Mesoplasma tabanidae: MTABA_v1c03020
Help
Entry
MTABA_v1c03020 CDS
T05273
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mtab
Mesoplasma tabanidae
Pathway
mtab03030
DNA replication
mtab03430
Mismatch repair
mtab03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mtab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MTABA_v1c03020 (polC)
03430 Mismatch repair
MTABA_v1c03020 (polC)
03440 Homologous recombination
MTABA_v1c03020 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mtab03032
]
MTABA_v1c03020 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mtab03400
]
MTABA_v1c03020 (polC)
Enzymes [BR:
mtab01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MTABA_v1c03020 (polC)
DNA replication proteins [BR:
mtab03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MTABA_v1c03020 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mtab03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MTABA_v1c03020 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
DNA_pol3_a_NII
DNA_pol3_a_NI
HHH_6
RNase_H_2
tRNA_anti-codon
Rv2179c-like
DEDDh_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATZ21505
UniProt:
A0A2K8P7B9
LinkDB
All DBs
Position
341325..345806
Genome browser
AA seq
1493 aa
AA seq
DB search
MSDNKVLELFQKLKINLNEGELSYFEHSEIEKTAISSVKSKLKLSLKIKNFLPIRVLSEI
HEKCIGAEDIKIKLILNVQHQRIDKEIICEYIEFIKNVKSQNKTIIWNFIESEGFEYDDE
ENQIKFVVDSNELKNQLTIEMEYCLAKLSQFGFKNLSYDIQVEDKTEEYIKQSLKIEQET
KEQYKQFAPEQTEKSQNIIISRQNSQKWNQSLDKPSYETFEDIEEDAQNIVLHGKVMSIE
IRDSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGKEEERTIMDPLTEEELASDRIDEIRLKRIAK
GDWIAVKGKTSYSQFDREQNFIIDKIGKISRSESSVKDEANQKRVELHVHTKMSAMDGVS
SIQDYLQMVDKWNWKAIAVTDHINVQTFPDAYNELRKINKNKADEDKLKLIYGLEMNMIE
KGDYWIVKNPKGLKIRERKMVVFDLETTGLSPEFNEIIEFGAVVFDPTTGKTVKHDYLFK
PKEPLKQFTIDLTNITPEMLEDKKNIDDDFAKIYDLIKDSILIAHNANFDFNFLNSLSKR
LGYGELDNTVIDTLTLSRLVRPALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFF
KIIAELKLTTPIIYDNDLMKLEPKNDKDNVNLLRSRGVHVNVLAKNQQGLKDIFKLVSIS
HTDNFFNSPKVFKEKLKEFKEKSNILIGAGCVNSEVMEIARIGTDEKLEEIISFYDYIEI
QPLSVYKNLINDNQLQQDELINVINKIIRLAKKHNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYIN
AKGLGGSRHPLFSFRNKNKLIDYPDQYLRTTNEMLKEFAWLNDAALIQEMVVTNTNKIAD
MIDPNIVVIKDGLFTPNIENVDTLLKDKCYETAHAMYGEVLPEIVEARLEKELTSIIKHG
FAVVYWISHLLVERSNNDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFN
TPIEIKCGYDLPEQNCPKCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHN
FTKEMFGENNVFRAGTISTVAEKTAFGYVKAFYEETGVLEEDMPRKIEIERQAKLVEGVK
RTTGQHPGGIIILPKEFEIEDFSPVNFPADDASSSWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVD
PTALRMLGDLTGVNPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKAEQINGETTGAIGLPEFGTSFV
RSMLRETKPKSFADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKNNTANISTVIGCRDDIMVYLMGQ
GIDATTSFKIMESVRKGQGLRKEWKEIMLAHNVPEWYIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMA
YRIAWYKIYYPAEYYATFLTNRADAFDLKTFLGGYNGVREKLIELESRKNKKDKMTTKEL
ALMPVLEIGLEMFSRGIKMANLNFEKSLADKYIIEKDETTGEATLYPPFLVIDSLGDAVA
DSIIKARSERPLTSVKDLTSRTTITQTQMKIFEQLNVLDTLAQDEQLEFDFFN
NT seq
4482 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagacaataaagtattagaattatttcaaaaattgaaaattaacttaaatgaaggt
gagctttcatattttgaacattctgaaattgaaaaaactgctataagttcagttaaatca
aaacttaagttgtcattgaagataaaaaactttttaccaataagagtattaagtgaaatt
cacgaaaaatgtataggagcagaagatattaaaattaaattaattttaaatgttcagcat
caaagaatagacaaagaaataatttgtgaatatattgaatttattaaaaacgtaaaatct
caaaacaaaacaattatttgaaattttattgaatcagaaggatttgagtatgatgatgaa
gaaaatcaaattaaatttgttgttgattctaatgaattaaaaaatcagttaacaattgaa
atggaatattgtttagctaaactatctcaatttggatttaaaaatttaagttatgatatt
caagttgaagataaaacagaagagtacataaaacaatcattaaaaattgagcaagaaaca
aaagaacaatataagcagtttgcaccagaacaaactgaaaaatcacaaaatattattatt
tctagacaaaattcacaaaaatgaaatcagtcattagataagccaagttatgaaacattt
gaagacattgaagaagatgctcaaaatatagttttacatggtaaagttatgagcattgaa
attagagattcaaaagctaataatcgtaagatctattcaataggtttaactgacaataat
tcatcaattaagtgcatatattttggcaaagaagaagaaagaacaataatggacccctta
actgaagaggaattggcatcagatagaattgatgaaattcgattaaaaagaattgcaaag
ggtgattgaattgcagttaaaggtaaaacatcatattctcaatttgatagggaacaaaac
tttattattgataaaataggtaaaatttcacgttcagaatcatcagttaaagatgaagct
aatcaaaaacgtgttgaacttcacgtacatacaaaaatgagtgcaatggacggagtttca
tcaattcaagactatttacaaatggttgataaatgaaattgaaaagctattgctgtaact
gatcatatcaatgttcaaacatttcctgatgcgtataatgagttaagaaaaattaataaa
aataaagcagatgaagataaattaaaactaatttatggtcttgaaatgaatatgattgaa
aaaggagattattgaattgttaaaaatcccaaaggtctaaaaataagagaaagaaaaatg
gttgtatttgacttagaaacaacaggtttatcgcctgaatttaatgaaattattgaattt
ggtgctgttgtatttgatccaactactggaaagacagttaaacatgattatttattcaaa
ccaaaagaacctttaaaacaatttaccattgatttaacaaacataacaccagaaatgtta
gaagataagaaaaatattgatgatgattttgctaaaatttatgacttaattaaagatagt
attttaattgcccataatgcaaactttgactttaattttttaaatagtttatctaagcgt
ttaggttatggtgaattagataatactgttattgatacacttactctttctagattagtt
agaccagctttaaaatctcacagacttggtgctgtatgtaagaaatttggaattttatat
gatgagcatgtagctcaccgtggagattatgatgctgatgttttaaatgatttattcttt
aaaataattgctgaattaaaactgacaactccaattatttatgataatgacttaatgaaa
ttagaaccaaaaaatgataaagacaacgttaacttattaagatctcgcggagttcatgtt
aatgtattagctaaaaatcaacaagggctaaaagatatctttaaactagtttcaatttct
catactgataacttttttaactctcctaaagtatttaaggaaaaattaaaagaatttaaa
gaaaaaagtaatattttaattggtgcagggtgtgttaactcagaagtaatggaaattgct
agaattggaactgatgaaaaactagaagaaattatttctttttatgactatattgaaata
caacctctaagcgtttataagaatttaattaatgataaccaattacaacaagatgaatta
ataaacgtaattaataaaattattagattagctaaaaaacataatgttatgttagttgca
acaagtgatgctcactatacaagacctgaattaaaaaaaattcgtgacgtttatattaat
gctaaaggacttggaggaagtagacatccattatttagttttagaaataaaaataaatta
attgattatcctgatcaatatttaagaacaacaaatgaaatgttaaaagaatttgcatga
ttaaatgatgcagcattaattcaagaaatggtagttacaaatacaaataaaatagctgat
atgattgatccaaatattgtagttattaaagatggtttatttacaccaaacattgaaaac
gtagatacattattaaaagataaatgttatgaaactgcacatgcaatgtatggagaagtt
ttacctgaaattgttgaagcacgtttagaaaaagaattaacatcaattattaaacatgga
tttgctgttgtttattgaatttcacatttactagttgaaagatctaataatgatggttat
cttgttggttcaagaggaagtgttggttcttcatttgtagcaacagcttcaaagattact
gaggttaacccattaaaagcacactatagatgtttaaattgtaaatactctgattttaat
actccaatcgaaattaaatgtggatatgatttgccagaacaaaattgtccaaaatgtaat
gaaaaattaattggtgatggacacgatattccatttgaaactttcttaggatttgatggt
gataaagttccagatattgatttaaacttttctggagaatatcaaccaattgcgcataac
tttactaaagagatgtttggtgaaaacaatgtatttagagccggaacaatctcaacagtt
gctgaaaaaactgcctttggatatgtaaaagcattttatgaagaaactggtgtattagaa
gaagacatgccaagaaaaattgaaattgaaagacaagcaaaattagttgaaggggtaaaa
agaacaacaggtcaacaccctggtggaattattattttacctaaagagtttgaaatagaa
gatttctccccagttaactttccagctgatgatgcatctagttcatgaaaaacaactcac
tttgatttccactcaattcacgataatttattaaaaatggatattttaggacacgttgat
ccaactgcattaagaatgcttggtgatttaactggggttaatccaattaatattccaaca
aatgatccaaaagtatattcattatttagcaatctttctgctttaaacattaaagcagaa
cagattaatggagaaacaactggagctattggtttacctgaatttggaacaagttttgtt
agatcaatgttaagagaaacaaaacctaaatcatttgctgatctagtacaaatttcagga
ctatcacatggaactgatgtttgattaggaaatgctagagacttaattaaaaataataca
gcaaacatttcaactgttattggttgtcgtgatgatattatggtttatttaatgggacaa
ggtattgatgctactacttcatttaaaataatggaatcagtacgtaaaggacaaggttta
agaaaagaatgaaaagaaattatgctagcgcataatgttcctgaatgatatattgaatct
tgtttaaaaattaaatatatgttccctaaagcccatgctacagcgtatgtattaatggct
tatcgaattgcttgatacaaaatctattatccagcagaatactatgcaacattcttaact
aatagagctgatgcttttgatttaaaaacattcttaggtggttataatggtgttagagaa
aaactaatagaattagaatcaagaaaaaataaaaaagataaaatgactacaaaggaatta
gcattaatgccagttctagaaattggattagaaatgtttagtcgtggaattaaaatggct
aatttaaactttgaaaaatctttagcagataaatatattattgaaaaagatgaaacaact
ggtgaagctacattatatcctccattcttagtaattgattcacttggagatgctgtggct
gattcaattattaaagctagaagtgaaagacctttaactagtgttaaagatctaacatca
agaacaactattactcaaacacaaatgaaaatatttgagcaattaaatgttttagataca
ttagcacaagatgaacaattagaatttgacttttttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
