Geotrypetes seraphini (Gaboon caecilian): 117367570
Help
Entry
117367570 CDS
T09159
Symbol
NOTCH1
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1
KO
K02599
Notch 1
Organism
gsh
Geotrypetes seraphini (Gaboon caecilian)
Pathway
gsh04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gsh00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
117367570 (NOTCH1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
Ank
Notch
EGF_2
NOD
NODP
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117367570
NCBI-ProteinID:
XP_033816121
UniProt:
A0A6P8SLV1
LinkDB
All DBs
Position
10:61592965..61792176
Genome browser
AA seq
2527 aa
AA seq
DB search
MRWFLVHALLLSLPAFTRGLQCTQPSEICLNGGKCEIAPSGTGECRCNNAHVGERCQFSN
PCLSSPCRNAGTCHAVISGNAVDYTCKCPVQFSDKLCVTPDNNICLHNPCRNGGTCELIT
LADYKCRCPPGWTGETCQQADPCASNPCGNGGQCVPFEAQYVCKCASGFHGQTCKQDVNE
CMQNPCKNGGTCTNEVGSYRCDCRQAFMGRNCELPYVPCNPSPCQNGGTCRQTSDTTYDC
TCLPGFSGQTCEENIDDCPGNSCMNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLMP
NACQNGGTCHNIVGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCANAACYHGATCHDRVASFYCECPH
GRTGLLCHLDDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYMGPACNQDVDECSLGANPC
EHGGKCINTQGSFQCQCAQGYTGPRCEIDVNECLSNPCQNDATCLDQIGGFQCICMAGYE
GVYCEINTDECASSPCLHNGNCIDKINEFQCRCPTGFSGFLCQLDIDECASTPCKNGAKC
LDGPNTYTCECREGFTGNHCEQDIDECSPDPCYYGTCSDGIASFICLCNPGYTGHRCDIN
INECQSMPCQNGGECQDRDAGYICKCSKGTTGPNCETNLDDCASNPCDYGRCIDKINSYE
CACEPGYTGRMCNINIDECASYPCHNGGTCRDAINGFTCICPEGYQDPMCLSEVNECNSN
PCIHGTCHDGVNGYNCDCDLGWSGTNCDINNNECESNPCTNGGICKDMTSGYICTCREGF
SGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCMVPYTGTTCEAVLAPCAANPCKNGGT
CQESEDYESFSCQCPTGWQGQTCEIDMNECIISPCRNGAGCVNTAGSYRCNCLDGYAGRN
CETDVNDCQPNPCQNGGSCSDGISTFFCSCLAGFRGPRCEEDINECASNPCKNGANCTDC
VNSYTCTCPCGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINTFTCLCPTGFTGSYCEHDIN
ECDSKPCLNGGTCQDSYGTYKCTCPQGYTGLNCQSLVRWCDSAPCKNGGKCWQTNNLYRC
ECDSGWTGLYCDIPNVSCEVAARQQDVDITNLCRNSGFCVDTGNTHYCRCSVGYTGSYCE
EQVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCECVPGYHGVNCSEEINECLSHPCQNGGTCIDLIN
TYKCSCPRGTQGVHCEINIDDCTPFFDTVSLEPKCFNNGKCTDKVGGYSCICPPGFVGER
CEGDVNECLSNPCDTQGAQNCIQLVNDYRCECMQGYTGRHCESVVDGCKGRPCRNGGTCS
IASNTGRGFICKCLPGFDGASCEYDSRACGNLRCLNGGTCISVHKTSKCICPAAFMGLEC
QHPVNSPCNSSPCYNGGTCQPSSEAPFYHCLCPINFNGLFCHILDYKFYGGIGQNITPPK
NEEHCENAVCEEYAGNKICDSKCNNHACGWDGGDCSLDFYDPWKNCTDSLQCWTYFSNGK
CDSQCNNAGCLYDGFDCQKVEVQCNPLYDQYCKDHFQDGHCDQGCNNAECEWDGLDCANN
MPKNLADGTLVLVVLLSPEKLKNNSLNFLRELSRVLHTNVVFRKNAKGEYMIFPYYGNKE
ELKKHRTKRSTEDWSNVPGAVFEKVTSSLFSSVGGRRRRELDEMEVKGSIVHLEIDNRQC
LHSSSQCFQSATDVAAFLGALASRGTLNIPYRIEAVKSETKDPDKASQIYFVYVGLAFLL
VLGFSLVGVLFRKRRREHGQLWLPDGFKMTESSKKKRREPLGEDSVGLKPLKNSTDGSLM
DDNQNEWGDEETLDSKRFQFEEQVMLPELDDQTDHRQWTQQHLDAADLRNASMAPTPPQG
EIDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETANSEEEEDASANVISDFIYQGASLHNQT
DRTGETALHLAARYARSDAAKRLLESSADANIQDHMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNR
ATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDAA
IVLLKNGANKDMQDNKDETPLFLAAREGSCETIKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDIAQER
MHHDIVQLLDSYNLVRSPPMSNGALGAPTLSPPICSPNGYLGNMKPAVQGKKARKPSTKG
LGCNGKDSKDMKARRKKSQDGKGGLLDSANVLSPVDSLESPHGYMSDIASPPLMTSPFQQ
SPSMPMNHLPGMADAHISLNHLNLASKQDMGMGGSNRMGFESILPRLSHLPVSSPNTILS
SGSMNFTMGGTSNMNGQCDWLSRLQNGMVQNQYNPVRNNIQQGSHQSTQALQHGMMTSLH
NGLPTTTLSQLMSYQAIPTTRLANPPHLIQAHQLQQIQQQNLQQQLQQQSLQQQHHISNT
TTNGHINQPFCNSDISQSDLQQSMSVHTVLPQDPQILTTLPTSLTQSIPTTQFLTPPSQH
GYSSPMDNTPNHQLQVPDHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNMSDWSEGISSPPTSIQAQMG
HIPEAFK
NT seq
7584 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggtggtttttggtgcacgccctgctgctgtcactacctgccttcacacgaggttta
caatgtacgcagccatcggaaatctgcttgaatggaggaaagtgtgaaatagcccccagt
gggactggagaatgtagatgtaacaatgcacatgtaggcgagagatgtcagttctccaac
ccttgcctaagttcaccatgccgaaatgctggaacgtgccatgctgtgatcagtggaaat
gcagtggattacacctgtaaatgcccagtacagttctcggacaagctgtgcgtcacaccc
gataacaacatttgtctgcacaatccctgccgcaatggaggcacctgtgaacttatcacg
ctggcagattacaagtgtagatgtcccccaggctggacaggtgaaacatgtcagcaggct
gatccttgcgcatccaacccctgtggcaatggtgggcagtgtgtgccatttgaagcccag
tatgtctgcaagtgtgcttccggcttccacgggcagacgtgcaagcaggatgttaatgaa
tgtatgcagaatccatgcaagaatggtggaacatgtaccaatgaagttggatcctacagg
tgtgactgcaggcaggccttcatgggtcgcaactgtgagctcccttacgtgccttgcaac
ccttcaccctgtcaaaatggggggacttgtcgtcagaccagtgatactacttacgactgc
acttgccttccaggtttttctggtcagacctgtgaggaaaacattgacgactgccctgga
aatagctgtatgaatggaggaacttgtgttgatggtgtgaatacatataactgccagtgt
ccacctgaatggacaggtcagttctgcaccgaggatgtagatgaatgtcagcttatgccg
aatgcctgccagaatggaggaacttgccacaatatcgttggtggatacaactgtgtctgt
gttaacggttggactggcgaggactgcagtgagaacattgatgactgtgctaatgccgcc
tgttaccatggagctacctgccatgaccgggtagcatcattctactgcgaatgcccgcat
ggacgtacaggtttgctctgccatcttgatgatgcatgcatcagtaacccgtgcaatgaa
ggatccaactgtgatacgaaccctgtcaatggaaaggccatctgcacatgtccttctggt
tacatggggcctgcctgcaatcaagatgtggatgagtgctctcttggtgctaacccttgc
gagcatggcgggaaatgcataaacacgcagggatccttccagtgccagtgtgcccaggga
tacactggtcctcgctgtgagattgatgtcaatgagtgcctgtctaatccctgtcagaat
gatgctacctgcctagaccagattggaggattccagtgtatctgcatggcagggtacgag
ggagtatactgtgagatcaacacagatgagtgtgccagcagcccttgcttgcacaatgga
aactgcatagataaaatcaatgaatttcaatgcaggtgccccacaggtttcagtggcttt
ctctgtcagttggatattgatgagtgtgccagcactccatgcaaaaatggtgccaaatgc
ctggatgggcccaacacgtacacttgtgaatgcagagaaggatttactggtaaccactgt
gagcaggacatcgatgagtgctccccagatccttgttattatgggacctgtagtgatggg
attgcttccttcatctgtctctgtaatcctggctacaccggccaccgatgtgacatcaat
atcaatgagtgccagagtatgccatgccagaatggtggagagtgccaggatcgggatgct
ggctatatttgcaagtgctctaaaggaaccacagggccaaattgtgaaaccaacttggat
gactgtgccagcaacccctgtgattatggcagatgtattgacaagatcaatagctatgag
tgtgcatgtgagcctggatatacagggagaatgtgtaacattaatattgatgaatgtgcc
tcctacccatgtcataatggaggaacgtgcagagatgccatcaatggtttcacctgcatt
tgcccagagggataccaggaccctatgtgcctgtctgaagttaatgagtgcaacagcaac
ccctgcattcacgggacgtgccacgacggtgtcaacgggtacaattgtgactgtgacctg
ggttggagtggcaccaattgcgacattaacaacaatgagtgtgaatccaacccttgcacg
aatggtggaatttgcaaggacatgaccagtggctatatctgtacctgccgggagggcttc
agtggtcctaattgccagactaatatcaatgaatgtgcttccaacccttgcttgaaccag
gggacctgcatagatgatgtggctggttacaaatgtaactgcatggtgccctacacaggc
accacctgtgaggcagtgctggctccctgtgctgcaaacccttgtaagaacggaggtaca
tgccaggaatccgaagactacgagagcttttcatgccagtgtccaacaggatggcagggt
caaacatgtgagatagacatgaatgagtgcattataagcccctgccgcaatggcgcaggg
tgtgtgaacacagcagggagctacaggtgtaactgcttggatggctacgcaggccgcaac
tgtgaaactgatgtcaacgactgccagccaaacccttgtcagaatggtggatcctgctct
gatggtatcagtaccttcttctgcagttgtctggcaggattccggggtcccaggtgtgag
gaggatatcaatgagtgcgccagcaacccatgcaagaatggtgccaactgtactgactgt
gtcaacagctacacatgcacctgcccctgtgggtttagtggcatccactgtgaaaataat
actccagactgcactgagagctcctgttttaatgggggcacctgtgtggatggcatcaac
accttcacctgcttgtgtccgactggcttcacaggcagctactgtgaacatgacattaat
gaatgtgattccaagccatgcctcaatggtggaacctgtcaagatagctacgggacctat
aaatgtacttgtccccagggatacactggtctgaactgtcagagccttgtgcggtggtgt
gattcagctccctgcaagaatggaggcaaatgctggcaaacaaataacctgtaccgctgt
gagtgcgacagtgggtggactggtctctactgtgacatccccaatgtttcctgtgaagtg
gctgctagacagcaggatgttgacatcacaaatctctgtaggaactccggtttctgcgtg
gacactggtaacactcactactgccgctgctcggtgggatacactggcagttactgtgaa
gagcaagttgatgagtgctctccaagcccctgtcagaacggagccacatgcacagactat
ctgggaggctactcctgtgagtgcgttcctggctatcatggtgttaactgctcagaagaa
atcaacgagtgcctgtctcacccttgccagaatggagggacctgtatcgatctcattaat
acctacaaatgctcctgccccaggggaacccaaggtgttcactgtgaaatcaacattgat
gactgcactccatttttcgatacggtcagtctggagcctaagtgttttaacaatgggaag
tgtaccgataaagtgggcggctacagctgcatctgccctcctggctttgtgggcgagcgc
tgtgagggggacgtcaatgagtgcctatcaaacccctgtgacacccagggggctcagaac
tgcattcagctggtgaatgactacaggtgtgaatgcatgcaaggatatacaggtcgccac
tgtgaatctgttgtggatggttgtaaaggaagaccttgcaggaatggtggcacgtgttca
attgctagcaacactgggcgtggctttatctgcaagtgccttcctggctttgatggcgcg
tcttgtgagtatgattcacgcgcgtgtgggaacctgcgctgtctgaatggtggaacatgc
atctctgtgcacaagacctcaaagtgcatatgcccagctgcgtttatgggactcgaatgc
cagcaccctgtaaacagcccatgcaattccagcccatgctacaacggtggcacttgccag
cccagctctgaagctcccttctaccactgtctctgcccaatcaatttcaatggcctcttc
tgccacatcctggactacaaattctatggaggaatagggcagaacatcaccccacccaaa
aatgaggagcactgcgagaatgcggtgtgtgaagagtatgctggcaacaagatctgcgac
agcaaatgcaacaaccacgcttgcggctgggatggaggggactgctctcttgatttctat
gatccctggaagaactgcacagattctctgcaatgctggacgtatttcagtaatggaaaa
tgtgattcccagtgtaacaatgctgggtgtctctacgatgggtttgactgtcagaaagtg
gaagtccagtgcaaccctctctatgaccagtactgcaaagaccactttcaggatggccac
tgcgaccagggctgtaacaatgctgagtgtgaatgggatggcttggactgcgctaacaac
atgccaaagaacctggcagacggcaccttggttctggtagtgctcttgtccccagaaaag
ctgaaaaacaactccttgaattttttgcgagagctcagccgtgttctgcacaccaatgtg
gtgttcaggaagaacgccaagggagaatacatgatcttcccttactacggcaacaaagaa
gaactgaagaagcaccgtacgaagaggtcaacggaagactggtctaatgtgcccggcgct
gtctttgaaaaggtgacgagctcactcttttcctctgttggcgggagacggcgccgtgaa
ctggatgagatggaagtcaaagggtcgattgtacatctggaaattgataatcgccagtgc
ctccactcctcttcccagtgcttccagagtgcaacagatgtggctgctttcttgggcgct
ctggcttcaagggggaccctgaacatcccctacagaatagaagctgtcaaaagtgagacg
aaggacccagataaggcttctcagatctatttcgtgtatgtggggctggcgtttctgctt
gtgctaggtttcagtttggtgggcgtcctgtttcgcaagcgaaggagggagcatgggcaa
ctttggctccccgatggcttcaagatgacagagtccagcaaaaagaaaaggcgggaacca
cttggggaggattcagttggtctgaaacctctgaaaaattctaccgatggctccttaatg
gatgacaaccaaaatgaatggggtgatgaggaaaccctggacagcaagagattccagttt
gaggagcaggtgatgttgccagagctagatgaccagactgaccatagacagtggactcaa
cagcacttggatgctgctgaccttcgaaatgcatccatggcaccgaccccacctcaggga
gaaatagatgcagattgcatggatgtcaacgtccgagggcctgatgggttcaccccactc
atgattgcatcatgcagtggaggaggactggaaactgccaacagtgaagaagaggaggat
gcctctgccaatgtgatttctgatttcatctaccagggtgccagcctgcacaaccaaacg
gaccgcacaggcgagacagcactgcatctggcagcacggtatgcccgttcagatgcagct
aagcgcctgctggagtccagcgctgatgccaacatccaagaccacatggggcggacgcca
ctccatgctgcagtagccgccgatgcccagggtgtttttcagattctaattaggaaccga
gccacggacctggatgcccgtatgcatgacgggacaaccccattgattctggcagctcgc
ttggcagtggagggtatggtagaagagctgattaactgccatgcagatgtcaatgctgtt
gatgaactaggtaaatctgctttgcattgggcagctgccgtcaataatgttgatgctgcc
attgtgctgctgaagaatggtgcaaataaagacatgcaagataataaggatgaaacacca
ctgttccttgcagccagggaagggagctgtgaaaccatcaaagttcttctagaccatttt
gcaaatcgtgacatcacggatcatatggacaggctgcctcgtgacatcgctcaagagcgc
atgcaccatgacattgtgcagttgttggatagctacaacctggtgcgaagtccaccaatg
agcaatggtgctcttggagcaccaactctctctccccctatctgctctcccaatggttac
ttgggtaacatgaaacctgcagtccaggggaagaaagcaagaaagccaagcacaaaaggt
ctgggatgcaatggcaaagattccaaagacatgaaggcaaggagaaaaaaatctcaggat
gggaaaggtggccttttagatagcgctaatgtattatcaccagtggattcactggagtca
cctcatgggtacatgtcagatattgcatcacctccactgatgacttcaccatttcagcaa
tccccctcaatgcctatgaatcatctcccaggcatggctgatgctcatatcagcctaaat
caccttaacctggctagtaaacaagatatgggaatgggaggttccaacagaatgggcttt
gaatcaattcttccacgtctttcccatcttcctgtatcaagtcccaacacaatattgagc
agtgggtctatgaattttacaatgggtggaacttcaaatatgaatggtcagtgtgactgg
ttatcaagattgcaaaatggaatggtgcaaaatcaatataatccagtgaggaataatata
caacaagggtcccaccagtcaacccaagctctccagcatggtatgatgacatcactacac
aatggtttgcccacaacaactttatctcagttgatgagctatcaagccatacctaccaca
aggctggccaacccacctcatttaatacaggctcatcaactacagcaaattcaacaacaa
aatctgcagcagcagctacaacagcaaagcctgcaacaacagcatcacatctccaatacc
actactaatggtcacattaatcaaccattttgcaacagtgatataagccagtcagacctg
caacagagtatgtcagttcacacagttttgcctcaagatccccagattctgacaactcta
ccaacatcactcacgcaatctattccaacaacccaatttttaactccaccgtctcagcat
ggttactcttcccctatggacaatacacctaaccatcaactgcaggttccagaccaccct
ttcttgactccatcccctgagtcacctgaccagtggtcaagctcctcccctcattccaac
atgtctgattggtcagaaggtatatctagtcccccaacaagtatacaggcacaaatgggg
cacattccagaagcattcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
