Polypterus senegalus (gray bichir): 120535787
Help
Entry
120535787 CDS
T08668
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
psex
Polypterus senegalus (gray bichir)
Pathway
psex04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psex00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
120535787
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
Ank
EGF_2
Notch
NOD
NODP
Ank_3
Ank_5
Ank_4
EGF_3
DL-JAG_EGF-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120535787
NCBI-ProteinID:
XP_039619789
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(130284362..130330260)
Genome browser
AA seq
2529 aa
AA seq
DB search
MYHLLTSLVFLISLLPFSQGITCTEPAGSCLNGGRCEDVGKCRCISGYAGGRCQFKDPCM
SSPCNNGGTCNLIDRGNSMDFKCNCRLGFTDQLCLTPISHACLNNPCKNGGTCDLISLNE
YKCRCPPGWSGQVCHQPDPCASNPCANGGQCSPFDAHYRCKCPPGFHGQSCVQDVNECAL
NPPQCKNGGTCHNMVGSYKCSCPVEFTGKNCEILYVPCSPSPCLNGGTCRQTGETTYDCT
CLPGFIGQNCETNVDDCPDNKCQNGGTCVDGIHTYNCQCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPN
ACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGDDCSENIDDCANAACHNGATCHDRVASFFCQCPHG
RTGLLCHLNDACISNPCRMGSNCDTNPVNGKAICTCPPGYTGSACNVDVDECALGANPCE
HSGKCINTKGSFQCQCLPGYTGPRCELDVNECMSNPCMNDATCLDQIGGFQCICMSGYAG
MFCENNVDECASSPCLNNGNCIDKINAHHCECPTGFTGTLCQVDIDECASTPCKNGAKCI
DGSNKYTCQCTEGFTGPHCEIDIDECQPDPCHYGTCKDGVATFTCLCKPGYGGRRCETEI
NECQSHPCQNGGTCQDRVNAYYCICPKGTAGPNCEINLDDCESNPCDYGKCIDKINGYEC
ACELGYTGSMCNFNINECASNPCHNGGTCKDGINGFTCVCPEGYHDPTCLSEVNECNSNP
CIHGSCQDGVNGYKCVCDPGWSGTNCDINNNECDSNPCMNGGTCKDMTSGYICACRAGFS
GPNCQTNINECASNPCLNKGNCIDDVAGYKCNCMLPYTGDNCELVLAPCVSNPCKNDGKC
RESEDYESFSCDCPEGWQGQTCEIDINECVENPCQNSASCQNTIGSYKCNCKTGYSGRNC
ETDIDDCQPNPCSNGGSCSDGINTFVCTCLLGFRGLKCEEDINECDSNPCKNGANCTDCV
NSYTCTCPPGFSGIHCENNTQDCTESSCFNGGTCLDGINTFTCLCPPGFTGSYCQHDINE
CDSKPCLNGGTCQDSYGTYKCTCPHGYTGINCQNLVRWCDSSPCKNGGTCWQTNTSYSCQ
CKSGWTGLYCDVPSVSCEVAARQQGTDLAHLCRNSGLCVNAGNTHYCQCQAGYTGSYCEA
QVDECIPNPCQNGATCTDYLGGYSCECVPGYQGMNCSDEINECLSQPCQNGGTCIDLINT
YKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPSVDPITQEPKCFNGGKCVDKVGGYQCICQAGFVGERC
EGDVNECLSNPCDPRGTQNCIQLINSYRCECRTGYTGRRCDAVFDGCKGKPCQNGGTCAV
ASNTPHGFICRCLPGFEGSACEYDSRFCGSLQCRNGGTCMLVSKSPKCLCPAAFTGTECQ
YPVNSPCNSNPCYNGGTCKPSAESPFYQCECPTKFNGISCHILDHTFTGGIGQNITPPPE
ITERCENLECENRKNNKICDSLCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWRYFNDGK
CDTQCNNPGCLYDGFDCQNVDGQCNPLYDQYCKDHYADGHCDQGCNNPECEWDGLDCANM
PEKLAEGRLVLVVHILPEQLKNNSFGFLRELSRVLHTNVVFRKDEKSEYMIYPYYGSEQE
LKKHNIKRSTGSWSDFSSNVFTKMKTSMYSAINSRKRRELDAMQIKGSVVHLEIDNRQCY
QQSTECFQSATDVAAFLGALASSGNLNMPYVKSVTSETDFKTKTPELYPMYVVVAALVLL
AFIGIGVLVSRKRRREHGQLWFPEGFKVTEPSKKQRREPVGEDSVGLKPLKNSLDMSLMD
DNQNEWGDEEPSDTKRFRFEEQAMLDFDDQTDHRQWTQQHLDAADLRVPSMAPTPPQGEI
DNDCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEEDASANVISDFIYQGANLHNQTDR
TGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRAT
DLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVEAAVV
LLKNGANKDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMH
HDIVRLLDEYNLVRSPPLHNGSIGATLSPPLCSPNSYLGNLKPAVQSKKARKPSAKGMSC
NGKEAKDVKARRKKSQDGKGNLLDSSAVLSPVDSLESPHGYLSDVASPPMMTSPFQQSPS
IPLNHMQSISDAHIGVNHLGMTGKQDISIGGANRMPFESVPPRLSHLPVSSPNSTVPQHN
GSMSFTMSGAPGVNGQCDWLSRIQATMGQNQFNPMRNTSQGSIHQSNQALQHGMMTTLHN
GLPTTTLSQMMSYQGMQNTRLTSQTHLIQAQQMQQVQNQQNLQLQQQQTMHPQLQHQNSN
SATSSHALSQSFIGGDLNQPDLQLSGNTLPIHTILPQEPQILPSSITQPIATTQFLTPPS
QHSYSSPLDNTPNHQLQVPDHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNMSDWSEGISSPPTSMQSQ
ISHIPDQFK
NT seq
7590 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcatttgcttacgagcctagtgtttttgatatcattgctccctttctcacaaggt
ataacctgtacagagcccgctggatcgtgcttaaatggtgggagatgcgaagatgttggg
aaatgcaggtgtatttctggatatgctggagggaggtgccaatttaaagacccctgcatg
agctccccatgtaacaatgggggaacttgtaacttgattgatcgtggtaacagcatggac
tttaaatgtaactgcagacttggatttactgatcagctgtgcctcacgccaatcagccat
gcgtgcctgaacaatccctgcaaaaatggtgggacctgtgatctcatctctctcaatgaa
tacaaatgtcgttgcccaccaggttggtcaggtcaagtttgccatcagcctgacccctgt
gcctctaatccatgtgccaatggtggtcagtgtagcccatttgatgctcactaccgttgc
aagtgtccaccaggttttcatggacagtcatgcgtacaagatgtcaatgaatgtgcgtta
aatcctccgcaatgtaagaatggtggtacctgtcataatatggttggctcttataaatgc
tcatgtccagtggagttcaccgggaaaaactgtgaaatcctttatgtgccatgcagtcct
tctccttgtcttaatgggggcacatgtcgacagactggggagactacctatgactgcaca
tgtctgccaggatttataggtcagaactgtgaaactaatgtagatgactgtccagataac
aagtgccagaatggaggaacctgtgtggatggaattcacacctacaactgccagtgccca
ccagaatggacaggccagtactgcactgaggatgttgatgaatgccagctaatgccaaat
gcgtgccagaatggaggtacttgccataatactcatggtggctataactgcgtctgtgta
aatggctggacaggagatgactgcagtgaaaatattgatgattgtgctaatgctgcttgc
cacaatggagccacttgccatgaccgtgttgcctctttcttttgccagtgtccacatgga
cgcaccggcttgctgtgccacctgaatgacgcatgcattagcaatccatgccgaatgggc
tccaattgtgatactaatccagttaacggcaaggcaatttgcacatgtccacctggctat
actggctcagcctgcaatgtagatgttgatgaatgtgctctaggtgccaatccatgtgag
cattcaggaaaatgtatcaacaccaagggttcctttcagtgccagtgtcttccaggttat
actggtccccgctgtgagctggatgttaatgagtgtatgtcaaatccctgcatgaatgat
gctacctgcttggatcagattggtggattccaatgtatttgcatgtcaggttatgcagga
atgttttgtgaaaacaatgtagatgagtgtgccagcagcccatgtttgaacaatggaaac
tgtatcgacaagatcaacgcacatcactgcgagtgccccacaggcttcacaggaacgttg
tgccaggtggatatagatgaatgtgctagtactccttgcaaaaatggtgccaaatgcatt
gatggttctaataagtatacttgccagtgcactgagggttttacaggcccccactgtgaa
attgacattgatgagtgccagccagatccttgccattatggaacatgtaaggatggcgtg
gcaaccttcacttgcctctgcaaacctggttatgggggtcgccggtgtgaaactgaaatt
aatgagtgtcaaagccatccttgtcagaatggaggaacctgtcaggacagagtcaatgcc
tactattgtatatgtcctaagggtacagcaggacctaactgtgaaataaatctggatgat
tgtgagagcaatccctgtgattatggaaagtgtatagacaaaattaatggctatgaatgt
gcctgtgagctgggttatacagggtctatgtgtaactttaatataaatgagtgtgcttcc
aatccctgccacaatggtggtacttgcaaagatggcatcaatggcttcacctgtgtgtgc
ccagaagggtatcatgaccctacttgtctttcagaagtgaatgaatgcaacagtaacccc
tgcattcatggcagttgccaggatggagtcaatggttacaaatgtgtttgtgatccaggc
tggagtggcactaactgtgacattaataacaatgaatgtgattcaaacccttgcatgaat
ggagggacctgcaaagacatgacaagtggatacatttgtgcctgtagagcaggcttcagt
ggtcccaattgccagacaaacattaatgaatgtgcttcaaatccttgtcttaacaaaggc
aattgcattgatgatgtagctggatataaatgcaactgcatgcttccatatactggagac
aactgtgaactagtgcttgctccatgtgtttcaaacccctgcaagaacgatggaaaatgt
agggagtctgaggattatgagagtttctcatgtgattgtccagaaggatggcaagggcag
acttgtgaaatcgacatcaatgaatgtgttgaaaatccctgccaaaactcagcctcctgc
cagaacaccattggcagctacaagtgtaactgtaagacaggctactctggccgcaactgt
gaaacggatattgatgactgccagccaaatccttgcagtaatggtggctcatgttcagat
ggcatcaacacgtttgtatgtacctgccttctgggatttcgtggattgaaatgtgaagag
gatatcaatgaatgtgacagcaatccttgcaaaaatggagccaactgcactgactgtgtg
aacagctatacttgcacttgcccaccgggcttcagtggaatacactgtgagaacaacacc
caagactgcactgaaagctcttgcttcaatggaggcacatgtttggatggcatcaataca
tttacctgcttatgcccacctggcttcacaggaagctactgccaacatgatatcaatgaa
tgtgactcaaagccttgcctaaatggtggcacctgtcaggacagttatggcacatacaag
tgtacctgccctcatggatacacaggaataaactgccagaatcttgtacgttggtgtgac
tcctccccatgcaagaacggaggcacatgttggcagacaaacacttcctatagctgccaa
tgcaaaagtggctggactggactctattgtgatgttccaagcgtctcctgtgaggtagca
gcccgtcaacaaggcacagatttggcacacttatgcagaaattcaggcctttgtgtgaat
gcaggaaatactcattactgccagtgtcaagctggttatacaggcagttactgtgaggcc
caagtagatgagtgcatccccaatccctgtcagaatggtgccacctgtactgactacttg
ggaggttactcctgtgagtgtgtaccaggatatcagggaatgaactgttcagatgaaatc
aatgagtgcctttcacagccttgccagaatggtgggacttgcatagatctgatcaacact
tacaagtgttcatgtcctcgaggaacacaaggtgtacattgtgaaattaatgttgatgac
tgcaatccttctgtggatcccatcacgcaagaaccaaagtgttttaatggtggaaaatgt
gtcgacaaggttggtggataccaatgtatctgtcaggctggatttgtgggagagcgctgt
gaaggtgatgtcaatgaatgcttgtcaaatccatgtgacccaagaggcactcagaactgc
atacagctaataaacagctatcggtgtgagtgccgcactggttatactggaaggcgttgt
gatgcagtttttgatggctgcaagggaaagccgtgccaaaatggagggacatgtgcagtg
gccagtaacacacctcatggattcatctgtagatgccttccaggctttgaagggtctgca
tgtgaatatgattcccgattctgtggaagtcttcagtgtcgaaatggaggaacctgtatg
ttggtttcaaaaagtcctaagtgtttgtgcccagcagcctttactggcactgaatgccag
tatccagtcaatagtccctgcaactctaacccatgttacaatggaggaacttgcaagcct
tctgcagaatctcctttctaccagtgtgagtgtcccaccaaattcaatggaatctcttgc
cacatactggaccacactttcacaggtggaataggtcaaaatatcacaccacctcctgag
atcacagagcgatgtgagaacctagaatgtgagaaccgcaagaacaacaagatttgtgat
agcctgtgcaacaaccatgcatgtggctgggatgggggtgactgttcccttaatttcaat
gatccatggaagaactgcactcagtccctgcagtgctggcgctacttcaatgatggaaaa
tgtgacacacaatgcaacaaccctggctgtctctatgatggctttgattgtcaaaatgtg
gatgggcagtgcaaccctttatacgatcaatactgtaaagatcactatgctgatggacac
tgtgatcaaggttgcaataatccagagtgtgaatgggatggccttgactgtgccaatatg
ccagaaaaattggcagaaggccggctagtgctagtggtgcacatcttacctgaacagctg
aagaacaattcgtttggcttcctcagagagctcagtagggtacttcacaccaatgttgtc
ttccgcaaagatgagaaaagcgagtacatgatatacccatactacggcagtgaacaggag
ctcaaaaaacataatatcaagagatcaacaggcagctggagtgacttctccagtaatgtc
tttaccaagatgaagacatctatgtactcagctataaactccagaaaacgtagagagctg
gatgccatgcaaattaaaggctctgttgtacatttggagattgacaaccgacagtgttac
caacaatcaacagaatgtttccagagtgcaacagatgtggctgctttccttggtgctctt
gcctccagtggaaatttgaatatgccttatgttaaatctgtcacaagtgagacagatttt
aagacgaagacacctgagctgtaccctatgtatgtggtggtggcagcacttgtgctatta
gcatttattggcattggggtcttagtctcccgaaaacgcaggagagagcatggacaactg
tggtttcccgagggcttcaaagtgacagaaccaagcaagaagcagcgacgtgagcctgtt
ggggaggactctgttggcttaaagccgttgaaaaactctctggacatgtccttaatggat
gataatcaaaatgaatggggtgatgaggagccatccgacaccaaacgattccggtttgaa
gaacaagcaatgttagactttgatgatcaaacagatcacaggcaatggacacaacaacac
ttagacgcagctgatcttcgtgtgccgtccatggctcctaccccaccacagggggaaatt
gacaatgactgtatggatgtgaatgttaggggaccagatggctttactccactcatgata
gcatcatgtagtggtggaggactggagactggaaatagtgaggaagaagaagatgcctct
gccaacgtcatttcagatttcatctaccaaggcgcaaatcttcacaaccagacagatcgc
acaggagagacagcactacatctggcagcaagatatgcccgttctgatgcagccaagcgc
ctcctggaagccagtgcagatgcaaacatccaggataacatggggcgcacaccattgcat
gctgccgtggcagctgatgctcagggagtttttcagattctaataagaaaccgagccaca
gacttggatgctcgcatgcatgatgggaccactccactgattctggcagctcgccttgca
gtggaaggcatggtggaggagctcattaactgccacgcagatgttaatgcgattgatgac
tttggcaaatctgctctgcattgggcagcagctgtgaacaatgtggaggctgcagttgtg
ctgctgaagaacggggccaataaggatatgcagaacaataaggaggaaacaccattgttc
cttgcagctagagaaggcagctatgagacagcaaaagtcttgttagatcactttgccaac
agggaaattactgaccacatggaccgtctgccaagggacattgcccaggaacgtatgcac
catgatattgtgcgattactggatgaatacaatttagtcaggagccctccactgcacaat
gggtctattggggcaacgctctcaccgcctctttgctccccgaacagttaccttgggaac
ttgaaacctgcagttcagagcaagaaagccagaaagccaagtgccaagggaatgagctgc
aatggaaaagaggccaaagatgtcaaagcacggaggaagaagtcccaagacgggaaggga
aacctgcttgacagttcagctgtgctctctccagtagattcccttgaatctcctcatggc
tacttgtcagatgtggcatcacctccaatgatgacatctccttttcaacagtccccttca
atacccctcaaccatatgcagagtatatcagatgctcacattggagtaaaccacctgggt
atgaccggaaagcaagatatttcaataggtggtgccaacagaatgccatttgagtcagta
ccacctcgtctgtctcatttaccagtgtccagtccaaacagcacagttccacagcacaat
ggctctatgtccttcaccatgagtggagctccaggtgtgaatggtcagtgtgactggcta
tccagaatacaggcaactatggggcaaaaccagtttaatccaatgagaaataccagtcag
ggcagcattcatcagagtaaccaggctcttcagcatggcatgatgaccactttgcataac
ggattaccaacaactaccctttctcagatgatgagctaccagggaatgcaaaacacaagg
ctcactagtcaaacacacctaatccaggctcagcaaatgcagcaggtgcaaaaccagcag
aacctccagctccagcagcaacaaaccatgcacccgcaactgcaacaccaaaattctaac
agtgctaccagcagtcatgcactgagccagagcttcattgggggtgacttaaaccagcct
gatctgcagctttcaggaaacaccttgcccattcacactattctgccacaagagccccag
atcttgccctcctccattacccagccaattgcaaccacccagtttttgactcccccttca
cagcacagctactcttcaccactggacaatactccaaaccaccagctccaagtgccagat
cacccctttctgaccccatccccagaatcacctgaccaatggtctagctcttctccacat
tccaatatgtcagactggtcagaaggcatctccagccctccaaccagtatgcagtctcaa
atttcccacattccagatcaatttaagtga
DBGET
integrated database retrieval system
