Lethenteron reissneri (Far Eastern brook lamprey): 133361118
Help
Entry
133361118 CDS
T09663
Symbol
GRIN1
Name
(RefSeq) glutamate receptor ionotropic, NMDA 1 isoform X1
KO
K05208
glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
Organism
lrj
Lethenteron reissneri (Far Eastern brook lamprey)
Pathway
lrj04020
Calcium signaling pathway
lrj04080
Neuroactive ligand-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lrj00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04020 Calcium signaling pathway
133361118 (GRIN1)
09133 Signaling molecules and interaction
04080 Neuroactive ligand-receptor interaction
133361118 (GRIN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
lrj04040
]
133361118 (GRIN1)
Ion channels [BR:
lrj04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
133361118 (GRIN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lig_chan-Glu_bd
SBP_bac_3
Lig_chan
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
133361118
NCBI-ProteinID:
XP_061435954
LinkDB
All DBs
Position
71:complement(1961752..1975666)
Genome browser
AA seq
539 aa
AA seq
DB search
MLMALMVLRMLLMLRLLVMAILVMVMLLRIMLMTVLTMMMVTMMMVTMMLVTMMMAILVM
VMMLRIMLMTVLTMMMVTMMMVTMIMVTMMMVTMMMAILVMVMMLRIMLMTVLTMMMVTM
MMVTMMLVTMMMAILVMVMMLRIMLMTVLTMMMVTMMMVTMIMVTMMMVTMMMAILVMVM
MLRIMLMTVLTMMMVTMMMVTMMLVTMMMAILVMVMMLRIMLMTVLTMMMVMMMMVTMIM
VTMMMVTMMMAILVMVMMLRIMLMTVLTMMMVTMMMVTMMMAILVMVMMLRIMLMTVLTM
MMVTMMMVTMMMVTMMMAILVMVMLTIIPDRFKMSTKLKIVTIHQEPFVYVKPTLKDGTC
KKELTIFGDTIQKVICMGPNNTLPVRCVAAGRPIVPQCCYGFCVDLLIKLANNLNFTYDV
HLVHDGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLMGQADTIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQ
GLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFRSIPAARPSCVT
NT seq
1620 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgatggcgttgatggtgttgaggatgctgctgatgttgaggttgctggtgatggcg
atactggtgatggtgatgttgttgaggattatgctgatgacggtattaacaatgatgatg
gtgacgatgatgatggtgacaatgatgttggtgacgatgatgatggcgatactggtgatg
gtgatgatgttgaggattatgctgatgacggtattaacaatgatgatggtgacgatgatg
atggtgacgatgataatggtgacgatgatgatggtgacgatgatgatggcgatactggtg
atggtgatgatgttgaggattatgctgatgacggtattaacaatgatgatggtgacgatg
atgatggtgacaatgatgttggtgacgatgatgatggcgatactggtgatggtgatgatg
ttgaggattatgctgatgacggtattaacaatgatgatggtgacgatgatgatggtgacg
atgataatggtgacgatgatgatggtgacgatgatgatggcgatactggtgatggtgatg
atgttgaggattatgctgatgacggtattaacaatgatgatggtgacgatgatgatggtg
acaatgatgttggtgacgatgatgatggcgatactggtgatggtgatgatgttgaggatt
atgctgatgacggtattaacaatgatgatggtgatgatgatgatggtgacgatgataatg
gtgacgatgatgatggtgacgatgatgatggcgatactggtgatggtgatgatgttgagg
attatgctgatgacggtattaacaatgatgatggtgacgatgatgatggtgacgatgatg
atggcgatactggtgatggtgatgatgttgaggattatgctgatgacggtattaacaatg
atgatggtgacgatgatgatggtgacgatgatgatggtgacgatgatgatggcgatactg
gtgatggtgatgttgacgatcatcccagacaggttcaagatgtcgaccaaactcaagatc
gtcacgatccaccaggagccgttcgtctacgtgaagccgacgctgaaggacggcacctgc
aagaaggagctcaccatcttcggcgacaccatccagaaggtcatctgcatggggcccaac
aacacccttccagttcgttgtgtggcggcagggcgtcccatcgtgccgcagtgctgctac
ggcttctgcgtggacctcctcatcaagctggccaacaacctcaacttcacctacgacgtc
cacctcgtgcacgacggaaagttcggcacccaggagagggtaaacaacagcaacaagaag
gagtggaacggcatgatgggggagctgctgatgggccaggcggacaccatcgtggcgccg
ctcaccatcaacaacgagcgggcgcagtacatcgagttctccaagccgttcaagtaccag
ggactcaccatcctcgtcaagaaggagatcccgcgtagcacgctcgactcgttcatgcag
ccgttccagagcacgctgtggctgctcgtgggactctcggtgcacgtggtggccgtcatg
ctctacctgctcgaccgcttcagatccattccagctgcacgtccgtcgtgtgtcacgtga
DBGET
integrated database retrieval system
