Plasmodium berghei: PBANKA_1237800
Help
Entry
PBANKA_1237800 CDS
T01111
Name
(RefSeq) ABC transporter B family member 1, putative
KO
K05658
ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1 [EC:
7.6.2.2
]
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Pathway
pbe02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
PBANKA_1237800
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pbe02000
]
PBANKA_1237800
04147 Exosome [BR:
pbe04147
]
PBANKA_1237800
04090 CD molecules [BR:
pbe04090
]
PBANKA_1237800
Enzymes [BR:
pbe01000
]
7. Translocases
7.6 Catalysing the translocation of other compounds
7.6.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
7.6.2.2 ABC-type xenobiotic transporter
PBANKA_1237800
Transporters [BR:
pbe02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB1, 4, 5 subgroups
PBANKA_1237800
Exosome [BR:
pbe04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
PBANKA_1237800
CD molecules [BR:
pbe04090
]
Proteins
PBANKA_1237800
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
AAA_22
SMC_N
RsgA_GTPase
ABC_ATPase
AAA_29
DUF5906
AAA_18
nSTAND3
AAA_15
AAA_7
Zeta_toxin
AAA_23
DEAD
AAA_14
DUF87
ResIII
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55151227
NCBI-ProteinID:
XP_034423052
LinkDB
All DBs
Position
12:1452481..1456740
Genome browser
AA seq
1419 aa
AA seq
DB search
MAEEKSNNNSIKHEVEKELNKKSTVELFKKIKSQKIPLFLPFHSLPSKYKKLLVVSFICA
TISGASLPIFISVFGVTMANLNIGESVNDTVLKLIIVGICQFILSSISSLCMDVVTTKIL
RTLKLKYLKSVFHQDGEFHDNNPGSKLTSDLDFYLEQVNAGIGTKFITIFTYSSSFLGLY
FWSLYKNVRLTLCITCVFPVIYICSSICNKRVRLNKKTSLLYNNNTMSIIEEAIVGIKTV
ASYCGESVILKKFKLSEQFYSKYMLKANFMESLHIGLINGFILASYALGFWYGTRIIIHD
IKTLNYGSGFNGSAVISILLGVLISMFMLTIILPNVAEYMKSLEATNNIYEVINRKPAVD
RNQNKGKKLDDIKKIEFKNVKFHYGTRKDVEIYKDLNFTLKEGNTYAFVGESGCGKSTIL
KLLERFYDPTDGDIVINDSHSLKDVDLKWWRSKIGVVSQDPLLFSNSIKNNIKYSLISPN
SLEAVENGFDFRGNSDSSLNRDNSKNGKCTSILDEISKRNTTSDLLEVISSINSVEDSKV
VDVSKKVLIHDFVASLPDKYDTLVGSSSSKLSGGQKQRISIGRAVIRNPKILILDEATSY
LDNKSEYLVQKTINNLKGNENRITIIIAHRLSTIRYANQIFVLSNRDQESTGNDENKQGA
INSNNGSVIVEQGTHDSLMKNKNGIYYSMIQNQKVSSSGNGENDCDNNSSVYKDSDTGAA
KSATDTNMDINIDKDFNIRKEKEIADTDKPSKPSFFKRMFGKKEKKPPSNLSMVYKEMFS
HKKEVFIILLSTIVAGGLYPLFAILYAKYVGTLFDITNMEHNSNKYSLYILLIALSMFIS
ETLKNYYNNLIGEKVENKFKYLLFESIIHQEIGFFDKDEHAPGFLSSHINRDIHLLKTGL
VNNIVIFTHFIILFIISTILSFYFCPIIAGALTLAYTITTRTFAIRTRLQKSKEIERIGS
KRDGQFSYTNDEEIFKDPNFLIQEAFYNMQTIVTYGLEDYFCKLIENAIDYDSKGDRRKM
IVNSLLWGFSQCTQLFINAFAYWLGSILIDHRIIEVDNFMKSLFTFIFTGSYGGKLMSFK
GDADKAKITFEKYYPIMVRKSNIDVRDESGIRINDPNKIDGKIEVKDVNFRYLSRPNVPI
YKDLSFSCDSKKTTAIVGETGCGKSTIMHLLMRFYDLKDDHVLLDNQHIEKDNKDKSKDI
EMRDATSMKNLNELGKKNANEEFTVYKNSGKILLDGIDICDYNLKDLRGLFAIVNQEPML
FNMSIYENIKFGKQDATLDDVKRVCKFAAIDEFIESLPNKYDTNVGPYGKSLSGGQKQRV
AIARALLREPKILLLDEATSSLDSHSEKLIEKTIVDIKDKADKTIITIAHRIASIKRSNK
IVVFNNPDKNGSFVQAQKTHDELIRDKDSVYTKYVKLTK
NT seq
4260 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggaagaaaaaagtaataataatagtatcaaacatgaagttgagaaagagttaaat
aagaaatctaccgttgagctgtttaaaaagatcaagtcacaaaagattccattgtttttg
ccatttcattcattaccatccaaatataagaaattattagttgtatcttttatatgtgca
actatatcaggagcttcgttgcctatttttatttcggtgtttggtgttaccatggcaaat
cttaatattggagaaagtgtgaatgatactgttttaaaattaataatagttggtatatgt
caatttatattatcatcgatttcaagtttatgcatggatgttgttactacaaaaatttta
agaacattaaaattaaaatatttaaaaagtgtttttcatcaagatggagaatttcatgat
aataatccaggttctaaattaacatctgatttagatttttatttagaacaagtaaatgca
ggaataggaacaaaatttattacaatatttacatatagtagttcatttttaggtttatat
ttctggtcattatataaaaatgtaagattaacattatgtattacatgcgttttcccagta
atatatatatgcagctctatatgtaataaaagggtccgattaaataaaaaaacatcacta
ttatataataacaatacaatgtcgataattgaagaagcaatagttggtattaaaactgta
gcaagttattgtggagaaagtgtaatattaaaaaaatttaaattatcagaacaattttac
agtaaatacatgttaaaggcaaattttatggaatcactacatattggtttaattaatgga
tttatattagcttcttatgctttgggattttggtatggtactagaattataatacatgat
attaaaactttgaattacggtagtggcttcaatggaagcgcagttatatcaatattatta
ggagttcttataagtatgtttatgcttactattatattaccaaatgttgctgaatatatg
aaatcgttagaggcaactaacaatatatatgaagttattaacagaaaaccagctgtcgac
agaaatcaaaataaaggtaaaaaattagatgatattaaaaaaattgaatttaaaaatgta
aagtttcattatggtactagaaaagatgtcgaaatttataaggatttgaattttacttta
aaagaaggaaatacttatgcatttgttggagaatctggatgtggtaaatcaacaatttta
aaattacttgaacgattttatgacccaacagacggagatattgttattaatgattcacac
agtttgaaagacgttgatctaaaatggtggagatctaaaattggagtagttagtcaagat
cctttattatttagcaattctattaaaaataatattaaatatagtttaataagtccaaat
agtttagaagcagtagaaaatgggttcgattttcgcggaaatagtgattcttcattaaat
agagataatagtaaaaatggaaagtgcactagtattttggatgaaatatctaagaggaat
acaactagcgatttattagaagtaatatcgtctattaattcagttgaagattcaaaagtt
gtagatgtatctaagaaagtcttaatccacgattttgtagcatccttaccagataaatat
gacactttagtaggttctagctcatctaagttgtcaggtggacaaaaacaacgaatatct
ataggtagagctgttattagaaatcctaaaattttaattcttgatgaagctacatcatat
cttgataataaatcagaatatttagttcagaaaacaattaacaatttaaaaggaaatgaa
aatagaattactattattattgctcatagattaagtactattcgatatgctaatcaaatt
tttgtcttatcaaatagagatcaagaatcaacaggaaatgatgaaaacaaacaaggtgct
ataaatagtaataacggaagtgtaatagttgaacaaggcactcatgatagtttgatgaaa
aataaaaatggtatttactattctatgattcaaaaccagaaagtatcgtcaagtggaaat
ggtgaaaatgactgtgataataatagtagtgtatataaagattctgatacaggtgctgct
aaatctgctactgatacaaatatggatattaacatagataaagatttcaatattcgaaaa
gaaaaagagattgcagatactgataagccaagtaaaccatcattcttcaaaagaatgttt
ggaaagaaagagaagaaacctcctagcaatttgagtatggtatataaagaaatgttttct
cacaaaaaagaggtttttattatacttttaagtactatagtggcaggtggtttatatcca
ttgtttgccatattatatgcaaaatatgttggaacattatttgatatcacaaacatggaa
cataattcaaataaatattctctctatatattacttattgctttatctatgtttatttct
gaaacgttaaaaaattattataataatttaattggagaaaaggttgagaacaaatttaaa
tatttattgtttgagagtataatacatcaagaaattggtttttttgataaagatgaacat
gcccctggatttttatcgtcgcatattaacagagatatacatttgttaaaaactggttta
gtaaataatattgtaatatttacgcattttattattttgtttattattagtacgattttg
tcattttatttttgcccaataatagcaggagctttaacattagcatataccattacaacg
cgaacatttgctataagaacacgattgcaaaaatctaaagaaatagagaggattggaagt
aaaagagatggacagttttcatatactaatgatgaagaaatatttaaagaccctaacttt
ttaattcaagaagcattttataatatgcaaacaattgttacatatggattagaagattat
ttttgtaaattaatagaaaatgcaatagattatgacagtaaaggggatagaagaaaaatg
atagttaattcattattatggggatttagtcaatgtacacaattatttattaatgcattt
gcttattggttaggttctattttgatagatcaccgtattatagaggttgataattttatg
aaatctttatttacatttatatttactggtagttatggtggtaaattaatgtccttcaaa
ggagatgcagataaagctaaaataacatttgagaaatattatcctataatggttagaaaa
tcaaatatagatgtaagagatgaaagtggtataagaataaatgatccaaataaaatagac
ggaaaaatagaagtgaaggatgttaattttagatatttatctagaccaaatgtaccaata
tataaagatttatcctttagttgtgatagcaaaaaaacaacagctatagttggagaaact
ggatgtggtaaatccacgattatgcatttattaatgcgattctacgatttgaaagatgac
cacgttttattggataatcaacatattgaaaaagacaataaagataaatcaaaggatata
gaaatgcgtgatgcaacatctatgaaaaatttgaacgaattgggtaaaaaaaacgcaaat
gaagaatttactgtttacaaaaatagtggcaaaattttacttgatggtatagatatttgt
gattataacttaaaagatctaagaggattatttgcaatagttaaccaagaaccaatgttg
tttaatatgtctatttatgaaaatataaaattcggtaaacaagatgcaacattagatgat
gtaaaaagagtatgtaaatttgctgctattgacgaatttattgaatcattaccaaataaa
tatgatactaacgtaggaccttatggtaaaagtttatcaggtggtcaaaaacaacgagtt
gctattgctagagccttattaagagaacctaaaatattattgttagacgaagctacttca
tctcttgattcacactcagaaaaattaatcgaaaaaactattgttgatattaaagataaa
gctgacaaaacaatcattactattgctcacagaattgcatctattaaaagatcaaataaa
attgtagtttttaataacccagataaaaatggatcttttgttcaagcccaaaaaacacat
gacgaattgattcgtgataaagatagtgtttatacgaaatatgtcaaattaactaaataa
DBGET
integrated database retrieval system