Plasmodium chabaudi: PCHAS_1108700
Help
Entry
PCHAS_1108700 CDS
T01108
Name
(RefSeq) RNA polymerase I, putative
KO
K02999
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Pathway
pcb03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
PCHAS_1108700
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
pcb03021
]
PCHAS_1108700
Enzymes [BR:
pcb01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
PCHAS_1108700
Transcription machinery [BR:
pcb03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
PCHAS_1108700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3492567
NCBI-ProteinID:
XP_016653933
UniProt:
A0A4V0KA27
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(300069..307976)
Genome browser
AA seq
2570 aa
AA seq
DB search
MYDINSAKCSEIKSAELDVLSSQELKRISLGKYENQLQEFEKISKDGTSNRITYDPRFGT
IDYSQICSVCFEKHDNCLGHVGHIEFMLPVFNPLFYKDLQELLNLVCYNCYALCYSEDVI
FLLKHIYQLKSLNEIESSNKFVIKKNNENEYIVSEIERLYNKICKESNITMDDIVESICQ
DYEKSFGNNEKTNNENNSNEDNQTYELWKKINNDMNSGDEQNEPDPSKESEKKQDDNNDL
KKQKSNEEAESQETKEKIRFLKEKIKKYNFDISKLAFQSNYNYEEYLILNKAIKIHMKKG
ANCSYCKFRRSITVKTSPKKDTINFVGAYTNNSFFKRYLSKKDKNKISGENGDDNLEDNE
INYDHVDVEKPNKQGKESKSGKRKSLDNINLENGDDQLVEGTDNNKDGDENDESFKDAVA
SYKRKTSKEKCTVRLFSFQIVDLLKKIFVNNNKDIINLLYPFTKKDGCQVFFLYDMGISA
NRFRTQFRGIHKRIKVTNYICKLNNFVKLCINSKKNIDFDYMIEYNKTELDLYNEMFSLF
SLKQRSRTVSNSMDFNVEIAKSDFLRCYSLIYNNKSAYLNILFGNLQLAVNTFFDSSLID
KRVQKNLDNICIKEILDKKEGVVRKNIMGKRVNNCARTVISPDTFIETNQIGVPIEFAKT
LTIDEHITENNFEYIKKLIENGPDMYPGALSYKDSQGRVFKLSRSYEGRMKLINELANLL
RKEKKETLILHRHARDGDIVIMNRQPTLHKFSIMAHFLKIFEKEKVFRLNYVNCSSYNAD
FDGDEMNLHLLQTPLARAEATHLMNSDFLFTSFKDGSPLRGLAQDFILGGLHLTSLETFL
NYDEYCNLLQCSLNVLLRQKNSFFFRKPKRSNTSGSPNRKDGNKNSGSNDKGTSNSFSGI
NSKISNYSYLDPYASNLSRTHFTIKTEEPTILFPKKLWTGKQLISSILKTIINELAIETY
NKNGDNNFMENFKGINYIAKAKTDPELWSFDPIKECDIIIRNSELLQGVLDKLHFGASSN
SFVHLCYELFGPKSAAVMLDCFGRLFISFLQLRGTSLSLYDFILKKKAKDEKKKIKKRIS
FTGFYLQNLFVYTIGKALNADMNKMNEYSNKKISNYEECKNLFSNKLYDIYLKKSKIINN
YEKKLGKEINIENEDVNTNLCLTKTEDLTKNISSKFNLFNDEEFNMKKDLYFITLLNKEI
ENIFIQNKLLSDNVKNDQPEQIETYEYSNSPHLNYIIKAENYELFEKYVIEKTKDDSVDE
HNETGYSEFVNNIIHKLYNSIKNPSFYKSTTFTSVQIVKVIEKIITFLREAKCNKRLKVF
ILFELFQNENITKYFPSLIEFATNLNTDISSEEIVETVINNILLKKDLKLETEQISSRDV
EKSSFNGKRWETTNDIILKRYLYLYNRLVKVEKDKKGQINNSPLKPKNDQDADIINETPL
ENSQNININENVHIYDGDAIKNCLISSLPSFALNEDINNLSYNNRYQYYEKYLNIKDEKY
SRFKFYKMEDVFHKLDFLINNFFSLKRLDFDNMLDSLFQPYLCRVSSGTNNLITMENLMN
KFLDNGFSNMIFTGAKGSKVNYSMICGMLDQQYLEGKRVPRMRSGKTLPSFHRYDYGARS
CGLITDCFLEGLRPQEYFFHCMSGREGLIDTAVKTAKSGYIQRCLIKSMESIILHYDGTV
RNEDNAIIQFLYGEDGIDPSKTAYLNSPSDLINNYNISFSKYLNYGSSQLIQKNQNLFMS
NGSCSKNEDPLICQYNPYTYIGSVSDNYDSKLNNILRKSDFNLTNNDENFYSLSSSLLRS
KYFHSLCSPGESIGILVAQSFGEPATQMTLNTFHLAGTENVTMGIPRLKEIFLTSKLTSK
PMIYVPIKLEENNMNNPNEIKNYITNIADKILSSYQSILLSEVIYGIGIDRKLIIRDKID
NKEIHMIQLDKVEPKDNEKKSFDWDIYKTKDYSKILQVLENTNLNFDLKKEWAHEIVIQF
DNLNHFCKVNKHLSVSFILYKIVNIVLISILNKIQSSISHHNIRNINFMNHEHYDELFDF
ISGKMSEDFNFNFDKYEYKNDEDEINAKLKHMPKDAGGNKSGDENDYGRSHNLNNSKKYN
EENDDNMSMGDKNEESGNEKNNKSDGNDDSDQNDDGRESDEYKSEQEDKEYDESEEDADN
EDDSRSSQNEQDSDDDVKHDSMNGSESDDNKYDETEKNLKKKKSEKKSEKKKSKLLNETD
SESDASSNLTITNPGIIDGESKESNKSKKEENMGISGKKRKLSDGSDYIKNEKHRKEINY
DSSMSSENEAELKKEMSKRFSKYSYDYKNRMNKIDLDVSDYEDLSIGIAGNKNKLYDQKY
IKHIIEKMKSSLLCFIKRIEFSPITWVLKFELSWDVNFFPYPIDFLSYLQNDISKEILFK
VKDLNNPKILKGKDITHSGEEYELQIEGRNVYKLFNIKDKYIDKTKLYCNDIYTIVKTYG
IEAGRLCITKELKKVFEAYGIKIDFRHLSFISDFMTHTGDLKSFNRYGMSAYRNIFHKMS
FECATSFMIQGCIQNSVDYLSTASSSLFFGKHIKVGTNVSNIITCINGGT
NT seq
7713 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatgacataaacagtgcgaaatgctctgaaatcaaaagtgcggaacttgatgtgttg
agcagccaagaactaaaaagaatttctcttggtaaatatgagaatcagttacaagaattt
gaaaaaatttcaaaagatggaacatcaaatcgaattacatatgatcccagatttgggact
atagattattcacaaatatgttctgtttgttttgaaaaacatgacaattgcttaggtcat
gttggacacatagagtttatgctcccagtatttaatcccctattttataaagacttacaa
gaattactaaatctagtttgttataattgttatgcactatgctactcagaagatgttata
tttttattaaaacatatttatcaattaaagtcattaaatgaaattgaaagctcaaacaag
tttgtaataaaaaaaaataatgaaaatgaatatatagttagtgaaatagaaagattatat
aataaaatatgtaaagaatcaaatattactatggacgatatagttgaatccatatgtcag
gattatgaaaaaagttttggaaataatgaaaaaacaaataatgaaaataattcaaatgaa
gataaccaaacatatgagttatggaaaaaaataaataatgatatgaacagtggtgacgaa
caaaacgagccggatcctagtaaagaatctgaaaaaaaacaagatgataataatgattta
aaaaaacaaaaatcaaatgaagaagcagaaagtcaagaaacaaaagaaaaaataagattc
ctaaaggaaaaaataaaaaaatataattttgatataagtaaattagcttttcaatcaaat
tataattatgaagaatatttaattttaaataaagccataaaaattcatatgaaaaaaggg
gctaactgttcatattgtaaatttcgtagaagtataacagtaaaaacatcccccaaaaaa
gatactattaattttgtaggggcatatacaaataactcgttttttaaaaggtatctttcg
aaaaaggataaaaataagatatctggagaaaatggagatgataatttagaagataatgaa
ataaattatgaccatgtagatgtagagaaaccaaataaacaaggtaaagaatccaaatct
gggaaaagaaaaagtttagataatataaatttagaaaatggagatgatcagcttgtggaa
ggaactgataataataaagatggagatgaaaatgatgaatcattcaaagatgctgtagct
tcatataaacggaaaacatcaaaggaaaaatgtacagttcgtttatttagttttcaaatt
gttgatttattaaaaaagatttttgtaaataataataaagatataattaatttgttatac
ccatttacaaaaaaagacggatgtcaagtattttttttatatgatatgggaataagtgca
aatcgttttcgaacgcaatttagagggatacataaaagaataaaagttacaaattatata
tgcaaattgaataattttgtaaaattatgtataaatagcaaaaaaaatatcgattttgat
tatatgatagaatataataaaactgaattagatttatataatgaaatgttttcattattt
tctttaaaacaacgatcaagaactgtttcaaattctatggatttcaatgttgaaattgca
aaatcagattttttgcgatgctattcattaatatataataataaaagtgcttacttaaat
attttgtttggtaatttacaactcgcagtaaatacattttttgatagcagtttgattgat
aaacgggttcaaaaaaatttagataatatatgtataaaagaaatcctcgataaaaaagaa
ggtgtagtacgaaaaaatataatggggaaacgtgtaaataattgtgctcgtactgttata
tctcctgatacatttattgaaacaaatcaaattggggttcctatcgaatttgcgaaaact
ttaactattgatgaacatataactgaaaataattttgagtatataaaaaaattaattgag
aatgggccagatatgtatccaggtgctttaagttataaagatagtcaaggaagagtattt
aaattatctcgctcatatgaaggtagaatgaaactaataaatgaactagccaatttatta
cgtaaagaaaaaaaagaaactttaattttacataggcatgctagagatggagatatagtc
ataatgaatagacaaccaactttacataaattttctattatggcacattttttaaaaatt
tttgaaaaagaaaaagtttttagattaaattatgttaattgtagtagttataatgctgat
tttgatggagatgaaatgaatcttcatttattacaaacccctttagcacgtgcagaagca
acacatttaatgaattctgattttttatttacaagttttaaagatggatcacctttacga
ggattagctcaagattttattcttggtggattacatcttacttctttagaaacattttta
aattacgatgaatattgcaacttattacaatgctctcttaatgttttgcttcgtcaaaaa
aattcattttttttcagaaagccaaaacgtagcaatacatctgggagtccaaacagaaaa
gatggaaataaaaattcagggtctaatgataaaggtacatctaattcatttagtggaatc
aattcaaaaatatcgaattatagttatttagatccttatgcatctaatttaagcagaaca
cactttactataaaaacagaagagccaactattttattccctaaaaaactatggacagga
aaacaattaatatcaagtattttgaaaactatcataaatgaactagctattgaaacatat
aataaaaatggagataataattttatggaaaattttaaaggaataaattatatagccaaa
gctaaaacagatcctgaattatggtcatttgatcctataaaagaatgtgatattattatt
agaaattcagaattattacaaggtgtattagataaattacattttggagctagctcaaat
agttttgtacatctatgttatgaattatttggacctaaatctgctgcagttatgcttgat
tgttttggtagattatttataagttttttacaattacgtggtacaagtttaagtctatat
gattttattttaaaaaagaaagctaaagatgaaaagaaaaaaattaaaaaaagaatatca
tttactgggttctacttacaaaatctttttgtttatacaatcggaaaagcattaaatgca
gatatgaataaaatgaatgaatatagtaataaaaaaataagtaactatgaagagtgtaaa
aatttattttcaaataaattatatgatatctatttaaaaaaatcaaaaattataaataac
tatgaaaagaaattaggaaaagaaattaatattgaaaatgaagatgtaaacacaaattta
tgcttaactaaaacagaggatcttacaaaaaatatttcaagcaagtttaatctttttaat
gatgaagaatttaatatgaaaaaggatttatattttattacattactaaacaaagagatc
gaaaacatatttattcaaaacaaattgcttagtgataatgtaaaaaatgaccaacctgaa
cagatagaaacatatgaatattcaaactcaccacatttaaactatataattaaagcagaa
aattatgaactgtttgagaagtatgtaattgaaaaaacgaaggatgattcggtagatgag
cacaatgaaacgggatactctgaatttgttaataatataatacacaaattatataattca
ataaagaatccatctttttataaaagcacaacatttacaagtgtacaaatagtaaaggtt
attgaaaaaattataacctttttaagagaagcaaagtgtaataaaagattaaaagtattt
attttatttgaactatttcaaaatgaaaatataacaaaatattttccttctttaattgaa
tttgccactaatttaaacacagatataagtagtgaagaaatagtcgaaactgtaataaat
aatatattattaaaaaaggatcttaaactcgaaacagaacagatatcatctcgtgatgta
gaaaaatccagtttcaatggcaaaagatgggaaacaacaaatgatatcatattgaaaaga
tatttatatttgtataatcgtttagtgaaagtagagaaggacaaaaaaggtcaaataaat
aattcccctttaaaacctaagaatgatcaagatgcagatataataaatgagacacctctt
gagaattcacaaaatataaatataaatgaaaatgtacatatatatgatggagatgctata
aaaaattgcttaatatcaagtttaccttcatttgctcttaacgaagatataaataatctt
tcctacaataacagatatcaatattatgagaaatatttaaatataaaagatgaaaaatat
tcacgttttaaattttacaaaatggaagatgtatttcataaattagattttttaataaat
aattttttttcattaaaaagattagattttgataatatgcttgattcattgtttcaacca
tatttatgtagagtatcatctggaacaaataatttaataactatggaaaatttgatgaat
aaatttttagataatggatttagtaatatgatttttactggtgctaaaggaagtaaggtt
aattattctatgatttgtggtatgctagatcaacaatatttagaaggaaaaagagtccca
agaatgagatcaggaaaaactttacctagcttccatagatatgattatggtgctagatct
tgtgggttaattacagattgttttttagagggcttaagacctcaagaatatttttttcat
tgtatgtctggtagagaaggattaatagatacagctgtcaaaacagccaaatctggatat
atacaaagatgtttaattaaatcaatggaatcaataattttacattatgatggtacagtt
cgaaatgaagataatgcaattatacaatttctatatggagaagatggtattgatccatca
aaaactgcttatctaaattcaccttcggatttaataaataactataatatatcatttagt
aaatatttaaattatggatcaagccaacttatacaaaaaaatcaaaacttatttatgagc
aacggaagctgtagcaaaaatgaagacccactgatatgtcaatataatccatatacttat
ataggatctgtttcggataattacgattcaaaattaaataatattcttaggaaaagtgat
ttcaatttaacaaataatgatgaaaatttctattctttatcttcatcattgttaaggtcg
aaatattttcattctttatgttcccctggagaatcaattggaattttagttgcccaatct
tttggtgaaccagctacacaaatgacattaaacacttttcacttagcaggaactgaaaat
gtgactatgggtatacctagattaaaagaaatatttttaacttcaaaattgacatcaaag
cctatgatatatgttccaataaaattagaagaaaacaatatgaacaatccaaatgaaata
aaaaattatataactaatattgcagataaaatattaagcagctatcaaagtatactacta
tctgaagttatatatggtataggaatcgatcgaaaattaataattcgtgataaaattgat
aataaagaaattcatatgattcaattagataaagtagaaccaaaagataatgaaaaaaaa
agttttgattgggatatatataaaactaaagattattctaaaattttacaagttttagaa
aatactaatttaaattttgatttaaaaaaagaatgggctcatgagattgttattcagttt
gataacttaaatcatttttgtaaggttaataagcatttatctgtttcttttattttatat
aaaattgtaaatatagttcttatatcaatactgaataaaatacaaagtagtatatcacat
cataatattcgaaatattaattttatgaatcatgagcattatgatgaactatttgatttc
attagtggaaaaatgtctgaagattttaatttcaattttgataaatatgaatataaaaat
gatgaagacgaaattaatgcaaaactaaaacatatgccaaaagatgctggaggaaataaa
tcaggagatgaaaatgattatggtcgttctcataatttaaacaattcaaaaaaatacaat
gaagaaaatgatgataatatgtcaatgggtgataaaaatgaagaaagcggtaatgaaaaa
aataataaatcagatggaaatgatgatagtgatcaaaatgatgatggaagagaaagtgat
gaatataaatcggaacaagaagataaagaatacgatgaaagtgaagaagatgcagataat
gaggatgatagtaggtcctctcaaaatgaacaagatagtgatgatgatgttaaacatgac
agtatgaatggtagcgaatccgatgataataaatatgatgaaacagaaaaaaatttgaaa
aaaaaaaaatccgaaaaaaaatctgaaaaaaaaaaatcgaaattattaaacgaaaccgat
tcagaaagtgatgcctcttcaaatttaaccatcacaaatcctggaataatcgatggagaa
tctaaagaatcaaataaatccaaaaaagaagaaaacatgggcatatcaggtaaaaagaga
aagctatccgatggaagtgattatataaaaaatgaaaaacatcgaaaagaaataaattat
gactcgtcaatgagtagcgaaaatgaagcagaattaaaaaaagaaatgagtaaaaggttt
tcaaaatattcatatgattataaaaatagaatgaataaaatagatttagatgttagtgat
tatgaagatctatctataggaatagctggaaataaaaataaattatatgatcaaaaatat
ataaaacatattattgaaaaaatgaaaagtagtttactttgttttataaagagaatagaa
ttttctccaattacatgggtcttaaaatttgaattatcttgggatgtgaatttttttcca
taccctatcgactttttaagttacttacaaaatgatatatccaaagaaattttatttaaa
gttaaagatttaaataatccaaaaattttgaaaggaaaagatataacacatagtggggaa
gaatatgagttacaaatcgaaggaaggaatgtatacaaactttttaatattaaagataaa
tatattgataaaacaaaattatattgtaacgatatatatacaattgttaaaacatatggt
atagaagcgggaagattatgtattacaaaggagttaaagaaagttttcgaggcatatgga
attaaaatcgatttccgacacttgtccttcatcagtgatttcatgactcacacaggcgac
ttgaaatcctttaatcgatacggaatgagtgcatatcgtaatattttccacaagatgagt
ttcgaatgtgcaacatcttttatgatacaaggatgtatacaaaattcagttgattattta
tcaaccgcatcgagtagtttatttttcggaaagcatataaaagttggaacaaatgtgtcc
aacattataacctgtattaatggaggaacataa
DBGET
integrated database retrieval system