Methanobacterium formicicum DSM1535: DSM1535_2354
Help
Entry
DSM1535_2354 CDS
T03743
Name
(GenBank) putative secreted protein
KO
K02230
cobaltochelatase CobN [EC:
6.6.1.2
]
Organism
mfi
Methanobacterium formicicum DSM1535
Pathway
mfi00860
Porphyrin metabolism
mfi01100
Metabolic pathways
mfi01240
Biosynthesis of cofactors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mfi00001
]
09100 Metabolism
09108 Metabolism of cofactors and vitamins
00860 Porphyrin metabolism
DSM1535_2354
Enzymes [BR:
mfi01000
]
6. Ligases
6.6 Forming nitrogen-metal bonds
6.6.1 Forming coordination complexes
6.6.1.2 cobaltochelatase
DSM1535_2354
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CobN-Mg_chel
CarbopepD_reg_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEA14751
UniProt:
A0A090I544
LinkDB
All DBs
Position
complement(2372796..2377220)
Genome browser
AA seq
1474 aa
AA seq
DB search
MKKRRILMVVMFLFSLTLCGTVYAEDIEDDSGVLINSSSESTNNSLNDSSNKLNEINITG
KVVDCVTGELFSGVNVTASYNGRQLATTQTDGQGMYLLHFFSNLTQFNITASYPGHKPSS
QLVNFTENNTALNGTADFQLGKPRVLFIVNSVKASFIDAVIACDYLDVTVFAGKNLPETI
NVNDYDLIFVDWLSSGLSYCTRVVALMQEAVANNITVIMTKTWYLDIPSEVIIADGNAPY
QYVRDYWSNMNNINAKELLKFIGVKFFTLELGQPQAAVLLKSEAIYHPDASTLFESLEDY
YAWYNYNSSNPTVAILFIETEFKNGDLLVVNALIHAFENKGYNVIPYFYPNNGRPNIAKY
LMQEGKSAVDLIIHYKMLGWSSNSTTEDIQSDLQTLNVPVLKAYKYFADYNSWLNGTQGM
QSESIGATIVPSEMDGMFDPIIIATQELDPAYSAFGVTVYKPIERQINWLVNTAISWINL
RYEENTDKKIAIIYWHGVGKDKGASAGHLDVYASIANLLTALKNEGYDLGNGSLPNSEDL
VEIIRKQGYNIGVWASNELAEMVTNYPVILIPENEYLAWFNQLNSDKRQEVLDMWGEPPG
DIMVYVKDGLRYLVLPVIQYGNVILAPEPSRGYAQDDDALYHSSSIPPTHQYLAFYFWLK
QDFGADAIIDLGRHGSLAWLPGKSGPGLDIENCWPAIVSQDIPVIYPFTVEGSEGLLPKR
RQGSIMISHLIPSMTISELYGELAVLNGKINDYNAPNIDADAKLALKNSILTMVSDLKIN
EDIGIAMTSINDSNFDEFLGKLQKYLEDIESEFIPYGLHVLGEAPTGEELTNLVQTLLGY
EFQDYMASNHLNNTMIQALLTAVLINGETPEQAQILVLGSVNSAMTSYLLTALDYATRIN
NCTNEITSIINALNGTYIPPGMSGDPVTNQDVLPTGTNFYSFDPRKVPTDEATAIGNKMA
QDIINRYLQETGKYPEKISFMLWSCHTQQDMGVMEAAIFYLLGVERVFDKNNPGIVVDVK
LIENLGRPRIDVVITTTSLYISMYRSRLDLINKAVLLAANANDTLPNYVKRNSEVIYNAL
KAKGYSDEDARKLSVCRIFSQEEGNHNNAMQNALLITSSWENEGQLAETFIDTFGNVFMG
SEINSIHIEDLYSLNLNGTEVAMFRRVVNVNDLFGDSDYFGYFGGMGLAIKHVSGQEPKM
WIMNVENPSNPKLESLSESLWRDTRSTYFNSKYIQAIKSYGATGAGIFADFFRYMSAWKI
TSPDSVNDNMFQEAYEVYFQDKYGLGMNEWFTRNNPYAQQAMAAILLDSIRRGDWKADAN
VVNDLVNVLAQNVINNGIACCDCTCANLANMKWAAQYLNVDILAQFNQQIYKTTGNPGFA
PSQSQPQSSPAQSGGTTTQVASESSGSAGGAGEQSTEESASPGEEGEGKAYEISPQSSSS
GTSESGLPIAAIVGVIALVSLVGLGYFRGTFKGK
NT seq
4425 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaagaaggatactaatggttgtaatgtttcttttcagtttaacactgtgcgga
acagtgtatgcagaagatatagaagatgattcaggagttttaattaattctagcagtgaa
tcaaccaacaatagcttgaatgactcgtcaaataaattgaacgagatcaatatcactggc
aaagttgttgattgtgttaccggagaactattttcgggggttaatgtgacggcatcctac
aatggccgtcaactggcaaccacccaaactgatggtcagggaatgtatttattgcatttt
ttcagtaaccttacccagttcaatatcacggccagctatccgggacataaaccctcatct
caactggtaaattttaccgagaataacaccgccctaaatggaactgctgattttcaactt
ggaaaacctcgggtgttgtttattgttaattcagtaaaagcatcgttcattgatgcagta
attgcctgtgattatttagatgtaactgtttttgccgggaaaaaccttcccgaaaccata
aatgtcaatgattatgatctgatctttgtggactggctttcttcgggtttatcctattgt
acgcgggtggttgccctaatgcaggaggcagttgccaacaatataaccgtaataatgacc
aaaacatggtatttggatattcccagtgaagttataatcgctgatggcaatgccccctac
cagtatgtccgggattactggagcaacatgaataatatcaatgccaaggaacttttaaag
ttcataggggttaaattctttacattagaacttggacaaccacaagctgctgttttatta
aaaagtgaggctatttaccacccggatgccagtaccttatttgagagtctggaggattat
tacgcctggtacaactataactcctctaatcctacggtggccatactgttcattgaaaca
gaatttaaaaacggggatttgctggttgttaacgccttaatccatgcctttgaaaacaag
ggatacaatgtaataccttacttctatcctaataacggcagacctaatatagccaaatac
ctcatgcaggaaggtaaatctgctgtagatttgataatacactacaagatgctggggtgg
tcctccaacagtaccactgaagatatccagtctgatctgcaaactctaaatgtccccgtc
ctgaaagcttataaatatttcgctgattacaatagctggctaaacggcacacagggaatg
caatcagagtctataggtgcaactattgtaccatcagagatggatggaatgtttgatccc
attataattgctactcaagaattggatcctgcttattctgcctttggtgtaactgtctac
aaaccaattgaaagacagattaactggctggttaacacggccatatcatggataaatttg
cgatatgaagaaaatacagataaaaaaattgccattatctactggcacggggtgggtaaa
gacaaaggtgccagtgccggacatctggacgtgtatgccagtatagccaatttattgact
gcccttaaaaatgaaggttatgacctgggaaacgggtctctacccaacagtgaagacttg
gtggaaattatccgaaaacagggttataacattggagtttgggcttccaacgaattagca
gaaatggttaccaattatcctgtgattttaattcctgaaaacgagtacttggcctggttt
aaccagttaaattcagataagaggcaggaagtccttgatatgtggggtgaaccgccaggg
gatatcatggtttacgtaaaggatggtttaaggtacctggtgctcccggtaatccagtac
ggtaacgtgattttagccccggaaccttcacgtggctatgctcaggacgacgatgcactg
taccacagcagtagcataccacccacacaccagtacctggcattctacttctggttaaaa
caggatttcggtgccgacgccattatcgacttgggacggcatggatctctggcctggtta
cctggaaaatcaggacccggactggacatagaaaactgctggccagcaattgttagccag
gacatacccgtaatatacccctttacagtggaaggtagtgaaggcctcctaccaaaaaga
cgccagggatcaataatgatcagccatttaataccttcaatgacaatttctgaactttat
ggggaattagcagtacttaacggtaagataaatgattataatgcgccaaatattgatgca
gatgccaagttagccttaaaaaattcaattttaactatggtcagtgatctgaagatcaac
gaggatataggtattgccatgaccagcatcaatgactccaacttcgatgaattcctggga
aaactgcagaaatacctggaagacatagaatcagaattcatcccctacggtttacatgta
ctgggagaggcacctacaggagaagagttaaccaacctggttcaaacccttttaggttat
gaattccaggattatatggcctctaaccatttaaataacaccatgatacaggctttactc
accgcagttctgattaatggtgaaacccctgaacaagcacaaattctggttctggggagt
gttaattctgcaatgaccagttaccttttaacagcccttgattatgccactagaatcaac
aactgcaccaatgagataaccagcataatcaatgccttaaatggaacctatataccgcca
ggaatgtccggagacccggttaccaatcaggatgtacttcccactggaaccaatttctat
tcatttgatcctagaaaagtacctaccgatgaagcaaccgccattggaaacaagatggct
caagatatcatcaaccgttacctccaggaaaccggaaaatatccggaaaaaatatccttc
atgctctggtcctgccacacgcaacaggatatgggagttatggaagctgctatcttttat
ctattgggtgtggagagggtatttgataaaaacaaccctggtatcgtggttgatgttaaa
ctaattgaaaacctgggaagaccacgaattgacgtggtaattaccaccacttctctttac
atcagcatgtaccggtctcggttggatttaataaacaaagcagtactactggcagccaat
gccaatgatactcttccaaattatgttaaacgaaactcagaagttatttataatgctttg
aaggccaagggatacagtgatgaagatgcccggaaattatcggtgtgcaggatattctca
caggaagagggcaaccacaataacgctatgcaaaacgcgttactgatcaccagttcctgg
gaaaacgaagggcagctggcagaaacattcattgacacattcggaaatgtcttcatggga
agtgaaattaattccatccacattgaagatctatactccctgaatctgaatggaactgaa
gttgccatgttcagaagggtggtaaatgtgaacgatctgtttggagacagtgactacttt
ggatactttggggggatgggattagccataaaacatgtttctggtcaggaacctaagatg
tggattatgaatgttgaaaacccatcaaatcccaaattggaatcgttatcagaatccctc
tggagagatacccgttcaacctactttaattctaaatacattcaggcaatcaagagttat
ggggcaacaggtgcagggatatttgctgacttttttagatacatgtcagcttggaagatt
acttcaccagattccgtaaacgacaacatgttccaggaagcctacgaggtttacttccag
gataaatatggtctgggaatgaatgaatggtttaccaggaataacccctatgcacaacag
gctatggcagcaatcctgcttgattcgattagaagaggggattggaaggccgatgcgaat
gttgtaaatgatctggtcaatgtcctggcccagaatgttattaacaatggaatagcctgc
tgtgactgcacctgtgctaatctagccaatatgaaatgggcggcacagtaccttaacgtg
gacatcctggcacagttcaaccaacagatatacaaaactactggaaacccaggatttgct
cccagccaatcgcagcctcaatcttctccagcccaatctggaggtactactactcaggtg
gcatccgagagtagtggaagtgctggtggggcgggagaacagtctactgaggaaagtgcc
agtcccggtgaagaaggagaaggcaaagcctacgaaatttccccgcagagttcctcatca
ggaacatcagaatcaggtcttcccatagcagccatagttggggtaattgccctggtctct
ctggtagggttagggtactttagaggaacttttaagggaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
