Geminocystis sp. NIES-3708: GM3708_798
Help
Entry
GM3708_798 CDS
T04168
Name
(GenBank) lycopene cyclase
KO
K14605
lycopene cyclase CruA [EC:
5.5.1.19
]
Organism
gee
Geminocystis sp. NIES-3708
Pathway
gee00906
Carotenoid biosynthesis
gee01100
Metabolic pathways
gee01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gee00001
]
09100 Metabolism
09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
00906 Carotenoid biosynthesis
GM3708_798
Enzymes [BR:
gee01000
]
5. Isomerases
5.5 Intramolecular lyases
5.5.1 Intramolecular lyases (only sub-subclass identified to date)
5.5.1.19 lycopene beta-cyclase
GM3708_798
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FAD_binding_3
FAD_oxidored
Pyr_redox_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAQ60392
UniProt:
A0A0D6AC90
LinkDB
All DBs
Position
885132..887126
Genome browser
AA seq
664 aa
AA seq
DB search
MKLKEILYLEIPNPNSQLICDWLQEIWQPSQGKKIKTPDGIRLELADNHELSIFTWSLQR
TTYLKIFRWGEKQVINENKIKRELEIAINQKFPPNYSSLPEIDLTHQSIFTALESHYPNT
VKFFQKMPQGEYDLTRAYWWEKKWRESVKSQGKNIPKNPLKQVIFRDQTTGKTDYDIVYV
GGALGAIHAALMAKLGYSVLLIERLKFGRMNREWNISRLEFQVLIDNGLFTKKEFESIIA
AEYKDGFSKFFDANNPSNLKANILHTPTVLNIAIDTSKLLTLCGEKLRQYGAEIWEETEF
NRVTVGTDLVTVNTTNLINKQEKETTARLLIDAMGTASPIAWQISGNRAFDSVCPTVGAI
LEGIAPEVWDRDYGDVLFSHGDISRGRQLIWELFPAEGDEVTIYLFHYHQVHPDNPGSLL
EMYEDFFTILPEYRRCDLDKLVWKKPTFGYIPGKFTIKKGDRKIATDRILAIGDAASLQS
PLIFTGFGSLVRNLGKLTTLLDSALKYNLLDEDSLNQIQAYQSNIAVTWLFSKGMMVPTH
KTLPPQRINSMLNTFFGLLADEPDTAEMFIKDRTDWLTFNRLALKAAWKNPSLLFWIWQM
AGSKDIFRWLGAYNAFTLDAFKNLLFSRWFKTWLENKNSWLPKSNPKLWFKLFVFGSNLH
QKQK
NT seq
1995 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactaaaagaaattttatatttagaaattcctaaccctaattctcaacttatttgt
gattggttgcaggagatatggcaaccttctcaaggcaaaaaaattaaaactcctgatggt
attcgtttagaattagctgataatcatgaactgtctattttcacttggagtttacaacga
actacttatttaaaaatctttcgttggggtgaaaaacaagttattaatgaaaataaaata
aaacgagaattagaaatagcgattaatcaaaaatttcctcctaattattcttctttaccc
gaaatagatttaactcatcaatcaatttttactgctttagaatctcattatccaaatacg
gttaaatttttccaaaagatgccccaaggagaatatgatttaaccagagcttattggtgg
gaaaaaaaatggagagaaagtgttaaaagtcaaggaaaaaatattccaaaaaatccactc
aagcaagttatttttagagatcaaacaactggtaaaacagactatgatatagtttatgtt
ggtggtgcattaggagcaattcatgcggctttaatggcaaaattaggctatagtgtatta
ttaattgaacgcttaaaatttggtagaatgaatcgagaatggaatatttctcgcctagaa
tttcaagtattaattgataatggattatttactaaaaaagaatttgaatccataattgcc
gcagaatataaagatggttttagtaagttttttgatgccaataatccttctaatttaaaa
gcaaatattttacatactcccacagttttaaatattgctatcgatacctcaaaattatta
acattatgcggtgaaaaattacgtcaatatggagcggaaatttgggaagaaacagaattt
aaccgagtaacagtcggcacagatttagtgacagtaaacaccactaatttaattaataaa
caagaaaaagaaactaccgcaagactgttgattgacgctatgggcacagcttcccctatt
gcatggcaaatttcaggtaatcgggcttttgatagtgtttgcccaacagtaggagcaatc
ttagaaggtattgccccagaagtgtgggatcgagattatggtgatgttttattttctcat
ggagatatatcgagaggcagacagttaatttgggaattatttcccgcagaaggtgatgaa
gttacaatttatttattccattatcatcaagtacatcctgataatcccggctcactattg
gaaatgtatgaagacttttttacgattttacctgagtatcgtcgttgtgatctcgataaa
ttagtctggaaaaaaccgacttttggttatattccgggcaagtttaccatcaaaaaaggc
gatcgaaaaattgccacagatcgtatattagctattggagacgctgcttctttacaatca
ccattaatttttacaggttttggctcattagtccgaaatttaggaaaattgaccacttta
ctagactctgctctcaaatataacttattagacgaagattctttaaaccaaattcaggca
tatcaaagcaatatcgccgttacttggctattttctaaagggatgatggtgccaacccat
aagactttaccacctcaacgcatcaactctatgttaaataccttctttggtttactggca
gatgagcctgatactgcggagatgtttattaaagatcgcacagattggctcacttttaat
cgtttagccttaaaagcagcatggaaaaatccttccttattattttggatttggcaaatg
gcaggaagtaaggatatttttcgttggttaggtgcttataatgctttcactctcgatgct
tttaaaaatctattatttagtcgttggtttaaaacttggttagaaaacaaaaattcatgg
ctaccgaagtctaacccaaaactatggtttaagttattcgtatttgggtcaaacttacat
caaaaacaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
