Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI: PLF_218
Help
Entry
PLF_218 CDS
T03738
Symbol
glnS
Name
(GenBank) Glutamine--tRNA ligase
KO
K01886
glutaminyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.18
]
Organism
pli
Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI
Pathway
pli00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
pli01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pli00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
PLF_218 (glnS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
pli01007
]
PLF_218 (glnS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
pli03016
]
PLF_218 (glnS)
Enzymes [BR:
pli01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.18 glutamine---tRNA ligase
PLF_218 (glnS)
Amino acid related enzymes [BR:
pli01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (A)
PLF_218 (glnS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
pli03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Multi-aminoacyl-tRNA synthetase complex (MSC)
PLF_218 (glnS)
Prokaryotic type
Other AARSs
PLF_218 (glnS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1c
tRNA-synt_1c_C
tRNA-synt_1c_C2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEL12457
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(199596..201185)
Genome browser
AA seq
529 aa
AA seq
DB search
MLKNINNIKKIVTRFSPEPNGFLHIGHVKSIWLNLNLAKIQKGKCFIRFDDTNPLKENNI
YINSILEDIKWLGYKFNKIYYASNYFDNLYYWALYLIKKGKAYVDDLSIKEIKKYRGDFK
SVGYNSPYRNRTIKENIFLFKKMRKGFFKEGGKVLRAKIDMKSNNLTLRDPIMYRIINVF
HSRTGNKWKIYPSYDYAHGQSDILEGITHSICTLEFENNRNLYNWFIKNILNNKYISPKQ
IEFSRMNINYSLTSKRKIKFLIDKNIVCGWDDPRLLTVSGMRRRGYTPSSLKKLCEKTGI
TRSNNKIDIKMQYYVIRSDLENKVSRVMCVINPVKLVLTNLVVGYEEIIKVKNHPVREDM
GTRKIFFNREIWIDLNDFNINPKKNFFRLSIGKKVRLRHSYIIKCNKIIYLKNKNIKEIQ
GIAYLNTKNKNFEGKKIKGVIHWVSVKYGVKVEIRNYKNLLKNNKENIYNNITSNSLKIK
NSIGEPLLSKIKPETKLQFERVGYFCADRYDYNKNNFVFNKIISLKNNC
NT seq
1590 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaatataaataatattaagaagattgttactagattttctccagaaccaaat
ggttttttgcatattggccatgttaaatcaatatggttaaatttaaatttagctaaaatc
caaaaaggaaaatgttttattagatttgatgacacaaatcctctgaaagaaaataatata
tatattaattctattttagaagatattaaatggttaggatataaatttaataaaatttat
tatgcttctaattattttgataatttatattattgggctttatatttaataaaaaaaggt
aaagcttatgttgatgatttatctataaaagaaataaaaaaatatagaggtgattttaag
tcagttggatataatagtccttatagaaatcgtactataaaagaaaatatttttttattt
aaaaaaatgcgtaaaggattttttaaagaaggaggtaaagttttacgtgcgaaaattgat
atgaaatctaataatctaactttaagagatcctatcatgtatcggattataaatgttttt
cactctagaacaggtaataaatggaaaatttatccatcttatgattatgcgcatgggcaa
tctgatatattggaaggtataacacattctatttgtactttagaatttgaaaataatcga
aatttatataattggtttattaaaaatatattaaataacaaatatatttcaccaaaacaa
atagaattttctagaatgaatataaattattctttaacttctaaaagaaaaataaaattc
ttaatagacaagaatattgtatgtggatgggatgatcctagattacttacagtttcagga
atgcgacgaagaggttatacgccatcttctttaaaaaaattatgtgaaaaaacaggaata
acaagatcaaataataagatagatataaaaatgcaatattatgttatacgttctgattta
gaaaataaagttagtagagtaatgtgtgtaattaatcctgtaaaattagtattaactaat
ttagttgtaggatatgaagaaataattaaggttaagaatcatccagttagagaagatatg
ggtactagaaagatattttttaatagagagatttggatagatttaaatgattttaatata
aatccaaaaaaaaatttttttagattatctatcggaaaaaaagtgaggctccgtcattct
tatataataaaatgtaataaaattatttatttaaaaaataaaaatataaaagaaatacaa
ggaattgcttatttaaatactaaaaataaaaattttgaaggaaaaaaaataaaaggtgtg
attcattgggtaagtgtaaaatatggagtaaaagttgaaatacgtaattataaaaattta
ttaaaaaataataaagaaaatatatataataatataacttcaaattctttaaaaataaaa
aactctataggagaacctcttttatcaaaaattaaacctgaaacaaaattacaatttgaa
agagtaggttatttttgtgcagatagatatgattataataaaaataattttgtttttaat
aagataataagcttaaaaaataattgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
