Pseudoalteromonas nigrifaciens: PNIG_a2753
Help
Entry
PNIG_a2753 CDS
T05271
Symbol
mnmC
Name
(GenBank) tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis bifunctional protein
KO
K15461
tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis bifunctional protein [EC:
2.1.1.61
1.5.-.-]
Organism
png
Pseudoalteromonas nigrifaciens
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
png00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
png03016
]
PNIG_a2753 (mnmC)
Enzymes [BR:
png01000
]
2. Transferases
2.1 Transferring one-carbon groups
2.1.1 Methyltransferases
2.1.1.61 tRNA 5-(aminomethyl)-2-thiouridylate-methyltransferase
PNIG_a2753 (mnmC)
Transfer RNA biogenesis [BR:
png03016
]
Prokaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
PNIG_a2753 (mnmC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Methyltransf_30
DAO
NAD_binding_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASM54735
UniProt:
A0AAC9UHS3
LinkDB
All DBs
Position
I:2508588..2510597
Genome browser
AA seq
669 aa
AA seq
DB search
MIKNANIHFNHQGTPVANDFDDIYYSDDNGLAESYYVFYQQNNIDTRLQSHDQAHFVIAE
TGFGTGLNFLNTCQHFTDHLARQQVQKQLDYGVKRLHFIAFEKHPLSISDLSKILKVWPE
LNLLSEQLISQYPINLAGCHRLEFNNGTIVLDLYFGDALESIKTMSYPRSGIVDAWFLDG
FAPSKNPDMWQQSLFDTMVNISKIGATLATFTAAGFVRRGLTDAGFTMQKVKGFAHKRSM
LIGTLKHTNDTQSAPSYFNHDVSPLTNVAVIGGGIASSCILYSLAKRGISSQLFCQDAAP
AMGASHNVQGAVYPHLQAKNSPHSELFAHSFLYAKRLYKQLLNDGFSFDHSWCGVLQHAV
KQPLTDRHENLAQQQLWPQTLMRNVTAEQGDTIAGVTTGYSGVYFEQGGWVNPPQLVNAM
LSAAHCLSPYESTFNCHIEQLEKTSNGWLLFSNGKQFGPFSDVIICAGEHSDAFAQTKVL
PIVGVRGQVSHVQSSEQSTKLKTVLCHKGYFTPAYLDHHCMGATFEKNTKSRQVTEQDNL
SNREQLLNFYGHCNFATSLGNITAAKAAVRCSFIDHLPMAGEWVEQSDYLTAFANLRLGK
RYQYQALSKKQQGLHIFTGFGARALCSAPLCSEHLISSLNNEPRPLSERVSQAIHPARFI
VRDLIRNKI
NT seq
2010 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaacgccaacattcactttaaccaccaaggcacacctgttgccaatgacttc
gatgatatttattattctgacgataatggcttagctgaatcttattatgtgttttatcag
caaaacaatatagatacacggttacaaagccatgaccaagcacattttgttatagccgaa
accggttttggcaccggccttaactttttaaatacatgccagcactttactgaccacctt
gcacgccaacaagttcaaaagcaactagactatggtgtaaaacggctacactttattgcc
tttgaaaaacacccattgagtataagcgacttaagcaaaatattaaaagtatggcctgaa
cttaatttattaagtgagcaacttatcagccagtatcccattaatttagcaggctgccat
cggcttgaatttaataatgggacaatagtgctcgacctatattttggtgatgcactggaa
tcgattaaaacaatgagctatccgcgctccggcatagtagacgcttggtttttagatggt
tttgcaccgagtaaaaaccctgacatgtggcagcaaagcctgtttgataccatggttaac
atttcaaaaataggagctacccttgctacctttaccgctgctggctttgttcgccgtggg
ttaaccgatgcaggctttaccatgcaaaaagttaaagggttcgcgcacaaacgtagcatg
ctaattggcacattaaaacacactaacgatacacaatcagcgccaagttattttaatcac
gatgttagcccgcttactaatgtggcggtaattggtggtggtattgccagtagctgtatt
ttatacagcctagctaagcgaggtattagcagccaattattttgccaagatgctgcaccc
gctatgggggcatcgcacaacgtgcaaggagcggtataccctcatttacaagcaaaaaac
tctccacacagcgagttatttgcgcatagctttttatatgccaaacggctttataaacaa
ttactcaatgatggttttagttttgatcatagctggtgcggcgtattgcagcatgcagta
aaacagccactcactgatcgccatgaaaatttagcccagcagcaattatggccacaaaca
ttaatgcgtaacgtaaccgcagagcaaggagatactatagccggcgttactactggttat
tctggcgtatattttgaacaaggtggctgggtaaatccaccacaactagttaatgctatg
ctgagcgccgcccattgtttatcgccttatgaaagtacttttaactgccatatagaacaa
ttagaaaaaaccagcaacggctggctactttttagtaacggcaaacagtttggccccttt
agcgatgtaattatatgtgcaggtgagcacagcgatgcatttgcacaaaccaaagtatta
ccaatcgttggtgtacgcggacaagtatcgcatgtgcaatcaagtgagcaatcaactaaa
ctaaaaacggtgctgtgccataaaggctattttacacccgcttatttagatcatcattgc
atgggcgcaacgtttgaaaaaaacaccaaaagccgacaagtaactgagcaagacaacctt
agtaatcgcgagcaattactcaacttttacggccactgtaattttgcaactagcttaggc
aatataaccgcagcaaaagccgcagtgcgttgtagttttattgatcacttacctatggca
ggagagtgggtagagcaaagcgattacctaactgcctttgctaatttacgtttaggtaaa
cgctatcagtaccaagccctaagtaaaaaacaacaagggctacatattttcaccggcttt
ggtgcacgtgctttatgcagtgcgccactttgcagtgaacacttaattagcagtttaaac
aacgagccgcgcccgctcagcgagcgtgtaagccaagctattcaccctgctcgttttata
gtgcgtgatttaattcgtaataaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
