Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_69629
Help
Entry
NAEGRDRAFT_69629 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K19031
cell migration-inducing and hyaluronan-binding protein [EC:
3.2.1.35
]
Organism
ngr
Naegleria gruberi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ngr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ngr00536
]
NAEGRDRAFT_69629
Enzymes [BR:
ngr01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.35 hyaluronoglucosaminidase
NAEGRDRAFT_69629
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ngr00536
]
Hyaluronan
Cell surface receptors
NAEGRDRAFT_69629
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
G8
CHRD
SH3_19
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8851766
NCBI-ProteinID:
XP_002675289
JGI:
Naegr1_69629
UniProt:
D2VL17
LinkDB
All DBs
AA seq
1248 aa
AA seq
DB search
MYCNKHCITILLVSTLLCLLMIESVLVFGQCPYQQAGLVNFNTLTGWNVANSDIVISNAV
KMNVSPPNRLRSITVKSGGSLIFDNVNLSLDLNFIRVESNGSFIMGSSSCPITSKVVVTF
YGDRVSSSVNDIGSDPYDGASLGSKGIAFLSGSIVQMYGKVYGPSWTEIVKNASKGINQL
ELRDAVTWNVGDSIVVSSTDYGEVYDYRVEKNASLGWIRGEPFPNQNEERKIIQLLNGNK
TVVLDRALNFTHFASANGKIRAEVGLLTRRIVFRGDDSSESSLFGGHFIIRLVEKFQMEG
VEITRFGQQGLMGRYSYQRCFVVHDTNYILLKNNVCYRAFGHMYFLEDGSEVGNEFNNNL
GVDPIPISRENPRQIILSDSDVSVFWITNPNNTFVGNHAVGGRFPFWFTMPTFPTGLSAN
RYAAGSVNPRTAPPKPFENNVGHSSSGNALHIDDMEKANGSTEQAGYYPPSGVTEALYVG
FIAYKNRGYGLWCRGGLLRFKNLYLADNRVAMNSPPGPNIIQDSIFIGESENVGEYSFRP
KIDNGNRTRPGQYISSNLDLIKGYETYDNGGPQYLRNITFINFLTDSYKYAGALSSLNNN
FKLQTKNRYSDLKFVNANRYMVFPWNYPTTYDNQKAIALMDVDGSITNISSIGGWITGNE
SIMLFPQCQARNDWNAYQCPFFGESFSQFRVLNYNFTGMNTTGSDGISRPDIINTGKAVT
RMIVVDLLRNRQSNVIGAIANGLYYMLSNMIARGFYGIRWPNDIPTPKDLSFFLDSGATN
DWIVIAIQYPKGTIFNIRYGNSINMTRTTSFSTMLQEQNTFYYYDDSTEHLYLKVKNNAA
RTSYRVVDTFVDYYSGGVFYVNATCPNNNCAPSKFSNPINPVSTYKALMREDRYVGRLEA
SQQASVKPLAANSASGGGYVFAFFNNRTNSLDFTLQHNLNSIVTSIDIGFGLPGKEEYIA
DSNIVPYSQSRFGYTLSYNEWNYLLQGKMFVKLSTTQNPNGHLRAQLYINNATSVICNLP
PLVSTVKPCDSLNLKNSSHVISIYDEGRKLTNEWYMYTYIPSDVRNSFLNVTYSPAICGN
SSIHFGFRKGNISFNKIGSNRINVDTSIFKYFEFFIKTVNNTGPVSGLTLIFGYLNDTKV
VDFAKITTQSNHTQYLRIDGTSVTRIRIPLTELGFAPIQNVQRIVFYLADQTNFVEFLLD
NMRFVGVPATSETTARSMTVSQCKYFGGVSSCGSLVNPDPDPFGIRKL
NT seq
3747 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattgcaacaaacattgtattacaatcttacttgtgagcactttattgtgtttactt
atgattgaaagtgtgttggtttttggacaatgcccatatcaacaagctggtctagtcaat
tttaatactttgactggatggaatgtagcaaattctgatattgttatctcaaacgctgtc
aagatgaatgtctctcctcccaatagattacgttcgattacggtcaaatcaggtggttct
ttaatatttgataatgtaaatttgagcttggatttgaattttattagagttgaatcaaat
ggtagttttattatgggaagttcaagttgtccaatcacttcaaaggttgttgttacattc
tatggcgatcgtgtgagcagttcagttaatgacattggttcagatccatatgatggagca
agtttgggttctaagggtattgcattcttaagtggttcaattgttcaaatgtatggtaaa
gtttatggtccaagttggacagaaattgttaagaatgcatccaagggaattaatcaactt
gagttgagagatgccgttacttggaatgttggtgattctattgttgttagttctactgac
tatggtgaggtgtatgattatagagttgaaaagaatgcttccttgggatggattagagga
gaaccattcccaaatcaaaatgaagaacgaaagattattcaattattgaatggtaataag
actgttgttcttgatagagcattgaactttactcactttgcaagtgcaaatggaaagatc
cgtgcagaggttggtttattaacaagaagaattgtctttagaggggatgattcgtctgag
agttcattatttggtggtcactttattattcgtttggttgaaaagttccaaatggaagga
gttgaaattacaagatttggtcaacaaggtttaatgggaagatatagttaccaaagatgt
tttgttgttcacgatactaattatattcttctgaagaataatgtttgttatcgtgctttt
ggtcatatgtactttttagaggatggttctgaagtaggaaacgaatttaacaataatttg
ggcgttgaccccattccaatctcaagagaaaatcctcgtcaaatcattttatctgattct
gatgtttcagtattttggattacgaatccaaacaatacattcgttggtaatcatgctgtt
ggtggtcgtttcccattttggtttacaatgccaacattcccgactggattgagtgcaaac
agatatgcagctggttctgttaatccaagaactgctcctccaaaaccattcgaaaacaat
gttggccacagttcatcaggaaatgctctccatatagacgatatggaaaaggccaatggt
tcgactgaacaggcaggatattaccctccttctggagtaactgaggcactttatgttgga
ttcattgcttacaagaatagaggttatggattgtggtgtagaggtggattgttacgtttc
aaaaatttatacttggctgataatagagtcgcaatgaattctccacctggtccgaatatt
attcaagatagtatctttattggtgaatctgaaaatgttggtgaatattcctttagacct
aagattgataatggtaacagaactagaccaggtcaatatatttcttctaatttggattta
attaagggatatgaaacatatgataatggcggtccacaatatttaagaaatattacattt
attaactttttaaccgattcttacaaatacgctggtgcactctcatcattgaataacaac
tttaagcttcaaacaaagaatagatattctgatttgaaatttgtcaatgccaatagatat
atggttttcccatggaactatccaaccacttatgataatcagaaagccattgcattgatg
gatgtcgatggatccattacaaatatttcatctattggaggatggatcactggtaacgaa
tcaatcatgttattccctcaatgtcaagcaagaaatgactggaatgcttaccaatgccca
ttctttggtgaatcattttctcaattccgtgttttgaattataactttactggcatgaac
acaactggaagtgatggtattagtagacctgatattattaacacaggcaaggcagttacg
agaatgatcgttgttgatttattgagaaatcgtcaatcgaatgttattggcgctattgca
aatggtttatattacatgcttagtaatatgatagccagaggattttacggtattcgttgg
cctaatgatattccaacaccaaaagatttgagctttttccttgactctggtgccacaaac
gattggattgtaattgctattcaatacccaaagggaacgattttcaatatcagatatggt
aactcaattaatatgactagaaccactagtttctcaaccatgttgcaggaacaaaatact
ttttattactacgatgatagcactgagcacttgtatttgaaagtcaaaaataatgctgca
agaacatcatatagagtggttgatacctttgttgattactattcaggtggtgtcttttat
gtgaatgctacatgtccaaataataactgtgctccatcaaagttcagtaatccaattaat
ccagtaagtacctacaaggctctaatgagagaggatcgatatgttgggcgattagaagca
agtcaacaagctagtgtaaaacctttggcagccaactctgctagtggaggtggatatgtg
tttgcttttttcaataataggacaaattctctcgattttacacttcaacataatttaaat
agtattgtaacatctattgatattggatttggacttcctggaaaggaggagtacattgct
gactctaatattgttccatactcccaaagtagatttggatatactttatcttacaatgaa
tggaactatttacttcaaggcaaaatgtttgtcaagttgtcaaccacacaaaatccaaat
ggacatttgagagctcaattatatattaataatgctacatccgttatttgtaatttacca
ccattagtgtccacagtcaagccatgtgatagcttgaacctgaagaactcatcccatgta
atttcaatttacgatgaaggaaggaaattaaccaatgaatggtacatgtacacctatatt
ccatcagatgttagaaatagttttttgaatgtgacttactctccagcaatttgtggaaat
tcttcaatacattttggttttagaaagggtaatatttcattcaataagattggttccaat
agaatcaatgttgataccagtatcttcaaatactttgaattctttatcaagactgtcaat
aatacaggtccagtctcaggtttgaccctcatatttggatatttgaatgataccaaagtg
gttgactttgccaaaatcaccacccaatccaatcacactcaatatctcagaattgatggt
acttccgttacacgtataagaattccactcactgaacttggttttgctcctatccaaaat
gttcaaagaatagtattctatttagcagaccaaaccaactttgtcgaattccttttggat
aatatgagatttgttggagttccagcaactagtgaaacaactgcaagatcaatgacagtt
tcacaatgcaaatactttggtggcgtttcatcatgtggaagtttggtcaatccagaccca
gatccattcggtattagaaaattataa
DBGET
integrated database retrieval system