Styela clava (leathery sea squirt): 120345158
Help
Entry
120345158 CDS
T07291
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
sclv
Styela clava (leathery sea squirt)
Pathway
sclv04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sclv00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
120345158
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
Ank_2
Ank
EGF_CA
Ank_5
Ank_3
Ank_4
EGF_2
EGF_3
Notch
DL-JAG_EGF-like
NODP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120345158
NCBI-ProteinID:
XP_039270515
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2342 aa
AA seq
DB search
MDLPQFRIIFQAAIFLPFLFVYASGCSSNADCTSGQICISSVCSVSPCASSPCDNSGTCG
VVATSSTDYTWQCSCPSTYMGTTCSDYNYCHSNPCNHGTCTVVSNSFECTCTDGYYGDTC
ANDKDECSDNPNLCANGGNCINVDGSYSCDCLTGFEGTHCEDNTDDCIGNECAAGSTCVD
ELNDYFCVCAEGWTGTHCKEDMDECNDGTTRCMNGGTCINTEGSFSCNCVNGWSGDDCSE
NIDDCSSAACFHNATCIDKVGTFVCVCVPGKTGILCHLDDACISNPCANGSTCDTNPITG
HWMCSCPDGYTSKSCDVNINECEIGENPCEHDGQCIDTEGSFECDCADGYTGPRCETNIN
ECESSPCQNDATCLDMVGKFQCVCMPGYTGLLCDIDIIECSSNPCMNGGTCIDEINGYTC
NCASGFTGSDCSFNIDECSSIPCQNKGTCVDKANSYECECADGYAGIHCETDIDDCQTNP
CHHGTCEDGVNQYICNCNAGYTGTICQTEINECESSPCENGGTCTDNVGYFSCSCPVGTS
GTRCENNPDDCVSNPCGVHGTCVDKVNEYECNCDPGYTGTHCTDEINECESNPCLNGATC
VDGINTYTCNCLPGYHGSRCSSDIEECSSNPCINGLCQEDVNQYICVCNSGYTGVNCEVE
INECESNPCEHGSCQNEIGRFVCVCTPGYTGVKCETDIDECATGPCQNGGICTSGVNVYS
CNCPARYTGTNCETELTPCNPNPCNGGECTPSADYLTYTCTCIQGYEGVTCQHDINECLS
SPCLNGGTCTNLSPDYKCACANGFTGTNCETNIDDCSPDPCMNAGKCIDDVGTYKCLCKP
GYNGFDCQFEIDECASNPCQNGGECQDYVNSFVCSCPTGYTSLTCSRNPDDCTSSSCLNG
GTCVDGDNTFTCECPSGYTGDKCQNEISACLSVSCLNGGTCYVDSGTARCACGIAYEGTY
CGNLIDLCADASLCKNRATCSQNGADFTCSCVTGYTGVYCDMEEVSCEQAATNRGVAVSA
LCSNHGDCRDTTTAHECTCDPGYTGSYCNIDINECALQPCLNGATCIDLINSYSCTCDAG
YTGENCEQNIDECASSPCKNGGTCVDMVNAVHCSCLAGTAGIFCEVNVDDCTDDSCYHGG
QCIDGINGFTCNCLSGYVGSRCEGDVNECLSNPCNAAGTTECIEGENSFTCVCSVDYAGT
LCDVKLGSCAINPCENGGTCTDNSYDPKGYFCSCSSGYYGINCQHQYSSCGDSHICYNNG
VCVNDACECTSNYYGDYCEKARVEDKTCSNPNCAQVKNNGVCNSDMNCTTHECDYDGTDC
TFGNANPWELCSPEYECWNLHKNGHCDEHCNTQECLLDGMDCSTPIGDCNPKYEVYCTDN
FNNSYCDEGCNNADCGWDGDDCNQYPEQYALGILVIQVGNMTPADVWTRKEELSIEFGKI
LHTQMKMIAVNVVTVEISRKKRSLFDEAYDSMTSIFSRTKRATSDGESSQMEFRMDNSKC
YISSGACFETASGASSFLAAARLTQTLEVSVDIETTGSIDEPTSEGSQHIVTYAVSGAAL
FAFVVVIFGVLLKRKRETGQLWRPEGFLLHKKQRREPIGQADLNLKKLNKSPSPDNDTNT
PFIQSFHDNGTNNHHKKYLASRQENEPLHGVQTENRKKTPECEVQSDNRKWTPQHIEAAR
ASSREVSSPLLEDNNDEIDARGPDGLTPLMIASTRGGGIEVIVDEESGEGNEGEGSENMI
ASLLLQGASLTAQTDRTGETPLHLAARYARADAAKRLLDAGADANMKEQTGRTPLHVAVA
ADAQGVFQILLRNRATDLDAKTNDGTTPLILAARLAVEGMVEELIGAHADVDAVDNHGKT
AMHWAAAVNNIEALSALLAAGAKRDAQTEREETPLFLAAREGSYEAVRLLLDHLANRDIT
DHMDRLPRDIAQERLHTDIIQLLDEYNLVRSPMGHMDNSPLMHNNAAYIAHITKGKKQRR
SNGKPDGKAARRTKKKSSTDNNIESPNGINPNLNPHHMYNSVLLSDGQSPGSNSMSSPST
YSDSTHSPPISNAGNLPPNAYYPRVMQGSHSGGMDNHLPLGPHPSQLSGRMIQHPRAQPH
LSGSNTGLGLNLGQLQMRYNDPELQQQHLARMAHYRAQAQVPYQQIINPHPHSANSGGYP
RSSQGMAFSEMIPNLPQQQLYHMDAPSYTQQLAMNQRQQQNFVHQSKGMPRSSTGGNSYL
LDKYPTPPSNSTLSPPSASFSPHSASNNHSHGHLKTQPQPGDLSYETPSPESPGDQWSSA
SPRSNSDWSDSIHSPPTGPHMHAPNLHQTIHPHGGMPVSHRGLGVRMHPPPNAAHSGKLQ
AA
NT seq
7029 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttacctcaatttcggattatttttcaagcggcaatttttcttccatttttattt
gtttacgcatctggttgttcatctaatgcggattgcacaagtggccaaatatgtataagt
tcagtttgcagtgtatctccatgtgcttcatcaccttgtgataatagcggaacgtgtggc
gtagtagcaacatcttccactgactatacatggcaatgttcttgcccatctacatatatg
gggaccacatgcagtgattacaattactgtcattcaaacccatgcaatcacggaacttgt
actgtcgtgtcaaacagttttgaatgcacttgcacggatggctattatggtgacacgtgt
gccaatgataaagatgaatgttctgacaatcctaacctatgtgcgaatggcggaaattgc
attaatgttgatggctcttactcatgtgattgtctgacagggtttgaaggaactcattgt
gaagacaacacagatgattgtatcggtaatgaatgtgctgcgggatcaacttgtgttgat
gaattgaatgattatttctgcgtttgtgccgagggttggaccggtactcattgcaaggaa
gacatggacgaatgtaacgatggtacaacaagatgtatgaatggaggaacatgcatcaat
acagaaggctcgttctcttgcaactgtgtgaatggttggtccggagatgactgtagtgaa
aacattgacgattgtagttctgctgcttgttttcacaatgcaacttgtatcgacaaagtt
ggaacattcgtttgtgtgtgcgttcctgggaaaactggtatcctttgtcatttggatgat
gcttgtatctctaatccatgtgccaacggatcaacttgcgacaccaaccccattacgggt
cactggatgtgttcctgtcctgacggttacacgtcaaaaagttgtgatgtcaacatcaac
gaatgtgaaataggtgaaaatccatgtgaacacgacggccaatgcattgacacggaagga
tcattcgaatgtgattgtgcagatggatacacaggacctagatgtgaaactaacataaat
gaatgcgaaagctcgccatgtcaaaatgacgcaacttgtcttgacatggttggaaagttt
caatgtgtttgcatgccaggatacactggattgttgtgtgatattgacatcattgaatgt
tcaagcaacccttgtatgaatggtggaacctgtattgatgaaatcaatggctacacatgc
aattgtgcttcgggattcaccggttctgattgcagttttaatattgacgagtgttcatcc
attccatgtcaaaataaaggaacatgtgtcgacaaggcaaatagttatgaatgcgaatgc
gcagatggatatgctggaattcattgtgaaactgatatagatgattgtcaaactaatccc
tgtcaccatggaacatgtgaagatggcgtgaaccaatacatctgcaattgcaatgcggga
tatacgggaacaatttgtcaaactgagataaacgaatgtgaatcaagtccatgtgagaat
ggaggaacgtgcaccgataacgtcggctatttttcatgtagttgtcccgttggaactagt
ggcacaaggtgtgaaaataatccagatgattgtgtttctaatccatgtggtgttcatggt
acttgtgtggataaagttaatgaatatgaatgcaattgtgatccaggatacacaggaacg
cattgtacagatgaaattaacgagtgtgaatcaaacccatgtctaaatggagccacatgt
gttgacggtattaacacatacacatgtaattgtttgccaggataccatggttcgcgatgt
tcctctgatattgaagaatgcagtagcaatccttgtattaatggattgtgccaagaagat
gtcaaccaatacatatgtgtatgcaattctggatacacaggagtgaattgcgaagtagaa
atcaacgaatgcgaatctaacccttgtgaacacggttcatgtcaaaatgaaatcggcaga
tttgtgtgtgtttgtacgcctgggtataccggagtcaaatgtgaaacggacatagacgaa
tgtgcgactggtccttgtcaaaacgggggtatatgcacaagtggggtcaatgtgtattcg
tgtaactgccccgcaagatacacaggaacaaattgtgagacggagcttaccccatgtaac
ccgaatccatgtaatggtggagagtgtaccccatccgctgattacttgacttacacttgc
acatgtatacaaggatatgaaggagtcacttgtcaacatgatattaatgaatgtctgtct
tcaccatgtttgaatggaggaacttgtactaatttatcacctgattataaatgtgcttgc
gcgaatggattcacaggaactaactgcgaaacaaatatagatgattgttcaccagatcca
tgtatgaacgctggaaaatgtatcgatgatgttggaacatataaatgcctatgtaaacct
ggttataacggattcgattgtcaatttgaaattgacgaatgtgcaagtaacccatgtcag
aatggtggtgaatgccaagattacgtcaacagctttgtttgctcatgccctactggatat
acttctttaacctgctcgagaaatccagacgattgtacatcaagttcttgtcttaatggt
gggacatgtgtggatggtgataatacttttacatgtgaatgtccaagcggctacacaggt
gataagtgccagaatgagatcagtgcttgtctatccgtatcttgtctcaatggtggaaca
tgctatgtggactcgggaacggcgagatgtgcttgtggtattgcttatgagggaacttat
tgtgggaatctaattgacttgtgtgccgatgccagtttatgtaaaaacagagcaacatgc
agtcagaatggagcagattttacatgttcgtgcgttactggttatactggcgtttattgt
gatatggaagaagtatcatgcgaacaggctgctacaaatagaggggttgctgtttctgca
ttatgctcaaaccacggagattgtcgtgacacaacaactgctcatgaatgtacatgtgat
ccaggatacacaggttcatattgtaacattgacatcaacgaatgtgctcttcaaccttgc
ctgaatggagctacgtgcattgatctgatcaacagttactcttgtacttgtgatgcggga
tacactggagaaaactgtgagcagaacattgacgagtgtgcgtcatctccatgcaagaat
ggtggcacttgtgtcgatatggttaatgctgttcactgttcctgtctcgccggcactgca
ggtatattctgtgaggtcaatgttgatgattgcactgatgactcctgttatcatggggga
caatgcatcgatggaatcaatggcttcacttgtaattgcttgtctggatatgtaggatca
aggtgtgaaggtgatgtgaatgaatgcttgtcaaatccttgtaatgcagcaggtactaca
gaatgcatcgagggagaaaacagctttacatgtgtatgctctgtggattatgctggaaca
ctctgtgatgtgaaactaggaagttgcgcaatcaatccttgtgaaaatggtggaacttgc
actgataacagctacgatcctaaaggatatttctgctcttgttcatctggttactatggc
atcaattgtcaacaccaatattcatcgtgtggggattcacacatttgttacaacaacgga
gtatgtgtgaatgacgcatgtgaatgcacttcaaattattacggagattattgtgaaaaa
gctagagtagaagataaaacctgttcaaatccaaactgcgctcaagtgaagaataatgga
gtctgcaatagcgacatgaactgtaccacacatgaatgtgattacgacggcaccgattgt
actttcggtaacgccaatccttgggaattatgttcgcctgagtatgaatgctggaatcta
cacaagaacggacattgcgacgaacactgcaatactcaagaatgccttctggatggaatg
gattgtagcactcctataggagattgcaatccgaaatatgaagtctactgtacagacaat
ttcaacaacagttattgtgatgaaggatgtaataatgctgattgtggatgggatggagac
gattgtaatcaatatcctgaacaatacgccctcggaatccttgtgattcaagttggcaac
atgactcctgctgatgtatggaccagaaaagaagaactttcaattgaattcggcaaaatt
ttacacactcaaatgaagatgatagctgtgaatgttgtaacggtcgaaatttcacgcaag
aaaagatctttatttgatgaagcatatgactcgatgacaagtatattcagcagaacgaaa
cgtgctacctcggatggggagtcgtcacagatggaattcagaatggataacagcaaatgt
tatatatcatctggtgcatgctttgaaactgcctcaggagcgtcatcttttctcgctgct
gcaagactcacccaaacactagaagtatcagtcgacattgaaactaccggcagtattgat
gaaccaacaagcgaaggatcacaacacatagttacttatgctgtatctggagcagctctt
tttgcctttgtggtcgtcatttttggggtactactaaaacgaaaaagagaaactggtcag
ctctggcgaccagaaggcttcctcctacacaagaaacaaagaagagaaccaataggacaa
gctgatttaaatcttaagaaattgaacaaatctccatctccagacaatgacacgaacact
cctttcattcaaagcttccacgataacgggacaaacaatcatcataaaaaatatttggca
agccgtcaagaaaatgaacccttgcatggtgtacaaacagaaaacaggaagaagacacca
gaatgtgaagttcagtctgacaacagaaaatggactccacaacatattgaagctgccaga
gcatcaagcagagaagtttcttctccattattagaagataataatgatgagattgatgct
cgtgggcctgacggcctcacacctttgatgattgcttctactcgaggaggtggaatcgaa
gttattgtagatgaggaatccggtgaaggaaacgagggagaaggaagtgaaaacatgatc
gcgagtcttttattacagggggcatcactcactgcacaaacagatagaacaggtgaaact
ccacttcacttagcagcgagatatgcccgagcagatgctgcaaaaagacttctcgatgca
ggtgccgacgctaacatgaaagaacaaacaggtcgcacgccattgcatgtggctgttgct
gctgatgcacaaggtgtcttccaaatattattgagaaacagagcaacggacttagatgcc
aaaaccaacgatggaacaactcctctcattctggctgcaagacttgctgtagaaggcatg
gttgaagaactcattggtgctcatgctgatgtagacgcagtagataaccacgggaaaaca
gcaatgcattgggcggctgccgtaaacaacattgaagctctgtccgctcttcttgccgcc
ggtgcaaaacgtgacgctcaaacggaaagagaagaaactccactgtttttagcggcacga
gaaggaagctatgaagcggtcaggttattacttgaccacttggcaaatagagatatcact
gaccatatggacaggttacccagagatattgcgcaggaaaggctgcatacagatattatt
caactactcgacgaatacaatttggtacgaagtcctatgggtcacatggataactctcct
ctcatgcataacaacgcagcttacattgctcatattacgaaaggtaaaaagcagaggaga
tcgaacggcaaaccagatggtaaagctgctcgcagaacaaagaaaaaatccagtactgat
aataacatagaatcacctaacggcatcaatccaaatttaaatcctcatcatatgtacaat
tcggtcttgttatcggacggtcagtcacccggcagcaattctatgtcttcgccttccaca
tacagcgactctacacattcaccaccgatttcaaatgcgggaaacttaccacctaatgcg
tattacccaagggtaatgcaaggaagtcactctggtggtatggacaaccatcttcctctc
ggccctcacccatcacaactcagtgggagaatgattcaacacccaagagcgcaacctcat
ctttcgggttctaacacaggattggggctaaatttggggcaacttcagatgcgttataac
gaccctgaattgcaacaacaacatttagcaaggatggcacattaccgtgcacaagctcaa
gttccttatcaacaaatcataaatcctcatccacatagtgccaattcaggaggttatcca
aggtcttcccagggaatggctttcagtgaaatgataccaaatcttccacaacaacaacta
tatcacatggatgctccatcttacactcaacagttggcaatgaaccaaagacaacaacaa
aattttgttcaccaatcaaaaggaatgccaaggtcttctactggaggcaactcgtattta
ttagataagtatccgactcctccatcaaactcaacactctctcctccttccgccagtttc
tcgccacattctgcctccaacaaccactcacatggtcatctcaaaactcagcctcagcca
ggcgatctgtcatatgaaacaccaagccctgaatcaccaggtgatcagtggtcaagcgca
tcaccgaggagcaattctgattggtcggatagcatacacagtccacctaccggaccgcac
atgcacgcacctaatctgcatcagacaattcaccctcatgggggaatgcccgtttcacat
aggggtttaggggtacggatgcacccacctccaaacgcggctcattctgggaaacttcaa
gccgcatag
DBGET
integrated database retrieval system
