Methanosarcina mazei Go1: MM_2478
Help
Entry
MM_2478 CDS
T00082
Name
(GenBank) putative chloride channel
KO
K05030
calcium-activated chloride channel regulator 3/4
Organism
mma
Methanosarcina mazei Go1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mma00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
mma04040
]
MM_2478
Ion channels [BR:
mma04040
]
Chloride channels
Chloride channel, calcium-activated (CaCC)
MM_2478
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWA
CHAP
VWA_2
VWA_3
Big_13
Filamin
CobT_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAM32174
UniProt:
Q8PU63
LinkDB
All DBs
Position
complement(2955351..2958365)
Genome browser
AA seq
1004 aa
AA seq
DB search
MKQKLVVMIAAVLILALTVSIASAEDQNDQTSLRSEQNDAFVAGDNLIDSSSVIKYGDPI
GSYKNVTAYSNKGNGKYQCVEYVKRFYKEAMNVEPDWDGTGNAITYYTNAEAKGLVSYSN
NGSVAPKPDDIIIFSPTDNGYGHVAIITEVGDKYIKIIEQNWNQENAFASLSLEKNGSKY
YISPRGASKRPTEGWCRTPILNIISPTKKSFSLVGNYNNPNLLTVDAEVKSENVPITGLN
KDNFTIEIGSKKVNDVTVSDVGEGKYKLSFNPPKQDSNGNYDLNVYVKYKKVTLSDSELN
AVRYGEDNANANANVMLVIDRSGSMSGSPISSAKNSANLFIDYMEAEDMAGVVSFSSSAR
YDYHLATLTPEVKNSIKQKINSIYASGVTAIGSGMRYGLNDLLNYGDPNNPWAIVLLSDG
YQNSGENPNNVIPSIKASNIQVYTVGLGPAVDQKLLGNIADQTGGKYYYSPTDSQLQEIY
NDIVGKIIGWKTVFKRNVKMFIHERVPIAVPIDSAIDKVSFGIGWPGSNVDLVLYKPDGT
LVDPSFADSDPTIEYLSGPTYKIYKVTDPESGMWNMELNATDMPAGGEDVYVTVLAESTL
SMSLSTNKGQYNQGEVVKIIADLSDAGTQITGADVKVNVTLPDSSVEYLTLYDDGGHGDN
GSQDGVYANYLVDTSLMGDYKVDVTSTGSLSDGSQFKRIEDTSFEIIQGISSISSIANLQ
STNDITWINWTWTNPTGPNFSHTEIYLDGVFQANTSAEFFNATGLEPETEYTLSTHTVDI
SGNVNETWVNSTATTSAELVSDVKKPVIDSVNLFPANTTAGATINLSINATDDTAVTEVI
AGDIQLIKTDDIWQGSITAPSSIGSYSLLIKAKDAAGNVAEASVPYRVVQLSGGANIAVS
PRSSSIVAGNSVTLNIKVKNTQNIDDIFKVNITVSELPAANQANIDWFSWTEQSVKLRAG
EEILLPLEVEVPDGTALGLKLFRANVNSETSVVTGFDTGYLKVV
NT seq
3015 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcaaaaactcgttgtgatgattgccgctgtgttaatactcgccctcacggtgagt
attgctagtgctgaggatcaaaatgatcagacaagtctgaggtctgaacagaatgatgcg
tttgttgcaggtgataatttaatagatagttcaagtgtaataaaatacggggatccaata
ggttcatataaaaatgtaaccgcttactcaaataaaggtaatggaaaatatcaatgtgtt
gaatacgttaagagattttataaagaggcaatgaatgttgaacctgactgggacggaact
ggtaatgccattacctattatactaatgccgaagccaaaggtttggtcagctattctaac
aacggttcggtagcgcctaagcctgatgatatcataatatttagtccaactgataatggt
tatggtcacgttgcaataatcacagaagtgggggataaatatataaaaattattgaacaa
aactggaaccaagagaatgcttttgcctctctgtctcttgaaaaaaatggatctaagtac
tatatttcacctagaggtgcgagtaaacgtccaactgaggggtggtgccggacgcctata
ttgaatatcatatcaccaaccaaaaaatcgttctcattagttggaaactataataatcca
aatcttctcacagtagatgctgaagtaaaaagtgaaaatgtccctattacaggattgaat
aaagataatttcactatcgaaattggtagtaaaaaagtaaatgatgtaacggttagtgat
gtaggtgaaggtaagtataaactcagtttcaatccgccaaagcaggattctaatgggaat
tatgatttaaatgtttatgttaaatataaaaaagtgaccttgagtgatagcgagctgaat
gctgtacgctatggagaagataacgctaacgctaacgctaatgtgatgcttgtcattgat
cgttcaggtagcatgtcgggttcaccaatttccagtgcaaagaactcagcaaatcttttt
attgactatatggaagctgaggatatggctggagttgtatcatttagttcatctgcacgt
tatgattatcaccttgctactcttactccggaagtaaaaaacagcattaaacagaagata
aactcaatttatgcctccggtgttactgcaattggaagcgggatgagatatggattaaat
gatttacttaactatggtgatccaaataatccgtgggcaattgttctgctttctgacgga
tatcaaaacagcggagaaaatccaaataacgttatcccctcaattaaagccagcaacata
caggtttacactgttggtcttggtcctgccgttgaccaaaagttgttaggtaacattgct
gaccagacaggaggcaaatattattattctcccacagatagccaactacaggagatatat
aacgatattgttggaaaaatcatcggatggaaaactgtcttcaaacgtaacgttaagatg
tttatccacgagcgtgtaccaatagcagtcccaattgattctgcaatagataaagtatcc
tttggcattggttggccaggaagtaatgtagacctagtattgtacaaacctgatgggacg
ttagtagatccctcttttgcagattcagaccctactattgaatatttgtctggtcccact
tataagatctataaagtcacagatccagaatctggaatgtggaatatggaattgaatgcg
accgacatgccagccggtggtgaggatgtttatgttactgtccttgctgaatcaacatta
tccatgtcactgtctactaataaaggccagtacaatcagggtgaagttgtaaaaatcatt
gccgatctttctgatgcaggaactcaaatcacaggagctgatgtcaaggtcaatgtcact
ctcccagattcgagtgttgaatatctcacactgtatgatgacggtggccacggagataat
ggatctcaggatggagtatacgcaaactatttagtggacacttctttaatgggagattat
aaggttgatgttacatcaacaggaagtttatcagacgggtctcagttcaagagaattgaa
gacacctcctttgaaataattcaaggaataagttcgatctcaagcattgcaaacctgcaa
tccaccaatgatataacgtggatcaactggacttggacaaacccaacaggccccaacttc
tcacacactgaaatctaccttgatggcgtcttccaggcaaatacatctgcagaattcttc
aacgccaccggtctagaacccgaaacagaatacaccttaagtacgcacacagtggatatt
tccggtaacgtaaacgagacatgggttaattcgactgcgacaacatcagcagagcttgta
tctgatgttaaaaaacccgttattgactcggtaaatttattcccagccaacacaactgct
ggtgccactattaatctaagtattaatgccacagatgataccgctgtaactgaagtaatt
gcaggagatatccagctcataaaaactgacgacatctggcagggcagcataactgctcct
tcatcaattggaagctattctcttttaataaaagcaaaagacgcggcagggaatgtagct
gaagcctcagtaccttatcgtgttgttcagctttccggtggagctaatatcgcagtttcc
ccaagatccagcagtatagttgcaggaaatagtgttactctaaacatcaaagtgaaaaac
acccagaatatcgatgatatctttaaggttaacatcactgtaagcgagcttccggctgct
aatcaggcaaatattgattggtttagctggactgaacaaagtgtaaagctcagggcagga
gaagagatattactaccccttgaagtggaagtgcctgatggaactgctcttggtctcaag
ctcttcagggcaaacgtaaattccgagacctcagtagttactggatttgatacgggatac
ttgaaagtggtataa
DBGET
integrated database retrieval system
