Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113789369
Help
Entry
113789369 CDS
T05775
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2-like
KO
K03002
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Pathway
dpte03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
113789369
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
dpte03021
]
113789369
Enzymes [BR:
dpte01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
113789369
Transcription machinery [BR:
dpte03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
113789369
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpa2_4
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
Rpr2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113789369
NCBI-ProteinID:
XP_027194734
UniProt:
A0A6P6XS56
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1196 aa
AA seq
DB search
MMANDLKTSSKTLVDELREQIESSTLKPSQKFITGSEWNDLKREQNRTLQNLARAHIESF
NFMINEGLQKGLQNLNPIGFELANGDRIVIQIMDCVILRPNVSNRNEIKSISSHHSLCTK
LYPSECRMAKTSYKAKVSLTINWSLNGRVQDIIEDIIGEIPIMVKSNRCNLEKLTRSELI
HRKEDSEEFGGYFIMNGNEYLIRKLIAQRRNYPMAIIRSSWKDSGQFFSEYGVSIRCVRN
DQIGSNMVLHYLTNGTVKLRFFYNRQPIYLPLILVLKVLCDVSDQFIFNELIKTRENDNF
FQSCIVNMLRMVQQEKLYTSKQIKKYIGERVRIRYEAPSWYTDEEITDNLFRECIAVHLN
SNVDKFNLLVFMTRKLFAFVQRECAEEKPDNPMFHEIYQSGHIYFTLLLERLQVFLSTVR
QAIERQYQQSLRYRDAHSFSLTTAMVRRALASKYREITRPMEHLITTGYLRSKTGLGLMQ
SAGMAVKAEKINFWRFLAHFRSVHRGQFFSEMKTTACRKLYPEAWGFLCPVHTPDGAPCG
LLNHFSELCQITNQQQSVRHLASVLTVLGMEPLDSPIKPDSNYLNVLLDGRTLGFVHENS
ATKIVNQLRMWKTTGKEKIPLTLEIGLVPRTDKPTQYPALYLFSTPSRMIRPVFNLLTQN
IEFIGTFEQCYMDICVTNSELISGITTHQEIRETSFLSILARQIPYPDFNQSPRNMYSCQ
MAKQTMGTASHTLRYRSDNKMYSILTPQSPLVRTAAYDHYALDNYPLGTNAVVAVISYTG
YDMEDAMILNKSSVERGFQAGIINKTEVIDLYELAGLRSTQLQELMLKFGYDETIDIDEK
YSGMFDKDGLPFIGRLVCQDDPVCAYLDMVENRTKFHKYKSSEPAYIFDVKILSDGNETR
ITRVAISFLIRRSPIIGDKFANRHGQKGICSFLWPAEDMPFTESGIIPDILFNPHGFPSR
MTIGQMIETLAGKSASMHGLVHDCTPFTFSEDNLASDYYGKLLESYGFNYYGTEKMFSGV
DGRELEAQIFIGVVYYIRLRHMVGDKYQVRSTGPIDQITHQPVKGRKRAGGIRFGEMERD
SLLAHGTTFLLQDRLFNNSDKTLVHMCKKCGSILSPYLFSTTTNKNNVNNEGIDKNDETI
NGGGGGGDLEAEKIQYWNCKLCDSAEHIVKVAIPFVLQYLVAELASVNIKVKFTAT
NT seq
3591 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggccaacgatttgaaaacatcatcgaaaacattagttgatgaacttcgtgaacaa
attgaatcatctacattgaagccaagtcaaaaatttattaccggttcagaatggaatgat
cttaaacgtgaacaaaatcggactttacagaatcttgctcgtgctcatattgaatcattt
aattttatgataaatgaaggtttacaaaaaggtttacaaaatctgaatccaattggattt
gaactggccaatggtgatagaattgtaatacagataatggattgtgtaattttacgacca
aatgtatcgaatagaaatgaaataaaatcaatatcatcacatcattcactttgtacaaaa
ctttatccatccgaatgtcgtatggcaaaaacatcatataaagcaaaagtttcattgaca
ataaattggagtttaaatggtcgtgttcaggatataattgaagatattattggtgaaatt
cctataatggttaaatctaatcgatgtaatttggaaaaattaacccgatcagaattgatt
catcgaaaagaagattccgaagaatttggtggttatttcataatgaatggtaatgaatat
ttgataagaaaattaattgcacaacgtagaaattatccaatggcaattatacgatcatca
tggaaagatagtggacaatttttttccgaatatggtgtatcaatacgttgtgtacgaaat
gatcaaattggttcaaatatggttctacattatttaactaatggaacagttaaattgaga
tttttctacaatcgtcaaccaatatatttaccattgattttagtgctaaaagttctttgt
gatgtatccgatcaatttatatttaatgaattaatcaaaacacgtgaaaatgataatttt
tttcaatcatgtattgttaatatgttacgtatggtacaacaggaaaaactttatacatcg
aaacagattaaaaaatatattggtgaacgtgttcgtatacgatatgaagcaccaagttgg
tatacggatgaagaaattactgataatctattcagagaatgtatcgccgttcatctaaat
tcaaatgttgataaattcaatttgttagtatttatgacaagaaaattatttgcatttgta
caacgtgaatgtgcagaagaaaaacccgataatccaatgtttcatgaaatttatcaatct
ggtcatatttattttacattattattggaacggttacaagtgtttttgagtaccgtacga
caagcaatcgaacgtcaatatcaacaatcattaagatatcgtgatgcacattcattttca
ttaacaacagctatggtacgtagagctttagcatcaaaatatcgtgaaattactagacca
atggaacatttgattacgactggatatcttcgttcgaaaactggccttggtttgatgcaa
tctgccggtatggctgttaaagctgaaaaaattaatttctggcgttttttagcacatttt
cgttcagtacatcgtggtcaattttttagtgaaatgaaaacaacagcatgtagaaaatta
tatccagaagcatggggatttctttgtcctgtacatacacctgatggtgctccttgtggt
cttttaaatcattttagtgaactttgtcaaataactaatcaacaacaatcagttagacat
ctggcttcagttttaactgttttaggaatggaaccattagattcaccaatcaaaccggat
tcaaattatttaaatgttcttttggatggacgaacattaggttttgttcatgaaaattcg
gctacaaaaattgttaatcaattacgaatgtggaaaacaaccggtaaagaaaagattcca
ttaacattggaaatcggattagttccacgtaccgataaaccaacacaatatccagcttta
tatctattttcaacaccatcacgtatgattcgtccagtgtttaatttactaacacaaaat
attgaatttattggaacatttgaacaatgttatatggatatttgtgttacaaattcggaa
ttaatatccggtataacaacacatcaagaaatacgtgaaacaagttttcttagtatactt
gctaggcaaattccatatccagattttaatcaaagtccacgtaatatgtattcatgtcag
atggcaaaacaaacaatgggtacagcaagtcatacattaagatatcgatcggataataaa
atgtattcaatattaacaccacaatcaccattagtacgtacagctgcatatgatcattat
gcattggataattatccattaggaactaatgcagttgttgctgttatttcatatactggt
tatgatatggaagatgctatgatattgaataaatcatcagttgaacgtggatttcaagcc
ggtattattaataaaacagaagttattgatctttatgaattagccggattacgttcaaca
caattacaagaattaatgttaaaatttggttatgatgaaacgattgatattgatgaaaaa
tattccggaatgtttgataaagatggattgccatttattggaagattagtttgtcaagat
gatccagtttgtgcatatttagatatggttgaaaatcgtacaaaatttcataaatataaa
agttcagaaccggcatatatttttgatgtaaaaattttaagtgatggtaatgaaacaaga
ataacaagagttgctatttcatttttaatacgacgatcaccaattattggtgataaattt
gctaatcgacatggacaaaaaggtatttgctcatttttatggccagctgaagatatgcca
tttactgaaagtggtattataccggatattctgtttaatccacatggttttccttcacgt
atgactattggacaaatgattgaaacattggctggaaaatcagcttcaatgcatggttta
gtacatgattgtacaccatttacattttcggaagataatcttgcatcagattattatggt
aaattattagaaagttatggttttaattattatggaacggaaaaaatgttcagtggtgtt
gatggccgagaattagaagcacaaatatttatcggtgttgtttattatattcgtttacgt
catatggttggtgataaatatcaggtacgatcaactggaccaatcgatcagattacacat
caaccggtaaaaggaagaaaacgtgctggtggtattcggtttggtgaaatggaacgtgat
tcacttcttgctcatggtacaacatttttactacaagatagattgtttaataattcggat
aaaacattggttcatatgtgcaaaaaatgtggctcaatattatcaccatatttattctcg
acaacaacgaataaaaacaatgtcaataatgaaggaatagataaaaatgatgaaactatc
aatggtggtggtggtggtggtgatctagaagccgaaaaaattcaatattggaattgtaaa
ctttgtgattcagctgaacatattgtaaaggtggcgataccttttgttttacaatatttg
gttgctgaattagcatccgttaatattaaagtaaaatttacggcaacttga
DBGET
integrated database retrieval system
