Plasmodium reichenowi: PRSY57_0302200
Help
Entry
PRSY57_0302200 CDS
T08079
Name
(RefSeq) exportin-1, putative
KO
K14290
exportin-1
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
prei03013
Nucleocytoplasmic transport
prei03250
Viral life cycle - HIV-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
PRSY57_0302200
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
PRSY57_0302200
09125 Information processing in viruses
03250 Viral life cycle - HIV-1
PRSY57_0302200
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
prei03019
]
PRSY57_0302200
03009 Ribosome biogenesis [BR:
prei03009
]
PRSY57_0302200
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
prei03016
]
PRSY57_0302200
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
prei03036
]
PRSY57_0302200
Messenger RNA biogenesis [BR:
prei03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Ran-mediated transport factors
PRSY57_0302200
Ribosome biogenesis [BR:
prei03009
]
Eukaryotic type
Pre-40S particles
Export and cytoplasmic maturation factors
PRSY57_0302200
Pre-60S particles
PRSY57_0302200
Transfer RNA biogenesis [BR:
prei03016
]
Eukaryotic type
tRNA transport factors
tRNA export factors
PRSY57_0302200
Chromosome and associated proteins [BR:
prei03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Centrosome duplication proteins
Regulators of centriole replication
PRSY57_0302200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CRM1_C
Xpo1
CRM1_repeat_2
IBN_N
CRM1_repeat_3
IDEAL
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24529205
NCBI-ProteinID:
XP_012761105
UniProt:
A0A060RNA6
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(78118..82148)
Genome browser
AA seq
1257 aa
AA seq
DB search
MENESFNPLSLLDKNQAFDAEKLKLLDNVVEALLDTKDKNRRDFAQNLLNQFKMLDTSWR
SVSIILEHSENVNTKFYGLQILEECINNRWNILPSEEKEGMKNFIACYTITLSTEGTTVG
VDRHLLNKLDETLIQIVKQEWPDSWSSFIPDIVNSAKLNQNVCENNMKLLNMLSEEVFEF
GNETLVKKKKEKLRNEYASQFQEVYNLCLYILEANVYNKRSTNTSLIKQTLHCLSNFFKW
IPLTYIFDKYKFNDNNIQIIDLLFDHFWDDISYKIECVKCIQEIVMLKIDEKNILYFDNV
FINLWTKLVSKIKLLPNANEMKNIPPELKIFWEQYFLQLSICITSFLKNYREKIVEKNNN
TNDVNIVFKFLNMLANSNMEEVFLIIIDYYNIFTEQLIRELITRLEQEHNFKNKNDMNSS
SLDMKNTLTTNMNLDSSSITNRKSYSFVTMNNDINLLNNNNNNNNNNLSNNMNSSNINSN
MVININEYSSILDKIDLNPSDIKKMCPRIKLYEFILNDIRKTVIEKMAKPQEIYISYDNE
TGEVVRDFEPDTTEISLYNTMKTTLVYLTYLGSEKTMELIVELLNKESEKSLKNTNKNEV
WNSTKTNRISYAVGSISMCMTLKKEQDFLMYILRIYLHMIEVKNGEENRAILASCVMYIV
SQYHRFLKLHWRFLKTVMKKLFEFAENEKVQDMAAETILKICKQCKNVIAKNNHNNDNNE
SFFSTFIKFHNNIMHKLPEKLNLLLYEAIAHVISCFPYEEKQESIKVLMSKLMNLWNSLI
YANNNGAIKDMNNTNSLNNNNINNNNNININNDDMKNLEHLCTYENSKLIITFVRVNCRL
AYALSYFYYEQLALVFLDFLKIYQLYSKFINLEVEANGTKRIKHAQFRNLFLMKREFLHL
IETTIERSCYNIQDLEKELLKREQKKLKNEIDESMEIHLPTIEEAKQINFQMTSNILNVL
LETILVDYRDSNPHIKDAEVFSLLSTVFKKIENVTCPILPTVLNYVLLPTIDMIKNDFSS
YPEHREKFYNFLDACVRHCFDYLFTLDSEIFNTFIQSLLWAIKHEHPSVADHGLRITQQF
LHNIIIKKKEYLEEFCKAFYYIILNEILKTLTDSFHKSGFHYQTIILMNLLRLLEFEVVN
IPEVEITKPHIIKHVQTFLTQSFENLNQKQIETFSVDMFNFCVESPSAFRSFVRDLLISL
KEFATNQDELYEADRQEALQRAKMAEDNKLIKLRGLMKEDVPSFSAIDVDDECINVE
NT seq
3774 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatgaatctttcaatcccctctctttgttagataaaaaccaagcgtttgatgct
gaaaaattgaaattgttagacaatgtggtggaagctttattagatactaaagataagaat
agaagagattttgcacagaatttgttaaatcaatttaagatgttagatacatcatggaga
tctgtatcaataatattagaacatagtgagaatgtgaatacaaaattttatggtttacaa
atattagaagaatgtataaataatcgttggaatatattaccttcagaagaaaaagaaggt
atgaagaattttatagcttgctatactattacgttatcaactgaaggtacaacggttggt
gtagatagacatttattgaacaaattagatgagactttaattcagattgtaaaacaagaa
tggcctgattcatggtctagttttattcctgatatagtaaattcagcaaaattaaatcaa
aatgtatgtgagaataatatgaaattattaaatatgttaagtgaagaagtatttgaattt
ggtaatgagaccttagttaaaaagaagaaagagaaattgagaaatgaatatgctagtcaa
tttcaagaagtttataatttatgtttatatatattagaagcaaatgtgtataataaaaga
agtacgaatacctctttgattaaacagacattacattgtttatctaatttttttaaatgg
attcctttaacatatatatttgataaatataaatttaatgataataatattcaaataata
gatttattgtttgatcatttttgggatgatatatcttataaaatagaatgtgttaagtgt
atacaagaaatagttatgttaaaaattgatgaaaaaaacatcctctattttgataatgtg
tttataaatttatggacaaaattagttagtaaaataaaattattaccaaatgcaaatgaa
atgaaaaacattccaccagaattaaaaatattttgggaacaatattttttacaattaagt
atttgtataactagctttttaaaaaattatcgagaaaaaattgttgaaaaaaacaataat
actaatgatgtaaatattgtattcaaatttttaaatatgttagctaatagtaatatggaa
gaagtatttttaattataattgattattataatatttttacagaacaattaattagagaa
ttaataactcgtttagaacaagaacataattttaaaaataaaaatgatatgaattcttca
tctcttgatatgaaaaatacattaacgacaaatatgaatttagattcatcatctataaca
aatagaaaatcatatagttttgtaacaatgaataatgatataaatcttttaaacaacaac
aataataataataataataatcttagtaataatatgaatagtagtaatattaattcaaat
atggttattaatattaatgaatattcttctattctagacaaaattgatttaaatccatca
gatattaagaaaatgtgtccacgtataaaattatatgaatttatattaaacgatattaga
aagactgttattgaaaaaatggctaaaccacaagaaatttatatttcttatgataatgag
actggtgaagtggttcgagattttgaaccagatactactgaaatttctttatataatact
atgaaaacaacattggtttatttaacttatttaggttcagaaaaaaccatggaattaatt
gttgaattattaaataaagaatcagagaaatcgttaaaaaatacgaataaaaatgaagta
tggaatagtaccaaaacgaatagaattagttatgccgttggttctatatctatgtgtatg
actttaaaaaaagaacaagactttttaatgtacattctgagaatatatttacatatgatt
gaagttaaaaatggcgaagaaaatagagctattctagcttcatgtgttatgtacattgtt
agtcaatatcatagatttttaaaacttcattggagatttcttaaaacggttatgaaaaaa
ttatttgaatttgctgaaaatgaaaaggtacaagatatggcagctgaaaccattttaaaa
atatgtaaacaatgtaaaaatgttatagctaaaaataatcataataatgataataatgaa
tctttttttagtacatttattaaattccataataatattatgcataagctaccagaaaaa
ttgaatcttttattatatgaagctatagctcatgttatttcatgtttcccttatgaagaa
aaacaagagagtataaaagtgttaatgagcaaattaatgaatttatggaattcattaata
tatgcaaataataatggtgctataaaagatatgaataatacaaattctttaaataataat
aatataaataataacaataatattaatattaataatgatgatatgaaaaatttagaacat
ttatgtacttatgaaaattccaaattgattattacctttgttagagtaaattgtagatta
gcatatgcattatcttatttttattatgaacaattagctttagtttttctagacttttta
aaaatttatcaactttatagtaaattcattaatttagaagtagaagcaaatggtacaaaa
agaattaagcatgcacaatttagaaatttgtttttaatgaaaagagaattcttacatcta
atcgaaactaccatagagagaagttgttataatatacaagatttagaaaaggagttgtta
aaaagagagcaaaaaaaattaaaaaatgaaattgatgaatccatggaaatccatttacca
acaattgaagaagcaaaacaaataaattttcaaatgacaagtaatatattaaatgtatta
ttagaaacgatattagttgattatagagatagtaatccacatataaaagatgcagaagta
ttttcattattatcaacagtttttaaaaaaattgaaaatgtaacatgtcctatcttacca
acagtactaaattatgtattattaccaacaatagatatgattaaaaatgatttctcatct
tatccagaacatcgtgaaaaattttataatttcttagatgcatgtgtaagacattgtttt
gattatttatttacattagattcagaaatatttaatacatttattcaatctttattatgg
gctataaaacatgaacatccatcggtagctgatcatggtttaagaataacacagcaattt
cttcataatattataataaagaaaaaagaatatttagaagaattttgtaaggcattttat
tacatcatattaaatgaaatactaaaaacactaacagattcttttcacaaatctggtttt
cattatcaaaccataattttaatgaatttattacgattgttagaatttgaagtagtaaat
ataccggaagtagaaataacaaaaccacatataataaaacatgtacaaacctttttaact
caatcttttgaaaatttaaaccaaaaacaaatagagacattctccgtcgatatgtttaat
ttttgtgtagagtctccatcagcctttcgatccttcgttcgagatttattaatatcacta
aaggaattcgcaacaaatcaagatgaactttatgaagccgatagacaagaagcattacag
agagcaaaaatggcagaagataataaactcataaagttaagaggattaatgaaggaagat
gtcccaagcttttcagctatagatgttgatgacgaatgtataaacgttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system