Tetrapisispora blattae: TBLA_0F02170
Help
Entry
TBLA_0F02170 CDS
T02489
Symbol
TBLA0F02170
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K03006
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
tbl
Tetrapisispora blattae
Pathway
tbl03020
RNA polymerase
tbl03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tbl00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
TBLA_0F02170 (TBLA0F02170)
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
TBLA_0F02170 (TBLA0F02170)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
tbl03021
]
TBLA_0F02170 (TBLA0F02170)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
tbl03400
]
TBLA_0F02170 (TBLA0F02170)
Enzymes [BR:
tbl01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
TBLA_0F02170 (TBLA0F02170)
Transcription machinery [BR:
tbl03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
RNA polymerase II
Core subunits
TBLA_0F02170 (TBLA0F02170)
DNA repair and recombination proteins [BR:
tbl03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase II complex
TBLA_0F02170 (TBLA0F02170)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_6
RNA_pol_Rpb1_7
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_R
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14496868
NCBI-ProteinID:
XP_004181278
UniProt:
I2H5V7
LinkDB
All DBs
Position
6:535350..540530
Genome browser
AA seq
1726 aa
AA seq
DB search
MVGQQYSSAPLRTIKEVQFGLFSPEEIRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGS
IDRNLKCQTCQEGMNECPGHFGHIDLAKPVFHIGFISKIKKVCECICMHCGKLLLDEHNE
QMRQILKIKDSKKRFNAIWSLCKTKMICDTDVPSEHDPTQLVSRGGCGNAQPTVRKDGLK
LVGSWKKEKNTSDGDEPEQRILSTEEILNIFKHISPEDSIAMGFNEEFSRPEWMFLTVLP
VPPPPVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHV
ATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLE
LDQVGVPKSIAKTLTYPEVVTPYNIDRLTHLVRNGPNEHPGAKYVIRDNGDRIDLRYSKR
AGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVRVMPFSTFRLNLSVTSPYNA
DFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVSAQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDNF
IEFDQVLNLLYWVPDWDGVIPTPAILKPKPLWSGKQILSIAIPKGIHLQRFDEGTTFLSP
KDNGMLIIDGQIIFGVVDKKTVGSSSGGLIHVVTREKGPQICAKLFSNIQKVTNYWFLHN
GFSTGIGDTIADGETMREITGTIAEAKRKVEEVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVR
FLNEARDKAGRLAEVNLNDTNNVKQMVSAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFV
DRTLPHFSKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRR
LVKALEDIMVHYDSTTRNSLGNVIQFVYGEDGIDAGHIEKQSIDTIGGSDAAFEKRYRID
LLNTENSLNPSLLESGAEISGNLKLQNLLDVEYKQLVKDRTFLRTVFVDGEPNWPLPVNI
KRIVQNAQQTFKVDHSKPSDLTIPDIVHGVQDLQEKLLVLRDKSEIMQKAQSDATTLFCC
LIRSRLATRRVLQEFKLNKQSFQWVLNNVEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMT
LNTFHFAGVASKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKTPSLTAYLEPAYAADQEKAKLIRSAIEH
TTLKSVTVASEIYYDPDPRTTVIAEDEEIMQLHFSLMDEETEKSLDQQSPWLLRLELDRA
AMNDKDLTMGQVGEKIRETFRNDLFVIWSEDNAEKLIIRCRVVRPKALDAETEAEEDHML
KKIENTMLENITLRGVENIERVVMMKYDRKIPGTSGAYEKVPEWVLETDGVNLLEVMTVP
GVDASRIYTNSFIDITEVLGIEAGRAALYKEVYNVIASDGSYVNYRHMALLVDVMTTNGS
LTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGS
FDVMIDEESLVKYMPEQKVSELADGQAGGETPYSSDAGLVNTEIDVKDELMFSPLVDSGS
TDAMAGGFTAYGGGDYGSATSPFTAYGETPASPGFGSVSSPGFSATSPAYSPTSPAYSPT
SPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSY
SPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTS
PSYSPTSPSYSPTSPNYSPRSPSYSPSSNSRNNDDDDDDDQTDKNN
NT seq
5181 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttggccaacaatattccagtgctcctctacgtaccattaaggaagttcaattcggt
cttttctcaccagaagaaattcgagccattagtgtagcaaaaattagatttcctgaaaca
atggatgaaacacagacaagagcaaaaattggtggtttgaacgatccaagattaggttca
atagaccgtaatttgaaatgtcaaacttgtcaagaggggatgaatgaatgtcctggccat
tttggccacattgatttggccaaacctgttttccacattggttttatttcaaaaattaaa
aaagtatgtgaatgtatatgtatgcactgtggtaaactgctacttgatgaacataatgaa
caaatgagacaaattctgaaaataaaagattccaagaagaggtttaatgctatttggagt
ttatgtaagacaaaaatgatttgtgataccgatgttccatcggaacatgatccaactcag
ttagtatcaagaggtggttgtggtaatgcacaacctactgtacgtaaggatgggttgaaa
ttagtcggtagttggaaaaaagaaaaaaatacaagtgatggcgatgaaccagaacaaaga
attttaagcacagaagaaattttaaacatttttaaacacatttctccagaagattcgatt
gcaatgggttttaatgaagaattttcacgccccgaatggatgttcttgactgttttacct
gttccaccaccaccagtacgtccatctatttcatttaatgaatctcagagaggtgaagat
gatttaacatttaaattagcagatatcttaaaagcaaatattagtttagagacattagag
cacaatggggccccacatcacgcaattgaagaagctgaaagtttgctacaatttcatgtg
gcaacttatatggataatgatattgcaggccaacctcaagctttacagaaatcaggacgt
cctgttaaatccattcgtgctcgtttaaagggtaaggaagggcgtattagaggtaatcta
atgggtaagcgtgtagacttttccgcaagaactgttatttcaggtgaccctaatttagaa
ctggatcaagttggtgttccaaaatcaattgccaaaactcttacgtaccctgaagttgtc
actccatacaatatcgatcgtctaacgcatttagtacgtaatggtccaaatgaacaccct
ggtgcaaagtatgtcattcgtgataatggtgatcgtattgacttaagatacagtaagaga
gctggtgatatacagttacaatacggctggaaagttgaacgtcatataatggataatgac
cctgttcttttcaatcgtcaaccttctttacataaaatgtctatgatggcacatagagtt
cgagtaatgcctttttcaactttcagattaaacctttctgttacttctccatataatgcg
gatttcgatggtgatgaaatgaacttgcatgtcccacaatcagaggaaacaagagcggaa
ctttcacaattatgtgctgtcccattacagattgtttctgcacaatctaataagccttgt
atgggtattgtccaagatacattatgtggtattagaaaacttactttaagagataacttt
attgaatttgatcaagtattaaatctattatactgggttccagattgggatggtgtcatt
ccaacacctgccatcttgaaacctaagccactttggtctggtaagcagatcttatcgatt
gcaattccaaaaggtattcacttacaacgtttcgatgaaggcactaccttcctttctcca
aaggataatggtatgttaatcattgatggccaaattatttttggtgttgttgataagaaa
actgttgggtcttctagtggtggtttaattcatgttgttacaagagaaaaaggtcctcaa
atttgtgcaaaactattcagtaatattcaaaaagttactaattattggttcttacataat
gggttctccacaggtattggtgatacaattgctgatggtgaaactatgagagagattaca
ggaactattgcagaagctaaaagaaaggtcgaggaagtcactaaagaagcacaagctaat
ttacttactgctaaacatggtatgacattgcgtgagtcgtttgaagataacgttgttcgt
ttcttaaacgaagcaagagataaagctgggcgtcttgcagaagttaatttaaatgatacg
aataatgttaaacaaatggtaagtgctgggtcaaaaggttctttcattaatatcgctcaa
atgtctgcttgtgtaggacaacaatccgttgaaggtaaacgtattgcttttggttttgtt
gaccgtacattacctcacttctctaaagatgattattctccagaatctaaaggttttgtt
gaaaattcttatttgagaggtttgacgcctcaagagttcttcttccatgcaatgggtggt
cgtgaaggtttaattgatactgcagtcaaaactgcagaaactggttatattcaacgtcgt
ctggttaaagctttagaagatattatggtacattatgatagtactacaagaaactctttg
ggtaatgttatccaatttgtgtacggtgaggatggtatcgatgctggtcatattgaaaaa
caatccatagatacaattggtggctctgatgctgcattcgaaaagagatacagaatcgat
ctattaaatacagaaaactctttgaatccttcattattagagtctggagctgaaataagc
ggtaatttaaaattacaaaacttattagatgtcgaatataaacagttggtaaaggatcgt
acgttcctaagaactgtttttgtcgatggtgaacctaactggcctctacctgtgaatatc
aaacgtatcgtgcaaaatgctcaacaaaccttcaaagttgatcattcaaagccatccgat
ttaactattccagatattgtccacggtgttcaagatctccaagagaaattattggtcttg
agagataagagtgaaatcatgcaaaaagctcaaagtgatgcaactacgttattttgctgt
ttaattcgttcacgtttggcaacacgtagagttttgcaagaatttaaattaaataagcaa
tccttccaatgggtattgaataacgtggaagcgcaatttttacgttcagttgttcaccct
ggtgaaatggttggtgttttggctgcccaatccattggtgaacctgccactcaaatgact
ctaaatactttccattttgctggtgtggcatctaaaaaagttacctctggtgttccacgt
ttaaaggaaattttaaatgttgctaagaacatgaagacaccatctttaactgcttacttg
gaacctgcatatgctgcagatcaagagaaagctaaattaattagatctgccattgagcac
acgacactaaaaagtgttaccgtggcatcagaaatttattatgatccagatccacgtaca
acagtgattgccgaagatgaagaaattatgcagttacacttctctttaatggatgaagaa
acagaaaaatcattagatcaacaatctccatggttattacgtttagaattagatcgtgct
gctatgaatgataaggatttaacaatgggccaagttggtgaaaagattagagagactttc
agaaatgatttgttcgttatatggtcagaagataacgccgaaaagttaattatacgttgc
cgtgttgtccgtcctaaggcccttgatgcggaaactgaagctgaagaagatcatatgttg
aagaaaatagaaaataccatgttagaaaatatcactttacgtggtgttgaaaatattgaa
cgtgtagttatgatgaaatatgatagaaaaatcccaggcacatctggtgcctatgagaaa
gtacctgaatgggtattagaaactgatggtgtcaatttgttggaagttatgactgttcct
ggtgttgacgcctctagaatatacaccaactcatttatcgacattactgaggtattaggt
atcgaagctggccgtgctgccttgtataaagaagtttacaatgttattgcttctgatggg
tcctacgttaactaccgtcatatggctctattggtcgatgtcatgacaacaaacggtagt
ctaacttcagttacacgtcatggtttcaataggtccaacaccggtgctctaatgagatgt
tcatttgaagaaacagtggaaattttgtttgaagctggtgcttctgcagaattagatgat
tgtcgtggtgtatctgaaaatgtcattttgggtcaaatggctccaattggtacaggatct
ttcgatgttatgatagatgaagaatctttggttaagtatatgccagaacaaaaggtatcc
gaattagctgatggccaagcaggtggtgaaactccatacagctctgacgcaggtctggtc
aacactgaaatcgacgttaaggatgaattaatgttctctccattggtcgattctggttca
acagatgccatggccggtggatttaccgcgtatggtggcggtgactatggtagtgcaaca
tcacctttcacagcttatggagaaactcctgcatctcctggatttggaagtgtttcatcc
cccggattttctgctacctcacctgcctattcgccaacttcaccagcatactcaccaact
tcgccaagctacagccctacatccccaagttatagcccaacttctccttcttactcaccc
acatctcctagctattcaccaacctccccaagttattcgccaacctccccaagttattca
ccaacctctccaagttattcacctacttctccatcctactctcctacttctccatcctac
tctccaacatctccaagctatagtcctacctcaccaagctatagtcctacctcaccaagc
tatagtccaacatcaccaagttacagccctacatcaccaagttattcgccaacttcaccc
agttactctccaacatctccaagctactctccaacttcccccagctatagcccaacatcc
ccaagctactctccaacttcccctagctatagcccaacctctccaaactatagtcccaga
tctccttcatattctccttcatctaatagtcgtaataatgatgatgatgacgatgacgat
caaacagataaaaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system