Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 101237495
Help
Entry
101237495 CDS
T01080
Name
(RefSeq) transient receptor potential cation channel subfamily A member 1-like isoform X1
KO
K04984
transient receptor potential cation channel subfamily A member 1
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
hmg04040
]
101237495
Ion channels [BR:
hmg04040
]
Voltage-gated cation channels
Transient receptor potential channel (TRP)
101237495
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank
Ank_4
Ank_3
Ank_5
Ion_trans
Cys_rich_VLP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101237495
NCBI-ProteinID:
XP_012565640
UniProt:
A0A8B7E4X3
LinkDB
All DBs
Position
8:40685039..40760179
Genome browser
AA seq
1083 aa
AA seq
DB search
MADNVENPITQISPFNNKNKAEFRGKYNANKSNQLLKIKNGFKTQKNSSMSSISSFLLHQ
AAIEGSIDQVKFLIKECCYNIEDIDCINLQGCTPLHLASRFNRLKVVKYLLENGSQINKT
TEVENNTPLLLAAKYNMTDTAKYLCEHGADVNIKNIHGSTALHLGASKGNEEICNVLIQH
GSDINALDCRNCTPLHMAIHGGSETITKLLIENGADIYAKDAEGEAPIHHAAAMNQGELI
ILLTKGALAIVDEEKWEETQRKYVNLRSDKKDTALHIAAWEGCLDTVKTLVSIGANINIC
SAAHSTPLHLAAINGDKIMVQYLLEHNAKINVFDHQNMTPTHKACQFGRLDVIKVLIEQG
AQIDSKDCDSFTPLMSAVSEGHSDAVEYLLKCGASVAISEMNMKNVLHLAIENGHSSTLK
VLLQNGGFSLINSHDMDFKRPIHYAAIHNFESVEILIKESADTEVTDNEEKTPLHIAAEY
GNCICLVMLIKNSTRNINCTDEKGQSPLHLAAKNGRVGTTSILIEMGAQISGRDDLNWTP
LDYAARNGHSKVVIALIKNGACVNEYDPNRLTPLHHASINGHVKCINILLDHGADISFQN
ADGKNCLDLALENHHTEACKIFVTHKRWKEVLNHIDNEGYSPMEKLISYAPEIALIVLDK
CIEYSKLDENSKGYYIRYDFKYLDSQPENSSKRVYFGPSCMITYKRKNLLSHPLTVQLIN
YKWSRLGRWIHLISLFIYIFFVGMLTGLLAIDKEREKQEEKNAFQIIIPKVILILSSFEI
CKEFVQAYLLKKEYFKDFNNYLELILYTSTFIYMLSFINYVTMNIKWTAGVFSILFAWTN
LLLYLKRDTFFGVYVVMIIEVLKSLINVIMVFVMIIIAFSLSFFVLFENSSFSSPEWSMV
KTIVMTLGETDFNDLFINNNTTVDNSDLPYPEMSYILFTLFLIVCPIVLMNLLVGLAVGN
IADVRDSAYIIMLKAQVDILKALESRCPKKLLKKTYHEILTVYPNTVSWKKSFFQSFGIS
DFNSLKDKQKSRFKWKTNIARNLELEHIEINRLKKKIETIKMLVREHYEITEDIIIALKI
DEN
NT seq
3252 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagataatgttgaaaacccaattactcagatttcaccatttaataacaaaaataaa
gcagaattcagaggcaaatataatgccaataaatcaaatcaacttttaaaaattaaaaat
ggttttaaaactcaaaagaacagctcaatgagtagcatctcatcttttttactccatcaa
gctgcaatagagggttcaattgatcaagttaaatttcttattaaagaatgttgttataac
attgaagacattgattgcataaacttgcaaggttgcactccattgcatttagcatctcga
tttaatagattaaaagttgttaaatatttattagaaaatggatcacagataaataaaact
acagaagtagaaaataatacgccacttcttcttgctgcaaaatataatatgacagatact
gcaaagtatttatgtgaacatggtgcagatgtcaacataaaaaatattcatggttctact
gctcttcatttaggagctagtaaaggaaatgaagaaatttgcaatgttttgattcaacat
ggttctgatataaatgctctagactgcagaaattgcacaccacttcatatggcaattcat
ggaggcagtgaaactataacaaagttgcttatagagaatggtgcagatatttatgcaaaa
gatgctgaaggggaggcacctattcatcatgccgctgctatgaatcaaggagaactaatt
attttactaacaaaaggagctcttgcaatagttgatgaagaaaaatgggaagagacacaa
agaaagtatgtaaatctaagaagtgataaaaaagatactgcgcttcacattgctgcttgg
gaaggttgtttagatactgtaaagaccttggtgtctattggtgccaatataaatatttgt
tctgctgcacattctacaccattgcaccttgcagcaatcaatggtgataaaattatggtt
caatatctgttagaacataatgccaaaataaatgtgtttgatcaccaaaatatgactcct
acacataaggcatgtcagtttggcagattagatgtaataaaagtgttgattgaacaagga
gcacaaattgattctaaagattgtgattcttttactccacttatgtcagctgtttcagaa
ggtcacagtgatgctgttgaatatttgttgaaatgcggagcaagtgtggccataagtgaa
atgaatatgaaaaatgttcttcatttagcaatagaaaatggtcatagttcaacactaaag
gtccttttacaaaatggagggttttctttaattaattcacatgatatggactttaaaaga
ccaatccattatgctgctatacataattttgagtcagtcgaaatacttattaaggaatca
gctgatactgaagttactgataatgaagaaaaaactccattgcatattgcagctgagtat
ggaaattgtatttgtttggtaatgttaatcaaaaactcaacaagaaacataaattgtact
gatgagaaaggacagtcacctttgcatctagctgcaaaaaatggccgggtaggtactacg
tcgattctaattgaaatgggtgctcaaatttcaggacgagatgatttaaactggacacca
cttgactatgctgcaagaaatggacattcaaaagttgtgatagctcttattaaaaatggt
gcttgtgtaaatgaatatgatccaaacagactaactcctcttcaccatgcctctattaat
ggacatgtcaagtgtataaatattttattggatcatggtgcagacatatcattccagaat
gcagatggaaaaaattgtcttgatctagctttagaaaatcatcatacagaagcttgcaag
atatttgtcacacacaaaagatggaaagaggtactcaaccatattgataatgaaggatat
agtccgatggaaaagttgatatcatatgctcctgagattgctctaattgttctagacaag
tgcatagaatactctaaacttgatgaaaattctaaaggatactacataagatatgacttt
aaatatcttgattctcaacctgaaaactcatcaaaaagagtttattttggaccttcgtgt
atgatcacatataagagaaaaaacttactttctcatccacttactgttcaattaattaat
tataaatggtcacgcctaggtcgctggattcatttaatcagcttgtttatttatatcttt
tttgtgggtatgcttactggtttactggccattgataaagaaagagagaaacaagaagaa
aaaaatgcatttcaaataataatccctaaagtgatacttattctgtcaagttttgaaatt
tgtaaagagtttgtacaggcttacttgttgaagaaagaatattttaaagactttaacaat
tacttggagttaatactttacacatctacttttatatatatgttatcatttattaattat
gtcactatgaatataaaatggactgctggagtattttcaattttatttgcttggactaat
ttgttactttacttaaaacgagatacattttttggagtttatgttgttatgattattgaa
gttttaaaatcgttgattaatgttattatggtatttgtgatgatcattatagcattctct
ttatcattttttgttctttttgaaaattcatctttttcctctcctgaatggtctatggta
aaaaccattgtcatgacacttggggagactgattttaatgacttattcataaataacaat
actacagttgataatagtgatttgccatacccagaaatgtcatatattttgttcacattg
tttttgattgtttgccctatagtacttatgaacttgttagttggtttagctgtaggtaat
atagctgatgttagagattcagcttacattattatgttgaaagctcaggttgatattcta
aaagcacttgagtcaagatgtcctaaaaaattgctgaaaaaaacttatcacgaaatactt
actgtttaccctaacactgtttcctggaaaaaaagtttttttcaatcgtttggtatttct
gacttcaattccttaaaagataagcagaaaagtagattcaaatggaaaacaaacattgca
agaaatttagaattagaacatattgagattaatcgcctaaaaaaaaaaatagaaacaata
aaaatgttggtgagagagcattatgagataacagaagatataattattgctctgaagatt
gacgaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system