Stegodyphus dumicola: 118196398
Help
Entry
118196398 CDS
T07385
Name
(RefSeq) neurogenic locus Notch protein-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
sdm
Stegodyphus dumicola
Pathway
sdm04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
118196398
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
Ank
NOD
EGF_3
Ank_4
Notch
Ank_5
Ank_3
NODP
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118196398
NCBI-ProteinID:
XP_035223738
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2481 aa
AA seq
DB search
MPPRCHHLGWLLGLTVLAATVLKPASPQGLLSCSQNPCKNGASCVSNPRGESYCNCPPMY
VGEYCQHLNPCHTGPGPRCQNGGTCNVEISVTNGPTFSCSCPVGFSASLCEITVPNSCDS
SPCLNGGTCTLVTLQNYTCACAAGYRGDHCQLPDHCASQPCRNGASCQSVKDGYSCTCAR
GFAGTNCTADIDECRQDLCVHGRCINTVGSYRCKCSAGYTGQNCESQYIPCDPSPCINGG
TCKHINNLNYQCSCPPGFTGTNCEINIDDCPGNLCQNGATCIDGVNTYTCHCPPTYTGTY
CGKDVDECALRPSVCKNGATCTNTIGGYTCICVNGWTGQDCSENIDDCAVAACFNGATCH
DRVGSFFCQCAPGKTGLLCHLDDACASDPCHAGAMCDTSPIDGTYICSCPNGFKGTDCTE
DIDECEEGYPCEHDGMCVNIPGSFSCNCTKGFTGPRCEININECDSNPCQNEGTCLDERG
GFRCVCMPGYTGIFCEEDIDECYSKPCLNGGICSDMINGFRCLCPIGFSGKKCEVNEDDC
LSHPCQNGARCKDAIASYICLCPQGFTGTNCETNINDCQSSPCRHGECIDGINAFHCNCK
RGYTGRLCQTQINECLSNPCQHGGKCEDLVNGYQCRCLPGTSGPNCEYNMNECASNPCRN
GATCIDGINSYTCLCHSGFTGLLCEINIDDCASNPCANGGICTDLIDGYRCKCPRGYYDA
RCLSDINECESNPCHHGATCEDEVNRFICHCPAGYGGHRCEIDIDECQSNPCQHGGSCRD
SLASYTCTCLPGYSGKNCEINVDDCAIDPCLNGGSCIDLVNAFQCVCEVPFTGTNCEVEL
DPCSPNKCRNSAKCIPSSNYQDFACSCYLGYTGRLCDEDIDECVISSPCRNGATCVNTNG
SYSCYCAKGYEGRDCLINTDDCASFPCQNGGTCLDGVGEYTCLCVDGFGGQHCESDINEC
ASNPCQNGATCNDYVNSYTCTCPSGFSGTNCQTNDEDCNLSSCVNGGTCIDGINNYTCRC
APGYTGSNCQYHINECDSHPCHHGATCVDHVGAFTCICPFGYTGLQCENFIDWCSTGVCM
NGATCKQINNTYGCTCKHGWTGKLCDVSMVSCNDAALQKGIPLGDLCKNGGKCENHGNSH
RCICLPGYEGSYCQHEINECTSQPCQNGAACNDLVGHYSCSCLPGFQGVNCEHNIDDCNP
NPCRNGGTCHDLVNSFVCSCPHGTQGILCEINLDECFEGACHHGGTCIDKVGNYECQCPP
GFVGPRCEGDVNECLSNPCHSLGTQDCVQLVNDYRCDCKVGFMGRHCESKVNFCSSNPCL
NGGVCSSVAQGHLCICTEGFYGENCGYANTSCTGNPCVNGGQCRQRKSGYVCVCPTGAEG
KNCEIDSHNDCLSSPCLNGGTCYDRIGKYECVCPEYWNGARCNIFDSSFAGGLGVFLQPG
PILRVDGEEKIDLCQLHECDKKSGNRKCNEECNNLACNFDGGDCTLGINPWLNCSAAINC
WDVFDNKECNIECNNIDCLFDGFDCEQKLLPCNEHYDTYCLKNYGNGYCDYGCNNEECNW
DGLDCESEPPKLADGALTATILMEPEVFLNNSVPFLREIGHALRTIVRIKKDENGQPMVY
PWHTKDVPPGYHYKKQGSKIYMEIDNRRCVKTAATECFQSATKAAQFLAAAHSRQAFAFQ
IQEISGEDKEKPAGVQMYYYPDLMYIVIGVIILIIMGLLFGVLFTTRKRARGITWFPEGF
FRTSSSQRRRSRRRGPDGQEMRNLNKQSSANRVDVNSNDNAASPPAPPLPPSDSNQWSDD
DGLDHPPVKRMKSEKSQDGSFGDSQSSIAPPEYDESDPRQWTQQHLDAADVRNPDILALT
PPQGDGDMEPGSVDVNVQGPGGLTPLMLASFRGGGIDVIEDGDDDDGSGSMIQDLLMQGA
KINMTLERTGETSLHLAARYARADAAKRLLDAGADANAQDNTGRTPLHAAVSADAQGVFQ
ILLRNRATNLNARMHDGTTPLILAARLAIEGMVEELVNAEADINAADDHGKTALHWAAAV
NNVDAVRVLISHGVNKDAQDNKEETPLFLAAREGSYQAAKILLENLANKEITDHMDRLPR
DVACERMHIDIVRLLEEYVPPSPQIANGNLNSGSPAVLLSSLLGSSKSKPKRRIKINNVG
SAPTRETSESATQNVENGIRRKPSIKRRKESSHMLVQGMDGSMSLSPGESLTSPNGMGQS
GIENSEPIYTQLTNVLHLQPNTMKQLPSYDDRLKINYCSMAASMDNQGLGPMYLDPGLTN
SMQNASSHHMRQNSMPNNGAVPPSSRPYNSASPIKQRPSLPTSPTHMAAMRAAHHQRTTK
LQSQGGGNPTYDYPSAISDVQHLMGSSLKTGVQGNGQQSLYPHLFHYPTPPSQHSHSGGE
STPQHYLHPPETYLTPSPESPGQWSSSSPHSAQSDWSESIASPMGHVHPQHAVDHSQHQK
LLPVSTNQQVSVAQSPEAVFI
NT seq
7446 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgccgcggtgtcatcatctgggctggttgttaggcttgaccgtcttggcggctacg
gtcttaaagcctgcctctcctcaaggactgctatcatgttcgcagaatccttgcaaaaat
ggtgcctcatgtgtatccaatccgagaggcgagtcctattgcaactgtcccccgatgtat
gtgggagaatactgccagcacttgaatccatgccacaccggtcctggaccacgatgtcaa
aatggcggcacatgtaacgtggaaatcagtgtcaccaacggtcccacattctcctgttcg
tgccccgttggattttcagcatcgctttgcgaaataaccgtcccgaacagctgcgatagc
agtccttgcctaaacggtggcacttgtactctagtcactctacaaaattacacctgtgct
tgtgctgccggatatcgaggcgatcattgccaattaccggatcactgtgcctcccagcca
tgccgaaatggtgcatcttgtcaatctgtcaaagatggttacagctgtacttgcgcaagg
ggatttgcaggcaccaactgtacggcggatatcgatgaatgccgacaagatctgtgcgta
catggacgatgtatcaacaccgttggatcctacaggtgtaaatgctctgccggttatacg
ggccaaaactgtgagtctcagtacattccatgtgatcctagtccgtgcataaatggtgga
acatgcaagcacataaataacctcaactaccaatgctcatgccctccgggttttaccgga
acaaattgcgaaattaacatagatgattgccctggaaatctttgtcaaaatggtgcaacg
tgtatcgatggcgttaatacttacacctgccactgcccacctacatatacaggaacatat
tgcggcaaagatgttgatgagtgtgctctgaggcctagcgtgtgtaagaatggtgccacg
tgtactaacacaattggtggatatacatgcatatgtgtcaatggctggactggacaagac
tgctctgaaaatattgacgattgtgctgttgctgcttgttttaatggtgcaacttgtcat
gaccgagttgggtctttcttttgccagtgtgctcccggaaaaacaggtcttctgtgccac
ctggatgatgcttgtgcaagtgatccatgtcatgccggagctatgtgtgacaccagtcct
attgatggaacatatatttgttcttgtccaaatggctttaaaggaactgattgtacagaa
gatatagacgaatgtgaagaagggtatccatgtgagcatgatggtatgtgtgtaaatata
ccaggttcatttagctgcaattgcactaaaggttttactggcccaagatgtgaaatcaat
atcaatgaatgtgattcaaatccatgccagaatgaaggcacttgcttagacgagagagga
ggatttcgttgcgtttgtatgccaggctatactggaatattttgtgaagaagatattgat
gaatgttattctaaaccgtgcttaaatggtggtatctgcagtgatatgataaatgggttc
agatgtttatgtccaattggattctctgggaaaaagtgtgaagtgaatgaagatgattgc
ctaagtcatccatgtcaaaatggagctagatgtaaagatgccattgcaagctacatttgc
ctatgccctcaaggatttactgggactaattgcgagacaaatattaatgattgccagtca
tccccttgtcgtcatggtgaatgtattgatggtataaatgcatttcattgcaactgcaaa
cgtggatatactgggagattgtgccaaactcagataaacgaatgccttagtaacccttgt
cagcatggaggtaaatgtgaagatcttgttaatggttaccagtgtagatgcttgccagga
acatctggaccaaactgtgaatataacatgaatgaatgtgctagcaatccatgtcgaaat
ggagccacgtgtatagatggcatcaattcatacacttgcctttgtcattctggatttaca
ggcctgctttgtgaaataaatattgatgattgtgcaagtaatccatgtgccaatggtgga
atatgtactgacctgattgatggttaccgatgtaaatgtccaagaggctattatgatgct
agatgcctttctgatatcaatgaatgcgaaagtaacccttgtcatcatggggctacttgt
gaggatgaagttaacagatttatctgtcactgtccagcaggttatggaggacatcgttgt
gaaatcgatattgatgaatgccaatccaatccatgccagcatggtggtagctgtcgagat
tctttagcaagttacacttgtacctgcctgcctggttattctggaaaaaattgtgaaatc
aatgtcgatgattgtgctatcgatccttgtttgaatggaggatcatgtatagatctagta
aatgctttccagtgtgtttgtgaagttccttttactggtactaattgtgaagtggaacta
gatccatgcagtccaaataaatgcagaaacagtgccaaatgcataccatcttcaaactat
caagattttgcctgcagttgctatttaggatatacaggacgtttatgtgatgaagacatt
gatgaatgtgtcatatcctctccttgtcgaaatggagcaacatgtgtcaatacaaatgga
tcatacagctgttattgtgcaaaaggttatgaaggaagagattgcctgatcaatactgat
gattgtgcatcttttccctgtcagaatggtggaacgtgtttagacggtgttggagagtat
acctgtctctgtgtggatggatttgggggccaacactgcgaaagtgatatcaatgaatgt
gcaagtaatccttgccaaaatggggctacatgcaatgattatgtaaacagttacacatgc
acttgtccatctggctttagtgggacaaattgtcaaaccaatgatgaagattgtaattta
agttcttgtgtgaatggtggtacttgtattgatggaattaataactatacatgccgctgt
gcccctggatatactggaagtaattgtcaatatcatataaatgaatgtgattcacatcct
tgtcaccatggtgctacttgtgttgatcatgttggagcgttcacatgtatttgtcccttt
ggatatactggcttacagtgtgagaattttattgattggtgcagcacaggcgtgtgtatg
aatggagctacatgcaaacagatcaataatacatatggctgcacttgtaagcatggttgg
actggaaagctctgtgatgtcagtatggtttcttgtaatgatgctgctttacaaaaaggt
attcctcttggtgatttatgtaagaatggtgggaaatgtgaaaatcatggtaatagtcat
cgatgcatttgtcttcctggctatgagggcagttactgtcagcatgaaatcaatgaatgt
acatcccagccatgtcaaaatggtgcagcttgcaatgatcttgttggacactattcatgt
tcttgccttccaggtttccaaggggtgaactgtgagcataatattgacgactgtaatcca
aatccttgccgaaatggtggaacttgtcatgatctagtgaatagttttgtatgttcttgt
cctcatggaacacaaggaattctttgtgaaatcaatcttgatgaatgctttgaaggagcc
tgccatcatggtggaacatgcattgacaaagttggaaattatgaatgtcaatgcccacct
ggatttgtggggccaaggtgtgaaggtgacgtcaacgaatgcttatcaaatccttgtcat
agcttgggtactcaagactgtgttcagttggttaatgattatcgctgtgactgtaaagta
ggtttcatgggtcgtcattgtgaatccaaagtgaatttttgttcatcaaacccctgttta
aatgggggtgtctgttcaagtgttgcacaaggtcatctgtgcatttgtactgagggattc
tatggtgagaactgtggctatgcaaatacatcatgcacaggaaatccgtgcgtaaatggt
ggtcagtgtcgacaaaggaagtcaggttatgtgtgtgtgtgcccaactggtgcagaagga
aaaaactgtgaaattgattctcataatgattgcttatcatcaccctgtttaaatggtggt
acttgttatgacagaataggtaaatatgaatgtgtatgccctgaatactggaatggagcc
cgatgtaatatatttgatagctcttttgctggtggacttggagttttccttcagcctgga
ccaatactgcgagtggatggagaagaaaaaatagatttatgtcaacttcatgaatgtgat
aaaaagtcaggaaacagaaaatgcaatgaagaatgtaataatttggcctgcaatttcgat
ggtggtgactgcacattaggtataaatccttggttgaattgttcagctgctattaattgt
tgggatgtatttgacaataaagaatgtaatatagagtgcaataacattgattgtttgttt
gatggttttgactgtgaacaaaagctgttaccttgcaatgaacattatgatacatactgc
ctaaaaaattatgggaatggttattgtgattacggctgcaataatgaagaatgtaattgg
gatggcttggattgtgaatctgagcctccaaaattagctgatggagcacttacagcaact
atattgatggagccagaggtgtttttaaataactcagtaccttttctaagagagattgga
catgctttaagaacaattgttcgtattaaaaaggatgaaaatggtcaaccaatggtttat
ccttggcataccaaagatgttcctcctggttatcattataaaaagcagggaagtaaaatt
tatatggaaattgataaccgaaggtgtgtcaaaactgctgctactgaatgttttcagtcg
gcaacaaaagctgcacaattccttgctgctgctcactcacggcaagcatttgctttccaa
attcaagaaatcagtggagaggataaagagaaacctgctggagttcagatgtattattat
cctgatctaatgtacatcgtgattggagtaataatattaataataatgggattattgttt
ggagttttgtttacaacccgcaaacgagcaaggggtataacctggtttcctgaaggcttt
tttagaactagtagtagtcagcgaagaagatctcgcagaagaggtcctgatggacaagaa
atgagaaatttgaacaaacagtcttcggccaatagagtggatgtaaattccaatgacaat
gctgcctctcctccagctcctcctttgccgccatccgattctaatcagtggagtgatgat
gatgggttggatcatccccctgtcaaaagaatgaaaagtgagaaatctcaagatgggagt
tttggtgacagtcagagttcaattgcaccacctgagtatgatgagagtgatccacgtcaa
tggactcaacagcatttggatgctgctgatgttagaaaccctgatattttagccttaacc
ccacctcagggagatggtgatatggaacctgggagtgtagatgttaatgttcaaggacct
ggtggtcttacccctttgatgttggcatcctttagaggaggaggaatagatgttattgaa
gatggagatgatgatgatggctctggtagcatgatacaagatttgttaatgcagggagct
aaaattaacatgactttagaaagaacaggagaaacatctttgcatctagctgcaagatat
gcacgagctgatgctgctaaaagacttttagatgctggagctgatgccaatgcacaagat
aacacagggcgtacacctctacatgcagcagtttcagcagatgcacaaggagtttttcaa
attttgctgaggaatagagctacaaacctgaatgctcgcatgcatgatggaacaacccct
ttaatacttgctgctcgtcttgcaattgaaggtatggtagaagaactagtgaatgcagag
gctgatattaatgctgcggatgatcatggtaaaacagctttgcattgggctgcagctgta
aataatgttgatgcagttcgtgtacttatatcacatggtgttaacaaagatgcacaggat
aataaagaagaaactcctctttttcttgctgccagagaaggtagttatcaagctgcaaaa
atccttttggaaaatctagcaaacaaagaaattacagatcatatggacagattaccacgt
gacgtagcctgtgaacgcatgcatattgacattgtgcgtttgttggaagagtatgttccc
ccgagccctcagatagcaaatggtaatttgaattcaggatcacctgcagtactactatca
agcctgcttgggtcttctaaatcaaaacctaaacgaagaattaaaataaacaatgttggt
tcagcaccaacaagggaaacatctgaatctgcaactcagaatgttgaaaatggaattaga
aggaaaccatcaattaaaaggcgaaaagaatcatcacatatgcttgtacaaggaatggat
ggttctatgtccctctcacctggtgaatccctcacttctccaaatggtatggggcaaagt
ggaatagaaaattctgagccaatttatacacagttgactaatgtgttacatttgcagccc
aatactatgaaacagttgccttcatatgatgataggcttaaaataaactactgctcaatg
gctgcgtcaatggataatcagggattgggtccaatgtatttggatcctggtttaacaaat
tctatgcagaatgcatcttcacatcacatgcggcaaaactccatgccaaataatggtgca
gtgccgccatcatcacgtccttacaattctgcctcgccaataaaacagcgaccatcctta
cctacatcacctactcatatggcagcaatgagagctgctcatcaccaacggactacaaaa
ctacagtctcagggtgggggtaatccaacatatgactatccttcagcaatatctgatgta
cagcacttaatgggatctagcctaaagacaggggtgcaaggtaatggacagcaatcatta
taccctcatttatttcattatcctacacctccatctcagcacagtcatagtggtggtgaa
tctacaccacaacattatcttcatccacctgagacttacttgacaccttctcctgaatca
ccagggcaatggtcaagctcatcaccacattctgcccagtcagactggtctgagagcata
gccagtccaatgggacatgttcatcctcaacatgcagttgatcattcacagcatcaaaaa
ctgttacctgtgagtactaaccaacaagtttctgtggctcagtcgccagaagctgttttt
atataa
DBGET
integrated database retrieval system
