Pocillopora damicornis (lace coral): 113679088
Help
Entry
113679088 CDS
T05773
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
pdam
Pocillopora damicornis (lace coral)
Pathway
pdam04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdam00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
113679088
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
Ank_2
Ank
EGF_CA
Ank_5
Ank_3
Ank_4
Notch
EGF_2
NODP
NOD
EGF_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113679088
NCBI-ProteinID:
XP_027051833
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2033 aa
AA seq
DB search
MTDQNIFFINSCPSNFSGVHCEIDVDECQVNNKCKNGGTCANNFGGYICSCIFGWDGPEC
TINKDDCVPSGNTPLCFNGGTCIDKVGKYDCLCPPGKMGPVCQHDDQCYHKPCYGTATCF
TDAFGAYSCICPRGWTGKNCSIDIDECSLDLVSPCHHGGTCVNTNGSFECSCVAGYKGER
CDKSIDECASNPCKNGADCLDYTNYFVCACKPGWTGKYCETLINECASSPCQNGGQCTDL
LNKYSCKCTIGFTGTNCEINIDDCAKPNPCKNGATCTDGVGSYTCTCASGFTGGNCDKDI
DDCVSVPCKHYGTCVDEVNGYSCQCTPGYTGNNCENQVDECASNPCMNGGSCTDLQNGFR
CTCPQGTSGVRCEHNVDDCIGVTCANGGTCIDELNSYKCACHPGFYGGKCEMNTDECRSQ
PCQNGGICTDGVAQYHCQCPADFTGRSCETRVDNCLGNQCQNGATCLSEQNGYSCQCAPG
FKGQLCVFDIDECASNPCNHGECRDGLNKYVCVCDSGYSGTKCETNIDDCQPNPCFHGST
CFDKVNNFSCTCSPGFSGQRCEHHIDECNSQPCQNGATCVDEIGSYSCYCKPGYTGRNCE
SVINWCQSSPCKNGGTCKQDPNALDFHCDCLTGFKGIICDVENITCNNAKTKLTDRSTVC
LNGGSCIDDYQNVQSCSCPPGFMGSYCELNINDCASGPCKNGAQCSDGVANYTCSCARGF
AGDDCEENIDDCALNPCDNGGTCIDLVDGFICSCPVGYVGNRCEQNPNDCLISSTACFNG
GHCVDGLKAFSCQCAAGYSGVRCEVDIDECASNPCSALGTEKCYSLPNNDYSCKCKMGFL
GKNCDIDINECLSNPCQNGAECKDGAGKHICLCQMGYSGLNCERRVYSCSDDPCLNSGTC
LTHTNGSFSCACVDGVKGKSCEWNLDDCLATPCQNGGTCVDLFGNYECKCPVGYTGRNCE
QEINECQSDPCKHNGTCEDMMGHYRCKCPVGFNGTDCEEEAKCPYSYCKKTFVPGGTCNE
SCNTHSCNWDGTLCSLGIQPWKNCSVASGEFCFKVFQNGICNKHCNKAECLFDGFDCNAP
KEECSNDDYCKSRFENAICDRVCNNEACLKDGLDCETGKPEPGEGTLILVLRVPPEVFRN
GSRIFMRQLSAVLNTIAFIKRQGNEEMIYSFDLRTRKRRQVVHLRVVRAADGTGTKVHVQ
LDQRGCSGPACISTASEAARYLGALKSSNKLDLPYPVYRDSSSTSSPPVSGTKLSPLYIA
ILCVVIPLLLVGGLLGGKKVYAKLWVPEGFPIYRSRRQPSTRRDPVGQEVSMRSMSKSSS
EIDEEGACADGESSRSDLTPPRESKRVKLDNGEDSRKWTTLHKQAADVTVRNCALALTPP
QEGSGERGVPGVDVDARGPGGMTALHLASCRGTYGDGSSLDDDKDSDDSGGAMVSDLLSL
GANYVSKTDLEETPLHLAARHSRADVAKRLLDYGADANARDRLNRTPLHLAIGADAQGVF
QILLRNRATDLEARMDDGTTPLILAARHDLPDLVRHLIKAGVKVNSADNQGKTALHWAAS
VNSLDVTKELLRNGAKKDAQDEKGQTPLFLGCREGSVQTVRHLLVNYANRKVADSMDMTP
EDIAKQRHHHDIVELLTDWSLGCNSPKAVPAPTSPPEGQKSPMVSIASPLATSPPAVEIP
NGSAAAMVQQFHAARPKATGSRTPGSRPRPSATGNNNNNNAKRKRKKARPDEEVHSSMSV
VPTLSSPGSGHVVTSCTAGQQQQQAFSPNCVPITNVLSPLGSISPGISPGISPGISPADS
TTLSPFQAPNSLDAQPPSPLEILSPDDLAGLEEVDLDWDLVGALDDPTDMSICGFTMNTS
LGQGAAMDHTVPTTSDCLYMPVRPVEGQRLYSVHSTPDLPCVGLQPSDSRSLVFNGRTCH
SAQKAPPPISQQAAFQAITNSNMYSHAGGVGGLGNGLPFRKDYQNDDYSMRHQQLQHMPH
QLVFPADEMAPVHTQVRFMNNYDSSPQKYLSSFPTPSPDSPGDCSSSSSSSSC
NT seq
6102 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgaccaaaatatattcttcatcaacagttgtccttctaatttctctggagtccat
tgtgaaattgacgtggatgaatgccaagtgaataataaatgcaaaaatggtggaacttgc
gcaaataattttggtggctacatttgtagttgtatatttggttgggatggacctgaatgc
accatcaacaaggatgactgtgtgccctctggtaatacccccttgtgttttaatggtggc
acatgcattgataaagttggaaaatatgattgtctctgtcctcctggaaaaatgggtcct
gtgtgccaacatgatgatcaatgttatcataaaccttgttatggaactgccacttgcttt
actgatgcatttggagcatatagttgcatttgtccgagagggtggactggtaagaattgc
agtattgacattgatgaatgcagtttggatttggtgtcaccttgtcaccatggtggtaca
tgtgtcaacactaatggatcatttgaatgcagttgtgttgctggttacaaaggtgaaaga
tgtgacaaatctatagatgagtgtgcttcgaatccatgcaagaatggtgctgattgctta
gactacactaattattttgtatgtgcatgcaaaccaggatggacaggcaaatattgtgag
actttgataaatgaatgtgccagcagtccttgtcaaaatggtggtcagtgcacggattta
ctgaacaagtacagttgtaaatgcaccattggctttactggcactaattgtgagataaac
attgatgattgtgcaaaacctaatccatgcaaaaatggagccacatgcactgatggtgtt
ggatcatatacatgcacatgtgctagtgggtttacaggaggtaactgtgataaagacatt
gatgactgtgtctcagtaccttgtaaacattatggaacatgtgtggatgaagtgaatggc
tactcttgtcagtgcacccctggttatacaggaaataattgtgaaaaccaagttgatgaa
tgtgctagcaatccttgcatgaatggtggaagctgcacggatttgcaaaatggtttccgc
tgcacctgtccacaaggcacaagtggtgtaagatgtgagcacaatgttgatgattgcatt
ggagtgacttgtgccaatggtggcacatgcattgatgaactcaatagctacaaatgtgcc
tgtcatcctggtttttatggtggaaaatgtgaaatgaacactgacgagtgtcgctcacaa
ccttgtcaaaatggtggcatttgtactgatggtgttgcccagtatcactgtcagtgtcca
gctgacttcactggtcgaagttgtgaaaccagagttgacaactgtcttggaaatcagtgc
caaaatggtgcaacatgcctctctgagcagaatggctactcatgtcagtgtgcccccggc
tttaagggacagttgtgcgtgtttgacattgatgaatgtgcttccaacccctgcaatcat
ggtgaatgcagggatggtctcaacaaatatgtttgtgtctgtgacagtggctacagtggc
actaaatgtgaaaccaatattgacgactgtcaacctaatccctgtttccatggatcaact
tgttttgataaagtaaataatttttcctgtacgtgttctcctggtttctctgggcagagg
tgcgaacaccatattgatgaatgtaattcacaaccctgccaaaatggtgcaacctgtgtt
gatgagattggctcctacagctgctactgcaagccaggctacactggaaggaattgtgaa
agtgtgataaattggtgtcagagctctccatgtaaaaatggtggaacatgtaaacaagac
ccaaatgctcttgattttcattgtgattgtcttacaggatttaaaggtataatttgtgat
gtggaaaacataacctgtaacaatgctaagactaaacttacagatcgaagtactgtgtgt
ttgaatggtggttcttgcattgatgattaccagaatgtgcagtcctgttcttgtcctcct
ggctttatgggaagctactgcgaattgaacatcaatgattgtgcaagtggtccttgtaag
aatggtgctcagtgctccgatggtgtagcaaactatacctgcagttgtgcgagaggattt
gctggtgacgactgtgaagaaaatattgatgattgtgctttaaacccatgtgacaatggt
ggcacttgcattgatcttgtagatggctttatctgctcttgtcctgttggatatgttggc
aacaggtgtgaacagaatcctaatgattgcttgatatctagtactgcctgtttcaatgga
gggcattgtgtggatggcctgaaggctttctcctgccaatgtgctgcaggatattcagga
gtgcgttgtgaggttgacatcgatgaatgtgcatccaatccttgctctgcacttgggact
gaaaagtgttattctttgcctaataatgattacagttgtaagtgcaagatgggatttctt
gggaaaaactgtgacatcgatatcaacgaatgtttgtcaaatccctgccaaaatggagct
gaatgcaaggatggggctgggaaacatatctgcctctgccagatgggatattcagggcta
aactgtgagcgccgtgtttactcatgttcagatgatccttgcttgaacagcggcacctgc
ttgacacatacaaatggtagtttttcatgtgcttgtgtggatggggtaaaaggaaaaagc
tgtgaatggaatctggacgactgtcttgccacaccttgccagaatgggggaacatgtgtg
gatttgtttggtaactatgagtgcaagtgccctgtggggtatactggaagaaactgtgag
caggagattaatgaatgccaaagcgatccctgcaagcacaatggtacatgtgaagatatg
atgggccattacagatgcaagtgtccagttggctttaacgggaccgactgcgaggaagaa
gcgaaatgcccctattcgtattgtaaaaaaacatttgtaccaggagggacttgtaacgaa
agttgcaacactcactcttgcaactgggacgggactctttgttccctcggaatacaacca
tggaagaattgctctgtagcaagtggagaattttgcttcaaagtgttccaaaatggaata
tgcaacaagcattgcaacaaagctgaatgcctttttgatggatttgactgcaatgcaccc
aaggaagaatgcagcaatgatgattattgcaagtcacgctttgagaatgcaatatgtgac
agggtgtgcaacaatgaagcttgtttgaaagatggcctggactgcgagactggaaaaccg
gaaccgggcgaagggacgcttatactagtgttgagggtgcctccagaagttttccgcaat
ggctcaagaatatttatgagacaactttctgcggttttgaacaccattgcgtttatcaag
agacaaggcaacgaggaaatgatctattcctttgatctgagaacgcgtaaacgtcgccaa
gttgttcatctgcgtgttgttcgagcggccgacggaacggggacgaaagtgcacgtacag
cttgaccaacgaggttgttcaggaccagcgtgtatctccacagccagcgaagcggctcgc
tacctaggtgcgttaaagtcgtctaataagctggatctaccctatcctgtgtacagagac
tcctcttcaacttcatcaccgcctgtttctggaactaaactgtcaccactttacatagcc
attctgtgtgtagttatcccactgcttcttgtgggagggttgttgggtggcaagaaagta
tacgccaagctatgggtaccagagggctttcctatataccggtcccggcgccagccgtct
accagacgtgatcctgtagggcaagaagtctccatgagatcgatgagcaagagttcgtca
gaaattgatgaagagggtgcatgcgccgacggcgagagcagccgttcagacttgactcct
cccagagaatctaaacgcgttaagctggacaacggtgaagactcacgaaagtggaccaca
cttcataagcaagcggcggacgtaactgtgcgcaactgcgcgttggctttgactcctcct
caggagggaagcggcgaaagaggggtaccgggcgtagacgtggatgctagaggcccaggt
ggaatgacagcccttcacttggcatcctgccgtggaacttacggtgatggcagcagcctt
gatgatgacaaagacagtgatgacagtggaggggccatggtgtcggatctactgtccctt
ggggcaaactatgtttccaagacggatctggaagagacgccgcttcatcttgctgcccgg
cactcaagggcggatgtggctaaacgtctgttggactacggagcagatgccaacgcacgt
gaccgtctcaaccgcacgcccctccatttggccatcggagctgatgcacaaggtgtcttc
cagatcttgttaaggaatcgtgccacagacctcgaagcccgaatggacgacggtaccact
ccgcttatccttgccgcaagacacgaccttccagacctggtgcggcacctcatcaaagcc
ggagtgaaggttaacagtgctgacaatcaagggaaaacggctttgcattgggctgcgtca
gtgaacagcctggatgtcaccaaagagttgttaagaaatggcgctaagaaagacgcgcag
gacgaaaagggtcaaactccgttgttcctgggttgtcgtgaaggcagcgtacagaccgtg
agacatctcttggtgaattatgccaacaggaaagttgccgattctatggacatgacacct
gaagatatcgctaaacaaagacatcatcacgacattgtcgaattgcttacggattggtca
cttggctgtaactcgcctaaggcagttccagcccctacttcaccccccgaggggcaaaaa
tcacccatggttagcatagcatctcctctggcaacatcgccaccagctgtcgaaattccc
aatggtagcgcggcagccatggtacaacaattccacgcggcgcgtccaaaggccacaggg
agtagaacgcctggatcgagacccaggccgagtgcaaccggaaataataataacaataat
gcaaagaggaagcgcaagaaggcgcggcctgacgaggaagtgcactcgtcaatgagtgtc
gtcccaacgctttcatctcctgggtcggggcatgttgtaacgtcctgcactgctggacag
caacagcagcaggcgttttcgccaaattgtgtgccaatcacgaacgtactttcgccgtta
gggagcatttctcccggcatatctcccggcatatctcccggcatatctcctgcggattca
actacgctatcaccttttcaagctccaaattcgttggatgcacaaccgccttcaccgcta
gaaatattatcacccgatgacctagccgggttggaagaggttgaccttgattgggattta
gttggcgctctcgatgatcctacggatatgtccatatgcgggtttaccatgaacacttct
ttagggcagggggccgctatggaccacactgtacccactacatcagactgtctgtacatg
cccgtcaggccagtagagggtcaaagactctactcggtgcatagcacaccggacttacct
tgtgtcggtctgcaaccttccgactctcgatctttagtctttaacggaagaacttgtcat
tcggcgcagaaggcgcctccaccgatctctcaacaggccgcatttcaggccatcaccaac
tccaacatgtattcccacgccggtggcgttggcggattaggaaacggtctgccgtttagg
aaagactaccaaaatgacgattattcgatgcgccatcaacaattgcaacatatgccgcat
cagcttgtctttccggccgacgaaatggctcctgtacatacacaagtgcggttcatgaat
aattacgactcgtcgccgcaaaagtatttatcatctttcccgaccccctcacctgattcg
ccgggagactgttcatcatcgtcatcatcgtcctcgtgctaa
DBGET
integrated database retrieval system
