Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_71289
Help
Entry
NAEGRDRAFT_71289 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K22144
cell surface hyaluronidase [EC:
3.2.1.35
]
Organism
ngr
Naegleria gruberi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ngr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ngr00536
]
NAEGRDRAFT_71289
Enzymes [BR:
ngr01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.35 hyaluronoglucosaminidase
NAEGRDRAFT_71289
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ngr00536
]
Hyaluronan
Cell surface receptors
NAEGRDRAFT_71289
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
G8
RGM_C
EGF_2
fn3
TSP3_bac
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8855917
NCBI-ProteinID:
XP_002673723
JGI:
Naegr1_71289
UniProt:
D2VQN5
LinkDB
All DBs
AA seq
1829 aa
AA seq
DB search
MIMIGIVISFYCCMGMVTALDFDVAKLPNGLTFANSPLFQNIFKKDGNLTSFGRDFMNNN
YAWNTDLCMKDSDGDGLTNGDELGDPCCSWYYGGPPTRRYNLKDLSDPGNNSSVAPFPSA
SSVASIYNFRAIPTYHSVLLKWKMPDVSASTICYIQIQMSTLNAVGYTTITYKSYNVNNF
TRYNLDENKTYSFRILPYNKFTGYNSYGIGNQAIIFTTTKLNPYGHGIGDNCPSQVIKWS
EFDNSTFNNSTSDNSTIANDNSTIAGNSTTDNNSTVDGNSTIGNSSTTDSNNTSNSNSSN
IDDSQFNSTTNCTTEITREDIYDCYATEHTTECYTNSTFDGFYYTNHTDCVIFTHIDSFT
CDSANCSTCSNGDAMCISVTNSNCSNTTYISENVTSVVCNQITVNTSTVCSLNRTIFNVT
NCYGDNSTFILVNNTLISHNSTNSTTNSTNNYIDEEEEDDSLYLEPERILVVPENYTVIL
DVIPPKLDVVHVFGCLVFSDELDLEMHFKSMIVTGSLQIGNETSPHQHNATITLHGERNL
NRTLIGFGVKNIIVTSGGALSLHGKKHEVSWTLLGKSAQVGDTSVHLKQPTEWQVGDEIV
LASTDYYHNQAERRTISVRFNSTCFGFVKPLVYGHYANTEYYQKANGTVVTFDERGEVGL
LSHNIKIRGDLATSEDSMFGGHTAFLRTAQYVRLDNVEFTRMGQAGIPGRYPIYFQLFGD
ANTSYVHKVSVYDTYQRAVALQGTNYLHVEGVVAFNIYGHTFFLEDGAEQYNIFENNLGI
LSKVIPDSRSVMLPDNQDNNPATFYITNPNNIFIGNRAAGSDAFGFWYHLDSYATGASQT
PYIRPNRWYWGQFVNNTAHSNNQHGMMLYPNFYTCTNPKMEMYDSTNCGTDKNPWSEPVF
ENMNIWKNRQNGQYSHVQGKLNLKGSIFADNPVSYTVLNIIMSPIVVSGAIFIGFTQNKG
NPNNCNDGQCYRCGTDYKNPSSPYYRSLPSYSRNDPFIGVLYHRDGNTLLLQDLEFFDFV
DNCERKLSSIDLRNDDWASMNQGDYVTNRMYFHNANVMYLLAGLASKESSLSDVYRHEVI
IDTDGTLSRNITVPSKIRRAGARIIPSTMIMVDPILCAYVKEWNAFICDESVNFKRFEIT
TPAITNGIDRARVNSTNGYSEKLNGRLQYWGEWWYRALYMDYGIYRYSIDWLGVVGTPEK
IRLDWQGSTTLSVSIGFVKWGPLKVKIEFTDGSPTRNLSPSNFTDGLTTYDCKNNIVTLP
VKKEATVYIEEATYVPPGSNCVAVIDTDLCANRSSCGGAKRGKCVGPNECVCRWGWYTET
CSSFHCVHRNWCGGRGTCVGPNTCACFPGFGGSDCSLVHIFDLVNKVLAFGDIHLRTVDA
AEYTFNSIGEFYLYKSNELGLQGRLMKCTADSKTSCMKGISFMSGSDKVSILSDGKTGVK
VLVNDVQVYLNETKVNVQPVEADTKFEIPKDLQKLVEQIKGQVDPDTNQVANITESQLVY
KEPDTPILVLNGGATITQEDDTSSYYMVNGLKFYYKSITVKYSGDFKGQIKLRNDGLGWL
AVSFAPSKDVNFTGTELGGLYGTLDGNKDNEFTLRDGTVLPSPTAEQIHQVFGESWRISK
NESFFTYTVGSQYEDLNVLDFKPIMKASSENATLQALAEKACNSLGLTASFYESCMFDVL
STGLVEYAMASATAVAQDSCSNNGSCTAVLVCPNFCSLNGKCLSGVCKCDLGYLGEDCSI
PVTYINLVGIIVGSVIGGYVAVLFVCVSSIIALIIISRRYKVQNVTRMVSIVPTLDHRDE
LRSVCSADYEDQRIEMLDRTMGTITFKRE
NT seq
5490 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcatgataggaattgtaatttccttctattgctgtatgggaatggtaactgctttg
gattttgatgtggccaaacttcctaatggtctcacctttgctaattcacctctctttcag
aacattttcaaaaaggatggtaatttaacatctttcggaagagatttcatgaataacaat
tatgcctggaacactgatctctgcatgaaggactctgatggagatggcttaaccaatggt
gatgaattgggtgatccttgttgttcgtggtactatggaggtcctccaacaagaagatac
aacctgaaggacttgtctgatcctggcaataattcaagtgttgctccattcccttctgca
tcatcagttgcgagcatttacaattttagagcaattccaacctatcacagtgtattgtta
aagtggaaaatgccagatgtttctgctagtactatttgttatatccaaattcaaatgtct
acattgaatgcagttggatatactactattacttacaaatcttataatgtcaataatttc
acaagatataatttggatgaaaacaagacttacagttttagaattcttccatataacaag
tttactggatataatagttatggtattggtaatcaagcaattattttcacaacaaccaag
ttgaatccatatggacatggtattggtgataattgtccatcacaagtgatcaagtggtct
gaatttgataactccacctttaacaattccacttctgataactccacaatagctaatgat
aactcaacaattgctggaaactcaacaactgataataactctactgttgacggtaactca
actattggtaatagttcaacaactgattctaacaatacatccaatagcaatagttcaaat
attgatgattctcaattcaatagcactaccaattgcacaactgagattactcgtgaagat
atctatgactgttatgctacagaacacaccactgaatgttatacgaattcaacattcgat
ggattctactatacaaaccatactgattgtgtcatcttcactcatattgattcattcact
tgtgatagtgctaattgttcaacttgttccaatggagatgccatgtgtatttcagtaact
aattcaaactgcagcaatactacctacatttcagagaatgttaccagtgttgtctgtaat
caaattactgtaaatacctcaacagtttgttcccttaatagaaccattttcaatgttaca
aattgctatggcgataattcaacattcattcttgttaataatactctcatttcacacaat
tccaccaactctacaaccaattctaccaacaactatattgatgaagaagaagaggatgat
tctctctatcttgaacccgaaagaattttggttgttccagaaaactatactgttattttg
gatgtcattcctccaaaattggacgttgttcatgtatttggttgtttagttttcagtgat
gagcttgatttggaaatgcactttaaatcgatgattgttactggttctctccaaataggt
aatgaaaccagccctcatcaacacaatgccacaattacacttcacggtgaaagaaatctc
aatagaactttaattggatttggtgttaagaatatcattgtaaccagtggaggtgctttg
agcttgcatggtaagaaacatgaagtttcttggactttgttgggtaaatcagctcaagtt
ggtgatacttccgttcatcttaaacaaccaactgaatggcaagttggtgatgaaattgtt
ctagcttccactgattactatcacaatcaagctgaaagaagaacaatttcagtccgtttc
aatagtacatgttttggatttgttaaaccactcgtctatggtcactatgccaatacagaa
tactatcaaaaggctaatggaactgttgttacatttgatgaacgtggtgaagttggtttg
ttatcgcacaatattaagattagaggtgatttggcaacaagtgaagattcaatgtttggt
ggtcacactgccttcctcagaactgctcaatatgtcagacttgataatgttgaattcaca
cgaatgggtcaagctggtattccaggtcgttatccaatttacttccaattgtttggtgat
gccaatacttcctatgtccacaaggtttcagtctatgatacctatcaaagagctgttgca
ttgcaaggaaccaattatttacacgttgaaggagttgttgctttcaatatttatggacat
actttcttccttgaagatggtgctgaacagtataacattttcgaaaataatcttggtata
ctttcaaaggtcattccagattcaagatctgtcatgcttccagacaatcaagacaataat
ccagccaccttctacattaccaatccaaacaatattttcattggaaatcgtgcagctgga
agtgatgcttttggtttctggtatcatttggattcctatgctacaggtgcttctcaaact
ccatatattagacctaatagatggtactggggacaatttgttaacaacactgcccacagt
aataatcaacatggtatgatgttgtatccaaacttttacacatgcacaaatccaaagatg
gaaatgtatgattcaactaattgtggtactgataagaatccttggtctgaaccagtattt
gagaatatgaacatttggaagaatagacaaaatggtcaatactcccacgttcaaggaaaa
ctcaatttgaagggaagtatctttgcagacaatccagttagttatactgtccttaatatc
attatgagtccaattgttgttagtggtgccatctttattggttttacacaaaataagggt
aatccaaataattgtaatgatggtcaatgttatagatgtggaactgattacaagaatcca
tcctcaccatattatagatcacttccttcatacagtagaaatgatccatttatcggtgtt
ttatatcatcgtgatggtaatactttacttcttcaagatttggaattctttgattttgtt
gataattgtgaaagaaagctatcatccattgatcttagaaatgatgattgggcttcaatg
aatcaaggtgattatgttaccaatagaatgtatttccacaatgctaacgttatgtattta
cttgctggtttggcttctaaggaatcatcattgtctgatgtttatagacatgaagttatt
attgatactgacggcactttatctagaaatattactgtaccttctaaaatcagaagagct
ggtgctagaattattccaagtactatgatcatggtcgatccaattttgtgtgcctatgtt
aaggaatggaatgctttcatttgtgacgaatctgtgaatttcaagagatttgaaattaca
actccagccattaccaatggtattgatagagctagagtgaatagtactaatggatatagt
gaaaagttgaatggtagattgcaatattggggtgaatggtggtacagagcactttacatg
gattatggtatctatagatattccattgattggcttggtgttgttggtacacctgaaaag
ataagactcgattggcaaggttccacaactttgagtgtttccattggatttgtcaaatgg
ggaccattgaaagttaagattgaatttactgatggttcaccaactagaaatctctcacca
tccaatttcacagatggtctaactacttatgattgtaagaataatattgtcactcttcca
gtcaagaaggaagcaactgtctatattgaagaggctacctatgttcctcctggatctaat
tgtgttgctgtcattgatactgatttgtgtgctaatagatcaagttgtggtggtgctaag
agaggtaaatgtgttggaccaaatgaatgtgtctgtagatggggttggtacactgaaacc
tgttcatcattccattgtgtccatagaaattggtgtggaggaagaggtacttgtgttggt
ccaaatacttgtgcttgtttcccaggttttggaggatcagattgtagtcttgttcacata
tttgatttggtcaataaggttttggcctttggtgatattcaccttagaactgttgatgct
gcagaatatacattcaattcaattggtgaattctacttgtacaagtctaatgaattggga
ttacaaggtagattgatgaaatgtacagcagattcaaagacatcatgtatgaagggtatt
tcattcatgagcggatcggataaggtttcaatcttgtctgatggtaagactggtgttaag
gttcttgtcaatgatgttcaagtttatctcaatgaaacaaaagtcaatgttcaacctgtt
gaagctgataccaagtttgaaattccaaaggatcttcaaaagttagtagaacaaattaag
ggtcaagtcgatccagacactaaccaagttgccaatatcacagaatcacaacttgtgtat
aaggaaccagataccccaattcttgttttgaatggaggtgccacaattacccaagaagat
gatacatcaagttattacatggttaatggtttgaagttttattacaaatccattactgtc
aagtatagtggtgatttcaagggtcaaatcaaattgagaaatgatggacttggatggttg
gctgtttcatttgctccatcaaaggatgttaactttactggtactgaacttggaggtttg
tatggtacactcgatggaaataaggacaatgaatttacattgagagatggtactgttctt
ccttcacctactgctgaacaaattcaccaagtttttggtgaaagttggagaatttcaaag
aatgaatccttctttacttatactgttggatctcaatatgaagaccttaatgttcttgac
tttaagcctattatgaaggcctcttcggaaaatgctactctacaagctttggctgaaaag
gcttgtaatagtttgggattgacagcatcattctacgaatcatgtatgttcgatgtcttg
tcaactggtttggttgaatatgctatggcttctgctacagccgttgctcaagattcatgc
agcaataatggttcatgcacagcagttttggtatgtccaaacttctgttcattgaacggc
aagtgtttgagtggtgtttgtaaatgcgatttgggttatcttggagaggattgtagtatt
ccagttacgtatatcaacttggttggtattattgttggttctgtcattggtggttatgtt
gccgtcttgtttgtctgtgttagttccattattgccttaattataatttctagaagatac
aaagttcaaaatgttactagaatggtgagtattgtgccaactttggatcatagagatgaa
ttgagatctgtgtgtagtgctgactatgaagaccaaagaattgaaatgttggatagaaca
atgggcaccattacatttaaaagagaataa
DBGET
integrated database retrieval system