Plasmodium reichenowi: PRSY57_1205900
Help
Entry
PRSY57_1205900 CDS
T08079
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III subunit, putative
KO
K03021
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
PRSY57_1205900
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
prei03021
]
PRSY57_1205900
Enzymes [BR:
prei01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
PRSY57_1205900
Transcription machinery [BR:
prei03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
PRSY57_1205900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_4
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24532118
NCBI-ProteinID:
XP_012763943
UniProt:
A0A151L8G1
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(222729..227087)
Genome browser
AA seq
1452 aa
AA seq
DB search
MKDIIKIKAKRKNVNKINEENEEEIYQLKENNKTQNDDDDDDDYNNNEKNKINKIILKDE
NINSKNDYNNMMNPYDVIGKSENEEYTHIKIEEEKNKDNLYECKNDDNNFYESKINFIKK
QDEANNEDNNNYNNNNNNNNNNNDNNCYYNNYENKHLNIFNNMNEVNNKNLSSNKILKDE
YYDKNFNEDNINNLKEYIHNENKKPKKGKLYNNMNILNDEENFSGLVIKNKEHNKKIYEN
SKCVNTLNEKWKLLPAYLKVKGLVKQHIESYNYFIKREIKTIMNATTNKIIKSDIDEHFY
VEFLDITVGTPSVEENMIETKLTPQICRQRDLTYSAPIYVDVEYVKGNSIITKNNVEIGR
LPVMLRSDICVLNNKSEEELMKLGECPYDPGGYFIVKGTERVLLMQEQLSKNRIIVEMDI
KHNICATITSTTAESKSRCAIVYKNNKLYLKHNSFIEDIGVCIILRAMGYESDQEIFQMI
GSHKNYVNGILLSLYELYNENIKTNLDALLFIGKKIRPRLLAKGFFSSMKEKQVKNEKDI
IEEGLDFLSRVLLSHIQQKSKYDFRNKARCICLMIRRVLDSANNKNEIDDKDYYGNKRLE
LAGQLISLLFEDLYKRFYFTLKKQIDQTLSKYMQSNYNSKLRSTGNNMNDNYPDVFRNLP
KDIITRGMQTAISTGNWNIKRFKMEKSGVSQVLSRLSFIACIGMMTRLNSQFEKGRKVSG
PRALQPSQWGVLCPCDTPEGESCGLVKNLALMTHVTNDNENNENLIEILYTLGVEDSDSL
TGEEIYKEGVFFVILNGILLGVHKRPQKFMQRIRYLRRYGKIGQFVSIYDNFLHNAIYIS
TDGGRLCRPLIIIENGKSKLLPQHIKALENGTINFFDLLKSSVIEWIDVNEQNNLLIALN
ESDISLSTTHLEIDPLTILGVVAGLIPYPNHNQSPRNTYQCAMGKQAIGAIGYNQFVRCD
TLLYLLVYPQKPLVKSKTIEFINFEKLPAGQNAIVAVMSFCGYDIEDAIVMNKSSIDRGF
GRCMSLRKHSVELKKYFNGSNDIVLPSPLVINKLQQQRKEREIKSEIKNEKEKDGIKQEH
HHNNIDSNNNNLSKIHNVKKDSYGHKNISNESKDDIKKMANKDIRKYHSLDMDGVASIGY
LIKEGQLYVNKFSPKNIKDHVKDIGKVDINDFKINEIKYKSVYPSYIDKIIFTENSEGLK
IYKIIMRQTRLPELGDKFSSRHGQKGVVGLLVNQEDMPFTESGICPDLIMNPHGFPSRMT
VGKLLELVASKAAVMDGEFKYGSIFSGTPFEEIAEILFRYGFNCSSKELLYSGLTGEPLE
TYIFMGPIYYQKLKHMVQDKIHARARGPRQLLTRQPTEGRSKEGGLRLGEMERDCLIAYG
VSNLLLERLMLSSDVCNVYICEDCGMMGYDLYCTFCKKCDKNIVIQMPYACKLLFQELQT
MNVFPKIIVKEV
NT seq
4359 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagatattattaagattaaagcgaaaaggaaaaacgtgaataaaattaatgaagag
aatgaagaggaaatataccagttaaaagaaaataataaaacacaaaatgatgatgatgat
gatgatgattataataataatgagaaaaataagataaataaaataatactaaaagatgaa
aacataaatagtaaaaatgattataataatatgatgaatccatacgatgtaattggtaaa
agcgaaaatgaagaatatacacatataaaaatagaagaggagaaaaataaagataatttg
tatgaatgtaaaaatgatgataataatttctatgagagtaaaataaattttattaaaaaa
caagatgaagcaaataatgaagataataataattacaataataataataataataataat
aataataatgataataattgttattataataattatgagaataaacatttaaatatattc
aacaatatgaatgaagtgaataataaaaacttgtcaagtaataaaatattaaaagatgaa
tattatgataaaaattttaatgaagataatataaataatttaaaagaatatatacataat
gaaaataagaaaccaaaaaaaggaaagctatataataatatgaatattttaaatgatgaa
gaaaatttctcaggtttagttattaaaaataaagaacataataagaaaatttatgaaaat
tcaaaatgtgttaatacattaaacgaaaaatggaaattacttcctgcttatttgaaggta
aaaggtttagttaagcaacatattgaatcatataattattttataaaacgagaaataaaa
acaataatgaatgctactacaaataaaattataaaatcagatattgatgaacatttttat
gtagaatttttagatataaccgttggaacaccttctgttgaagaaaatatgatagaaacg
aaattaacacctcaaatatgtagacaacgtgatttaacatattcagctcctatatatgta
gatgtagaatatgtaaaaggaaatagtattataaccaaaaataatgtagaaattggtaga
ttacctgttatgttaagaagtgatatatgtgtattaaataataaaagtgaagaagaattg
atgaaattaggtgaatgtccttatgatcctggaggatattttattgttaaaggtacagaa
agggttttattaatgcaagaacaattatcaaaaaatcgaattattgtagaaatggatata
aaacataatatttgtgcaactattacatcaacaactgctgaatcgaaaagtagatgtgct
attgtatacaaaaataataaactctatttaaaacacaactcttttattgaagatattggt
gtttgtattatattaagagctatgggatatgaaagcgatcaagaaatatttcaaatgatt
ggatcacataaaaattatgttaacggtatattgttatcattatatgaattatacaatgaa
aatatcaaaacgaatttagatgctttattatttattgggaaaaaaatcagaccaaggtta
ttggctaaaggattctttagctccatgaaagaaaaacaagtaaaaaatgaaaaggatatt
attgaagaaggtttagattttttaagtcgagttttattatctcatattcagcaaaaaagt
aaatatgactttagaaataaagcgagatgtatttgtttaatgataagaagagttttagat
agtgcaaataataaaaatgaaatcgatgataaagattactatggtaataaaagattagaa
ttagctggacaattaatatcattattatttgaagatttatataaaagattttattttaca
ttaaaaaaacaaatagatcaaactttaagcaaatatatgcaaagtaattataattctaaa
ttaagaagtactggtaataatatgaatgataattatccagacgttttccgaaatttacca
aaggatattattacaagaggtatgcaaacagctatatcaactggtaattggaatattaaa
agatttaaaatggaaaagagtggtgtttctcaagttttatcacgtttatcatttattgca
tgtataggaatgatgaccagattaaattcccaattcgagaaaggaagaaaagtgagtggt
cctcgagctcttcagccatcacaatggggagtgttatgtccatgtgatacccctgaagga
gaatcatgtggtttagttaaaaatttagctttaatgacacatgttacaaatgacaatgag
aataatgaaaatttgattgaaatattgtacactttaggagtagaagatagcgatagttta
actggagaagaaatatataaagagggtgtattttttgttattttgaatggtatattatta
ggagtacataagagacctcaaaaatttatgcaacgtatacgatatttaagaagatatggg
aaaataggacaatttgtgtctatatatgataattttttacataatgctatatatatatct
acagatggaggacgattatgtagaccattaataattatagaaaatggtaaatctaaatta
ttaccacaacatattaaagcattagagaatggaactatcaatttttttgatttattaaaa
agttcggttattgaatggattgatgtaaatgaacaaaataatcttttaatagcattaaat
gaatcagatatatcattaagtactacacatttagaaatagatccattaactatacttggt
gtggttgctggattaattccatatcctaatcataaccagagtccaagaaatacataccaa
tgtgctatgggtaaacaagccataggtgctattggatataatcaatttgtaagatgtgat
accttgttatatttattagtatatccacagaagcctttagtaaaatctaaaacaattgaa
tttataaattttgaaaaattacctgctggacaaaatgcaatagttgctgttatgagtttt
tgtggatatgatattgaagatgctatagttatgaataaatcgtcaattgatagaggtttt
ggtagatgtatgtctttgagaaaacattcagtggaattaaaaaaatatttcaatggatcg
aacgatatagttttaccttctccgttggtaataaataaattacaacagcaacgaaaagaa
agggaaattaaaagtgagataaaaaatgaaaaagaaaaagatggaataaaacaagaacat
catcataataatatagatagtaataataataacttatccaaaatacataatgttaaaaaa
gattcatatggtcataagaatatatctaatgaatctaaagatgatataaaaaaaatggca
aataaggatattagaaaatatcattctctagatatggacggagttgcatctattggttat
ttgataaaagaagggcaattatatgtaaataaattttcaccaaaaaatattaaagatcat
gtaaaagatattggaaaagttgatataaatgatttcaaaattaatgaaattaaatataaa
agtgtatatccatcatatatagataaaattattttcactgaaaattcggaaggattaaaa
atatataaaataattatgagacaaacaagattacctgaactaggtgataaatttagttca
aggcatggacaaaaaggtgttgtaggtttgttagtaaatcaagaagatatgccatttact
gaatcgggaatatgtccagatttaattatgaatccacatggattcccatctcgtatgaca
gtaggaaaacttcttgaactagtggcatctaaggctgcagttatggatggtgaatttaag
tatggttctatttttagtgggacaccatttgaagaaatagcagaaatcttatttagatat
ggatttaattgttcaagtaaagaattattatattctggattaactggtgaacccttagaa
acctatatatttatgggaccaatttattatcaaaaattaaaacatatggtacaagataaa
atccatgctagagctagaggaccaagacaattacttacaagacaaccaactgaaggtaga
tcaaaagaaggaggtctcagattaggtgaaatggaaagagattgtttaatagcatatggt
gttagcaatttattacttgaaagattaatgttaagtagtgatgtatgtaatgtatatatt
tgtgaggattgtggtatgatgggatatgatttatattgtacattttgtaaaaaatgtgat
aaaaacattgttattcaaatgccatacgcatgcaaattgttatttcaggaacttcaaacc
atgaatgtttttccaaaaattatagtaaaggaggtatag
DBGET
integrated database retrieval system
