Oreochromis niloticus (Nile tilapia): 100703553
Help
Entry
100703553 CDS
T06104
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1
KO
K02599
Notch 1
Organism
onl
Oreochromis niloticus (Nile tilapia)
Pathway
onl04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
onl00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
100703553
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
EGF_2
Ank
NOD
Notch
NODP
Ank_4
Ank_3
Ank_5
EGF_3
cEGF
DL-JAG_EGF-like
JAG1-like_EGF2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100703553
NCBI-ProteinID:
XP_003451508
Ensembl:
ENSONIG00000007454
UniProt:
I3JKK2
LinkDB
All DBs
Position
LG7:complement(16622913..16646875)
Genome browser
AA seq
2480 aa
AA seq
DB search
MYRFFVKLTFLIPAIAIAQGLKCSLPTEACLNGGRCEATPNGNGECKCPSDYVGSRCQYP
NPCSPSPCRNGGECRAVSHGNTFDFRCVCRLGFTDRLCLTPTNHACMSSPCRNGGTCHLT
ALNAYRCDCPPGWSGKTCQAANPCASNPCANGGLCSALESTYICKCPRAFTGQTCKQDVN
ECAQTPSPCLNGGVCVNEVGSYHCRCPQEYTGQHCENPYLPCSPSPCQNGGTCVQKGDTA
YDCSCLPGFTGHNCEVNIDDCPGHNCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPHYTGQYCTENVDECE
LMPNACQNGGTCHDTHGGYHCVCVNGWTGDDCSENIDDCASAACHHGATCHDRVASFFCE
CPHGRTGLLCHLDDACISNPCQKGSNCDTNPVNGKAICTCPPGYTGSACNLDIDECSLGA
NPCEHGGRCLNTKGSFQCKCLQGYEGPRCEMDVNECMSNPCNNDATCLDQIGGFHCICMP
GYEGVFCHINTDECASQPCLNNGKCIDKINSFHCECPKGFSGSLCQVDVDECASTPCKNG
AKCTDGPNKYTCECAEGYTGQHCEIDINECYSNPCHYGTCRDGLASFTCQCRPGYTGRLC
ETNINECLSQPCKNGGICQDKENAYICSCPQGTAGFNCEVNLDDCKSKPCDYGKCIDKIN
GYECACEPGYTGAMCNINIDDCAINPCHNGGTCVDGINSFTCLCPEGYNDATCLSEVDEC
SSNPCIHGRCQDLLNGYKCTCDSGWSGQNCDINNNECESNPCMNGGTCKDMTSGYHCTCR
VGFTGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGENCETLLAPCSPRPCKN
GGICKESEDYQSFSCICPEGWQGQTCEIDINECVKSPCRNGALCLNTMGGYQCKCQPGYS
GQKCETDIDDCKPNPCSNGGLCRDGINSFTCTCPPGFRGGRCEQDINECESNPCRNGANC
TDCVNSYTCTCPPGFSGINCEINTNDCTDSSCFNGGTCVDGINTFTCLCLPGFTGSYCQY
DINECDSKPCLNGGTCLDSYGTYKCTCPHGYTGINCQNLVRWCDSAPCKNGGLCWQQGAS
YTCQCQTGWTGLYCDIPSVSCEVAAKQQGVDVAHLCRNSGQCLDAGNTHYCRCQAGYTGS
YCQEQVDECSPNPCQNGATCTDYLGGYSCECVPGYHGVNCSKEINECQSQPCQNGGTCID
LINTYKCSCPRGTQGVHCEINLDDCNPSRDPLTNEPKCFNNGKCVDRIGGYQCVCPPGYV
GERCEGDVNECLSDPCDPRGSYNCIQLTNSYRCECRTGYTGQRCDKVFDGCKGRPCRNGG
TCAVASNTPHGFVCKCPPGFTGSTCEYDSRACGSLNCRNGGTCVSGHLGPRCLCPSTFTG
PECQTPTDSLCISNPCYNGGTCQITPDPPFFQCSCPSNFNGLLCHILDYSFVGGFGRDIT
PPPEVEMSCEIPQCDEFAGNHICNSVCNNHACGWDGGDCSLNFDDPWQNCSSALQCWRYF
NDGKCDGQCNSPGCLYDGFDCQGQEGQCNPLYDQYCKDHYADGHCDQGCNNAECEWDGLD
CANNMPEKLADGHLVLVVHIPPDELKNRSSAFLRELSSVLHTNVVFRRDAKGEPMIFPYY
GNEQDLVKHNVLKRSADGWPDWASMPASVLDQVKDGVSSIVSSRKRRELDPLQIKGSVVY
LEIDNRQCYQQSTECFQSATDVAAFLGALATSGNLNVPYIEAVTSVRPTPSGSELYPMYI
VFLGLAALGFICLGVLVSRKRRREHGQLWFPEGFKASEPSKKKRSEPLGEDSVGLKPMKH
SDMNLMDDNQNEWEDEDPECKRFRFEEQAMLDLGDHTDHRKWTQQHLDAADLRIESIAPT
PPQGDIENGCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLENGNSEEEEDPSAEIISDFIYQGANL
HNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLESSADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQIL
IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADANATDESGKSALHWAAAVNN
VEAAVVLLKNGANKDMQDNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLEHFANREITDHLDQLPRDI
AQERMHHDIVRLLDEYNVVRSPGLHSAPLSTSTLSPPLCSPNDYLSNLKPNISGKKIRKP
SSGGKGGKDSGKDNRLKKKKSVDGKSNLLDTSAVLSPVDSLESPHGYLSDVASPPMASPF
QQSPPMSLNHLQGNGDSHPGQMNMGKDLSCMAFDPNPPRLSHLPVSSPNSQGATSIGGSR
GGQCDWVSRMHSSIGQQGSFAQPPQITHNMMGPLHGVSTATLSQIMGYQNLQTSHLGSSA
HMMQQAHSRQLQHQNSNNTTAAQSLSQSFPTVELNGSDMQQNNCSGRTMPIHTVMPQETQ
ILGTQFLTPPSQHSYSGPIDNTPSHQLQVPDHPFLTPSPGSPDQWSSSSPHSNMSDWSEG
ISSPPTSIHSQMNLIPDQFK
NT seq
7443 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcgtttctttgtgaaactaacatttctgattccagcaatcgccatcgcacaaggt
cttaaatgctctctacccactgaggcatgccttaatggaggaagatgtgaagccacccca
aacggaaatggtgaatgcaagtgccccagtgactacgtaggcagccggtgccagtatcca
aatccctgcagtccttcgccatgccgcaacggtggcgaatgccgcgctgtttcccatggc
aacacgttcgatttccgctgcgtgtgccgcctgggtttcactgaccgactgtgcctgacc
cccaccaaccacgcctgtatgagctccccctgtcgcaatggaggaacatgccatctcact
gccctcaatgcctaccgctgcgactgtccacctggatggtctggtaaaacctgccaggct
gccaacccatgtgcttccaatccatgtgcaaatggtggcctgtgctcagccttagaatcc
acctacatctgcaaatgcccacgcgcttttactggtcaaacctgcaagcaagacgtaaac
gagtgtgcccagactccctctccctgtctcaatggcggcgtatgcgtgaatgaggtgggc
tcgtaccactgccgttgtcctcaagagtacacaggccagcactgcgagaacccctatctg
ccatgcagcccgtcaccatgccagaatggaggcacttgcgtccagaagggggacaccgct
tacgactgtagctgtcttccaggcttcacaggccacaactgtgaggtcaacatcgatgac
tgtccaggccacaactgccagaacggtggtgtttgtgtggacggggtgaacacctacaac
tgccgatgcccacctcattacacaggtcaatactgcacagaaaatgtggacgagtgcgag
ctgatgcccaacgcatgtcagaatggcgggacgtgccatgacacgcacggtggctatcac
tgcgtctgtgtcaatgggtggacaggcgacgactgcagcgagaacattgatgactgcgcc
agtgcagcttgtcaccacggtgccacctgccacgaccgcgtggcctcattcttctgcgag
tgcccccatggacgcacaggtctgttgtgccaccttgatgatgcctgcatcagcaaccca
tgccaaaagggctccaactgcgacaccaacccagtcaatggcaaggcaatatgcacctgt
cccccaggttacactggatcggcctgcaacctggatattgatgagtgctctctgggtgcc
aacccctgtgagcatggcggtcgctgcctcaacacaaagggttctttccagtgcaagtgc
ctccaagggtatgaagggcctcgttgtgagatggatgtcaacgaatgcatgtctaatcct
tgcaacaatgatgccacctgcctggaccagatcggagggttccactgcatctgcatgcca
ggatatgagggtgtgttctgccacatcaacacagatgagtgtgccagccaaccttgtctc
aacaatggcaagtgcattgacaagatcaactccttccactgcgagtgccccaaaggcttt
tcagggagtctctgtcaggttgatgttgacgagtgtgccagcacaccctgcaagaatgga
gctaaatgtactgatggacccaacaagtacacctgtgaatgtgctgaaggatacacaggg
cagcactgtgagattgacatcaatgagtgctactccaatccctgccactatggcacctgc
agggatggcctggcttccttcacctgtcagtgtcgccctggctacactggtcgcttgtgt
gaaactaacatcaatgagtgtctaagccagccctgtaagaacggcggcatttgccaggac
aaagaaaatgcatacatctgttcctgcccacaaggcactgcaggtttcaattgtgaagtg
aacctggatgactgcaagagcaagccctgtgactacgggaagtgcatcgacaaaattaat
ggctatgaatgtgcatgcgagcccggttacacaggagcaatgtgtaacatcaacattgac
gactgtgccatcaacccctgtcacaatggaggcacatgtgtggatggcatcaacagcttc
acctgcctgtgcccagagggatacaatgatgccacctgtttgtccgaggttgacgagtgt
agcagcaacccctgcatacatggcagatgccaggaccttcttaatggatacaaatgtacc
tgtgactctggctggagcggccaaaattgcgacatcaataacaatgaatgtgagtccaac
ccatgcatgaacggaggaacctgcaaggatatgaccagcggataccactgcacgtgccga
gttggcttcacaggtcctaattgccaaactaacatcaatgagtgcgcctccaacccctgc
ctcaaccagggcacttgcatcgatgatgtggctggatacaagtgcaattgtttgctgcct
tacaccggtgaaaattgtgagactctactggccccctgcagtcccaggccatgtaaaaac
ggtggaatatgtaaggagtcagaagattatcaaagcttctcctgcatctgccctgaagga
tggcaaggtcagacatgtgagatcgatatcaacgaatgcgtgaagagcccatgtcgcaat
ggcgccctttgcctcaacacaatgggaggttaccagtgcaagtgccagccgggttactct
ggccagaagtgtgagacagacatcgatgactgcaaaccaaatccctgcagtaatggtggc
ctgtgccgcgatggcatcaacagtttcacatgcacctgtccgcccgggtttcgtggtggc
agatgcgagcaggacataaatgaatgcgagagcaacccgtgcaggaacggggccaactgc
accgattgtgtgaacagctacacctgcacctgcccacctggcttcagcggtatcaactgt
gagatcaacacaaacgactgcactgacagctcttgctttaatggcggcacctgtgtggat
ggaatcaacactttcacctgcttgtgcttacccggattcacaggcagttattgtcaatat
gatatcaatgagtgtgactccaagccatgcctcaatggaggcacttgtcttgacagttat
gggacctacaaatgcacctgtcctcatggctacacagggatcaattgtcagaatcttgtg
cgctggtgtgactctgctccctgcaaaaatggaggcttgtgttggcagcaaggtgcctcc
tacacctgccagtgtcagactggatggactggcctctactgtgacatcccaagtgtttcc
tgtgaggtggcagctaaacagcaaggtgttgacgtggcacacttatgccggaattcaggc
cagtgtctggatgctggaaacacgcattattgccgctgccaagctggctacactggcagt
tactgccaggaacaggtggatgagtgctcacccaacccttgccaaaatggagccacctgc
actgattatctaggaggctacagttgtgagtgtgtccctggctaccatggtgtgaattgc
tcaaaagagatcaatgaatgtcagtctcagccctgccaaaatggagggacctgcatcgac
ctaatcaacacatacaagtgctcgtgtcccagaggaacacaaggtgtccactgcgagatc
aacttagatgactgcaacccctccagagacccactcactaatgagcccaagtgctttaac
aatggcaagtgtgtggaccgcattggaggctaccagtgtgtgtgcccaccaggttatgta
ggtgagcgctgtgaaggtgacgtcaatgagtgtttgtcagatccttgtgaccccagaggc
tcctacaactgcatccaactcactaacagctaccggtgtgaatgccgcactgggtataca
ggccagcgttgtgacaaggtatttgatggctgcaaagggcgaccttgcagaaatgggggg
acatgtgctgttgccagtaacacacctcatggttttgtctgcaaatgtccacctggtttc
actggctccacctgcgagtatgactctcgtgcctgtggcagtctgaattgcaggaatggt
ggcacatgtgtgtcaggccacctaggtccacgctgcctgtgtccttcaaccttcaccggg
cctgagtgccaaactccgaccgacagcctctgcatctccaacccttgttacaatggtggc
acttgccagataactccagaccctccgtttttccagtgtagctgccccagcaacttcaat
ggtctgctgtgccatatacttgactactcgttcgttggcgggtttggccgggacatcacc
ccacctccggaggtggagatgagctgcgagattccacagtgtgacgagtttgcaggaaac
cacatctgcaactcggtgtgcaacaaccacgcctgcggctgggatggaggagactgctcg
cttaattttgatgatccgtggcaaaactgctcctctgctttacagtgctggcgatacttc
aatgatgggaagtgtgatgggcagtgtaatagccctgggtgtctctatgatggttttgat
tgccaaggacaagaaggacaatgcaaccctctatatgatcagtattgtaaagaccactat
gctgatggtcactgtgaccagggctgcaacaacgcagaatgtgaatgggatggactggac
tgtgccaacaacatgccagagaaactggctgatggacatttagttcttgtggtccacatc
ccaccagatgagcttaagaaccgctcttcagccttcctcagagagctcagcagtgtcctt
cacactaatgtggtgttccgccgtgacgccaaaggagaacccatgatcttcccttactat
ggcaatgagcaagaccttgttaagcacaatgtgctgaagcgctctgcagatgggtggcct
gactgggcttcgatgccagccagtgttttggatcaagttaaagatggtgtgtcgtccatc
gtcagctcacggaaacgcagggagttggatcctttgcaaatcaaagggtctgtggtgtac
ctggagattgacaaccgtcagtgttaccagcagtctactgaatgcttccagagtgccaca
gatgtagctgcattccttggagcactggccaccagtgggaatctcaatgttccctacatt
gaagctgtcacaagtgtgagacctactccctccggttcagagctctaccccatgtatata
gtcttcctcggtttggctgctctgggtttcatctgcctgggtgttctggtgtcccgtaag
cggcgacgagagcacggccagctctggtttcctgaaggattcaaagcatcggagccaagc
aaaaagaaacgcagcgagccactgggagaggattctgttggcttaaagccaatgaaacac
tcggacatgaaccttatggatgacaatcaaaatgaatgggaggacgaggatccggagtgc
aagcgcttcaggtttgaggaacaggccatgttggatttgggtgatcatacagatcacagg
aaatggacacagcaacatctggatgcagcggacctgcggattgaatccattgctcctaca
cctcctcagggagacatagagaatggatgcatggatgtcaatgtcagaggaccagatggt
tttactcccttgatgatcgcctcctgcagcggtggaggactggagaatggcaacagtgaa
gaggaagaggatccatcggcagaaataatctctgactttatttaccaaggcgccaacctc
cataaccagactgaccgtacaggcgagactgccctccacctggctgcccgctatgcccgc
tcagatgccgccaaacgcctcttggaatccagcgcagatgccaacgttcaggacaacatg
ggtcgcacaccgcttcatgcagccgtggcagcagatgcacagggagtgttccagatttta
atccgaaaccgtgctactgatcttgacgcccgcatgcatgatggaacaacaccattgatt
ctggcggcccgtttagcagttgagggcatggttgaagaacttatcaactgtcacgccgat
gctaatgccactgatgaatctggtaaatctgctctgcattgggctgcagctgtaaacaat
gtggaggctgctgtggtactgctgaaaaatggtgccaacaaagatatgcaagataataag
gaagaaacgccactcttcttggcagcccgtgaaggcagctatgagacagcgaaagttctt
ctggagcattttgccaatcgtgagatcactgatcatcttgaccagctgcccagagatatt
gcccaggaacgcatgcaccatgacattgtgcgtcttctggatgaatacaatgtggtccgg
agtcctgggcttcatagcgcacccctaagcacctccaccctctccccacctctctgctcc
cccaatgactatctcagcaacctcaagccaaacatttcgggcaagaagattcgtaagcct
agctcgggtggaaaaggaggaaaggacagcggcaaagataataggctgaagaagaaaaag
tcagtggatgggaagagtaacttgctagacacatcagctgtcctctcaccagttgattcc
ctcgagtcacctcatggctacctttccgatgttgcctcgcctcccatggcttcccccttt
cagcagtcgcccccaatgtctttaaatcacctgcaggggaatggagattcccatcctggc
cagatgaacatgggtaaggatctgagttgcatggcttttgatcctaacccaccccgtctc
tcccatttgcctgtgtccagccccaacagtcagggcgcaacatctataggtggtagcaga
ggagggcagtgtgactgggtctccaggatgcactcaagcataggccagcaaggaagcttc
gcccaaccgccacagataacccataacatgatgggtcctctgcatggtgtcagtactgcc
accctgtctcagataatgggctaccagaatctgcaaaccagccatctgggctcgtccgct
cacatgatgcaacaggctcactcgcggcagctccagcaccagaactctaacaacaccaca
gccgctcagtccctcagccagagtttcccgactgttgagctgaatggatctgacatgcag
caaaacaactgctcaggccgcaccatgcccatccacacggtgatgccgcaggagacccag
atccttggcacccagtttctcacccctccatctcagcacagctattcaggcccaatagac
aacacacctagccaccagctacaggtgcctgaccacccatttttaaccccctcccctggg
tcccctgaccaatggtccagctcttccccacattccaacatgtctgattggtcagagggc
atctccagccctcccacaagtatccactcgcagatgaatctcatcccagaccagtttaag
taa
DBGET
integrated database retrieval system
