Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_66848
Help
Entry
NAEGRDRAFT_66848 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K22144
cell surface hyaluronidase [EC:
3.2.1.35
]
Organism
ngr
Naegleria gruberi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ngr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ngr00536
]
NAEGRDRAFT_66848
Enzymes [BR:
ngr01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.35 hyaluronoglucosaminidase
NAEGRDRAFT_66848
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ngr00536
]
Hyaluronan
Cell surface receptors
NAEGRDRAFT_66848
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
G8
CHRD
SH3_19
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8850366
NCBI-ProteinID:
XP_002677981
JGI:
Naegr1_66848
UniProt:
D2VDH7
LinkDB
All DBs
AA seq
1264 aa
AA seq
DB search
MLSKVFLLQACIGTCLLCLFMLGMVSGQCPHQKTGLVNFSSLVGWNVANSDILITKAVKL
NDSPPNKLRSITIKSGGSLIFDNVNLNLDLNFIRVEQNASFIMGSSSCPITSKIVMTFYG
DRVNSSVNDMGSDPFDGSNLGSKGIAFLSGSIVQIFGKIDGPSWTEIVKNATKGSNQLVL
RDSVAWKVGDSIVIASTDYGEVYDYRTQKETSLNWAIGEPFPNQNEERKIVQLLNGNKTI
VLDVPLNYTHFASDNGKIRAEDLIMNYSSETSLFGGHFIIRLVDKFNMEGVEITRFGQQG
LMGRYSFHFHLLQSKPAGLNFTVKDNSVHHSYQRCYVVHDTHYILLQNNVCYRAYGHMYF
LEDGSEYGNQFISNLGIDPIPISKENSKRLIPSDTSVSVFWITNPNNTFIGNHAVGGRFP
FWFSLPSFPTGLSALRYPAGSVNPRTAPTKPFEYNVAHSSNGNGLHIDDFEKADGNSEIV
AFYTNNAVYSNFVSYKNRVFGVWCRGGYLRFDNLYLTDNKIAMNAPVGATLTEDSIFIGE
SENVGEYSYRPTVDLGKRTRPALYSSTLLDIIKGYEHYDIGGPQYLNNITFINFVTDSYK
YAGALSSRAANFKLQTKNKFSNLKFINSNRYFAFPYTYPTSYDNMKGIAMMDMDGTTTNI
TSFGGWIVGNETIRNFPQCQLRNDWNAYQCPFFGESYSHLRITTWNWPTLNTTGKDGVKR
PELADYTKPGTRMYLVDLLRNRQADLTGAYLTGPMDYYLQNNVINRGFYGLRWPYDIPTP
KNFSIALDSSATNDWLVLAIQYPRNSNFSIKYSTNSNKMVAASNFTTMFKDPTNYYYYDG
STEHLYVKLQNQASRTSYKLYDIFVDYSSSGGISLNATCPNDNCAPSQFSNPKNPGATYK
ALMREDRFVGRLETCQQSNIQPLASGSTVGGGLVFAFLDTEAASLDFTVPHSLSSIVTSL
DVGFGQPGKEDYIATPTSKTVPYSQSRFGYKLSYEEWNYLLQGKMFVKLSTSENPNGHLR
AQLYLSNGTSTSCNLPPLVSSVKPCDSPNVKNSSHVISIYNEASALSGEWSLTAYSPTDV
RNSFFNVSYSPAICGNTSLHFGLRKGDISFNKIGPKLFVDTSIYKYFELFIKTANPIYSI
QSIGFVFSYYNNSKLVEAGRYVATTSNFQHLYKIDGNRATRVRIPVSSLSFDPVQLIQRI
TIYLVDQTNYVEFLVDNMRFVGMEGKTETTERTMTISQCKNYGSVSSCGSLVNPDPDPLG
IRNL
NT seq
3795 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctttctaaagtttttcttctacaggcatgtataggcacatgtttattgtgtttattc
atgcttggcatggtcagtggacaatgtcctcatcaaaaaactggtttagtcaacttttca
tccttagttggatggaatgtagctaattctgacattctcataaccaaggctgtcaagtta
aatgattctcctccaaataagcttcgttccatcaccataaaatctggtggttcattaatc
tttgataatgtcaatctcaatttggatttgaatttcatcagagttgaacaaaacgcaagt
tttattatgggaagttcttcatgtccaatcacttccaagattgtcatgacattctatgga
gatcgtgtcaatagttctgtgaatgatatgggttctgatccatttgatggctccaatttg
ggatccaaaggtattgcctttttaagtggttccattgtccaaatttttggtaaaattgat
ggtccaagttggacagaaattgtaaagaatgctactaagggaagtaatcaacttgtttta
agggattcagtcgcatggaaagttggcgattctattgtgattgcctcaactgattatggt
gaagtttatgattacagaactcaaaaggaaacttcattgaattgggcaattggtgaacca
tttccaaatcagaatgaagaaagaaagattgttcaattgttgaatggaaacaagactata
gttttggatgttccattgaattatactcactttgcaagtgataatggtaaaattcgtgct
gaggatcttattatgaattattcatccgaaacttcactctttggtggtcactttattatt
cgtttggtcgataagtttaatatggaaggagttgaaattactagatttggtcaacagggt
ttaatgggaagatacagtttccatttccatttattacaaagtaaaccagctggtttaaac
tttacagttaaggacaactctgtccatcacagttaccagagatgttacgttgtccatgac
actcactatattctcctccaaaataatgtttgttatcgtgcttatggccacatgtacttt
ttagaagatggatctgaatatggaaatcagtttatttctaatttaggaattgaccctatt
ccaatatcaaaggaaaattccaaaagattaattccatctgatacttcagtttctgttttt
tggattactaatccaaataatacctttattggtaatcatgcagtgggtggtcgttttcca
ttttggttttcacttccatcattcccaactggtttgagtgctttaagatatcctgctgga
tcagttaatccaagaactgcaccaactaaacctttcgaatataatgtagctcacagttca
aatggaaatggtctccacattgatgattttgaaaaggcagatggcaattctgaaattgtt
gcattctacaccaataatgctgtttattccaactttgtttcatataagaatagagtcttt
ggagtttggtgcagaggaggttatcttcgtttcgacaatctctacttgactgataataag
attgccatgaatgctccagttggtgctactcttacagaagatagtattttcattggagaa
tctgaaaatgtcggtgaatattcatacagaccgacagttgacttgggaaagagaactagg
ccagctctctattcttccacattattggatattattaagggttatgaacattatgatatt
ggtggtccacaatatttgaacaatatcacatttattaatttcgttacagattcgtataag
tatgcaggtgctttatcttcgagagctgccaattttaaacttcaaaccaaaaataagttt
tccaatttaaagtttatcaattcgaatagatattttgcctttccttatacttatccaact
tcctatgataacatgaaaggaattgcaatgatggacatggacggaacaaccacaaatatt
acttcgtttggtggttggattgttggaaatgaaactattcgaaacttccctcaatgtcaa
ttaagaaatgattggaatgcctatcaatgtccattctttggcgagtcatactctcacttg
agaattacaacttggaattggccaactcttaacacaactggaaaggacggagtaaagaga
cctgaacttgccgattatactaaacctggcacaagaatgtacttggttgacttgttaaga
aatcgtcaagctgatttaactggagcttacttgaccggtccaatggattactatttacaa
aataatgtcatcaatagaggtttttatggactccgttggccgtatgatattccaactccg
aagaatttctcaattgccttggattcaagtgctaccaatgattggcttgttttggccatt
caatatccaaggaattccaacttttctatcaagtattctacaaattcgaataagatggtt
gctgcttctaattttacaacaatgtttaaggatccaactaattattactattatgatggg
tcaactgaacatttatatgtcaagttacaaaatcaagcttccagaacttcttacaaattg
tatgatatctttgtagattattcatcttctggtggaatttcattgaatgccacatgtcca
aatgataattgtgctccatctcaattttccaatccaaagaatcctggagctacctacaag
gcactcatgagagaagatcgatttgttggtagattggaaacctgtcagcaatcaaatata
caaccattggcctctggatcaacagttggtggtggattagtgtttgccttcttggataca
gaagcagcttcacttgattttacagttccacacagtttgagttctattgtaacaagtttg
gatgttggatttggtcaacctggtaaggaagattacattgccactccaacttcaaagact
gttccctattctcaaagtagattcggatataaattatcctacgaggagtggaattacttg
cttcagggaaaaatgtttgtaaaattgtcaactagtgaaaatccaaatggtcatttgagg
gctcaattatatttaagtaatggaacttccacaagttgtaatttacctcctttggtttcg
tctgtcaaaccatgtgacagtcctaacgtgaaaaattcatctcacgttatttccatttac
aatgaagctagtgctttgagtggagaatggtcattgactgcatacagtccaaccgatgtc
agaaactcattcttcaatgtatcctatagtcctgcaatttgtggaaatacttcattgcat
tttggtttaagaaagggcgatatttcattcaacaagattggtccaaagttgtttgttgac
actagcatttacaaatactttgaattattcatcaagactgcgaatccaatttacagtatt
caaagtattggtttcgtatttagttattacaataattcgaaattggtagaagctggcaga
tacgttgcaaccacaagcaacttccaacacttgtacaaaatcgatggaaacagagcaact
cgtgtgagaattccagtttcgtctttaagtttcgatcctgttcaattaatccaaagaatt
accatctacttggtagatcaaactaattatgtcgaattcttggtggataacatgagattt
gttggaatggaaggaaagactgaaacaaccgaaagaacaatgaccatttctcaatgcaag
aattatggaagtgtttcttcatgtggaagtttagtcaatccagatccagatccattagga
ataagaaacttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system