KEGG   Mycoplasmopsis phocirhinis: EG856_03000
Entry
EG856_03000       CDS       T06916                                 
Name
(GenBank) PolC-type DNA polymerase III
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mphi  Mycoplasmopsis phocirhinis
Pathway
mphi03030  DNA replication
mphi03430  Mismatch repair
mphi03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mphi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    EG856_03000
   03430 Mismatch repair
    EG856_03000
   03440 Homologous recombination
    EG856_03000
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mphi03032]
    EG856_03000
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mphi03400]
    EG856_03000
Enzymes [BR:mphi01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     EG856_03000
DNA replication proteins [BR:mphi03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     EG856_03000
DNA repair and recombination proteins [BR:mphi03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     EG856_03000
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP HHH_6 HHH_3 RNase_H_2 T2SSK
Other DBs
NCBI-ProteinID: QBF34865
UniProt: A0A4P6MMK2
LinkDB
Position
743179..747543
AA seq 1454 aa
MSSTNNKRFIKLCNSLSLPITQSLQKTEITGYYHDQVQDVLEIWFNFNDEVITEDFFYFH
KCILNNAHYRIMPHYNFDILQYKQQNIISFIEHLLNKSPKYVDLKQSRFHKLMINKDNHK
FEFIVNDEEEFNFLKPQLMHFVDQLKLYGFKHLDIQIKYAPVRSQEFNFNSNIQYKKEEI
EEFNKLVQQLEQNRKIINNSNNKIKTTKRWSQKKYQQTKINEISLFPEKSDVEINGEIFE
YDLLTTKNDKFIYSLSICDYEDAITVKWFRDEALDENIVNNDFIKGKWISVRGTTAIQSF
GKSEWFIYMDNYEIIESMCLISSDEAPQNQKRIELHVSSKLNTMDGIIEPEEIIQRAKKF
AMPAVAISDLDAVQGYPRFYQAAKKANIKAIYGASYSTYHKQPKIFLGSIPKGKISEQTF
VCFDIETTGLSPRFHELIEYGSFSINVEKPSVKPVQFLIKPKGKIKPFTTSLTGITQSDI
DKKGIDYRESLQKIYDDLNGKIALAHNAKFDFNFIKEQFRIHNMPFPDVCVIDTLVVSRL
MFPERKKHSLGDLANNLDVNYDPNVAHRADYDAKVLADVWVEMMDKMRLKDVLSFEDLLN
YQPEHKYKERFPYTISTLVKNQQGLKKQFKMISDCLTTNYSFGPKTYLEDIKKDDDLLIG
SGTLRSKLIDDYFYSNHEEFLNEILRYDYIEIPAPQCFQHWIDTDFITKEQLYFALKEII
ITAKEFGKIPIATADVRYLDLVDKKAFEILVYAKGIGASRHYLYDHRRAKSKTLTIPNQH
FLTTQEMLEQFSFLNDVNLINEIVVKNTQKIADMIENVEVIKDKLYTPVFDDSKTKLRDL
VYQNAKKKYGVNLPDIVKQRIEAELTPIIKYGFDVIYWISHKLVKKSLDEGYVVGSRGSV
GSSLVATLSDISEVNPLAPHYVCEQCKHFELANIDSITSCYDLPDRMCNKCKINMNKDGH
SIAFETFLGFEADKVPDIDLNFSGEFQGEVHNETKKIFGQSHTLRAGTISTIAFKTGYGY
VKSFLEESEKKYSDSFASFLAKKIEGVKRTTGQHPGGIIIIPTEYDVFDFTPVNYPADDT
KSTWLTTHFEYKAIHDNVLKLDLLGHDNPTIIKMLEKYTGIKIASLPKNDENLIKVFTST
QPLGIKPQDIGGEQTGAIGLPEFGTKFVRQMLTQAQPKSFADLVSISGLSHGESVWIGNN
QDLIMSQGFVLPEIFSCRDDILASLSKQGVPEQYAFNIMEKVRKGKGINEEEENKLIEYK
IPTWQIESMKKIKYMFPKAHAVAYVLMAWWIAWFKIYKPLAFYAAYYATHSNSLDIEGMI
DVRYGKKAHNKLIYLESKTKNELESKEKIIMPTLEITRELYARGLYISNIDIEKSLSEEW
LIDEENNCLIPPFSALDGLGKAVADSIINARTQKAYTSIQDFTSRAKVNKTLTEKLRELG
AFGNLDDTDQIRLF
NT seq 4365 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagttcaacaaataataaaagatttattaaattatgtaattctttgagtttgcccata
acacaaagtttacaaaaaacagagattactggatattatcacgatcaagtgcaagatgtt
ttggaaatatgatttaattttaacgatgaggttataaccgaggattttttttattttcat
aaatgtattttgaataatgctcattaccggataatgcctcattataattttgatattttg
caatacaaacaacaaaatataattagttttattgaacatttactgaataaatcgccaaaa
tatgttgatttaaaacaatctagatttcacaaattaatgattaataaagacaatcataaa
tttgaatttatagtcaatgacgaagaagaatttaattttttaaaacctcaattaatgcac
tttgttgatcaattaaaactttatggttttaaacatcttgatattcaaattaaatatgcg
ccggttcgttcgcaggagtttaactttaactcaaatattcaatataaaaaagaagaaatt
gaagaatttaataaattagtacaacaactcgaacaaaacagaaagattattaataattct
aataataaaatcaaaacaactaaacgttgatcacaaaaaaaataccaacaaactaaaatt
aatgaaattagtttatttcctgaaaaaagtgatgttgaaataaatggtgaaatttttgaa
tatgatttattaactacaaaaaatgataaatttatttactctctttctatatgtgattat
gaggacgctattacagttaaatgatttagagatgaagctttagatgaaaatattgtaaat
aacgattttataaaaggcaaatggatcagcgttagaggtacgacagccattcaatcattt
ggcaaatctgaatgatttatttacatggataattacgaaataattgaatcgatgtgttta
atcagcagcgatgaagctccacaaaaccaaaaacgcattgagttacatgtcagttcaaaa
ctaaacacaatggatgggataatagaaccagaagaaattattcaaagagccaaaaaattc
gctatgccagcagtggctatatcagatttagatgctgtgcaaggttatccaagattttat
caagcagcaaaaaaagcaaacataaaagcaatttatggtgcttcttattcaacataccac
aagcaacctaaaatatttttaggttcaattccaaaaggtaaaataagtgagcaaacattt
gtttgttttgatattgaaactactggtttaagtcctcgtttccatgagttgattgaatat
ggttcatttagtataaatgttgaaaaaccgagcgtaaaaccggtgcaatttttaattaaa
ccaaaaggaaaaattaaaccttttactacgtctttaactggtattactcaatcagatata
gataaaaaaggaattgattatcgtgaatcattgcaaaaaatttatgatgatttaaatggc
aaaatcgctctggcccacaacgctaaatttgactttaattttattaaagaacaatttaga
attcataatatgccatttcccgatgtttgtgttattgacacgttagtggtttctagatta
atgtttccagaacgaaaaaaacattcattaggtgatttggcaaataatttagatgttaat
tatgaccctaatgtagctcaccgagctgattacgatgccaaagttttggctgatgtttga
gttgaaatgatggacaaaatgagacttaaagatgttttgagttttgaagatttacttaat
tatcaaccagaacataaatataaagaacgttttccatacacaatcagcacattggtaaaa
aatcagcaaggtttaaaaaaacaattcaaaatgattagtgattgtttaacgacaaattat
agttttgggccaaaaacataccttgaagacatcaaaaaagatgatgatttattaattggt
tcaggaacattgaggtctaaattaattgatgattacttttattcaaatcatgaggaattt
ttaaatgaaatattacgctatgattatatagaaattccagcacctcaatgttttcaacat
tgaatcgatactgattttataactaaagagcaattgtattttgctcttaaagaaataatt
attacagctaaagaatttggcaaaataccaattgctaccgctgatgttagatatttagat
ttagtagacaaaaaagcatttgaaattttagtatatgcaaaaggcataggtgcttcgaga
cattatctttatgatcataggcgagctaaatcaaaaaccttaactatacccaaccaacat
tttctaactacacaggaaatgctagaacaattttcatttctaaatgatgtaaatttaatc
aatgaaattgttgtgaaaaatacacaaaaaatagcagatatgattgaaaatgttgaagtt
attaaagacaaactttatacacctgtttttgacgattcaaaaactaagttgcgtgatttg
gtttatcaaaatgcgaaaaaaaaatatggagtaaatttacccgatattgttaaacaacgt
attgaagctgaattgactccaattattaaatatggttttgatgttatatactgaatttcg
cataaattagttaaaaaatctctggatgaaggttatgttgtgggaagtcgtggttcagta
ggttcttcattagtggctactttaagtgatatatcagaagtaaaccctttagctccacac
tatgtctgtgaacaatgcaaacactttgaattagctaatattgactcaattacttcttgt
tatgacttgcctgatcgcatgtgtaataagtgtaaaattaatatgaataaagatggacac
tcaattgcttttgaaacttttttaggttttgaagctgataaagttcccgatatagattta
aatttttctggtgaatttcaaggtgaagtacacaacgaaactaaaaaaatatttggtcaa
agccatacattgagagcgggtacaatttcaaccatagcttttaaaactggttatggttat
gtaaaaagttttttagaagaaagtgaaaaaaaatattctgattcgtttgcttcgttttta
gctaaaaaaatagaaggggttaaaagaacaacaggccagcaccctggcggaataataata
atacccactgagtatgatgtatttgattttacaccagttaattacccagccgatgataca
aaatctacttggctaactacacattttgaatataaagctattcatgataatgttttaaaa
cttgatttactaggccatgataatcccacaattattaaaatgttagaaaaatatactggc
attaagattgcttctttgccaaaaaatgacgaaaatcttattaaagtttttacttcaaca
cagccacttggaattaaacctcaagatattggtggagaacaaactggtgcaataggttta
cctgaatttggaactaaatttgttcgccaaatgcttacgcaagcacaaccgaaatcattt
gctgatttagtatctatatctggtttaagtcatggtgagagtgtttggatcgggaataat
caagatttaattatgtcgcagggttttgttttaccggaaattttttcttgtcgtgatgat
atattagcctcgttgagtaaacaaggagttcctgagcaatatgcgtttaatataatggaa
aaagtgcgtaaaggtaaaggaataaatgaagaggaagaaaataagcttattgaatataaa
attcccacctgacaaattgaaagtatgaaaaaaattaaatatatgtttccaaaagcacac
gcagttgcctatgttttaatggcttgatgaattgcttgatttaaaatttataaaccatta
gccttttatgccgcttattatgctacacactcaaattcattagatatagagggaatgatt
gatgttagatatggtaaaaaagctcataataaattaatttatttagaatctaaaactaaa
aatgaattagaaagcaaagaaaaaattataatgccaacgcttgaaatcacacgggaattg
tatgcgagaggtttatatatttctaatattgatattgaaaagtctttatcagaagaatga
ttgattgatgaagaaaataattgtttaattcctccgtttagtgctctagatggactaggc
aaagcagttgctgattcaattattaatgcccgaacacaaaaggcttatacatcaattcaa
gattttactagccgggcaaaagttaataaaacattaactgaaaaattaagagaattaggt
gcttttggtaatttagatgacaccgatcaaataaggttattttag

DBGET integrated database retrieval system