Nematolebias whitei (Rio pearlfish): 119424682
Help
Entry
119424682 CDS
T08042
Symbol
notch1a
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1
KO
K02599
Notch 1
Organism
nwh
Nematolebias whitei (Rio pearlfish)
Pathway
nwh04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nwh00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
119424682 (notch1a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
EGF_2
Ank
Notch
NOD
NODP
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_3
DL-JAG_EGF-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119424682
NCBI-ProteinID:
XP_037548099
LinkDB
All DBs
Position
18:23149333..23174019
Genome browser
AA seq
2478 aa
AA seq
DB search
MSRFFVKLAFLIPAIVLSQGLKCFLPTESCLNGGRCEATPHGNGECKCPSDYVGDRCQYP
SPCSPSPCHNGGECQAVSHANTFDFRCVCRLGFTDRLCLTPTNHACMNSPCRNGGTCELI
SLSVFRCRCPPGWSGKTCQTPNPCASNPCANGGQCSALDSTYKCTCPPTFQGQTCKQDVN
ECAQTPSLCLNGGICVNEVGSYHCRCPQEFTGQHCETTYQPCSPSPCLNGGTCVQKRETT
LDCSCLPGFTGQHCEQNIDDCPGHNCQNGGVCVDGVNTYNCQCPPHYTGQYCTENVDECE
LMPDACQNGGTCHDTHGGYHCVCVNGWMGDDCSENIDDCASAACYQGATCHDRVASFFCE
CPHGRTGLLCHLDDACISNPCQKGSNCDTNPVNGKAICTCPPGYTGSACNSDIDECALGA
NPCEHGGRCLNTKGSFQCKCLQGYGGPRCEMDVNECMSNPCHNDATCLDQIGGFHCICMP
GYEGVFCHINTDECASQPCLNNGKCIDKINSFYCECPKGFSGNLCQVDIDECASTPCKNG
AKCIDGPNKYTCECAEGYTGQHCEIDINECYSDPCHYGTCKDGLASFTCYCHPGYTGRLC
ETNINECLSQPCKNGGTCQDRENSYFCSCPKGTAGLNCEVNLDDCKSKPCDFGKCIDKIN
GYECACEPGYTGTMCNINIDDCAINPCHNGGTCVDGINSFTCLCSEGYKDATCLSQLDEC
VSNPCIHGHCQDLINGYKCTCDSGWSGQNCDINNNECESNPCMNGGICKDMTSGYHCTCR
VGFTGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGFKCNCLLPYTGENCETLLAPCSSRPCKN
GGMCKEAEDYQSFSCICPEGWQGQTCEIDINECVKHPCHNGAVCLNTMGGYQCKCKAGYF
GKKCETDIDDCKPNPCSNGGLCYDGINSFTCTCLPGFRGSRCEQDINECESNPCKNRANC
TDCVNSYTCTCPLGFSGINCEINTNDCTDSSCFNGGTCVDGINTFTCLCLTGFTGSYCQY
DINECDSKPCLNGGTCLDGYGTYKCTCPHGYTGVNCQNLVRWCDSFPCKNGGSCWQQGAS
YTCQCQTGWTGLYCDIPSVSCEVAAKQQGVEVSQLCRNSGQCLDAGNTHYCRCQAGYTGS
YCQDQVDECSPNPCQNGATCTDYLGGYSCECVPGYHGVNCSKEINECQSQPCQNGGTCID
LINTYKCSCPRGTQGVHCEINLDDCNPLIDPFTKEPKCFNNGKCVDRIGGYQCVCPPGYV
GERCEGDVNECLSDPCDPRGSYNCIQLTNSYRCECRTGYTGQRCDKVFDGCKGQPCRNGG
TCAVASNTPHGFICKCPPGFTGSSCEYDSRSCGSLNCRNGGTCVSGHLGPRCLCPSTFTG
PECLTPTDSLCISNPCYNGGTCQITPDAPFFQCSCPSNFNGLLCHILDYSFVGGFGRDIT
PPPEVEVSCEIPQCDEWAGNHICDSLCNNHACGWDGGDCSLNFDDPWQNCSAALQCWRYF
NNGKCDGQCNSPGCLYDGFDCQGQEGQCNPLYDQYCKDHYADGHCDQGCNNAECEWDGLD
CANNMPEKLADGHLVLVVHITPEHLKNRSSSFLRELSSVLHTNVVFRRDAKGEPMIFPYY
GNEQDLVKHNMLKRSADGWPEWASMPASVLGQVKESVSSMVSPRKRRELDPLQVKGSIVY
LEIDNRQCYQQSTECFQSATDVAAFLGALATSGNLNVPYIEAVTSVRPTPRTTELYPMYV
VFLGLAALGFLCLGVLVSRKRRREHGQLWFPEGFKASEPSKKKRREPLGEDSVGLKPMKN
SDFSLMDDNQNEWDDDHPDCRRFRLEEQAMLDFSNQGDQRKWTQQHLDAADLRIASIAAT
PPQGEIENDCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEEDPSAEIISDFIYQGANL
HNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLESSADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQIL
IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAIDGMVEELINCHADANATDDTGKSALHWAASVNN
VEAAVVLLKNGANKDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLEHFANREITDHLDQLPRDI
AQERMHHDIVRLLDEYNVVRSPGLHSAPLSTSTLSPPLCSPGDYLSNLKPTPSVKKPRKP
SSGGKGGKDGGKDIRVKKKKSLDGKNNLLDTSAVLSPVDSLESPHGYLSDVASPPMASPF
QQSPPMSLNHLQGNGNSHLGQINMGKDMGCMSFDPPRLSHLPVSSPTSQGTTSLGGSRGS
QCDWVTRMHPSVNQQGSFTQGPPIAHNIMGALHSVSTATLSQIMGYQNLQSSRPGSSAHL
MQQAHPRQVQHQNSSSSTAGQAHNQSFPNIELNGSDMQQNSGSGRSVAIHTIMPQETQML
GTQFLTPPSQHSYSGPMDNTPNHQLQAPEHPFLTPSPGSPDQWSSSSPHSNLSDWSEGIS
SPPTSIHSQMNLIPDKFK
NT seq
7437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcgtttctttgtgaaacttgcatttctgattccagcaatcgtcctctcacaaggt
ctaaaatgcttcctacccaccgagtcgtgcctgaatggaggaagatgtgaagccactcca
catgggaatggagagtgcaagtgtcccagtgactacgtaggtgaccggtgccagtatcct
agcccatgcagcccttcaccttgccacaacggtggtgaatgccaagctgtttctcatgcc
aacacttttgacttccgttgtgtatgccgcctgggttttacagacagactatgcctgacc
cccacaaaccatgcctgcatgaactccccctgtcgcaacggtggaacatgtgaactcatt
agtctttctgtcttccgctgtcgctgcccaccaggatggtcaggcaagacctgccagact
cccaacccctgcgcttccaatccatgtgcaaatggtggccagtgctcagccttagattcc
acgtacaagtgcacctgcccacccacattccaaggtcaaacctgcaaacaggacgtaaat
gagtgtgcacagactccttctctgtgtcttaatggtggcatttgtgtgaatgaggttggc
tcgtaccactgtcgctgtcctcaagagtttactggtcagcactgtgagaccacttaccag
ccatgtagtccttcgccatgcttgaatggaggaacttgtgtccagaagagagaaaccacc
ctcgactgtagttgccttccaggctttacagggcagcactgtgagcaaaacattgatgac
tgtccaggtcacaactgccagaatggtggtgtgtgtgtggatggggtgaacacatacaac
tgccagtgcccacctcattacacaggtcagtactgtacagaaaacgtggacgagtgcgag
ctgatgcctgacgcatgccagaatggaggaacgtgtcatgacacacacggtggctaccac
tgtgtttgtgtcaatggttggatgggcgacgactgcagcgaaaatatagacgactgcgct
agtgcagcttgctatcaaggcgccacctgccatgaccgcgtagcctcgttcttctgcgag
tgtcctcatggacgcacaggtctgctctgccaccttgatgacgcctgtattagcaaccca
tgtcaaaaaggttctaactgtgacaccaacccagtaaacggcaaggcaatatgcacctgt
ccaccaggttacactggatcagcctgcaactcagatatcgatgagtgtgcccttggtgct
aatccttgtgagcatggtggtcgctgcctcaacaccaaaggctccttccagtgcaagtgt
cttcaaggatatggtggacctcgttgtgagatggatgttaatgaatgcatgtccaatcca
tgtcataatgacgccacctgcctagaccagattggagggttccactgcatctgtatgcca
ggatacgagggcgtgttttgccacatcaacacggatgaatgtgccagccagccttgcctc
aataatggcaagtgcatcgacaagatcaactctttctactgcgagtgtccaaaaggattt
tcaggaaacttgtgccaggtggatattgatgaatgtgctagcaccccctgtaagaatgga
gctaagtgtattgatggacccaataagtacacttgtgaatgtgctgaaggttacacaggg
cagcactgtgagattgatatcaatgagtgctactctgatccctgccactatggcacttgt
aaggatggcctggcctcattcacctgctactgccaccctggctacactggccgcttgtgt
gagaccaacatcaatgagtgtcttagtcagccctgtaaaaacggtggcacttgccaggac
agggagaactcgtatttctgttcttgccccaaaggcactgcaggcttgaactgtgaagta
aacctggacgactgtaagagcaaaccgtgtgatttcggaaagtgcatcgacaaaatcaat
ggttatgagtgtgcatgcgagccaggctacacaggcacaatgtgtaacattaacattgat
gattgcgccatcaacccctgtcacaatgggggcacgtgtgttgatggcatcaacagcttc
acgtgtctctgttcagagggctacaaagatgctacctgtttgtcacagctggacgagtgt
gtcagcaacccctgtattcacggccactgtcaagacctcataaatggctacaaatgtacc
tgtgactctggttggagtggccaaaactgtgacattaataacaacgaatgtgagtccaac
ccttgcatgaatgggggaatctgcaaggacatgaccagcggataccactgcacatgcaga
gtcggcttcactggacctaattgccaaactaacatcaatgagtgtgcatccaatccctgc
ctcaaccagggaacctgcattgatgatgtggctggattcaaatgcaactgtttgctgcca
tacactggtgaaaattgtgagaccctgttggccccctgcagctctcggccatgtaaaaat
ggtggaatgtgtaaagaagctgaagactaccaaagtttctcttgcatctgccctgaagga
tggcaaggtcagacatgtgaaattgatatcaacgaatgtgtgaaacatccatgccacaat
ggtgctgtgtgccttaacactatgggtggctaccagtgcaagtgcaaagcaggttacttt
ggcaaaaagtgtgagacagacattgatgactgcaagccaaatccatgcagtaatggagga
ctgtgttacgatggaatcaatagtttcacatgtacctgtctgccagggtttcgtggcagc
cgatgtgagcaggacataaatgaatgtgagagcaacccatgcaagaatagagccaattgc
actgactgtgtcaacagctatacctgcacctgcccattgggctttagtggtatcaactgt
gagattaacaccaatgactgcactgacagttcttgcttcaatggcggcacctgtgtggat
ggaattaacaccttcacctgcctctgtctgactggtttcactggcagctactgtcaatat
gatataaatgagtgtgactctaagccatgcctcaatggaggcacctgtcttgacggttat
gggacatacaagtgcacctgtcctcatggttacactggagtcaattgtcagaatctggtg
cgctggtgtgactctttcccttgtaaaaatggaggatcatgctggcaacagggagcatct
tacacctgccagtgtcagactgggtggactggcctctactgtgacataccaagtgtgtct
tgtgaggttgcagccaaacagcaaggtgttgaagtgtctcagttgtgcaggaattcaggc
cagtgcctggatgcagggaacacacattactgtcgctgccaagctggttacactgggagt
tactgccaggaccaggtggacgagtgttcacccaatccttgccagaatggagcaacctgt
actgattatttaggaggctacagttgtgagtgtgtccctggttaccatggtgtgaactgc
tcaaaggagatcaatgaatgtcagtctcaaccctgccaaaatggaggcacctgcattgac
ctcatcaacacatacaaatgctcttgtccaagaggaacacaaggtgttcactgtgagatt
aatttggatgactgcaacccactcattgacccatttacaaaagaacccaagtgtttcaac
aatggcaagtgtgtggaccgcatcggaggctaccagtgtgtgtgtccaccaggttatgta
ggcgagcgctgtgagggtgatgtcaatgagtgcctatcagatccttgtgaccccagaggg
tcatacaactgtatccaactcacaaatagctatcgctgtgaatgtcgaactggatataca
ggtcagcgttgtgacaaggtgtttgatggctgcaagggacaaccttgcagaaatggaggg
acttgtgctgttgccagtaatacgcctcatggtttcatctgcaaatgtccacctggtttc
actggttcctcttgcgagtatgattctcgctcttgtggcagtctgaattgcaggaatggt
ggtacctgtgtatcagggcacctgggcccacgctgtctgtgcccctcaacctttacaggt
cctgagtgcctaactcccactgacagcctctgcatctctaatccctgttacaatggaggt
acttgccagatcaccccagatgctccctttttccagtgcagctgtcccagtaacttcaac
ggcttgctttgccacatactggactactcctttgttggggggtttggtcgagacattacc
ccacctccagaagtggaggtgagttgtgagattcctcagtgtgatgagtgggcaggaaac
cacatctgtgactctctgtgcaacaaccatgcctgcggatgggacggaggagactgctcg
ctgaattttgatgatccttggcaaaattgctccgctgctctgcagtgttggcgttacttc
aataatgggaaatgtgacggccagtgtaacagtccagggtgtctctatgatggctttgat
tgccaaggacaggaaggacagtgcaatcctctgtatgatcagtattgtaaagatcactat
gctgatggtcattgtgaccaaggctgcaacaatgcagaatgtgaatgggatggccttgac
tgtgccaacaacatgccagagaagcttgcagatggacatttagtcctggttgtccatatt
actccagaacatcttaaaaaccggtcctcatccttcctcagagagctgagcagtgtccta
cacaccaatgtggtgtttcgccgagacgccaaaggggagcccatgatctttccttactat
ggcaatgaacaagacctggttaaacacaacatgctgaagcgctctgcagatggttggcct
gagtgggcctcaatgccagccagtgttttgggtcaggtaaaggagagtgtgtcctccatg
gtcagtccacggaaacgcagagagctggatcctttacaagtcaaagggtctattgtttac
ctggagattgacaaccgtcagtgttatcagcagtccactgaatgtttccaaagtgcaacg
gatgtggctgcatttcttggagcactggccaccagtgggaatcttaatgtcccatatatt
gaggcagttacaagtgtgagacctactccccgaactacagagctctaccccatgtatgta
gtcttccttggcctggctgctttgggtttcctctgcctgggtgttctagtgtctcgtaag
aggagacgagagcatggccagctttggtttcctgagggattcaaagcatcggagcctagc
aaaaagaaacgcagagagccactgggagaggattctgttggactcaaacctatgaaaaac
tcagacttcagtcttatggatgataatcaaaatgaatgggatgatgatcatccagattgt
aggcgattcaggcttgaggagcaagccatgttggatttcagcaatcaaggtgaccaaagg
aaatggactcagcagcatctggatgcagctgatctcaggatagcatccattgctgctaca
cctcctcagggagagatagagaatgactgcatggatgtcaatgtcagaggaccagatggt
ttcaccccactgatgattgcttcctgcagtggtggaggactggagactggtaacagtgaa
gaggaagaagatccatcagcggaaataatctctgacttcatttatcagggcgctaacctc
cataatcagaccgatcgcactggtgagaccgcactccacttagcagcccgttatgcccgc
tcagatgctgccaaacgcctcctagagtccagcgccgatgccaacgttcaggacaacatg
ggtcgcacaccgcttcatgctgccgtggctgcagatgcacagggagtgtttcagatctta
atccgaaatcgtgccactgatcttgatgcccggatgcatgatggaacaacgccactcatc
ctagctgcccgattagcgattgatggcatggtggaagaacttatcaactgccacgctgac
gctaacgccactgatgatactggtaaatctgctcttcactgggctgcatctgttaacaat
gtggaagctgcagtggtgctgttgaagaacggggccaacaaagacatgcagaacaacaag
gaggagaccccactcttccttgcagctcgtgaaggcagttatgaaacagcaaaagtcctg
ctggagcactttgccaaccgtgagatcaccgaccatcttgaccagctgccgcgggatatt
gcccaggaacgcatgcatcatgacattgtcaggcttctagatgagtacaacgtggttagg
agtcctggtcttcacagtgcccccttgagcacatctactctttctcctcctctctgctcc
cccggtgactatcttagcaaccttaagccaacaccctctgtcaagaagcctcgaaaacca
agctctggtgggaaagggggtaaggatgggggtaaggatattagagtaaagaagaaaaag
tcactggatggaaaaaataatttactagacacatccgctgttctctccccggttgattca
cttgagtcacctcatggctacctgtcagatgttgcttctcctccaatggcatcacctttc
cagcagtcacctcccatgtctttaaatcatctacaaggcaacgggaattctcatttgggg
cagattaatatgggtaaagacatgggttgcatgtcttttgaccctccccgtctctcccac
ttgcctgtgtccagccccacctctcagggcacaacatctttaggtggcagcagagggagt
cagtgtgattgggtcaccaggatgcatcctagtgtaaaccagcaaggaagctttacccaa
gggccacccatagcacacaacataatgggcgcactgcacagtgtcagcactgccaccttg
tcacagataatgggctaccagaacctgcagagcagccgccctggctcatctgcacacttg
atgcagcaggctcacccacggcaggttcagcaccagaactcaagctcctccacagctggg
caagctcacaaccagagcttcccaaacatcgagctgaacggctccgacatgcagcagaac
agtggctcaggacgctcggtggcgattcacaccatcatgccacaggagacgcaaatgctc
ggcacccagtttctcacacctccctcccagcacagctattcaggccctatggacaacaca
cctaatcaccagctacaggcacccgaacacccttttctaaccccctcccctggttccccc
gaccagtggtctagttcatccccacattccaacctgtccgactggtcagagggcatctcc
agtccgcccacaagtatccactcgcagatgaatctgatcccagacaagtttaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
