Homarus americanus (American lobster): 121864256
Help
Entry
121864256 CDS
T07477
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: neurogenic locus Notch protein-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
hame
Homarus americanus (American lobster)
Pathway
hame04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hame00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
121864256
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
Ank
EGF_3
EGF_2
Notch
Ank_4
Ank_3
Ank_5
NODP
NOD
cEGF
DL-JAG_EGF-like
KH_7
DUF2970
RR_TM4-6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121864256
NCBI-ProteinID:
XP_042219268
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2516 aa
AA seq
DB search
MVSNEMLLSRKMHVHSGILLWTLCLLTSSHGFLSCSPNPCKNSGTCVSNSGAESSCECTD
EYVGEYCQYLNPCRNGPGPRCQNGGTCNVILSISGPKFNCSCPVGYQASLCEIAVANACD
SDPCMNGATCQLLTLDTYRCQCPSGYRGDQCQKVDYCASKPCRNGATCHSPGNTFTCTCP
PGFTGTTCTSDVNECLSRPCRHGTCSNTFGSYTCTCEVGYTGVNCESRYVPCKPSPCNNG
GTCNAMDSLSYECRCPEGFTGRNCEVNIDDCHNNICQNGATCVDRVNTYTCDCPSTFTGP
YCTEDVDECAMRPTICKNGATCTNTQGGFSCICVNGWTGDDCSENIDDCTGAACFNGATC
IDRVGSFLCQCTPGKTGLLCHLDDACASNPCHPGSMCDTSPIDGGYICTCPPGYKGIDCT
QDIDECQEGLPCEHNGTCVNTPGSFRCDCSKGFTGPRCEININECESNPCHNQGTCLDER
GAFRCVCMPGYTGQHCEEDVDECASHPCHNNGICSDLINEYRCSCTQGFTGRQCHINIDD
CASEPCHHGGTCVDRVAGYNCRCSPGFTGTNCETNIDDCLSSPCRHGSCVDGDNSFTCMC
HPGYTGLLCQTEIDECMSTPCQHGGACKNLINSYKCICPNGTAGGNCEYNINECFSNPCR
HGAKCKDGINEYRCECEPGFTGRFCETNIDDCLSQPCANGGVCIDQVDGFRCQCPSGYYD
ARCLSNVNECASDPCLNGGSCYDDVNRFNCKCPPGYTGHRCEHEIDECQSNPCQHGGTCH
DALNAYTCLCPPGYSGRNCESNIDDCRSRPCRNGGSCIDLVNSYKCVCELPHTGQNCEVR
MDPCSPNKCRHDARCTPTANFLDFTCECELGYTGRLCDEDINECNVSPSPCKNGATCQNT
NGSYSCQCSVGYEGRQCTINTNDCALQPCLNGGTCLDEIGKYTCLCVDGFGGTNCQHDLN
ECDSNPCQNGATCNDYVNSYTCSCPLGFSGTNCGINDEDCTETSCMNNGTCIDSINNYTC
ECLSGFTGSHCQHRINECHSNPCKNGGTCNDHVGFSTCHCLYGYTGQRCERIVDWCSASP
CFNNGVCKQTENRYKCECPRGWTGLLCDVEMVSCATAAASKGVIPSKLCLHNGKCQDIGN
THRCECDVGYTGSYCQHEIKECDSQPCMNGATCNDHIGTYSCSCRPGFQGPNCEYNVDDC
KPNNPCQNGGVCHDQVNGFQCSCPHGTLGKLCEINTYDCYEGACHNDGECIDKVGGFECR
CKPGYVGARCEGDVNECLSFPCVKEGTADCVQLVNNYRCNCWPGFMGRHCESKRDFCAES
PCQNGGVCSNTDGDYSCHCPEGFTGKSCEFPSDNCASNPCGPGETCRPYERGIECVPKRL
QSSYCTPNPCTHNGRCLDNISYYECHCPPLWNGKRCEVKDHNFKGGIGRATEAGSNITLE
REKCELYRCHEKKNNMRCDPECSSIACDYDGYECSLGRNPWAFCQADIDCWHVFGDGVCN
TQCNNAGCLFDGLDCQNPVGTCNPIYDAYCATNYENGHCDQGCNNAECGWDGLDCEMKPP
SLMSEGLQIVFNTNEADFRANKKTFVRKLSSSLRMHLVIKRDQSGEEMIYPFDRDGIQGL
LVYFEIDKRRCTIEDQCFDSVTDIANFLAANKLRLGSDVGIPITGVIVEPHPNPPPGYTY
VIVGIVFTMVLVGIIFMVVTNNRKRSRGITWFPEGFFPKYNTNSSASADPTRRKPDGQEM
HSFNKGASVHHLTDIGDTDGMSRGLPMPGPLGDWSDDDSEHPPSKRSRHEAGYSDQTHLT
DYDDANDPRVWTQQHLDAADIKNPDLLALTPPQVEPEEQRGIAGEVDPKGPMGLTPLMIA
SFRGGGLESHTDEDDKDGSAAVIQELIEQGAKLNAKMDRTGETSLHLAARYARADAAKRL
LDAKADANAQDATGRSPLHAAVAADAQGVFQILLRNRSTDLNAKTNDGTTPLILAARLAI
EGMVEDLINADADINAADDSGKTALHWAASVNNVEAVQILLTHGANRDAQNNRDETALFL
AAREGSFEACKVLLDHFANRDITDNMERLPEDVANERLHHDIVRLXCEHHPRSPQMAQVV
TTSHLVAHQHNQQPQNTILSQQMTPQPAQRTNTQPKAKARRPXSSVMSLPGGSINTPVSP
DGTSSIKRSASVKKKREANGVPSVESQTQSSPLNSLGSPHGVFXAATSPFETGLFTGGMS
GLNPHFTEVGVTQPPPYEDCVKAAVSMSNLPQMGDHDNNPFSYSNMMGNHQHQHPQGHVI
HQRQQSMPASFSPQSQTMSPPHHMTPPNSSPQHVQSPHTSGLVTSPGKMRPALPTSPTHM
AALRHATATSGFEFPSGSAASYTLQGQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
QQQQQQQQQPHQGSSGFYPHYPTPPSQHSGVEATPQHSVAPTTHDAFPTPSPESPGQWSS
ASPRSQSDWSEGVRSPLGPPGIPPHHQIFPVGQQQQQQQQGPPQPLGLPSQGSIYI
NT seq
7551 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtatctaacgaaatgttactctctcgcaagatgcacgtgcactcggggatactcttg
tggacgctgtgtctccttacatcctctcatggttttttatcgtgctccccgaacccgtgc
aaaaacagtggtacttgcgtctccaactccggagccgagtcctcgtgcgagtgcacggac
gagtatgtgggcgagtattgccagtacctgaacccgtgtcggaatggcccgggcccgcgc
tgccagaacggcggcacctgcaacgtgatcctctccatttccggccccaaattcaactgc
agctgtccagtgggttatcaggcctctctgtgtgagatcgctgtagccaacgcctgcgac
tcagacccttgtatgaatggtgccacctgccagctgcttaccctcgacacctaccgatgt
cagtgtccttctgggtaccgcggcgatcagtgtcagaaggtggattactgtgcctccaag
ccctgtcgcaacggtgctacctgtcactccccgggaaacacctttacttgtacctgccca
ccgggcttcaccggtaccacctgtacttcagatgttaacgaatgcctttcccgtccctgc
agacatggcacctgcagcaatacctttgggtcgtacacatgcacatgtgaggtggggtac
acgggcgtcaactgtgagagtcgctacgtgccatgcaagccctcgccctgcaacaacggt
ggcacctgcaatgccatggactccctctcctacgagtgtcgatgtcccgaagggttcaca
ggacgaaactgtgaagtgaatattgatgattgtcacaacaacatatgtcagaacggtgcc
acttgtgtggaccgagtgaacacatatacttgtgactgtccatccaccttcactggccct
tactgcacggaggatgtggacgagtgtgccatgagaccaactatctgtaagaatggagcg
acatgcacaaacacccagggtgggttctcatgcatctgtgttaatggttggacaggggat
gattgctctgagaacattgacgactgcacaggtgctgcctgcttcaatggtgccacctgt
atagaccgtgttggctccttcctctgtcagtgcactccagggaagactggactgctatgc
catcttgacgatgcatgtgccagcaacccttgccacccaggctctatgtgcgacacgtca
cccatcgatggtggctacatttgcacttgcccacctggttacaagggcattgactgcaca
caggatatagatgagtgtcaggagggcctcccctgtgaacacaatggcacctgtgtcaac
acacctggatccttcaggtgtgattgctccaagggattcactggtccaaggtgtgagatc
aacatcaacgaatgtgagagtaatccatgtcataaccagggcacttgtctggatgagcgt
ggcgccttccgttgtgtgtgcatgccaggatatactgggcagcactgtgaagaagatgtc
gatgagtgtgcctcacacccatgccacaataatggaatatgcagtgacctcataaatgaa
tatcgatgcagctgtacacagggtttcactggacgacagtgccacatcaacattgatgat
tgtgcatccgagccatgtcatcatggtggtacatgtgtggaccgtgtggctggatacaac
tgtcgctgtagtcctggatttaccgggacgaactgtgagactaacattgatgattgcctc
tcatcaccttgtcgccatgggtcttgtgttgatggagataactccttcacctgtatgtgt
catcccggttacactggtttactttgtcagacagaaattgacgagtgtatgtcaactcca
tgccaacatggaggcgcctgtaagaatctcatcaatagttacaagtgcatttgccccaat
ggcactgctggtggtaactgtgaatacaatattaacgaatgttttagtaatccatgtcgc
catggtgccaagtgcaaagatggtatcaacgaatacagatgtgagtgtgaaccaggattc
actggaagattctgtgagactaatattgatgactgtttgtctcaaccctgtgccaatggt
ggtgtttgtatagatcaagtggatggttttcgctgtcagtgcccttctggttactatgat
gcccgatgcctttcaaatgtaaatgaatgtgccagtgacccctgtctgaatggtggttcc
tgttatgatgatgtcaacagattcaattgtaaatgccctccaggatatactggccaccgt
tgtgaacatgagattgatgaatgtcagtctaatccatgccaacatggcggcacttgtcat
gatgcccttaatgcttatacatgcttatgtcctcctggttactctggtcgcaactgtgaa
tcaaatattgatgactgccgaagtcgaccttgcaggaatggtggctcttgtattgattta
gtcaattcttacaagtgtgtatgtgagcttcctcacactggacagaactgtgaagttcga
atggatccttgctcacctaacaagtgtcgacatgatgcccgttgtacaccaacagcaaat
tttctggattttacttgtgagtgcgaattaggctacacaggccgtctctgtgatgaggat
ataaatgagtgcaatgtatcaccttcaccatgcaaaaatggtgctacttgccaaaataca
aatggatcatattcatgtcagtgttctgttgggtatgaaggccgtcagtgtaccattaac
acaaatgactgtgcattacaaccatgtcttaatggtggaacttgtcttgatgaaattgga
aaatatacttgtttatgtgttgatggttttggaggaaccaactgtcaacatgatctgaac
gaatgtgattcaaacccgtgccaaaatggagctacttgcaatgactatgtaaattcttat
acatgcagttgccctttaggattttcaggaacaaactgtggaattaatgatgaagactgc
actgaaacatcttgtatgaacaatggcacctgtattgatagtataaacaactacacctgt
gagtgtctttcaggatttactggttctcattgtcaacaccgcataaatgaatgtcactca
aatccatgcaaaaatggtggtacttgtaatgatcatgtaggattctctacttgtcattgt
ctttatggctacacaggacagcgatgtgagcgtatagttgactggtgttctgcttcaccc
tgttttaataatggtgtatgcaagcagacagagaatcggtataagtgtgaatgtccacgt
gggtggacaggtttgttgtgcgatgtggagatggtgtcttgtgcaacagcggctgccagt
aaaggtgtcattccttcgaaactttgtcttcacaatggtaaatgtcaagacattggcaat
acccatcgatgtgaatgtgatgttggctatacaggttcctattgccagcatgagattaaa
gaatgtgactcccaaccatgtatgaatggtgcaacttgcaatgatcacataggtacttat
tcctgttcgtgccgcccaggttttcaaggtccaaactgtgaatataatgttgatgactgt
aaaccaaacaacccctgtcaaaatggaggtgtgtgccatgatcaggtgaatggatttcag
tgctcctgcccacatggtactcttggtaaactgtgtgagattaacacctatgactgttat
gaaggtgcttgccataatgatggagaatgcatagataaagtaggtgggtttgaatgtcgc
tgcaaacctggttatgtaggtgcaagatgtgaaggggatgtaaatgagtgtctgtctttc
ccatgtgtgaaagaaggtactgcagattgtgttcaacttgtaaataactatcgatgcaat
tgctggccaggatttatgggacgtcattgtgaaagcaaaagagatttctgtgctgaatca
ccttgtcaaaatggtggagtatgcagcaatactgatggagactattcttgtcattgtcca
gaaggtttcactggcaaatcttgtgagtttccaagtgacaactgtgcttcaaatccctgt
ggtccaggtgaaacatgcaggccatatgaacgaggaattgaatgtgtaccaaaacgtctt
cagtcttcctattgtactccaaatccttgtacacataatggtagatgccttgataatata
tcttattatgaatgccattgtccaccactttggaatgggaaaagatgtgaagtgaaggat
cataactttaaaggtggaattggaagagcaactgaagctggtagtaatattactcttgaa
cgagagaagtgtgaactctatcgctgccatgaaaagaaaaataacatgcgatgtgaccca
gaatgtagtagtattgcttgtgactatgatggatatgaatgctctttgggccgtaatcct
tgggccttttgtcaagctgatattgactgttggcatgtttttggtgatggggtatgtaac
acacagtgcaacaatgctgggtgcctctttgatggtctggattgccagaatcctgtggga
acatgtaatcctatttatgatgcctattgtgcaacaaattatgagaatggccattgtgat
caaggttgtaataatgcagaatgtggatgggatggacttgattgtgaaatgaaaccacct
tcattaatgtcagagggactccagatagttttcaacactaatgaggctgattttcgagcc
aacaagaagacgtttgtaaggaaactaagtagctccttgagaatgcatctagttatcaaa
cgtgatcagtcgggtgaagaaatgatctaccccttcgacagagatggtattcagggtctc
ttggtgtactttgaaattgataaacgtcgatgtacaatagaagaccagtgctttgacagt
gttacagatatagcaaattttttggctgcaaacaagcttcgtttaggaagtgatgttgga
attccaataactggagtcattgtagagcctcatccgaaccctccacctggatacacttat
gttattgttggtattgtatttaccatggtattagttgggatcatcttcatggtagttaca
aacaatcgaaagcggtcgcgaggtatcacctggtttccagagggtttcttccctaaatat
aacacaaattctagtgcaagtgctgatcctacaagaagaaagccagatggccaagagatg
catagtttcaataagggtgcatctgttcatcatctaactgacattggtgatactgatggt
atgagtaggggtttgcccatgccaggtccattaggtgattggtctgatgatgacagtgag
cacccacctagtaaacgttcacgacatgaagctggttattctgaccaaactcatctcact
gactatgatgatgctaatgatcctagagtctggactcaacaacatcttgatgctgcagat
ataaagaatcctgatctgttagcattaaccccacctcaagtagaacctgaagaacagcgt
ggtattgctggagaagtggaccctaaaggacccatgggtcttactccactaatgattgca
tcattccgaggtggtggtttggagagccatactgacgaagatgataaagatggatcagca
gcagtcattcaagaactcattgagcaaggggccaagctaaatgccaagatggatcgcaca
ggagagacctcactacaccttgctgccaggtatgcaagggcagatgctgccaagcgactg
ttagatgctaaagctgatgctaatgctcaggatgcaactggtcgctcaccactacatgct
gcagttgctgctgatgcacaaggtgttttccagatcttgttgcggaaccgatcaacagac
ttgaatgccaaaacaaatgatgggacaacccctctaattcttgcggcgcgacttgctatt
gaagggatggtagaagacctcataaatgccgatgctgacataaatgctgctgatgattca
ggcaaaacagctctgcattgggctgcttctgttaacaatgtagaagctgtacaaatactt
ctcactcatggtgccaaccgtgatgcacagaacaacagggatgaaacagcattgttcctt
gctgctagagagggaagttttgaagcctgtaaagtacttttggaccactttgccaataga
gatataactgataacatggagagacttccagaagatgttgctaatgagagactccaccat
gatatagtacgactcncctgtgaacatcatcctcgttccccccaaatggcacaagtggtt
actacttctcatttggtagcacatcagcacaaccaacaacctcaaaatactatactgtcc
cagcagatgaccccacaacctgctcagaggactaacactcagccaaaagctaaggctaga
aggccgnnttcatcagttatgtcccttccagggggatcaataaatactccagtaagtcct
gatggcacttcatccattaaacgcagtgccagtgtcaagaagaaacgtgaagctaatggg
gtgcccagtgtagagtcccagacacagtcatcacctctcaactccttaggatcaccacat
ggagtgtttnnggctgctacaagcccatttgagacaggtttgtttactggtggcatgagt
ggcctcaatccacactttacagaagtgggagtaacacagcctcctccatatgaagactgt
gtaaaggcagcagtttcaatgagtaaccttccacaaatgggtgatcatgataataatcct
ttcagctactcaaacatgatgggaaatcatcaacatcagcacccacagggtcatgtgatt
caccagaggcagcagtctatgccagcttctttctccccacagagtcaaactatgtctcca
ccacaccacatgactccaccaaattcatctccacagcatgtacagtcaccacatacatca
ggtcttgtaacttctcctggtaagatgcgacctgccttacccacttcaccaacacacatg
gctgcattacggcatgctacagctacatcaggatttgaattcccctccggaagtgctgct
agctatactcttcaaggtcagcaacaacagcagcagcagcagcagcagcagcagcaacaa
caacagcaacaacaacaacaacagcaacaacaacaacaacagcagcagcagcagcaacag
cagcaacaacaacagcagcagcagcaaccacatcaagggagtagtgggttctatccacat
tacccaaccccaccatcacaacactcaggagttgaggcaacaccacagcatagtgttgca
ccaactactcatgatgcatttcctacaccatccccagaatcgccagggcaatggtcatct
gcatcacctagaagccagagtgattggtctgagggagtgaggtcccccttgggccctcca
gggataccccctcatcatcaaattttcccagtgggtcagcaacaacaacagcaacagcaa
ggtcccccacaacctctgggactaccttcacagggctcaatctacatctag
DBGET
integrated database retrieval system
