KEGG   Plasmodium malariae: PMUG01_06015500
Entry
PMUG01_06015500   CDS       T09444                                 
Symbol
RNAPI
Name
(RefSeq) RNA polymerase I, putative
  KO
K02999  DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 [EC:2.7.7.6]
Organism
pmal  Plasmodium malariae
Pathway
pmal03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pmal00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    PMUG01_06015500 (RNAPI)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:pmal03021]
    PMUG01_06015500 (RNAPI)
Enzymes [BR:pmal01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     PMUG01_06015500 (RNAPI)
Transcription machinery [BR:pmal03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Core subunits
     PMUG01_06015500 (RNAPI)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_4 Collagen
Other DBs
NCBI-GeneID: 39867548
NCBI-ProteinID: XP_028859812
LinkDB
Position
6:314479..323633
AA seq 2878 aa
MIQDINKVICSEIKSVELDILSSQELKNISFGKFENQLYDYEKGGKGGVVNTLRYDPRYG
TVDSKQICSVCYEKHDNCFGHIGHIDFALPVFNPLFYKDLHELLGLVCFNCYSFCYSEDI
IFLLKHIFQLKALNEIESTNKFVCKKNSNFTYIIDEIDRLYKKICKDSSISMEDIAETIC
QDYVKSKEKKGNHGDEGGSAVADDDNNDDDGDDDYDNKKEQIVSKLFNGIDETKEEEGRG
QMGKYHVKKEEEEEEGVAEEEVDINMLKEKIRKYKFDPNKLAFQANYNYEEYLILNKMIK
ICMKKRSRCANCKFHKSITVKMSTNKDTIDFVGIHSNSTFFRKYMFKKEKIEEDNLDLNE
HAGGDAEEEGLEGMEGVEGLEGVEGLEGVEGLEGLEGLEGVEGLEGVEGVEGVNEAKETF
EKKNKQIFNNSYGGKSSRDNKKSVANKTGINEFTQLTDAYNKLKAKEKCTVRLFSFQIVD
ILKKIFVKRNKEALDLLYPFTKKNGYKVFFLYNMGISANRFRLIYRGVHKRMKMIRNLYR
FNSYVILCINAKKEINFDNILENNKKELGLYKSIFNFFSLKFRYKLNSELMDNDTDITKS
DFLKHYSLFYRNKSSYINVLFTNLQIAVNTFYDSTIAQKTRNKNISNIGLREILDKKEGI
LRKSIMGKRVNNCARTVISPDTFIETNYIGVPLEFAKALTIDEPVTERNFEYLSKLIENG
PDIYPGALSYKDTKGRVFKLPHNYEQRLYILDLIKKFYQKNNYGFITVHRHARDGDIVIM
NRQPTLHKYSIMAHFIKVFEKEKVFRLNYVNCSSYNADFDGDEMNLHLLQTPLARAEATH
LMNSDFLFTNFKDGSPLRGLTQDFILGGLHLTSLETFLNYDEYCNLLQCSLNCLLSQKNA
FFFKQKRGVANSLVNGSRSGSMINIHSAHNDKDDIGTKPQNGQDTPKRFSGNILKLNNYS
YLDPYATVLNRTTFSIVTEGPAILFPKRLWTGKQLITSILKTIIDRVAIETYNRYGENEF
MKNYKGINYIASAKTAADLWSFDPNNECEVIIRNSELLQGVLDKLHFGASSNSFVHLCYE
LFGPKTAAVMLDCFGRLFISFLQMRGTSLSLYDFILKKEAKQEKTKIKRRISFTGFYLQN
LFVNSIAKSLNVDINDMNFYSKKNICTGQENKDLVVSNLYDLYRKKEEIIKNCEQVRSNR
LGQNSCTNENEEKRRTPLEGGRNFKRKKMIQDCNGIFLYDKNSENAEVKYSYTDTANDDS
VILKTEQSMAINEEPYFIALFNKEIERIFLQSEDYDVDGEKSYISRDNEKGYNKNSTSKT
GKTAQSLIECALKKINSDILEKYVNSRSRNGSSFNDLDAVPLEETDEEKHAFLLNVVTHR
LYNALKEPSFFRSSNFRGDKIMRVIEKVLHFLKEAECNKKLKVYILFELFQNKNILKYFP
SLVNYVYNFEYHLSDKEIWKTVLKNVLSKEAGELDEEEEGKGCYNSPIKGRNACDELYKE
HLKKETKEHKIRRICKEFYEHVQEKGNPMDNNNNRYYVNTNFSYNSNGEMISDCNYVGAD
AEGMLDHMYDEHFLKNCFISSMPSFILNDDICNLSFNGKNHYYEYYVNKKEVEEDSYFRF
DNMRDIYYKTEYLINTYFPLQRDEFDGLIDSLSQPYLCRVSSNTNSLINMNNLINKFLNN
GFSNMIFTGAKGSKVNYSMICGMLDQQYLEGKRVPRMKSGKTLPSFHKYDYGARACGLIT
DCFLEGLRPQEYFFHCMSGREGLIDTAVKTAKSGYIQRCLIKCMESVILHYDGTVRNEDN
AIVQFLYGEDGIDPSKTAYLDVTKDLIYNHQLSFSKYISHGISKKIVHNEELFKMCNGDS
NDNGSGNGSDNGSGNGSGNGSGNGSDNGSDNDYNISHNSDRTNGRRKRQHEEPLISTYNP
YTYIGAISDKFEEKINKFLMNDISLLNNYDDLPENFDLLASTLMKSKYYNSLCSPGESIG
ILVGQSFGEPATQMTLNTFHLAGTENVTMGIPRLKEIFLTSKITSKPMIYVPIKIELNID
DPDKMKKYITSVADKILSSYKSIQLSDVIYGIGVERKIILKDKEKNTQVHSINLSKLEHR
NSNNEYISSRYNNEYAFNEDSHPINCNYSNKNSFEDDYLDVEKIMNEVKKTNLNFDLNKE
WNYEIIIQFENLHHFCTVNKHITISSILYKVVSLLLTSVLSRIAESMSVHNLYSVNALNH
EYYDELFDFISSKMSEEFSYLYDEIDYKNDEEQINAKLKFMSKGEDEHNDTGYLRSSTKF
KSKENFDSSIKPQKNKEYSNMDEDNIFYVDTMNDRMNDDQSIEEESNFLAEEKGTTSEGN
VDGQGGEVDSRSEKGEEDTATEDEREYDESEDEEEISSRGGDDKASSDDDDNASSDDEME
EKEQIINKGKKTLEKRNKGKLGREKNPPRLRRSSSSSSSSGGGNNSSRNSSKRTKFDKES
KCKQSPSEFAYSQENSCISNRSSRNASKSLELLYNTSTTVNSLSSEASVTHNILVDEKSD
EFINMKDNKMHNHKKRQNNEENKLREYKKRSKIKRKEFSTVESTSFASSLSSLALSGGST
QSERISEEEDTEAGDDDSEKEEHIIAKDFSKYSYDYKNNINLSNSESEYEQEEEQNDLSK
NNIYEPRYVKSIVDKIKSSLLCFIKKISFSPVTWTLKLEISWDINFFPYSIDFLESVKYD
ISKEILFKINDLNNPKILKGKDITHSGQEYELQIEGKNIYKLYSIKDKYIDKTKLYCNDI
YAIVKTYGIEAGRLCITKELKKVFEAYGISIDFRHLSFISDFMTHTGDLKPFNRYGLGCF
RNVLQKMSYECATNFLEQGCVHKSIDYLSTASSSLFFGKPIKVGTNVADIVACIGGSN
NT seq 8637 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattcaagatataaacaaagtcatctgctccgaaataaagagtgtggagctagatata
ctaagcagccaggagctgaaaaatatttcgtttggtaagtttgagaatcaattgtatgat
tatgaaaaagggggaaaaggaggagtggtaaatacattacgatatgatccgagatatggt
acagtggacagtaaacaaatttgttccgtttgttatgaaaaacatgataactgttttggt
catataggtcatatagattttgcattacctgtatttaatccattattttataaagattta
catgaactattaggtttagtttgttttaattgttatagtttttgttattccgaggatata
atatttttactaaaacacatttttcagttaaaggcattaaatgaaattgaaagtacgaat
aaatttgtgtgcaaaaaaaatagcaattttacatatataatagatgaaatagatagacta
tacaaaaaaatatgcaaagattcaagtatatctatggaggatattgctgaaacgatatgt
caggattatgtaaaaagtaaagaaaagaaaggaaatcatggcgatgaaggcggtagtgct
gttgctgatgatgataataatgatgatgatggtgatgatgattatgataataagaaagaa
caaatagtgagtaaattattcaacggaatagacgaaacgaaggaggaagagggaagggga
caaatgggcaaataccatgtgaagaaagaagaagaagaagaagaaggagtagcagaggag
gaggtagacattaacatgttaaaggaaaaaattcgaaaatataaatttgatccgaataaa
ttagctttccaggctaattataattatgaggagtatcttattttgaataaaatgatcaaa
atctgtatgaagaaaagatcaagatgcgcaaattgtaaatttcataaaagcataacagta
aaaatgtcgactaataaagacactatagattttgtaggaattcattctaatagtaccttt
tttagaaaatacatgtttaagaaggaaaaaattgaagaggacaatttggacttaaatgaa
catgcggggggagatgcagaggaggaaggattggaagggatggaaggagtggaaggattg
gaaggagtggaaggattggaaggagtggaaggattggaaggattggaaggattggaagga
gtggaaggattggaaggagtggaaggagtggaaggagttaacgaagcgaaggaaactttt
gaaaagaagaataaacaaattttcaataacagttatgggggaaaatcatctagagataac
aaaaaaagtgttgcaaacaaaacaggtataaacgaatttacacaattgactgatgcgtat
aataagcttaaggcaaaggaaaagtgcactgttcgcctattcagttttcaaattgtagat
atattgaaaaaaatatttgtaaaaagaaataaagaagctttagatttattatacccattt
acaaaaaagaatgggtataaagttttttttttatataatatgggaattagtgcaaatagg
ttccgactgatatatagaggagtacataaaagaatgaagatgataaggaatttgtataga
tttaatagttatgtaatattatgtataaatgctaaaaaagaaataaattttgataatata
ttagaaaataataaaaaggaattaggtttatataaaagtatatttaattttttttcctta
aaatttagatataaattaaattcagaattgatggataatgatacagatattaccaagtct
gatttcttaaaacattattcattattttatagaaataaaagttcatatataaatgtgctt
tttacaaatttacaaatagcagtaaatacattttatgatagtacaatagcacaaaaaact
cgtaataaaaatatttcaaatataggtttaagagaaatattagataaaaaagaaggtatt
ctaagaaaaagtattatgggtaaaagagtaaataattgtgctcgaactgttatttcacca
gatacatttatagaaaccaattacattggagttccacttgaatttgcaaaagcattaaca
attgatgaacctgttactgaacgaaattttgaatatttaagtaaattaatagaaaatggc
cccgatatatatccaggtgcattaagttataaagataccaagggaagagtattcaaatta
cctcataattatgaacaaagattatatatcctagatcttatcaaaaagttttaccaaaaa
aataactatggattcataactgtacataggcatgcacgtgatggagatatagtcattatg
aatagacaaccgacattacataaatattctatcatggctcattttatcaaagtttttgaa
aaagaaaaagtgttcagattaaattatgttaattgtagttcatataatgctgattttgat
ggagatgaaatgaatttacatttattacaaaccccattagctagagcagaagctactcat
ttgatgaactcagactttttatttactaattttaaagatggctcaccattgagagggttg
acacaggattttattctaggtggattacatttaacttcattggaaacgttcttgaactat
gatgaatattgtaacttgctgcaatgctcgcttaactgtctgctttcacagaagaacgcc
tttttctttaagcagaaaagaggggtagcaaactccttggtaaatggctcgcgaagtggc
agtatgattaacatccacagtgcgcataatgacaaagacgatattggaaccaagccacaa
aatggtcaagatacacctaaaagattcagtggaaacattcttaaactgaacaattacagc
tacctagacccctatgcaactgtcttaaatagaacaacgttcagcatagttacagaagga
ccggcgatactatttccaaagagattatggacgggtaagcaattaataactagtatattg
aagacaataattgatagagttgctatagaaacatataacagatatggagagaacgaattt
atgaaaaattataagggaataaattatatagctagtgcaaaaactgctgctgatttatgg
tcctttgacccaaataatgaatgtgaagttattattagaaattcggaactactgcaaggg
gtattggacaaactacattttggtgctagctcgaatagttttgtacatttatgttatgaa
ctatttggacctaaaactgctgctgtgatgcttgattgctttggtcgtttatttataagc
ttcttacaaatgcgtggtacaagtttaagtctgtatgattttattttaaaaaaagaagct
aaacaagaaaaaacaaaaattaaaagaagaatatcttttacaggattttatttacaaaat
ttatttgttaattcgattgcaaagtccttaaatgtggatattaatgatatgaatttttac
agtaaaaaaaatatatgcacaggtcaggaaaataaagatttagttgtcagtaatttgtat
gacttgtacaggaaaaaggaggaaattataaaaaattgtgaacaagtaaggtcaaacagg
ttgggacaaaatagttgtacaaatgagaatgaggaaaaaagaagaacaccattagaaggg
gggagaaattttaaaaggaaaaaaatgattcaagattgtaatggtatatttttgtatgat
aagaattcagaaaatgctgaggtgaagtacagttacacagatacagcaaatgacgatagt
gttatactaaaaactgaacagagcatggccataaatgaggaaccttattttattgctcta
tttaataaagaaatagagagaatctttttgcaaagcgaggattatgatgttgatggtgaa
aagagttatatcagtagggataatgaaaaaggatacaataaaaatagcacgtcgaagacg
ggaaaaactgctcagtcccttattgagtgtgcacttaaaaagattaattcagacatttta
gaaaagtacgtgaatagtagaagcagaaatggaagcagtttcaacgatttggatgcagtt
cctttggaagagacggacgaagagaaacacgcgtttctcctgaatgtagtaactcatagg
ttatacaacgcgttgaaggagccatcattttttaggagttccaattttagaggagacaaa
ataatgagagtaattgagaaggttcttcactttttaaaggaagcagaatgcaataaaaaa
ctaaaagtgtacatactatttgagctttttcaaaataaaaatattctaaagtatttccct
tcacttgttaattatgtatataattttgaataccatttgagtgataaagagatatggaag
actgttctgaaaaatgtattatcaaaggaagcgggggaactggatgaagaagaggagggg
aagggttgctataattctcctattaagggaagaaatgcatgcgatgaattatacaaagaa
catcttaaaaaagaaacaaaagaacataaaattagaaggatatgtaaagagttttatgaa
catgtgcaggaaaaagggaatcctatggataataataacaataggtattatgtaaataca
aattttagctacaatagtaatggggaaatgataagtgattgtaattatgtcggtgcagat
gcagagggaatgttagatcatatgtatgatgaacattttttaaagaattgtttcatatct
agtatgccgtcctttatactgaatgatgatatatgtaatttgtcctttaatgggaaaaat
cattattatgaatattatgtaaataagaaagaagtggaagaggattcttattttagattt
gataatatgagggatatatattacaaaactgagtatctcataaatacatattttccttta
caaagggatgagtttgatggtttaattgactccttatctcaaccatatttatgtcgtgta
tcatcaaatactaatagtttaataaatatgaataatttgataaataaatttttgaataac
gggtttagtaatatgatttttactggagcaaaaggaagtaaagttaattattcgatgata
tgtggtatgttagatcaacaatatttagaaggtaaaagagtacctagaatgaaatcagga
aaaacacttccaagttttcataaatatgattatggagcaagagcatgtggattaattaca
gattgttttttagaaggattaagaccacaagaatatttttttcattgtatgtcaggaaga
gaaggattaatagacacagcagtgaagacagccaagtcaggttatatacaaaggtgttta
ataaaatgtatggaatcagtgatattacattatgatggaactgttcgaaatgaagataat
gcgatcgttcagtttttatatggagaagatggaatagatccgtcaaaaactgcgtactta
gatgtaacaaaagatttaatatacaatcatcagttatcatttagtaaatatataagtcat
ggaataagtaaaaaaattgtgcataatgaggagttatttaaaatgtgtaatggggatagt
aatgataatggtagtggcaatggtagtgataatggtagtggcaatggtagtggcaatggt
agtggcaatggtagtgataatggtagtgataatgattataatattagtcataatagcgat
agaacaaatggcagaagaaagagacaacatgaagaaccgctgataagcacatataatccg
tatacttacataggtgcaatatcggataaatttgaagaaaagattaataaatttttaatg
aatgatataagtttattaaacaactatgatgacttaccagaaaattttgacttgcttgct
tctactcttatgaaatcaaaatattataattcgttatgtagcccaggtgaatctataggg
attttagttggacagtcttttggtgaaccggctactcaaatgactctaaatacatttcac
ttagctggtacagaaaatgtaacaatgggaatacctagattgaaagaaatttttctaact
tccaaaatcacatcaaaacctatgatatatgttcctattaaaatcgaattaaatatagat
gatcctgataaaatgaaaaaatatattaccagtgttgctgataaaattttaagctcttac
aaaagtatacaactgagtgatgttatatatggcataggggtggaaagaaaaattattcta
aaagataaagagaaaaatacgcaagtgcattcgataaatttgtccaaacttgaacatagg
aacagtaataatgagtatatctccagtaggtacaataatgagtatgccttcaatgaggac
agtcatcccattaattgcaattacagtaataagaactcatttgaagatgattatttggat
gtagaaaaaattatgaatgaggtaaaaaaaacaaacttaaattttgatctaaataaagaa
tggaattatgaaatcattattcaatttgaaaaccttcatcatttctgtactgttaataaa
catattactatatcttctatactttataaagtggtaagtcttcttctaacatctgtactt
agtagaatagcagaatccatgagtgtacacaatttatattcagtcaatgctttgaatcat
gaatattatgacgagctatttgatttcattagtagcaaaatgagtgaagagtttagttac
ctatatgatgagattgattataaaaatgatgaagaacaaataaatgcaaaactaaaattc
atgtccaaaggtgaagacgaacataatgatacaggttatttacgaagtagtaccaaattt
aaatcaaaagaaaattttgatagttcaataaaaccacaaaagaataaagaatattctaat
atggatgaagataatattttctatgttgacactatgaatgataggatgaatgatgatcag
tccattgaagaggaaagcaattttttagcagaagagaagggaaccacgtccgagggtaat
gtcgatggacaggggggggaggtggattcacgcagtgagaaaggggaagaagacacagcc
accgaggacgagagggagtacgacgaaagtgaagatgaagaggagatcagcagtaggggg
ggagacgataaagcaagtagtgatgacgatgataatgcaagtagtgatgacgaaatggaa
gagaaggagcaaataataaacaaagggaaaaagacactagagaaacgtaataagggaaaa
ctcggaagggagaaaaatccccctagattgagaagaagcagtagtagtagtagtagtagt
ggtggtggtaataatagtagtaggaatagtagtaaacgtaccaagtttgataaagagagc
aaatgtaaacagagtcctagcgaatttgcatattcacaggaaaacagctgcataagtaat
agaagctcaagaaatgcttcgaagtctttggaattgttgtacaacacctcaacaactgta
aattctctttcgtctgaagcaagtgttacacataatatattagtagatgaaaaatcagat
gagttcattaatatgaaagataataaaatgcataatcataaaaaaaggcaaaataatgaa
gaaaataaattaagagaatataaaaaaagatcgaagataaaacgtaaagaattttcaaca
gttgaatcaacgtcatttgcttcttctttatcatcattagcattatcagggggatctaca
caaagtgaaagaataagtgaagaggaagatacagaagcgggagatgacgacagtgagaaa
gaagaacatattattgcaaaagatttttcaaaatattcgtacgattataaaaataacatc
aacttatccaattctgaaagtgaatatgaacaagaagaagaacagaacgatttatccaaa
aataatatttatgaaccaagatatgttaaaagcattgttgacaaaataaaaagtagttta
ctttgttttataaaaaaaattagcttctctcctgttacttggaccttgaaacttgaaatt
tcgtgggatatcaactttttcccatattcaatagattttttagaatctgtaaaatacgac
atttcgaaagaaattttattcaaaattaatgatttaaataatcctaaaatattaaaagga
aaagacataactcatagtggtcaagaatatgaattacaaattgaaggaaaaaacatttat
aaattgtacagtattaaagataaatatattgataaaacaaaattatactgcaatgatatt
tacgcaattgtaaaaacttatggtattgaagctggaaggttatgtataacgaaagagttg
aaaaaagttttcgaggcatacggaatttcaatcgattttaggcatttatcttttattagt
gattttatgacccatacaggtgacttgaagccttttaacagatatggactgggctgtttt
cgtaatgttcttcagaaaatgagttatgaatgtgcaaccaactttttagaacagggttgt
gtacataagtcaattgattacttatcaacggcttcgagcagcttattttttggaaaaccc
ataaaagtagggaccaatgtagctgatatagtagcatgtattgggggaagcaactga

DBGET integrated database retrieval system