Microplitis demolitor: 103570595
Help
Entry
103570595 CDS
T05600
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1
KO
K02999
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mdl
Microplitis demolitor
Pathway
mdl03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mdl00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
103570595
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mdl03021
]
103570595
Enzymes [BR:
mdl01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
103570595
Transcription machinery [BR:
mdl03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
103570595
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_4
Poxvirus_B22R_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103570595
NCBI-ProteinID:
XP_008546606
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1698 aa
AA seq
DB search
MSYRFKSRVSAKHLDPRALTFSMYSSEDIKRISAVKIKSPLSFSQTGLPLRGGLYDPSLG
PTHTQSDPCGTCSETFANCPGHFGHIELPVPVVNPLFHKVLCSLIKLTCLSCFTLQIPSH
EKLLLIGKFRMIMSGFYTELEDLEHEIGVLVDNKKDLNAAELEFLRESVTTFINDLKEKK
SVHDKDHLENLSNVTTKNINIQWIKYIDNVIKRCAGSKICINCHRPFTKVSILKNKITVQ
RVTNLTEDDEFSDKKVATVMLTPDQSKAYLRKVWRNDKDVLKVMIPCLSSIDIEFPTDIF
FFDLIPVVPPKTRPPNMLRNQVLEHPRSQVYKSIMSDCLVLRNIIQAIQDGNTEQLPPEG
LAVYDQIRGKTPTEKLHNAWQGLQANVDHLMDRDMSKTSESANCLGVKQIIEKKEGVIRM
HMMGKRVDFAARSVITPDPNINIDEIGFPECFAKRLSYPVAVTPWNVTELRQMIINGPNV
HPGANMIEIDGWVQRLSATDPLAREAIAKRLLTSNKDTDLAQSVKIVHRHLQNGDIMLLN
RQPTLHKPSIMAHKARILKGEQTIRLHYSNCKAYNADFDGDEMNAHFPQNELGRSEGYNL
ASVPTQYLVPKDGTPLGGLIQDHVIGGVRLTLRGNFFTKDDYMNLVLSALTDHVGQIKIL
PPAIIKPIEMWSGKQVVSTVIINLIPRGKALINLTSGAKIRASAWEAEKPRAWKCGEEFK
DPNTMSEAEVILRGGELLCGILDKTHYGATPYGLVHCIYELYGGACSTKMLSSFAKLFQM
YLRLIGFTLGVEDILVVESGDEKRREVISRCKLVGESVQKEILKLPEETPQEVVLEKIEE
AYWRNKKFRAQIDHKYKSTMDKFTNAINKASLGEGLLKKFPSNNLQFMVQTGAKGSDVNR
LQISGLLAQIELEGKRPPLMISGRGLPCFPPYYPSPRAGGYIDGRFMTGILPPEFFFHCM
AGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGVSVHYDSTVRDSDGSLIQMLYGEDGEDITKS
RFLRKEQMNFLAENKNAIIDKKLLKQLKDTTEYGKIMKSVKKLRKWKSKNGSEFQRIRIS
PFAKYSQDHYKAESAKNKEIDSGTGRTKAAWSLSKKWEHISEEVKKRYAKECNKCPEPIV
GERRQDLDYGVLTERLESLIDNYMESRKSFTSTISHDQMRDLICLKLMNTLCPAGEPVGL
LAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGRGDMNVTLGIPRLREILMMASKNIKTPSMEIPFNKNLK
NLTRSANRLRMKLTRCTLADVLKSIHVERKMQQRPSRQLEYYLTVKFLPHKYYKHEFCLS
SKQVLERTETLFFKELFREIKKVAKKSGTTLLNVDDKKKRNTELEDSLLDGRIDDDVEEA
DTKSNKRKIDIGENHESSDEEDGNTEDTFAVKRAQVHKEMESYDDPEAEEAPEEISNDID
EENVDDKKSETDENEDEDQDDQIILSPEMLHARQMAAEQRKIDVVSSSSYGIEYDFDVEK
YHWFKYSFYLPLKLIKLDLPTIIRDAAKKVVLWETPAIKRAFTFENPEGETILKTDGLNI
VEMAKYVDVLDLQRLYTNDIYGISQTYGIEAANRVIVKEVKDVFKMYGITVDPRHLSLIA
DYMTFEGTFQPLSRKGMETSASPLQQMSFESSLVFLRNATLQGKCDNLISPSGRLMLGQP
CKTGTGCFDVIDQPILSS
NT seq
5097 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttaccgttttaaatcacgtgtttcggcaaaacacttggatccacgtgcattaaca
ttttctatgtactcatctgaagatattaaacgtataagtgctgtcaaaatcaaatcacca
ttgagttttagtcagactggacttccactacgaggtggtctttatgatccatcactagga
ccaactcatactcaatcagatccatgtggaacatgcagtgaaacatttgctaattgtcct
ggtcattttggtcatatagagttgccagtacctgtagtcaatcccttatttcacaaagtt
ctttgttcgttgataaaattaacatgtttgtcatgttttactttacaaattcccagtcac
gaaaaattattgctcatcggaaagtttcgtatgatcatgtcaggattttatacagagctt
gaagatctagagcatgaaatcggggtattggtcgataacaaaaaagatcttaatgctgcg
gaattagagttcctacgtgaatcagttactacatttataaatgatcttaaagaaaaaaaa
tctgttcatgataaagatcatctagaaaatctatcaaatgttactacaaaaaatataaac
atccagtggattaaatatattgacaatgtaattaaacgatgtgctggcagtaaaatttgt
ataaattgccaccggccatttactaaagtatcaattctcaaaaacaaaataacggtccaa
cgtgttactaatctaacggaagacgacgaattttctgataaaaaagttgcgacagttatg
cttactccggatcaatcaaaagcatatttacgaaaagtttggcgtaatgacaaagatgtt
ctcaaagttatgattccatgcttgtcttcaatagacatcgaatttccaacagatatattt
tttttcgatttaattcctgttgttccaccaaaaactcgcccgccaaatatgctcagaaat
caagtgctcgaacatccgcgatcacaagtttataaaagcataatgtcagattgtttggta
ctgcgaaatataatacaggcaatacaagacggtaatacagagcagcttccaccagaaggt
ttggcggtttatgatcagatacgcggtaaaacaccaactgaaaaactccataatgcgtgg
caaggattgcaagcaaatgttgatcatttaatggatcgcgatatgagtaaaactagtgag
tccgcaaattgtctaggtgtaaaacagattattgaaaaaaaagagggtgtgatacgtatg
catatgatgggaaaacgtgttgactttgcagcccgatcggtaataactcccgatcctaat
ataaacattgatgagataggattcccggaatgtttcgctaaaagactgtcgtatccagtg
gcagtgacaccctggaatgttactgaattacggcagatgattataaatggaccgaatgtt
catccaggagctaatatgatcgaaattgatggctgggttcagcgtcttagtgctactgac
cctcttgcaagagaggcaattgctaaacgattactcacatctaataaggatactgacttg
gcccaatcggttaaaattgttcaccggcatttgcagaacggggatataatgctgctgaat
cgtcaaccaacattacacaagcccagtattatggcacacaaagcgaggattcttaaaggt
gagcagactatacgtttacattattctaattgtaaagcatacaatgctgattttgatggt
gatgaaatgaatgcccactttccccaaaatgaattgggacgtagtgagggttataatctc
gcgtcggtacctacacagtatctagtacccaaagacggtacacctttgggaggtttaatt
caggatcacgttattggtggtgtgcgtttaactctacgtggtaattttttcacaaaagat
gattatatgaatctcgtattgtccgctttgactgatcatgtgggtcagataaaaatacta
ccgcctgcgattatcaaacctattgaaatgtggtcgggtaaacaagttgtatccacggtt
atcataaatctcattcctcggggtaaagcattaattaatttaacttcgggagctaaaatt
cgcgccagtgcttgggaagctgagaagcccagagcttggaaatgcggtgaagaatttaaa
gatccaaatacaatgagcgaggctgaagttattttacgtggtggtgaattgctttgtgga
attcttgataaaacgcattacggtgctactccttatggtttagttcattgtatctatgaa
ttgtatgggggagcgtgctctactaaaatgttaagttcctttgccaaattattccaaatg
tacttacgtcttattggtttcactttgggtgtcgaagatattcttgtagtagaatctggg
gatgaaaaacggagagaagttatttcgcgttgtaaacttgtaggtgaaagtgtccaaaaa
gaaatattaaaattgcctgaagaaactccgcaagaggtagttcttgaaaaaatagaagaa
gcttattggagaaacaaaaaattccgcgcgcaaattgatcacaagtataaatctacaatg
gataagtttactaatgctattaataaagctagtttaggtgaaggtctgttgaaaaaattc
cccagtaacaatctacagtttatggtgcaaactggtgcaaaaggttctgatgttaatcgt
ctgcagatttcaggattattagcacaaattgagttagaaggtaaacgaccaccattgatg
ataagtggacgtggtctaccttgtttcccaccttattatccatcccctcgtgctggagga
tacatagacgggcgttttatgacgggaattttaccacctgaattttttttccattgtatg
gctggtcgtgaaggtctaattgatactgctgttaaaaccagtcgttcaggttatcttcaa
agatgtttgataaaacatttagaaggtgtatcagtacactatgacagcacagtaagagat
tctgatggtagtttgatacaaatgttgtacggtgaagatggtgaagatattacgaaatca
cggtttttgcgaaaagaacaaatgaactttttggctgaaaataaaaatgcgataattgat
aagaagttattgaaacagctcaaagatactacggaatatggaaaaataatgaaaagtgta
aaaaaattacgaaagtggaaatcaaaaaacggaagtgagtttcaacgtattcgtatctct
ccttttgctaaatattcacaggatcattataaagctgaaagcgctaaaaataaagaaatt
gattctggcacaggacgtaccaaagccgcgtggtctttatcgaagaaatgggagcatatt
agtgaagaagtaaagaaaagatacgcgaaagagtgtaataaatgcccggaacccattgta
ggtgaacggagacaggatttagattatggagttttgaccgaacgactagaaagtttgatc
gataattatatggaatcacgaaaatcatttacttcgacaataagtcatgatcaaatgcgt
gatttgatatgtttgaagcttatgaatactctttgtccagctggtgaacctgtaggtctt
ttagcagctcagtctatcggtgaaccttcaactcagatgacactcaacacttttcatttt
gccggtcgaggtgacatgaatgtaactctgggtattccgcgtcttagagaaattttaatg
atggcctccaagaatattaaaacacctagtatggaaataccttttaataaaaaccttaaa
aatttaacacgttctgcaaatcgtttacgtatgaaattaacccgttgtacgcttgctgat
gttctaaaatcaattcacgttgaacgtaaaatgcagcaacgcccatcaagacaattggaa
tattatttaactgttaaatttttaccccacaagtattataaacatgaattttgtttatct
tccaaacaagtacttgagagaacagaaacattattttttaaagaattgttcagagaaata
aaaaaagttgccaaaaaatctggtactacgcttcttaatgttgatgacaagaaaaaaaga
aatacagaacttgaagattcgttattagacggcagaattgatgacgatgttgaagaagct
gatactaagtcaaataaacgaaaaatagatattggtgagaatcatgagtcatcagatgaa
gaagatggcaatactgaagatacatttgcggttaaaagagctcaagtccataaagaaatg
gaaagttatgatgatccagaagctgaagaagctcctgaagaaatttctaatgacatagac
gaagaaaatgttgatgataaaaaatcagaaaccgatgaaaatgaagatgaagaccaagac
gaccaaattattctgtcaccagaaatgcttcatgcccggcaaatggccgccgagcagcgt
aaaatagacgtcgttagtagctctagctacggaatagagtacgattttgatgtagaaaaa
taccattggtttaaatacagtttctacttaccactaaagctcatcaagcttgatttacca
acaattattcgtgatgcagctaaaaaagttgttttatgggaaacaccagccattaaacgc
gcctttacattcgaaaatcctgaaggtgaaactattttaaagacagacggacttaacatc
gttgaaatggcaaaatacgttgatgttttagatcttcaacgactatacactaatgacatt
tacggaatatctcagacttatggaatagaagccgcgaatcgagttattgttaaagaggtc
aaggatgtgttcaagatgtatggaattacagttgatccaagacatttatcgcttatcgct
gactacatgaccttcgaaggaactttccagccactaagtcgtaaaggaatggagacttca
gcatcaccgttgcagcaaatgagcttcgaaagttcattagttttcttgagaaatgcaaca
ttacaaggcaagtgcgacaacttgatatcgccttcaggtagattgatgctcgggcagcct
tgcaaaacaggtaccggatgctttgatgtaattgatcagcctatactgtctagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
