Shewanella sp. WE21: CKQ84_05975
Help
Entry
CKQ84_05975 CDS
T05404
Name
(GenBank) histidine kinase
KO
K07181
c-di-GMP phosphodiesterase [EC:
3.1.4.52
]
Organism
shew
Shewanella sp. WE21
Brite
Enzymes [BR:
shew01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.4 Phosphoric-diester hydrolases
3.1.4.52 cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase
CKQ84_05975
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HDOD
EAL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVI65467
UniProt:
A0A2R3ERY2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1408482..1409702)
Genome browser
AA seq
406 aa
AA seq
DB search
MRFYMARQPILNRNKNVVAYELLFRNSRDNYFPQGVTDNVATAKVFVNSYLSMDLEDLTE
GKPALINFPSHFLRDHLLYMFPYKNIIVEVLETVSPSEDNFILIKELFNLGYYLALDDFV
YSPEWERFFPFFKLIKIDIISTPLDSVSHLIPKFRQYNLKLLAEKVETLEEYRLAKSLGF
DYFQGYYFYKPELIEGSEIGATQHFVMSIYNEVFKSDFSYKKLENYFSQDLDLTYKLLRY
VNSSQFEHVNEFTSIKQTMVFLGENKLRKFVSLIILAELNPNKPVVLINNTIIRARLCEE
LISLMGFPLLKESAFLTGLLSTLDAILDKPMNRAIEPLPLEQQIKRALLNNHGYLAHCLQ
LTLAYMEGDWVTVDYFIDNYNIDPERLISACDKVYSWFNQYKNSVQ
NT seq
1221 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcttttatatggcaagacagcctatactgaatagaaataaaaacgttgttgcttat
gagttgctctttagaaatagccgggataactatttcccacagggtgttacagacaatgtt
gctacagctaaagtgtttgtaaatagttatttaagtatggatctagaggatttaaccgaa
gggaagcctgcattaattaattttccatctcatttcttgcgagaccatttattatacatg
ttcccatacaaaaatattattgttgaggtattggaaactgttagcccaagcgaggataac
tttattttaattaaagagttatttaacttgggttattatcttgctttagatgactttgtt
tattctcctgagtgggaacgtttttttcctttttttaaacttataaaaattgatataatt
tcaacgcctttagatagtgtttctcatctgatccctaaatttagacagtataatttaaaa
ctacttgcagagaaagttgaaacattggaagagtataggctagctaagtcactcggtttt
gattattttcaaggttattatttttataagccagaactcatagaggggagtgaaataggt
gctacacaacattttgttatgtctatttataatgaggtttttaagtctgattttagttat
aaaaaacttgaaaattatttttctcaagatttagatcttacttataaattactaagatat
gtcaattcaagtcagtttgagcatgtgaatgaatttacctctattaagcagactatggtt
tttttaggtgaaaataaacttcgtaagtttgtaagtctcattattttggctgaacttaac
cccaataaaccagttgtgttaattaataatactataatcagggctcggttatgtgaagag
ttaatatcattaatgggatttcctttgttgaaagagtcagcatttttgactggattatta
tctactttagatgccattttagataaaccgatgaacagagcgatagagccgcttcctctt
gaacagcaaataaagcgtgctttacttaataatcatggatacctagctcattgtttacaa
cttactctggcgtatatggaaggtgattgggttactgtcgattatttcattgataattat
aatattgatcctgagaggctcatctcagcgtgtgataaagtgtatagctggtttaatcag
tataaaaattcagttcagtag
DBGET
integrated database retrieval system
