Mycoplasma feriruminatoris: D500_00824
Help
Entry
D500_00824 CDS
T07962
Symbol
hsdM
Name
(GenBank) type I restriction-modification system, Msubunit
KO
K03427
type I restriction enzyme M protein [EC:
2.1.1.72
]
Organism
mfer
Mycoplasma feriruminatoris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mfer00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02048 Prokaryotic defense system [BR:
mfer02048
]
D500_00824 (hsdM)
Enzymes [BR:
mfer01000
]
2. Transferases
2.1 Transferring one-carbon groups
2.1.1 Methyltransferases
2.1.1.72 site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)
D500_00824 (hsdM)
Prokaryotic defense system [BR:
mfer02048
]
Restriction and modification system (R-M system)
Type I R-M system
D500_00824 (hsdM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
N6_Mtase
Eco57I
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKS54466
LinkDB
All DBs
Position
complement(955801..958158)
Genome browser
AA seq
785 aa
AA seq
DB search
MFNYWLEDKNNFGINNFQQAFNDFNDNINPDYELLFKDIFSKFERELDKLGSDTKKRIEN
ILGLINTIKDIPTTKQDYDVLGFIYEYLIARFASSAGAKAGEFYTPHEVSELMSKIIAYN
LKDYKENIKVYDSTSGSGSLLLNIGEEFKKYNNKTSPVKYYAQELNITTYNLTRMNLIMR
GISPNEINVRCADTLKEDWPTFENNDPNRYMLLRVNAVVSNPPYSSEWNPDEHREDPRYR
GYGIAPKSKADYAFLLHDLYHLDTNGIMAIVLPHGVLFRGNSEGVIRENLIKNWNIDAII
GLPSNMFYGTGIPTIIMILKKDKTSGDILFVDASQLYIKDGKNNKFTKSHVKKISDVVNN
RLEVANFSRIVSLQEIEENGYNLNISRYIDNFKKQEEYDLYSMMHGGVSVEEMNKYNKFF
NKFTDIKDKIFTLNNNNYYQFIKDVDIRQTIYDDTKVQNYLKSINNNLDDFTRYFKTLIN
SFDAIESVDLMKLEDNLTNYVFNNLNNISYVDVYDIYQIIFNNFDSITEDIELISTIFKS
YSKKSSSNDICYEILSNELTRKLEKSGSIKEWNSNILDRSLIEQTFYKNEFELIKQKQEE
LDDLTNQLSEVLDSISEEDKNDDIYDNEKEKWRHDEIKKIIKVLEKSEESFDEDSLEAKL
ISTKEIYSKIDKYKKSINESSKELIKKSYEKYLSLNKTEFYDLLITKWLDKIIDQLKQTT
TNVIDNFVSQLETLNNKYDDTLEDINDQIIKNEKELVGLLKDLNLEDETSDSIAIKELIK
ILGGE
NT seq
2358 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtttaactattgattagaagataaaaataattttggaattaacaactttcaacaagca
tttaatgattttaatgacaatataaaccctgattacgaattattgtttaaagatatattt
tctaaattcgaaagagaattagataaattaggtagtgatactaaaaaaagaatagaaaat
attttaggtttaataaacactattaaagatattccaacaacaaaacaagattatgatgtt
ctaggttttatttatgaatatttaatcgcaagatttgcctcatcagcaggtgctaaggcc
ggtgagttttatacacctcatgaagtgtctgaattaatgtcaaaaatcatagcatataat
ttaaaagattataaagaaaacattaaagtatatgattcaactagtggatcgggttcttta
cttttaaatattggtgaagagtttaaaaaatataataataagactagtccagttaaatat
tatgctcaagaattaaatattacaacttataacttaacaagaatgaatttaattatgaga
ggaattagtccaaatgaaattaatgtaagatgcgctgacactttaaaagaagattggcca
acatttgaaaataatgatcctaatcgttatatgcttttaagagttaatgctgttgtgtct
aatccaccatactctagtgaatgaaatcctgatgaacatagagaagacccacgttacaga
ggttatgggattgctcctaaatcaaaagctgattatgcttttttacttcatgatttatac
catttagatactaatgggattatggctattgttttacctcacggagttttatttagaggt
aattcagaaggtgttattcgtgagaatttaataaaaaattgaaatattgatgcaattatt
ggattgccttctaatatgttttatgggacaggtattccaacaattataatgattttaaaa
aaagacaaaactagcggtgatattttatttgtcgatgcttctcaactttatataaaagat
ggaaaaaataataaatttacaaaatcacatgtcaaaaagatctctgatgttgtaaacaac
agattagaagtagcaaatttttcaagaatagtttcattacaagaaattgaagaaaatggt
tataacttaaatatttctagatatattgataattttaaaaagcaagaagaatatgatctt
tactcaatgatgcacggtggtgttagcgttgaagagatgaataaatataataaattcttt
aataaattcactgatattaaagataagattttcacattgaataacaataattattatcaa
tttataaaagatgtagatattagacaaacaatttatgatgataccaaggtacagaattat
ttaaaatcgataaacaataatctagatgattttacaagatattttaaaaccttaattaat
tcatttgatgctattgaaagtgtagatctaatgaaattagaagacaatttaacaaattat
gtttttaataatttaaataatatttcttatgttgatgtgtatgatatttaccaaataatt
tttaataattttgatagcattacagaagatatcgagttaatttctacaatttttaaatca
tactcaaaaaaatcttcatctaatgatatttgttatgaaattttatctaatgaattaaca
cgaaaattagaaaaaagtggttctataaaagaatgaaattcaaatatattagatagatcg
ttaattgaacaaacattttataaaaatgaatttgaattaattaaacaaaaacaagaagaa
ttagatgatctaactaaccaactaagtgaagtactagattctattagtgaagaagataaa
aatgatgatatctatgataatgaaaaagaaaaatgaagacatgatgaaatcaaaaagatt
attaaagtattagagaagtctgaagaatcatttgatgaagatagtttagaagcaaaatta
atcagtacaaaagaaatttattcaaaaatagataaatataaaaaatctataaatgaatca
tctaaagagcttattaaaaaatcatatgaaaaatatttaagtttaaataaaactgaattt
tatgatcttttaataacaaaatgattagataaaattattgaccaattaaaacaaactaca
actaatgtaattgataattttgtttctcagttagaaactttaaataataagtatgatgac
actttagaagatataaatgatcaaataattaaaaacgaaaaagagttagttggtttatta
aaagacttaaatttagaagatgaaacaagcgattccatagctattaaagaattgataaag
attctaggtggtgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
