KEGG   Mesoplasma chauliocola: CK556_01570
Entry
CK556_01570       CDS       T05062                                 
Name
(GenBank) PolC-type DNA polymerase III
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mchc  Mesoplasma chauliocola
Pathway
mchc03030  DNA replication
mchc03430  Mismatch repair
mchc03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mchc00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    CK556_01570
   03430 Mismatch repair
    CK556_01570
   03440 Homologous recombination
    CK556_01570
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mchc03032]
    CK556_01570
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mchc03400]
    CK556_01570
Enzymes [BR:mchc01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     CK556_01570
DNA replication proteins [BR:mchc03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     CK556_01570
DNA repair and recombination proteins [BR:mchc03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     CK556_01570
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T PHP DNA_pol3_finger DNA_pol3_a_NII HHH_6 RNase_H_2 DNA_pol3_a_NI Pox_D5 Rv2179c-like DEDDh_C tRNA_anti-codon HBB Zn-ribbon_8
Other DBs
NCBI-ProteinID: ASZ09044
UniProt: A0A249SMY1
LinkDB
Position
347762..352243
AA seq 1493 aa
MLDQNILSLFQNLNIKLNEGELSFFEDATIEKKTLSSTKSKFKLYLKIKNFLPTRILHEI
HHKCVNASGIKIKLILNVQQQRIDKEILCEYIEFIKNNKAQNKTVIWNFIHSEDFEFDTD
ENLIKFVVDSKELKNQLVKELEYCLAKLNQFGFKELNYIIDVEDKTEEYIKQSLIIEQQT
KEQYKQFAPEQNDKSQGMFISKQNSQKWNTSLDKPSYASFEDIEEDAQNIVLHGKVLSIE
IRDSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGREDERTIMDPLTEEELSSDRVIEIKEKRVAK
GDWIAVKGKTSYSQYDKEQNFIIDKIAKISRSESMVKDEAEQKRVELHVHTKMSAMDGVS
TIQDYLHTADKWNWRAIAITDHINVQAFPDAYNELKKINKNKADDEKLKLIYGLEMNMIQ
KEDYWIVKNPKGQKIRDSKMVVFDLETTGLSPEMNEIIEFGAVVFDPITGKTTKHDYLFK
PKQPLKQFTMDLTNINEEMLVDKKNIEEDFDKIYELIKDSILIAHNANFDFNFLNNLSKK
LGYGELQNTVIDTLTLSRLVRPALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFF
KIIAELKMSTPIVFDHDLMKLIPENDKENTNLLRSRGLHVNVLAKNQQGLKDIFKLVSIS
HTENFFNSPKIFKEKLKEFKEKNNILIGAGCVNSEVFEIARLNTNNKLEEIIQLYDYVEI
QPLSVYKNLITDNQMEEHELIEVIQKIIKTAKKYNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYIN
AKGLGGSRHPLFSFKNKNKSVDYPDQFMRTTNEMIKEMNWLNDANLVQEMVITNTNKIAD
MIENDIVVIKDGLFTPNIDNVDTLLKNKCYETAHDMYGEVLPEIVEARLEKELNSIIKHG
FAVVYWISHLLVEKSNKDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCAKCKYSDFE
TPVEIKCGYDLPQKDCPKCNSPLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHN
FTKEMFGEGNVFRAGTISTVAEKTAFGYVKAFYEETGILEEEMPRKIEIERQAKLVEGVK
RTTGQHPGGIIILPKEFEIEDFSPVNYPADDASSSWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVD
PTALRMLGDLTGVDPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKPEQINGETTGAIGLPEFGTGFV
RGMLKETKPKSFADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKNDIANISTVIGCRDDIMVYLMGQ
GIDATTSFKIMESVRKGQGVRKEWKEIMLAHNVPEWYIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMA
YRIAWYKIYYPAEYYATFLTNRADAFDLRTFLGGYNGVKEKLTELETRRNKKDKMTTKEL
ALMPVLEIGLEMFSRGIKMANLNFEKSLASKYIIEKDPTTGEATLYPPFLVIDSLGDAVA
DSIIKARSERPLTSVKDLTSRTTITQTQLKIFEELNILDTLAQDEQLEFDFFN
NT seq 4482 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttggatcaaaatattttgagtttatttcaaaatttaaatattaaattaaatgaaggg
gaactttcattttttgaagatgcgacaattgagaagaaaactttaagttcaacaaaatca
aaatttaaattatatttaaaaattaagaattttttaccaacaagaatattgcatgaaatt
catcataaatgtgtaaatgcttcgggaattaaaataaaattaattttaaatgttcaacaa
caaagaattgataaagaaattctttgtgaatatatagaatttattaaaaataataaagct
caaaataaaacagttatttgaaactttatacattcagaagattttgaatttgatactgat
gaaaatttaattaagtttgttgttgattcaaaagaacttaaaaatcaattagtaaaagaa
ttagaatattgcttagcaaaattaaatcaatttggttttaaagaattaaactatataata
gatgttgaagataaaactgaagaatatataaaacaatcattaattattgaacaacaaacc
aaagaacaatataaacaatttgcacctgagcaaaatgataaaagtcaaggaatgtttatt
tcaaagcaaaattcacagaaatgaaatacttcattagataaaccaagttatgcttcattt
gaagatatagaagaagatgcacaaaacatagtattgcatggaaaagtattaagtattgaa
ataagagattctaaagctaataatcgtaaaatatactcaattggattaacagataataac
tcatcaattaaatgcatatactttggtagagaagatgaaagaactattatggatccatta
actgaagaagaattatcttcagatagagttattgaaattaaagaaaaaagagttgctaag
ggtgattgaatagcagttaaaggtaagacgtcttattcacaatatgacaaagagcaaaat
tttatcattgataaaattgctaaaatttcacgttctgaatcaatggtaaaagatgaagca
gaacaaaaacgtgttgaattacatgttcatacaaaaatgagtgctatggatggagtttct
acaattcaagactatttacatactgctgataaatgaaattgaagagcaatagctattaca
gatcatattaatgtacaagctttcccagatgcttataatgaacttaaaaaaattaataaa
aataaagcagatgatgaaaagctaaaactaatttatggtttagaaatgaatatgattcag
aaagaagattactgaattgttaaaaaccctaaaggccaaaaaattagagattctaaaatg
gtagtttttgacttggaaacaactggattatcaccggaaatgaatgaaataattgaattt
ggagcagttgtgtttgatccaattacaggtaaaacaacaaaacatgattatttatttaaa
ccaaagcaaccattaaagcaatttacgatggatttaactaacattaatgaagaaatgtta
gttgacaaaaaaaatatagaagaagattttgataaaatctacgaattaattaaagatagt
attctaatcgctcataatgcaaattttgactttaattttttaaataatttgtctaaaaaa
ctgggttatggagaattacaaaatacagtaattgatacattgactctttcaagattagta
agaccagctttaaaatctcatagacttggggctgtatgtaagaaattcggaattttatat
gatgaacatgtcgctcaccgtggtgattatgacgcagacgtattaaatgatttattcttt
aagattattgcagagttaaaaatgagtactcctattgtgtttgatcatgacttaatgaag
ttaataccagaaaatgataaagaaaatacaaacttgttaagatcacgtggacttcatgta
aatgttttagctaaaaatcaacagggtttaaaagatatatttaaattagtttctatttca
catactgaaaacttttttaactctcctaaaatatttaaagaaaagttaaaagagtttaaa
gaaaaaaataacattttaattggtgctggatgtgttaattcagaggtttttgaaattgct
agattaaatacaaacaataagctagaagaaataattcaattatatgattatgttgaaatt
caacctttaagtgtttataagaatttaattacagataatcaaatggaagaacacgaatta
attgaagtaatccaaaaaattattaaaacagcaaaaaaatataatgttatgttagttgct
acaagtgatgcacactacacaagacctgaattgaaaaaaattagagatgtatacattaat
gctaaaggattaggtggaagtagacacccattatttagttttaaaaataaaaataaatca
gttgattatcctgatcagttcatgcgaacaacaaatgaaatgattaaagagatgaactgg
ttaaacgatgctaatttagtgcaagaaatggttattacaaatacaaataaaattgctgac
atgattgaaaatgatattgttgtaattaaagatggtttgtttacacctaatattgataat
gtagatactttattaaaaaacaaatgttatgaaacagctcatgatatgtatggagaagta
ttgcctgaaattgttgaagctagattagaaaaagaattaaattcaattatcaaacatggt
tttgctgttgtttattgaatttcacatttattggttgaaaaatctaacaaagatggttat
ttggtaggttcaaggggaagtgttggttcaagctttgttgcaactgcatcaaaaatcact
gaggttaaccctttaaaagcacattatagatgtgcaaaatgtaaatattcagattttgaa
acaccagttgaaattaaatgtggatatgatttaccacaaaaagattgcccaaaatgtaat
tcaccattaattggtgatggacatgatattccatttgaaacattcttaggatttgatgga
gataaagttccagatattgatttaaacttttctggagaatatcaaccaattgcacataac
tttacaaaagaaatgtttggtgaaggcaacgtattcagagctggaacaatatcaactgtg
gctgaaaaaactgcctttggttatgtaaaagcattttatgaagaaacaggtattttagaa
gaagaaatgccaagaaaaattgaaattgaaagacaagcaaaattggttgaaggggtaaaa
agaacaacaggccaacaccctgggggaattataatcttaccaaaagagtttgaaatagaa
gatttcagtccagttaactatccagctgatgatgcttctagttcatgaaaaactacacac
tttgatttccactcaattcatgataatttattgaaaatggatattctaggacacgttgat
ccaactgctttaagaatgcttggagatttaacaggagttgatccaattaatattccaaca
aatgatcctaaagtatattctttatttagtaatctatctgctttaaatattaaaccagaa
caaattaatggagaaacaacaggagctattggattacctgaatttgggacaggatttgtt
agaggaatgttaaaagaaactaaacctaaatcatttgctgacttagtacaaatttctggt
ttatctcatggaactgatgtttgattaggtaatgctagagatttaattaaaaacgatata
gcaaacatttcaactgttataggatgtcgtgatgatattatggtttatttaatgggccaa
ggaattgatgcaacaacttcatttaaaattatggaatctgtacgtaaaggacagggagta
agaaaagaatgaaaagaaattatgttagcacataatgtacctgaatgatatattgaatct
tgtttaaaaattaaatatatgttccctaaagcgcatgctactgcttatgttttaatggca
tacagaattgcttgatataaaatatattatcctgctgaatattatgcgactttcttaact
aaccgagctgatgcatttgatctaagaactttcttaggcggttataatggagttaaagaa
aagctaacagaattagaaactagaagaaataaaaaagataaaatgactactaaagagcta
gcattaatgcctgttttagaaattggattagaaatgtttagtcgtggaattaaaatggct
aatttaaactttgaaaaatcactagcttctaaatatattattgaaaaagatccaacaact
ggagaagctacactatatcctccattcttagtaattgattcacttggagatgctgtggct
gattcaattattaaagcaagaagtgaacgaccattaacaagtgttaaagatttaactagt
cgtactacaataactcaaacacaattgaagatatttgaagagttaaatatcttagataca
ttagcacaagatgaacaattagaatttgacttttttaattaa

DBGET integrated database retrieval system