Leptopilina boulardi: 127290161
Help
Entry
127290161 CDS
T08910
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1
KO
K02999
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
lbd
Leptopilina boulardi
Pathway
lbd03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbd00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
127290161
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
lbd03021
]
127290161
Enzymes [BR:
lbd01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
127290161
Transcription machinery [BR:
lbd03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
127290161
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127290161
NCBI-ProteinID:
XP_051174534
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1743 aa
AA seq
DB search
MSGYKLAARKAARHLNPKKVIFSFLTEEEIRKLSVAKIYKPYPFNEVNHPEKGGLYDPAL
GPLHDDSDPCATCGLAILQCDGHFGHIDLPLIVVNPLCHKILYTILRLTCRQCFSLQFHI
HEKLLIVAKLKLLEEGFFSDIIELEQEVNSSLIDIKLKGNDCIYTYVEDIIKSYIQNLYN
RERYKNNLKSNENINDINTKNYNQEFQLHIDKIMKNCKLPKNCIYCNETFLKVTTSGNKL
MTPKINHVGPLNKDKIVPILPDQSKEYLRKLWKNEKEVLKVIVPALKLIKMEYPTDIFFN
NVILVLPTIFRPISMLNGQMVEHPRTQVYKIIIQNCLILRKIIHDLKMESTQNENIEMEI
ENNGRRSNSRVRDNINEETLQLLKKVKGASLIEKLHNSWQDLQINVNHLVDRDMNRTVDS
ASCLGLKQILEKKEGIIRMHMMGKRVNYAARTVITPDPNLDIDEIGIPEEFALKLTYPVP
VTHWNVHEIKQMVINGPDVHPGAVLIQNEDGTIKKISGDSLAQREGIAKTLMTKCSRTNK
FYDGVKIVHRHLQNGDMLLLNRQPTLHKPSIMAHRARILKAEKTLRLHYANCKAYNADFD
GDEMNAHFPQNEVARAEAKLIANVANQYLVPKDGTPLSGLIQDHIISGVRLTMRGQFFNK
EEYQHLTFAALWSLPGDFILLPPSILKPKVLWSGKQVISTIIINLIPKGKARINLTGKAK
IGNKEWTIEEPRKPKCGELEKNSNTMSEAEVIIRNGELLCGVLDKAHYGATTFGLIHCVY
ELYGGNCSTKMLSAFGKLFQTHLLQTGFTLGVKDIFLTAKADKKRKKIMKECRKIGEEIQ
RTAVEYSNDTPREKIVKKIESELATNPRFRTLLDRKYKTALDNYTNEINKICLPQGLIEK
FPKNNLQLMVQSGAKGSTVNTMQISCLLGQIELEGKRPPLMISGKSLPSFAAYDPSPRAG
GFIDGRFMTGIEPQEFFFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGVCVHYDSTVR
DSDGSVIQFYYGEDGLDISASKFLTHEQLNFLYENRAAIMDNDLMEHLKLNKNPKIEKDE
KKLKKWQTKYGSLLKKHRTSAFTEFSADNLNENSSKRNQIDPSSGRTKASLSLMRKWIRA
NDDVKKHYAERAKKCPDPLNSKYRQHMEFGVYSENIDKMIDDYFVKRKNMNKIENIKNNE
LKDEKEEELKKEKNELKDLISMKFMNSLCPPGEAVGLLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGR
GEMNVTLGIPRLREILMMASKKIKTPSMEIPFKNNIKQLKRKVNILRRKLTKCVLGDILE
NIDVNGFISYEPTRQLIYTIKLNFLPRKYYRYEYHITPEEILDKTEKQFFKELFREIKKA
GKISGISFYVEEIKNRDRRENARLDGDYDDDNNDGEESERQKTKTRLNDGEMHESSDEEE
IGGEVDATVERSTARHRENQEYDDPDDDEEREMENEDNGENEENLRNNVSLNNNDNVDVD
DDDDDDDNEERGQIDRKLKVANSYPNAISYDYDEEKGEWCSLTFSLPLKMYKLDLQSLLK
TAANKVILWETPNIKKAFTFQNQEGETILKTDGINIIEMFKYADILQLDRLYSNDIYGIS
QTYGIEAANRVIVKEVKDVFKMYGITVDTRHLSLIADYMTFDGSYQPMSRKGMEFSASPL
QQMTFESSLQFLKNATLQGKIDDLRSPSSRLMLGQPIRIGTGMIDVMFDLSKVLESQRKS
EAW
NT seq
5232 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaggatataaattggcagcacgcaaagccgcgaggcatttaaatccaaaaaaggtg
attttttcatttctcaccgaggaggaaattcgaaaattaagtgttgcaaaaatttacaaa
ccttatccatttaatgaagtaaatcatccggaaaaaggtggactttacgatccggcactt
ggacctttacacgatgactcggatccatgtgcaacatgtggtcttgcaatacttcaatgt
gatggacattttggtcatattgatttaccattaattgttgttaatccattgtgtcataaa
attttatacacaatattacgtttaacatgtcgacaatgttttagtttacaatttcatata
catgaaaaattattgattgttgcaaaattaaaattacttgaggagggcttttttagtgat
attattgaacttgaacaagaagttaattcatcattaattgatattaaattaaaaggcaac
gattgtatttatacatatgttgaggatattattaaaagttatatacaaaatttatataat
cgtgaaagatataaaaataatttaaaatcaaatgaaaatattaatgatattaatacaaaa
aattataatcaagaatttcaattgcatattgataaaataatgaaaaattgtaaattacca
aaaaattgtatttattgtaatgaaacatttttaaaagtaacaacaagtggaaacaaactc
atgacgcctaaaataaatcatgtgggcccattaaataaagataaaattgtgccaatttta
cctgatcaatcaaaagaatatttacgtaaattatggaaaaatgaaaaggaagtattaaaa
gtaattgtaccggcattgaaattaattaaaatggaatatccaacggatattttttttaat
aatgtaatattggtattgccaacaatttttcgtccaataagtatgttaaatggacaaatg
gttgaacatccacgtacacaagtttataaaataataatacaaaattgtttaatattgaga
aaaataattcacgatttaaaaatggaatcaacacaaaatgaaaatattgaaatggaaatt
gagaataatggaagaagaagtaattcacgtgttcgtgataatatcaatgaagaaactttg
caactattgaaaaaagtaaagggtgcaagtttaatagaaaaattacacaattcatggcag
gatttacaaataaatgtaaatcatttggttgatcgggacatgaatcgtacagttgattcg
gcgtcttgtcttggtttaaaacaaattttagaaaaaaaagaaggaattataagaatgcat
atgatgggaaaacgtgttaattatgcagcaagaacagtaataactcccgatccaaattta
gatatcgatgaaattggaatacctgaggaatttgcattgaaattaacgtatccagttcca
gtgacacattggaatgttcatgaaattaaacaaatggttattaatggacccgacgtacat
cctggagctgttttaattcaaaatgaagatggaacgataaaaaaaattagtggcgattca
ttggcgcaacgtgagggtattgcaaaaactttaatgacaaaatgttcgcgtacaaataaa
ttttatgatggtgtaaaaattgtacatcgacatttacaaaatggcgatatgttactttta
aatcgtcagccaacgcttcataaaccaagtattatggcgcatagagcaagaattttaaaa
gctgaaaaaacattacgattacattatgctaattgtaaggcgtataatgcagattttgat
ggcgatgaaatgaatgcacattttccacagaatgaagttgcacgcgccgaggcaaaattg
attgcaaatgttgcaaatcaatatttagtaccaaaggacggaacaccattgagtggatta
attcaggatcatattatttccggtgtacgattaacaatgcgaggacaatttttcaataaa
gaggaatatcaacatttaacatttgctgcactttggtcattgcctggtgattttattctt
ctaccgccgtcaattttaaaaccaaaagtcctttggtctggtaaacaagtgatatcaacg
attattattaatttaataccaaagggtaaggcgagaataaatttaacgggtaaggcaaaa
attggcaataaagaatggacaattgaagagccacgtaaaccaaaatgtggtgaattagaa
aaaaattcaaatacaatgtccgaagcggaagttattatacgtaatggtgaattactttgt
ggcgttttggataaggcacattatggcgctacaacatttggcctaattcattgtgtttac
gagctctacggtggaaattgttcgacaaaaatgttaagcgcttttggaaaattatttcaa
actcatcttttacaaacgggtttcactttaggtgttaaggacatttttttaacagccaaa
gccgataaaaaacgaaagaaaatcatgaaagaatgccgtaagattggagaggaaattcaa
agaacagccgttgaatattcaaatgatacgccacgtgagaaaatagtgaaaaaaattgaa
tctgaattggcaacaaatccacgttttcgtacattacttgatcgtaaatataaaacggca
ttggataattatacaaatgaaataaataaaatatgtttgccgcagggtttaattgaaaaa
tttccaaaaaataatttacaattaatggtacaatcgggtgcaaaaggttcaactgtgaat
acaatgcaaatatcatgtcttttgggacaaattgaattggaaggtaaacgaccgccttta
atgattagtggcaaaagtttaccatcatttgccgcttatgatccatcaccacgtgctggt
ggttttattgatggacgttttatgacgggcattgaaccgcaggaatttttttttcattgt
atggccggtagagagggtttaattgatacagcagtgaaaacaagtcgttcgggatattta
caaagatgtcttattaaacatcttgagggtgtttgcgttcattatgattcaacggtaaga
gactcagacggtagtgtaatacaattttattacggtgaggatggtcttgatatttcagca
tcaaaatttctcacacatgagcaattaaattttctctatgaaaatcgtgcggcaataatg
gataatgatttaatggaacatttgaaattaaataaaaatcccaaaattgagaaagatgag
aaaaaattgaaaaaatggcaaacaaaatatggttcattattaaaaaaacatcgtacatcg
gcatttactgaattttcagctgataatctcaatgaaaatagttcaaaacgtaatcaaatt
gatcccagtagtggacgtacaaaagcatcattatcattaatgagaaaatggataagagca
aatgatgatgtgaaaaaacattatgccgagagggcaaaaaaatgtcccgatccattaaat
tcaaaatatcgtcaacatatggaatttggcgtttattcagagaatattgataaaatgatt
gatgattattttgtaaaaagaaaaaacatgaataaaattgaaaatattaaaaataatgaa
ttaaaagatgaaaaagaagaggaattaaaaaaagaaaaaaatgaattaaaagatttaata
tcaatgaaatttatgaattcattatgtccacctggtgaagctgttggtttattggcagct
caatcaattggcgaaccatcaacacaaatgacattaaatacatttcattttgctggacgt
ggtgaaatgaatgtaacacttggtattccacgtttacgtgaaattttaatgatggcatca
aaaaaaattaaaaccccatcaatggaaataccatttaaaaataatattaaacaattaaaa
cgtaaagttaatattttaaggagaaaattaacaaaatgtgtattaggtgatattttagaa
aatattgatgttaatggatttatttcatatgagccaacaagacaattgatttatacaata
aaattaaattttctaccacgtaaatattatcgttatgaatatcatataacgcctgaggaa
atattagataaaacggagaaacaattttttaaagaattatttcgtgaaattaaaaaagct
ggtaaaataagtggtatttcattttatgttgaggaaataaaaaatcgtgatcgaagagaa
aatgcacgactcgatggtgattatgatgatgataataatgatggagaggagagtgagaga
cagaaaacaaaaacaagattaaatgatggcgaaatgcatgaatcgtctgatgaggaagaa
attggaggtgaagtggatgcaactgttgaaagatcaacggcacgtcatagggaaaatcag
gaatatgatgatcctgatgatgatgaggagagggaaatggaaaatgaggataatggagaa
aatgaggagaatttgagaaataatgtcagtttaaataataatgataatgttgatgttgat
gatgatgatgatgatgatgataatgaggaacgtggacaaattgatagaaaattgaaagtt
gcaaattcatatccaaatgcaatttcttatgattatgatgaggagaaaggtgaatggtgc
agtttaacattttcgcttccgctaaaaatgtacaaactagatcttcagtcgcttttaaaa
accgcagcgaataaagtaattttatgggagactccaaatattaaaaaagcattcactttt
caaaatcaagaaggtgaaacaattctcaaaacggatggaatcaatatcattgaaatgttc
aaatatgcggatattttacaattggatagactttattcgaatgatatttatggaatttca
caaacctatggaattgaagcggcaaatcgtgtaatagtaaaagaagtaaaggatgtcttt
aaaatgtatggaataacggttgatacacgacatttatcattaattgctgattatatgaca
tttgatggaagttatcagccaatgagtcgaaagggaatggaattctctgcatcgccattg
caacaaatgacatttgagagttctttgcaatttctcaaaaatgcaacgctacaaggtaaa
atcgacgatttaagatcgccgtcaagtcgattaatgttgggacaaccaattcgaatagga
actggaatgattgacgtaatgtttgacttgagtaaagtactcgaatcacagagaaaaagt
gaagcttggtaa
DBGET
integrated database retrieval system