLYL
AFIGVAIFGFIGLGVLVSRKRRREHGQLWFPEGFKVSEPSKKKRREPLGEDSVGLKPMKN
SDSNLMDDNQTEWGDDDPDCRHFKFEDQAMLDLSDHTDQRKWTQQHLDAADLRITSIAPT
PPQGEIENDCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLDNGNSEEEEDPSAEIITDFIYHGANL
HNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLESSADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQIL
IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADANATDDSGKSALHWAAAVNN
VEAAMVLLKNGANKDMQDNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLEHFANREITDHLDQLPRDI
AQERMHHDIVRLLDEYNVVRSPGLHSAPLSTSTLSPPLCSPNDYLSNLKPTPSGKKVRKP
SSGGKGGKDGGKDIRVKKKKPTDGKNNLLDTTGVLSPVESLESPHGYLSDVASPPMPSPF
QQSPRMSLNHLLGNGDSHAGQINMGKDMSCMSFDPPRLTHLPVSSSSSQGTTSVGGSRGG
QCDWLTRMHPGVSQQGSFTQGPQMSHNMMGPLHGVSTSTLSQIMGYQNLPSSHLGSTAHM
MQQPRSRQLQHQNSNSTTAGQPLSQSFPNVELNGADMQPNGSSGHSVPIHTVLPQEAQML
GTQFPTPPSQHSYTGPMDNTPSHQLQVPDHPFLTPSPGSPDHWSSSSPHSNLSDWSEGIS
SPPTSIHSQMNLIPDQFK
NT seq
7437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcgtttcttagtgaaactgacatttctgattccagcaatcgtcctctcacaaggt
ttaaaatgctccctccctactgagtcgtgcctaaatggaggaagatgtgaagccactcca
aatggagatggggagtgcaagtgttccagcgaatatgtgggggatcgatgccaataccca
agcccctgcagtccttcaccctgccgcaacggtggcgaatgccgccctgtctctcatggc
aacacgtttgatttccactgcatttgccgcctgggctttaccgacagactgtgcctgact
ccgaggaaccatccttgcatgagctccccctgtcgcaatggtggaacatgtgacctcatc
agtctcagcagtttccgctgccgatgcccaccgggatggtctggcaaaacttgccagact
cccaacccatgcgcatcaaatccatgtgcaaatggaggccagtgtcttgctttagattcc
accttcaagtgcaactgtccctccaacttccaaggtcaaacctgcaagcaggatgtaaac
gagtgtgcccagaatccaactctgtgtcgcaatggtggcttgtgtgtcaatgaagttggc
tcctaccactgccgctgtcctcaagagtttgttggccaacattgtgaaaccccttactcc
ccatgcagcccctcaccatgccagaatggaggcacatgtgttcagaagggagaaaccacc
tatgactgtagctgcctttcaggttttacaggccagaactgtgagcacaatatcgatgac
tgtccgggtcataactgtcagaatggtggcgtgtgtgtggatggagtcaacacctacaac
tgccagtgcccacctcattacacaggtcagttctgcactgaaaatgtggatgagtgcgag
ctgatgcccaatgcctgtcagaatgggggaacatgccacgacacgcatggcagctaccac
tgtgtctgtgtcaacggctggactggggatgactgcagcgagaacatcgacgactgtgcc
agtgcggcctgctacaacggcgccacctgccacgatcgtgtggcctcattcttctgcgag
tgtccacatggacgcacaggtttgctgtgccaccttgatgatgcctgtatcagcaatcct
tgccagaagggctcgaactgtgacacaaacccagtaaatggcaaggctatttgcacctgt
cctccgggttacacgggatcggcttgtaacctagacattgatgagtgctccctgggtgca
aacccttgcgagcatggcggtcgttgcctcaacaccttagggtctttccagtgcaagtgt
cttcaaggatacgagggacccagatgtgagatggacattaatgaatgcatatctaatccc
tgccaaaacgatgccacctgtttggaccagattggaggattccactgtatctgcatgcca
gggtatgagggtgttttctgccacatcaacacagatgaatgtgccagccagccttgtctg
aacaacggaaaatgcatagacaagataaatttgttccactgtgaatgtcctaaaggattt
tcaggaaatctgtgtcaggtggatattgatgagtgtgccagcacgccttgcaaaaatgga
gccaaatgtactgatggacccaataaatacacatgtgaatgtgctgaaggttacacaggg
cagcactgtgaggttaacatcaatgagtgttactctgatccttgccattatggtacatgc
aaagatggcctagcttccttcacatgccattgccaccctggctacactggccgcttgtgc
gaaactaacatcaatgagtgtctcagccagccatgtaaaaacgggggcacttgtcaggac
agggagaactcctacatctgttcctgccccaaaggcacagcaggcttcaactgtgaggtg
aacctcgacgactgcaagagccagccttgcgactatgggaggtgcatcgacaagatcaat
ggttacgagtgtgcatgtgagccgggttacacaggcacaatgtgcaacatcaacatagac
gactgtgtcatcaacccctgtcacaatggtggcacatgcattgatggtgtcagcagcttc
acatgcatctgtcctgagggctaccatgatgccacctgtttgtcagaggttaatgagtgt
gccagcaacccctgcatccatgggcattgtcaggacctcattaatgactatatatgtacc
tgtgattctggatggagcggcaaaaactgcaatatcaacaataacgagtgcgagtccaac
ccctgcatgaatggaggaacatgcaaggatatgaccagcgggtatcactgcacatgcaga
gttggcttcaccggacctaattgccaaactaacatcaatgagtgtgcctccaatccctgc
ctcaaccagggaacctgcattgatgatgtggctggatacaagtgcaactgtttgctaccc
tatactggtgaaaactgtgagaccttgctggccccttgcagcccccgatcctgtaaaaat
ggaggaatgtgtaaagaggctgaagactatcagagcttctcctgcatctgccctgaagga
tggcaaggtcagacatgtgaaatagatatcaacgaatgtgtgaagaacccctgccgtaat
ggcgctgtgtgtctcaacaccatgggcagctttcagtgcaagtgccagcctggttacact
ggccaacactgtgagaccaacatcgacgactgcaaaccgaatccatgcagtaatggaggt
ctgtgccgggatggtgtcaacacattcacgtgtacctgcctgcccggttttcgtggcagc
aggtgtgagcatgacataaacgaatgtgagagcaacccctgtaaaaacggggctaattgc
accgactgcgtaaacagctacacctgcacctgccctccaggcttcagtggcatcaactgt
gagatcaacaccaatgactgcacagacagctcttgttttaacggtggcacctgtgtggat
gggattaacaccttcacctgcctgtgtctaactggattcactggaagctactgtcaatac
gatatcgacgagtgtgactccaaaccatgcctcaatgggggcacctgtcttgatggttat
gggacctacaagtgcacctgtccacaaggctacacaggagtcaactgtcagagccttgtg
cgctggtgtgactcctctccttgtaaaaatggaggttcttgttggcagcagggagcttct
tacacctgccagtgtcagactggatggactggcctgtactgtgacatccccagtgtgtct
tgcgaagttgctgccaaacgacaaggtgttgaggtgtcacagctgtgtaggaactcaggc
caatgtctggatgctggaaacacacattactgccgctgccaggctggctatacagggagc
tactgccaggagcaggtggacgaatgctcgcctaatccttgccagaatggcgcaacctgt
aatgattatcttggaggttacagttgcgagtgtgtccctggttaccatggcatgaactgt
tcaaaagagatcaatgagtgtcagtctcaaccctgccagaatggagggacatgtatcgac
ctcataaacacctacaaatgctcctgtcctagaggaacacaaggagtccactgtgagatt
aatttggatgactgcaacccccccagcgatccgcttacaaatgagcccaagtgcttcaac
aacggaaagtgtgtagatcgcattggaggctatcagtgcttgtgcccaccgggttatgta
ggtgaacgctgcgagggtgacgtcaatgaatgcttgtctaacccttgtgaccccagaggg
tcatataattgcatccagctccccaatagctaccgctgtgaatgccgaaccggatataca
ggacaacgttgtgacaaggtgtttgatggctgcaagggaagaccctgcaggaacggagga
acatgtgctgttgccagtaacacactccatggttttatctgtaaatgtccaattggattt
acgggctcttcctgcgagtatgattctcgctcctgcggcagtctaaattgcaggaatggc
ggtacatgtgtgtctggcctcttgggcccacgctgcctttgtccctcaaccttcactggt
cctgagtgcctaacccccaccgacagcctctgcatctcaaacccctgctacaatggtgga
acctgccatataaccccagacgctccatttttccaatgcagctgtcccagcaatttcaac
ggtctgctttgccatatactggactactccttcatcggggggtttggtcgagacatcacg
ccacctcccgaagtggaggtgagctgtgagattcctcagtgtgacgagtgggcgggtaac
cacatctgtgactccctgtgtaacaaccatgcctgtggctgggacggaggtgactgctcg
ctcaattttgacgatccctggcaaaactgttcggctgctctgcagtgctggcgatacttc
aacaatgggaagtgtgatggccaatgtaacagccctgggtgtctctatgatggctttgat
tgccaaggacaggaagggcagtgcaaccctctatatgatcagtactgtaaagaccactat
gcggatggtcactgcgaccagggctgcaacaacgcagaatgcgaatgggatggcctggat
tgtgccaacaacatgccagaaaagcttgcagatggacatctagtccttgttgtccatatt
cccccagagcagcttaagaaccgctcctcgtctttcctcagagagctgagcagtgttctc
cacactaatgtagtgttccgccgtgatgcaaaaggagagccaatggtctttccctactac
ggaaatgaacaggacctgatgaaacacaacgttctcaagcgctctgcggacggctggcct
gagtggacttcaatgcctgccaatgttttgggtcaggtgaaggagagtgtgtcctccgtg
atcaacaaacgcaaacggagagagttggatcctgtgcaagtcaaaggatcgattgtatat
ctggagattgacaatcgtcagtgttaccagcagtcttctgaatgcttccagagtgctaca
gatgtggctgcctttcttggtgcacttgccaccagtgggaacctcaatgttccctatatt
gaagctgtaacaagcgtgagaccgactgccccaaccgaagagttgtaccccctttattta
gcatttattggggtggctattttcgggttcataggcctgggtgttctagtatctcgaaag
cggcgtcgggagcatggtcagctctggtttccagagggatttaaagtatcggagccaagc
aaaaagaaacgcagggagcctttgggagaggattctgttggtctgaagccaatgaagaac
tctgacagcaaccttatggatgacaatcaaacggaatggggagatgatgatccagattgc
cggcacttcaagtttgaggaccaggcaatgttggatttgagtgatcacacagaccagagg
aaatggacccagcaacatctggatgcagctgacctgcggataacatccattgcccccaca
cctcctcagggagagattgagaatgactgcatggacgtcaatgtcagaggaccagatggt
tttacgccactgatgatagcctcctgcagcggtggaggactggacaatggtaacagtgaa
gaggaagaggatccatcagcagagataattactgacttcatttaccacggagccaaccta
cataaccagactgaccgcacgggtgagactgccctccacctggccgcccgttacgctcgc
tcggatgctgccaaacgcctgctggagtctagtgcagatgccaatgtacaggacaacatg
ggacgcacaccgctgcatgctgctgttgctgcagatgcacagggagtgtttcagatttta
atccgaaatcgagccactgatcttgacgcccgaatgcatgatggaacaactcctctgatt
ctggctgcgcgattggctgtggagggaatggtggaagaacttatcaattgccatgctgat
gctaatgccactgatgattctgggaaatctgctttgcactgggccgctgctgtaaacaat
gtggaggctgctatggtgctgctgaaaaatggtgctaacaaagatatgcaggacaacaag
gaggagacaccactgtttcttgctgcccgtgaaggtagctatgagacagcaaaggttctt
ctagagcattttgccaaccgtgaaatcactgaccatcttgaccagctgccccgagatatc
gcccaggaacgcatgcatcacgacatagttcgactcctagacgaatataacgtggttcgg
agtcctgggctgcacagtgccccattaagcacctctaccctctcccctcctctctgctcc
cccaatgactatctaagcaatctcaagccgaccccctctgggaagaaggttcgaaagccg
agctctggaggaaagggagggaaggatggagggaaggatatcagggtaaagaagaagaag
ccaacggatggaaagaataacctgttagacacaactggggttctgtctcctgttgagtca
cttgagtcgcctcatggctatctgtctgatgtggcctctcctcctatgccgtcacctttc
cagcagtcgccacgtatgtccttaaatcacctcctaggcaatggggactcccatgcaggc
cagattaatatgggtaaagatatgagctgcatgtcttttgatcccccccgcctcactcac
ctgcctgtgtcaagttcaagcagccaaggcacaacatctgtaggaggcagcagaggaggc
cagtgcgactggctcactaggatgcacccaggtgtgagccagcagggaagcttcacccaa
ggtccgcagatgtcacacaacatgatggggcccctgcacggcgtcagtacttccactttg
tcgcagatcatgggataccaaaatctgcccagcagccacttaggctccactgcacacatg
atgcagcaaccgcgctcccggcagctgcagcaccagaactccaactccaccacggccggt
cagcccctgagtcagagctttcctaatgtggagctgaatggcgctgacatgcagccaaac
ggcagctccggccactctgttccaattcacaccgtattgccacaggaggctcagatgctt
ggcactcagtttcccactcccccttcacaacatagctatacaggacctatggacaacaca
cctagccaccagctacaggtgcctgaccacccgtttttaaccccttcccctggttctcct
gaccactggtccagctcatctccacattccaacttgtccgactggtcagagggcatctct
agcccaccaacaagtattcactcacagatgaatctaattcctgaccagtttaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
