KEGG   Plasmodium berghei: PBANKA_0605200
Entry
PBANKA_0605200    CDS       T01111                                 
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, putative
  KO
K03021  DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2 [EC:2.7.7.6]
Organism
pbe  Plasmodium berghei
Pathway
pbe03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pbe00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    PBANKA_0605200
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:pbe03021]
    PBANKA_0605200
Enzymes [BR:pbe01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     PBANKA_0605200
Transcription machinery [BR:pbe03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase III system
   RNA polymerase III
    Core subunits
     PBANKA_0605200
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_1 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb2_4 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_5
Other DBs
NCBI-GeneID: 55148623
NCBI-ProteinID: XP_034420553
LinkDB
Position
6:complement(262915..267180)
AA seq 1421 aa
MKEIIKIKGKKHMGNEVKNEKKNSENNFSNSKEEGSNVNIIKIKDEHKEEKKEDEYFKDE
IRQNFDSTCNDSKYIKNFTIQTGYKKGDNTMNELIDELNTNKNIKKQENIILDDEINNNN
YEQAINIRGEINSYGKSGNVNIQNQFSKDEKKKNDKIDVLLKTSENYTNMHNKNIGGDKN
YNSLTSEKKKKINISAKFGEKINFEEFSKNPNYNCNPDLLTKEKDLIDLVVKDSKHNKSI
YENSKSINTLNEKWKLLPAYLKVKGLVKQHIESYNYFIKREIKTIMNATTNKIIKSDIDE
HFYLEFLDISVGRPSIEENMIESNLTPQICRQRDLTYSAPIYVDVEYIKGNSIVTKNNVE
IGRLPVMLRSDICVLNNKNENELMQLGECPYDPGGYFIVKGTERVLLMQEQLSKNRIIVE
MDIKHNICATITSTTAESKSRCAIVYKNNKLYLKHNSFTEDIGVCIILRAMGYESDQEIF
QMIGSHKMYLNGILLSLYDLYTENIKTNLDALLYIGKKIRPRLLAKGFFSSMKEKQVKNE
KDIIEEGLDFLSRVLLSHIQQKSKYDFRNKARCICLMIRRVLDSANNKNELDDKDYYGNK
RLELAGQLISLLFEDLYKRFYFTLKKQIDQTLSKYMQSSYNSKLKNNSSIGGNNNFSDNS
YPDVFRNLPKDIITRGMQTAISTGNWNIKRFKMEKSGVSQVLSRLSFIACIGMMTRLNSQ
FEKGRKVSGPRALQPSQWGVLCPCDTPEGESCGLVKNLALMTHVTNDNENNENLIEILYT
LGVEDSDSLTGEEMYKEGVFFVVLNGILLGVHRKPLKFMKRIRCLRRYGKIGEFVSIYDN
FLHNAIYISTDGGRLCRPLIIVENGKSKLLNSHIKALESGEINFFDLLKSSVIEWIDVNE
QNNLLIALNEKDINLNTTHLEIDPLTILGVVAGLIPYPNHNQSPRNTYQCAMGKQAIGSI
GYNQFIRCDTLLYLLIYPQKPLVKSKTIEFINFEKLPAGQNAIVSVMSFCGYDIEDAIVM
NKSSIDRGFGRCMSLRKHFIELKKYFNGSNDIVLPSPLSISKQQQMQKKYGKESNDNLAN
AKEDPKKTINSELKKYHSLDADGVVSIGYLLKEGQVYVNKYSPINVKDHVKDISKLDLND
FKLSEVKYKSVYPSYVDKIIFTENGEGLKIYKIIMRQSRLPELGDKFSSRHGQKGVVGLL
VNQEDMPFTESGICPDLIMNPHGFPSRMTVGKLLELVSSKSAVLDGEYKYGSIFSGTPFE
EAAEVLFRYGFNWSCKELLYSGLTGEPLETYIFMGPIYYQKLKHMVQDKIHARSRGPRQL
LTRQPTEGRSKEGGLRLGEMERDCLIAYGVSNLLLERLMLSSDVCDTYICEDCGMMGYDL
CCTFCKKYDKNVVVKMPYACKLLFQELQTMNVFPKIIVKET
NT seq 4266 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaggaaataataaaaataaaagggaaaaaacatatgggaaatgaagtaaaaaacgaa
aaaaaaaatagtgaaaataatttttcaaattcaaaagaggaagggtcgaatgtgaacata
attaaaataaaggatgaacataaagaagaaaaaaaagaagatgaatattttaaggatgaa
ataagacaaaattttgatagtacatgtaatgatagtaaatatataaaaaactttacaata
caaactggttataaaaagggagataatacaatgaatgaattgatagatgagttaaataca
aataaaaatataaaaaaacaagaaaatataattcttgatgatgaaataaacaataataat
tatgagcaagctatcaatataagaggggaaattaattcatatggaaaaagtggtaatgta
aatatccaaaatcaattttctaaagatgaaaaaaaaaaaaatgataaaattgatgtacta
ttaaaaaccagtgaaaattatactaatatgcataataaaaatataggaggtgataaaaat
tacaatagtttaactagcgaaaaaaaaaaaaaaattaatattagtgccaaatttggggaa
aaaataaattttgaagaattttcaaaaaatccaaattataactgtaatccagatttgttg
acaaaagaaaaagatctaatagatcttgttgtaaaagattctaaacataataaaagtatt
tatgaaaattctaaaagcataaatacattaaatgaaaaatggaaattactaccagcatat
ttaaaagtgaaaggtttggtaaagcagcatattgaatcatataattattttataaaaaga
gaaataaaaacaataatgaatgcaacgacaaataaaattataaaatcagatattgatgag
catttctatttggaatttttagatatatctgttggaagaccatctatagaagaaaatatg
atagaatcaaatttaactcctcagatatgtagacaaagagatttaacatattctgctccg
atatatgtagatgtagaatatattaaaggtaatagtattgttacaaaaaataatgtcgaa
attggaagattaccagttatgttaaggagtgatatatgtgtattaaataataaaaatgaa
aatgaattaatgcaattaggcgaatgcccatatgatcctggaggatattttattgtaaaa
ggtactgaacgggtattattaatgcaagaacaattatcaaaaaatcgaattattgttgaa
atggatataaaacataatatatgtgccactattacatctactacagcagaatctaaaagc
agatgtgctattgtttataaaaataataagttatatttaaaacataattcatttacagaa
gatataggggtttgtattatccttcgagctatgggttatgaaagtgatcaagaaatattt
caaatgattggatctcataaaatgtatttaaatggcatattactttctttatatgattta
tatacagaaaatataaaaacaaatttagacgcattattatatataggtaaaaagattcga
ccgagattattagctaaagggttttttagttcaatgaaagagaaacaggtaaaaaatgaa
aaagatataatcgaagagggcctagattttttaagtcgtgttttattatcacatatacag
caaaaaagtaaatatgattttcgaaacaaagctagatgcatctgccttatgattagaaga
gtgttggatagtgcaaataataaaaatgaattagatgacaaggattattatggtaataaa
agattagaattagctggacaattaatatcattactttttgaagatttatataaaagattt
tattttactttaaaaaaacaaattgatcaaacattaagtaaatatatgcaaagtagctat
aactcgaaattgaaaaataatagtagcattggtggaaataataatttctctgataattct
tatccagatgtgtttagaaatttaccaaaagatatcataacaagaggaatgcaaacagct
atatctactggaaattggaacataaaaagatttaaaatggaaaaaagtggggtatctcaa
gttctttctcgtttatcatttattgcatgtataggcatgatgacaagattgaattctcaa
tttgaaaaaggccgaaaagttagtgggcctagagctttacaaccatctcaatggggagta
ctatgcccatgtgatacgcctgaaggggaatcatgtgggttggtaaaaaatttagcacta
atgacacatgtaacaaatgataatgaaaacaatgagaacctaatagaaattctttataca
ttaggagtagaagatagtgatagtttaactggagaagaaatgtataaagagggtgttttt
tttgttgtattaaatggtatattattaggggttcatagaaaacctcttaaatttatgaaa
agaattagatgcttaagaaggtacggaaaaataggagaatttgtatcgatatatgataat
tttttacataatgcaatttatatatcaactgatgggggaagattatgtagaccattaata
attgtcgaaaatggaaaatctaaattattaaattcacatattaaagcattagaatctgga
gaaataaatttttttgatttattaaaaagttccgtaatagaatggatagatgtaaatgaa
caaaataatttattaatagccttaaatgaaaaagatattaatttaaatacaacacattta
gaaattgatccattaacaattttaggagtagtagcaggattaataccctatccaaaccat
aaccagagtcctagaaatacatatcaatgtgctatgggaaagcaagctataggttctatt
ggatataatcaatttattagatgtgatacacttttgtatttgttaatatatccccaaaag
ccattagtaaaatctaaaactattgaatttattaattttgaaaaactcccagctgggcaa
aatgcaattgtatctgttatgagtttttgtggatatgatattgaagatgcaatagttatg
aacaaatcatcaatagatcgaggattcggtagatgcatgtctttaagaaaacattttata
gaattaaaaaaatatttcaatggttccaatgacatagttctcccttctcctctttctata
agcaaacaacaacaaatgcaaaaaaaatatggtaaggaatcaaacgataacttagcaaac
gcaaaagaagatcctaaaaaaactataaatagtgaattaaaaaaatatcattcattagat
gcagatggagttgtatctataggttatttattaaaagagggccaagtatatgtgaataaa
tattcgccaataaatgtaaaagatcatgtgaaagatattagcaaattagatttaaatgat
tttaaattaagtgaagtaaaatacaaaagtgtttatccttcatatgtcgataaaataata
tttacagaaaatggagaaggcttaaaaatatataaaattattatgagacaatctaggtta
ccagaattaggtgataaatttagttcacgacatggacaaaaaggtgttgttggattattg
gtaaatcaagaagatatgccatttacagaatcaggaatatgccctgatttaattatgaac
cctcatggatttccttctcgtatgacagtaggtaagcttcttgagctcgtttcatctaaa
tcggctgttctagatggggaatataaatatggctcaatttttagtggaacaccatttgaa
gaagcagctgaagttttgtttagatatggttttaattggtcatgtaaagaattattatat
tcaggattaacaggagagccattagaaacatatatatttatgggtccaatatattatcag
aaattaaaacatatggttcaagataaaatacatgctagatctcgagggcctaggcaattg
ttaacacggcagccaactgaaggtcgatcaaaagaaggaggattgaggcttggtgaaatg
gaaagagattgcttaattgcatatggtgttagtaacttattacttgaaaggcttatgtta
agtagtgatgtttgtgatacttatatttgtgaggattgcggaatgatgggttatgatttg
tgttgcacattttgtaaaaaatatgacaaaaatgtcgttgtcaaaatgccatatgcctgt
aagcttcttttccaggagttacagactatgaatgtattcccaaaaattattgtgaaggaa
acataa

DBGET integrated database retrieval system