KEGG   Schistosoma mansoni: Smp_157740
Entry
Smp_157740        CDS       T01095                                 
Name
(RefSeq) putative rna polymerase Rpb1
  KO
K03018  DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 [EC:2.7.7.6]
Organism
smm  Schistosoma mansoni
Pathway
smm03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    Smp_157740
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:smm03021]
    Smp_157740
Enzymes [BR:smm01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     Smp_157740
Transcription machinery [BR:smm03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase III system
   RNA polymerase III
    Core subunits
     Smp_157740
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 CID
Other DBs
NCBI-GeneID: 8343133
NCBI-ProteinID: XP_018654914
LinkDB
Position
W:34634304..34664936
AA seq 1342 aa
MPSLYKPPDLPRIVENIKFQLCSEGDLKRLSHVQVLKCLLYAEGQSNRRALDYGLLDPRL
GANKRDELCATCGLDYQTCIGHWGYFDLPTPIYHVGYTWHIVKILQTICKTCSRVLLPEQ
QRARFSISCSNPSLDYVHKKQLRKAIHKLSSRVHVCPFCSALNGVVTKGTSLSYVVHDIF
RHAKAKVDEYVNEFAKVITENTDLAPVVRKGLEIIRPGKALQLFSKIPEEDLPLLLMPFD
SQWTTHPRNLIVQRVPVCPSAIRPSVVSEVRSGTNEDDLTQMYQWILAQAATIEEDIGEA
DQIACLDNLHAEFARLINSQQSGLPPVQDHKFMRGLLQRLAGKHGRFRGSLLGKRTNFTA
RTVISPDPNMRIDEVCIPVHCAKLLTYPERVTDFNLNFLRSLVLNGPNNYPGAMFVSYKL
RGERKRQAEASGNSDVVKRFLASERAREDVAKYLQSGDIVERHLLDDDIVLFNRQPSLHR
VSIQAFRAVVKPFRTFRFNPCCCTPFNADFDGDEMNIHLPQTEAARAEAKHLMLSLKNIV
SPKNGEPLISPIQDLITATHLLTLKDVFLNRDQACTLAAQLLAGNHLGRLLSLPKPAILW
PVALWTGKQIFGLILSPHPSTGIKVNLRVPTKSMYSSKGQEMCPNDGFVLIQNSELLAGC
VDKKLLGGGSKSSIFYTLLRDYGREACADAMWRLGRIALFFLAHRGFSIGLGEVMPSSDL
VASKTALISRGFATCDDYINQYQMNTLVCNPGCSMEDTLESNISQELSKIRDEAGAACKR
QLHPSNSPLVMAQSGSKGSFLNISQMIACVGQQVIGGKRVPDVINGRSLVHFPPGSRTPE
AKGFVGNSFYSGLSPSEFFFHAMSGREGLTDTAVKTADTGYMQRRLVKFLEDLAVAYDDT
VRDSRGDIIQFRYGSDGLDPLEMETDTFPVNFVKEMEHIRTSYDCPHEVGMSAEELELAV
EVVFQLDAFRHLDSRLCSAIKEFIHNSVCPRIRKWQEWCTEHANGSNLINQNERLTRTQL
RIFLTHVKEKYEKALIEPGTAVGALCGQSVGEPATQMTLKTFHFAGVASMNITQGVPRMR
EIVNAAARIKTPLICVTLTDPFSASLARQVKLSIEPTRLADISLSLSQCLTPEYVYVAIK
LDKKRMDRRGITTPQVATAIQTTKLKKTKLSRVTYSKDYIFVYPVDLNALETVVKLVEDV
IVKGIPGVSRVVIQQDKGEHIIFVEGARLREVMCIPGVVAERTRSNNILEVEQVLGVEAA
RRVVIDELLAVMEGHGVEVNVRHVMLLADVMTNKWSTMDQCIVDDKIEMYLPYDVNENKK
LTIENAAKNDKNKRLILNIMSC
NT seq 4029 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgccgtctctgtacaaaccccctgatttgcctagaattgtagaaaacataaaatttcag
ctgtgcagtgaaggtgacctgaaaagattaagtcacgttcaggttctgaagtgtcttctc
tatgcggaagggcaaagcaatagacgagccttagattacggcctgttagatccaagactt
ggtgcaaataagagagatgagctgtgtgctacttgtggcttggactatcaaacatgtatt
ggtcattgggggtacttcgatttaccgacgccaatttatcatgtgggatatacttggcat
atagtaaaaatattacagactatctgcaaaacttgctcacgcgtccttctccctgagcaa
caacgtgccagattttcgattagttgttctaacccaagtttggactacgtacataaaaaa
caactcagaaaagcgatacacaaattgtctagcagggtacatgtctgtccgttctgctca
gcgcttaatggtgttgttacgaaaggtacgagtctttcgtacgttgttcatgatatattt
cgacatgcaaaagcaaaagtcgatgaatatgtaaatgagttcgcaaaagttatcacagaa
aatacggatttagctccagttgttcgtaaaggtttggaaattatacgacccggaaaggct
ctgcaattgttttctaaaattccagaagaagatttgccattactcctcatgccttttgat
tctcaatggactactcacccgcgaaacttgattgtccagagagtacctgtatgcccaagt
gctatcagaccatcagttgtttctgaagtccgtagtggaactaatgaagatgaccttact
caaatgtatcagtggatattagctcaggcagcgacaattgaagaagatatcggggaggca
gatcaaatcgcgtgtttagataacttacacgccgaattcgcaagactaattaattcacaa
caatcaggtttgcctcctgttcaagatcataagtttatgcgtggtttacttcaaaggtta
gctggtaaacatggtcgatttcgtggtagcctgttgggtaaacgaacaaattttactgcc
agaactgttatttcaccagatccaaacatgcgaattgatgaggtatgcattccagtccat
tgtgcgaaattgctaacatatcctgaacgtgtgactgatttcaatctgaattttcttcga
tctcttgtactgaatggaccaaataactatcctggagctatgtttgttagttataaacta
cgtggtgagaggaaacgccaagccgaagcatctggtaattctgatgtagtaaaacgtttc
ttggcatctgaacgtgcacgtgaagatgtagcaaaatatttacaatcaggtgatatagtt
gaaagacacttattggatgatgatattgttctgtttaaccgtcaaccctcactacatcgt
gtatctattcaagcattcagagcggttgtaaaaccttttcgaacttttcgtttcaatcca
tgctgttgtacaccattcaatgcagatttcgatggggatgaaatgaatatacatcttcca
caaactgaagcagctcgtgctgaagcaaaacatcttatgctgtctctcaagaatattgtt
agccctaaaaatggtgagccgttaatttcaccaattcaagacctaataactgcaacacat
ttgttgaccttgaaagacgttttccttaatcgtgatcaggcttgtactttagccgctcag
ctattagctggtaaccatttgggtcgacttttaagtttaccgaaaccggctatattatgg
cctgttgctctatggactggtaaacagatatttggtctcattctttcacctcatccatcc
actggaattaaggttaaccttcgggtaccaacaaagtctatgtattcatcaaaaggtcaa
gaaatgtgtccaaatgatggttttgttctaattcaaaatagtgagctccttgcgggatgt
gtagacaaaaagttacttggaggtggaagcaagtcaagcatattctacacattacttcga
gattatgggagagaagcttgcgcggacgctatgtggcgtttaggaagaattgctttgttt
ttcctggcacatcgaggtttttcgatcggacttggtgaagtaatgcccagctcagatctt
gttgcatctaaaacagcattgattagtcgtggatttgccacttgtgatgattatatcaat
caatatcagatgaatacactagtctgtaatccaggatgtagtatggaggatacgcttgaa
tctaatataagtcaagagttgtcgaaaattcgtgacgaagcaggagcagcttgtaagcgt
cagcttcacccatcgaactcaccacttgtcatggctcagtcagggtcaaaaggttcattt
ctcaacatatctcaaatgattgcttgtgttggtcaacaagtaattggtggtaaacgtgtt
ccagatgttattaatggacgcagtctagttcatttccctccaggttcacgaacacctgaa
gcaaaaggatttgttggaaacagtttttattcaggtctttcaccatctgaattctttttc
catgctatgagtggtcgtgaagggttgactgatactgctgtaaaaactgcagatacaggt
tatatgcaacgaagactagtcaagtttcttgaagatttggcggtggcttacgatgatact
gtacgtgatagtcggggcgacataatccaatttcgttacggttccgatggcctggatcct
ttagaaatggaaacagatacatttcctgtgaattttgtcaaagaaatggaacatataaga
actagttatgattgccctcatgaagttggaatgtctgctgaagagttagaactagcagta
gaggttgtctttcaacttgatgcatttcgacatttagatagtcgtttatgttcagcaatc
aaagaatttatacacaattcagtttgcccgagaattcgtaaatggcaagaatggtgtaca
gaacatgcaaatgggtcaaatttaatcaatcaaaatgaacgtttgactagaacacaacta
cgtatatttttgacacatgttaaagagaaatatgagaaagctttaattgaaccaggcaca
gctgttggtgcattatgtggtcaatctgttggtgaaccagctacacagatgacattaaaa
acatttcactttgctggtgtagctagtatgaatattactcaaggtgtcccacgtatgcgt
gaaattgttaatgcagcagccagaattaaaacaccattgatttgtgttactctaactgat
ccattctcagcatcattagcgcgtcaagttaaattgtctattgaaccaacacgactagca
gatatatcgttgtcattaagtcagtgtttaacaccagaatatgtatatgttgctattaaa
ttagataaaaaacgaatggatagacgtgggattacaacacctcaagtcgctacagctatt
caaacaactaagttaaagaagaccaaattatcgcgtgtaacctattcaaaagattatata
tttgtatatccagtggatttgaatgcgttggaaacagttgtcaaattagttgaagatgtt
attgttaagggtatacctggtgtatctcgtgttgtaattcaacaggataaaggcgaacat
ataatttttgttgaaggagctcggttacgcgaggtaatgtgtataccaggcgtcgttgct
gaacgtacacgaagtaataatattttagaagtggaacaagtgttgggtgtggaagcagct
cgacgtgttgttattgacgagttactagccgttatggaaggtcacggtgtcgaagtaaat
gtacgtcatgtaatgctgttagctgatgttatgactaataagtggagtacaatggatcaa
tgtatagttgatgataagatcgaaatgtatttaccatatgatgtcaatgagaataaaaaa
ctgaccatagaaaatgcagctaagaatgataaaaataaacgcttgatactaaatataatg
tcttgttag

DBGET integrated database retrieval system